MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 63667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011884	CGT	2	6	28	33	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011884	GAA	2	6	300	305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905644
3	NC_011884	CAG	2	6	311	316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905644
4	NC_011884	GAG	2	6	318	323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905644
5	NC_011884	CGT	2	6	434	439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905644
6	NC_011884	AAT	2	6	447	452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905644
7	NC_011884	GGA	2	6	525	530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905644
8	NC_011884	TGG	2	6	709	714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905644
9	NC_011884	GAA	2	6	753	758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905644
10	NC_011884	GGT	2	6	800	805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905644
11	NC_011884	CAC	2	6	1106	1111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905644
12	NC_011884	CTG	2	6	1143	1148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905644
13	NC_011884	CGC	2	6	1200	1205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905644
14	NC_011884	GGC	2	6	1293	1298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905644
15	NC_011884	CAA	2	6	1453	1458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011884	CTA	4	12	1693	1704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011884	AGT	3	9	1727	1735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011884	TAA	2	6	1813	1818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011884	CCG	2	6	1853	1858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_011884	GCT	2	6	1860	1865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011884	TGC	2	6	2019	2024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905645
22	NC_011884	AGA	2	6	2254	2259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905645
23	NC_011884	TGC	2	6	2422	2427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905645
24	NC_011884	GGT	2	6	2587	2592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905645
25	NC_011884	CTG	2	6	2639	2644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905645
26	NC_011884	CAG	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905645
27	NC_011884	CTC	2	6	2826	2831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905645
28	NC_011884	GAA	2	6	2846	2851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905645
29	NC_011884	GCC	2	6	2963	2968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905645
30	NC_011884	CTG	2	6	3110	3115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011884	ATT	2	6	3120	3125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011884	AGC	2	6	3284	3289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011884	AGA	2	6	3511	3516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011884	TGA	2	6	3581	3586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905646
35	NC_011884	TGT	2	6	3609	3614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905646
36	NC_011884	GAG	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011884	GGT	2	6	3885	3890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011884	TGA	2	6	3958	3963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011884	GAA	3	9	4033	4041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011884	TTG	2	6	4216	4221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011884	ATG	2	6	4242	4247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011884	GTA	2	6	4287	4292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905647
43	NC_011884	ATT	2	6	4364	4369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905647
44	NC_011884	TTC	2	6	4539	4544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905647
45	NC_011884	GCG	2	6	4643	4648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905647
46	NC_011884	GGC	2	6	4672	4677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905647
47	NC_011884	TAG	2	6	4711	4716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905647
48	NC_011884	GGC	2	6	4798	4803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905647
49	NC_011884	CTA	2	6	4834	4839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905647
50	NC_011884	ATC	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905647
51	NC_011884	GAG	2	6	4935	4940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905647
52	NC_011884	CAG	2	6	4949	4954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905647
53	NC_011884	TAG	2	6	4959	4964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905647
54	NC_011884	CAG	2	6	5066	5071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905647
55	NC_011884	CAC	2	6	5117	5122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905647
56	NC_011884	ACC	2	6	5144	5149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905647
57	NC_011884	GTG	2	6	5193	5198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905647
58	NC_011884	GCT	2	6	5205	5210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905647
59	NC_011884	AGG	2	6	5326	5331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905647
60	NC_011884	CGG	2	6	5360	5365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905647
61	NC_011884	ATC	2	6	5454	5459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905647
62	NC_011884	GCG	2	6	5465	5470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905647
63	NC_011884	GAA	2	6	5588	5593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905647
64	NC_011884	CTG	2	6	5797	5802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905648
65	NC_011884	GCG	2	6	5821	5826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905648
66	NC_011884	GAT	2	6	5911	5916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905648
67	NC_011884	TGC	2	6	5981	5986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905648
68	NC_011884	CAG	2	6	6046	6051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905648
69	NC_011884	AGC	2	6	6068	6073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905648
70	NC_011884	GCC	2	6	6106	6111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905648
71	NC_011884	AGG	2	6	6149	6154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905648
72	NC_011884	CAG	2	6	6155	6160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905648
73	NC_011884	CTG	2	6	6232	6237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905648
74	NC_011884	TGC	2	6	6255	6260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905648
75	NC_011884	CTG	2	6	6349	6354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905648
76	NC_011884	GCT	2	6	6373	6378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905648
77	NC_011884	CAA	2	6	6502	6507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905648
78	NC_011884	TCC	2	6	6556	6561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905648
79	NC_011884	CTA	2	6	6585	6590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905648
80	NC_011884	AGC	2	6	6594	6599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905648
81	NC_011884	CGC	2	6	6880	6885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905649
82	NC_011884	TGC	3	9	6960	6968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905649
83	NC_011884	TCC	2	6	7004	7009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905649
84	NC_011884	CGG	2	6	7085	7090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905649
85	NC_011884	CAG	2	6	7160	7165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905649
86	NC_011884	AGC	2	6	7173	7178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905649
87	NC_011884	GTG	2	6	7215	7220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905649
88	NC_011884	GCG	2	6	7224	7229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905649
89	NC_011884	CAA	2	6	7232	7237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905649
90	NC_011884	AGT	2	6	7253	7258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905649
91	NC_011884	TGT	2	6	7332	7337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905649
92	NC_011884	TGC	2	6	7372	7377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905649
93	NC_011884	CTG	4	12	7496	7507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905649
94	NC_011884	CTG	2	6	7517	7522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905649
95	NC_011884	TGT	2	6	7605	7610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905649
96	NC_011884	CCA	2	6	7619	7624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905649
97	NC_011884	AAG	2	6	7783	7788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905649
98	NC_011884	CTC	2	6	7814	7819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905649
99	NC_011884	AGC	2	6	7986	7991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905649
100	NC_011884	GAG	2	6	8015	8020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011884	CAG	2	6	8114	8119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011884	ACC	2	6	8201	8206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011884	CAG	2	6	8349	8354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905650
104	NC_011884	CTG	2	6	8401	8406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905650
105	NC_011884	GGT	2	6	8515	8520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905650
106	NC_011884	CGG	2	6	8529	8534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905650
107	NC_011884	CGG	2	6	8574	8579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905650
108	NC_011884	GTT	2	6	8703	8708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905650
109	NC_011884	CTG	2	6	8733	8738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905650
110	NC_011884	GGC	2	6	8803	8808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905650
111	NC_011884	TCA	2	6	8882	8887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905650
112	NC_011884	CTG	2	6	8932	8937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905650
113	NC_011884	GTT	3	9	8952	8960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905650
114	NC_011884	GGC	2	6	9132	9137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905650
115	NC_011884	CTG	2	6	9268	9273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905650
116	NC_011884	CAG	2	6	9367	9372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905650
117	NC_011884	TAA	2	6	9426	9431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905650
118	NC_011884	GAG	2	6	9478	9483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905650
119	NC_011884	CGC	2	6	9550	9555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_011884	AAT	2	6	9665	9670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011884	ATT	2	6	9765	9770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905651
122	NC_011884	CTC	2	6	10004	10009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905651
123	NC_011884	GCT	2	6	10020	10025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905651
124	NC_011884	TGT	2	6	10164	10169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905651
125	NC_011884	AAG	2	6	10170	10175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905651
126	NC_011884	GGT	2	6	10181	10186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905651
127	NC_011884	TGC	2	6	10456	10461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011884	TGA	2	6	10565	10570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905652
129	NC_011884	CAG	2	6	10606	10611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905652
130	NC_011884	CGG	2	6	10997	11002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905652
131	NC_011884	ATC	2	6	11033	11038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905652
132	NC_011884	CAG	2	6	11235	11240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905652
133	NC_011884	GGT	2	6	11316	11321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905652
134	NC_011884	GGA	2	6	11574	11579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905652
135	NC_011884	CAG	2	6	11686	11691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905652
136	NC_011884	ATT	2	6	11842	11847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905652
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138	NC_011884	GAA	2	6	12037	12042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905652
139	NC_011884	CCT	2	6	12193	12198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905653
140	NC_011884	CGC	2	6	12280	12285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905653
141	NC_011884	GGT	2	6	12339	12344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905653
142	NC_011884	TGC	2	6	12371	12376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905653
143	NC_011884	CGC	2	6	12604	12609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905653
144	NC_011884	CAA	2	6	12706	12711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905653
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146	NC_011884	AGC	2	6	12855	12860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_011884	GCT	2	6	12993	12998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905654
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156	NC_011884	TTG	2	6	14045	14050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011884	TCC	2	6	14210	14215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905656
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160	NC_011884	ATT	2	6	14466	14471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905656
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249	NC_011884	GCC	3	9	22677	22685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905663
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256	NC_011884	CGA	2	6	23250	23255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905663
257	NC_011884	CCA	2	6	23292	23297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905663
258	NC_011884	ACC	2	6	23327	23332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905663
259	NC_011884	TCC	2	6	23340	23345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905663
260	NC_011884	CCA	2	6	23376	23381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905663
261	NC_011884	TGA	2	6	23437	23442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905663
262	NC_011884	ACC	2	6	23483	23488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905663
263	NC_011884	TGG	2	6	23557	23562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905663
264	NC_011884	GAA	2	6	23594	23599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905663
265	NC_011884	CGG	2	6	23665	23670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905663
266	NC_011884	CAC	2	6	23725	23730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905663
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268	NC_011884	CCA	2	6	23927	23932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905663
269	NC_011884	ATT	2	6	23970	23975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905663
270	NC_011884	ACT	2	6	23978	23983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905663
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279	NC_011884	AGG	2	6	24869	24874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905664
280	NC_011884	GGT	2	6	24882	24887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905664
281	NC_011884	ATA	2	6	24929	24934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905664
282	NC_011884	GTC	2	6	24981	24986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905664
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285	NC_011884	ATT	2	6	25324	25329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_011884	TGA	2	6	25336	25341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_011884	TAC	2	6	25486	25491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_011884	GAA	2	6	25511	25516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_011884	GAA	2	6	25653	25658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_011884	ATC	2	6	25753	25758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_011884	GCC	2	6	25826	25831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_011884	TCA	3	9	25889	25897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905666
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295	NC_011884	TTC	2	6	25959	25964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905666
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297	NC_011884	AAC	2	6	26091	26096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_011884	ATA	2	6	26326	26331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_011884	GTT	2	6	26384	26389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_011884	CGA	2	6	28836	28841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905668
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342	NC_011884	CTT	2	6	29638	29643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905670
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361	NC_011884	CCA	2	6	31621	31626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
362	NC_011884	CTG	2	6	31684	31689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905673
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