MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 97323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011884	CAG	2	6	139692	139697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905783
2502	NC_011884	GGCT	2	8	139734	139741	0 %	25 %	50 %	25 %	220905783
2503	NC_011884	GTT	2	6	139761	139766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905783
2504	NC_011884	T	7	7	139789	139795	0 %	100 %	0 %	0 %	220905783
2505	NC_011884	TGT	2	6	139817	139822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905783
2506	NC_011884	GGTA	2	8	139853	139860	25 %	25 %	50 %	0 %	220905783
2507	NC_011884	TCCCCC	2	12	139868	139879	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	220905783
2508	NC_011884	GATT	2	8	140013	140020	25 %	50 %	25 %	0 %	220905784
2509	NC_011884	CTG	2	6	140031	140036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905784
2510	NC_011884	CCCCAA	2	12	140102	140113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905784
2511	NC_011884	CTG	2	6	140139	140144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905784
2512	NC_011884	CGT	2	6	140173	140178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905784
2513	NC_011884	C	6	6	140228	140233	0 %	0 %	0 %	100 %	220905784
2514	NC_011884	G	6	6	140254	140259	0 %	0 %	100 %	0 %	220905784
2515	NC_011884	GTT	2	6	140271	140276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905784
2516	NC_011884	TG	3	6	140387	140392	0 %	50 %	50 %	0 %	220905784
2517	NC_011884	GGA	2	6	140396	140401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905784
2518	NC_011884	TGC	2	6	140440	140445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905784
2519	NC_011884	AGT	2	6	140462	140467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905784
2520	NC_011884	GCA	2	6	140506	140511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905784
2521	NC_011884	CAC	2	6	140526	140531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905784
2522	NC_011884	C	6	6	140550	140555	0 %	0 %	0 %	100 %	220905784
2523	NC_011884	TGG	2	6	140595	140600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905784
2524	NC_011884	CGC	2	6	140614	140619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905784
2525	NC_011884	G	6	6	140647	140652	0 %	0 %	100 %	0 %	220905784
2526	NC_011884	GGT	3	9	140728	140736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905784
2527	NC_011884	AAC	2	6	140740	140745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905784
2528	NC_011884	AGA	2	6	140791	140796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905784
2529	NC_011884	AAG	2	6	140883	140888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905784
2530	NC_011884	GCA	2	6	140941	140946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905784
2531	NC_011884	CGG	2	6	141007	141012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905784
2532	NC_011884	AGG	2	6	141027	141032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905785
2533	NC_011884	T	7	7	141172	141178	0 %	100 %	0 %	0 %	220905785
2534	NC_011884	CTG	2	6	141245	141250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905785
2535	NC_011884	ACC	2	6	141258	141263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905785
2536	NC_011884	GAC	2	6	141346	141351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905785
2537	NC_011884	T	7	7	141393	141399	0 %	100 %	0 %	0 %	220905785
2538	NC_011884	TGG	2	6	141438	141443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905785
2539	NC_011884	G	8	8	141463	141470	0 %	0 %	100 %	0 %	220905785
2540	NC_011884	CCT	2	6	141513	141518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2541	NC_011884	AGC	2	6	141651	141656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_011884	AAC	2	6	141725	141730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_011884	CGA	2	6	141773	141778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905786
2544	NC_011884	GCT	2	6	141812	141817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905786
2545	NC_011884	GGC	2	6	141888	141893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905786
2546	NC_011884	TCAA	2	8	141985	141992	50 %	25 %	0 %	25 %	220905786
2547	NC_011884	ACC	2	6	142009	142014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905786
2548	NC_011884	GCA	2	6	142060	142065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905786
2549	NC_011884	GGGC	2	8	142114	142121	0 %	0 %	75 %	25 %	220905786
2550	NC_011884	CAC	2	6	142127	142132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905786
2551	NC_011884	TCTT	2	8	142225	142232	0 %	75 %	0 %	25 %	220905786
2552	NC_011884	TGA	2	6	142429	142434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905786
2553	NC_011884	G	6	6	142559	142564	0 %	0 %	100 %	0 %	220905786
2554	NC_011884	TTC	2	6	142635	142640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905786
2555	NC_011884	CCCG	2	8	142654	142661	0 %	0 %	25 %	75 %	220905786
2556	NC_011884	TTC	2	6	142705	142710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905786
2557	NC_011884	ATG	2	6	142768	142773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905786
2558	NC_011884	GTG	2	6	142837	142842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905786
2559	NC_011884	TGG	2	6	142868	142873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905786
2560	NC_011884	GCG	2	6	142882	142887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905786
2561	NC_011884	TCC	2	6	142939	142944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905786
2562	NC_011884	CAT	2	6	142958	142963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905786
2563	NC_011884	CCA	2	6	142985	142990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905786
2564	NC_011884	T	7	7	143024	143030	0 %	100 %	0 %	0 %	220905786
2565	NC_011884	CAG	2	6	143108	143113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905786
2566	NC_011884	GGC	2	6	143184	143189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905786
2567	NC_011884	GGT	2	6	143340	143345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905786
2568	NC_011884	G	7	7	143375	143381	0 %	0 %	100 %	0 %	220905786
2569	NC_011884	CTA	2	6	143444	143449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_011884	CTG	2	6	143465	143470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_011884	GTTGC	2	10	143483	143492	0 %	40 %	40 %	20 %	220905787
2572	NC_011884	GTC	2	6	143497	143502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905787
2573	NC_011884	GCT	2	6	143505	143510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905787
2574	NC_011884	CAG	2	6	143555	143560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905787
2575	NC_011884	ATCG	2	8	143570	143577	25 %	25 %	25 %	25 %	220905787
2576	NC_011884	GGC	2	6	143615	143620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905787
2577	NC_011884	GGT	2	6	143624	143629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905787
2578	NC_011884	CAG	2	6	143726	143731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905787
2579	NC_011884	ATC	2	6	143777	143782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905787
2580	NC_011884	TGGG	2	8	143874	143881	0 %	25 %	75 %	0 %	220905787
2581	NC_011884	CAG	2	6	143954	143959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905787
2582	NC_011884	TCT	2	6	144021	144026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905787
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2584	NC_011884	CAA	2	6	144253	144258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905787
2585	NC_011884	GGA	2	6	144290	144295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905787
2586	NC_011884	G	6	6	144308	144313	0 %	0 %	100 %	0 %	220905787
2587	NC_011884	CGGC	2	8	144345	144352	0 %	0 %	50 %	50 %	220905787
2588	NC_011884	GTTGA	2	10	144436	144445	20 %	40 %	40 %	0 %	220905787
2589	NC_011884	CCG	2	6	144458	144463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905787
2590	NC_011884	TTCCCT	2	12	144502	144513	0 %	50 %	0 %	50 %	220905787
2591	NC_011884	CTG	2	6	144652	144657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905787
2592	NC_011884	GATC	2	8	144670	144677	25 %	25 %	25 %	25 %	220905787
2593	NC_011884	GTT	2	6	144733	144738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905787
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2595	NC_011884	CAT	2	6	144835	144840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905787
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2599	NC_011884	ACCA	2	8	145188	145195	50 %	0 %	0 %	50 %	220905787
2600	NC_011884	G	7	7	145206	145212	0 %	0 %	100 %	0 %	220905787
2601	NC_011884	G	6	6	145318	145323	0 %	0 %	100 %	0 %	220905787
2602	NC_011884	CCA	2	6	145361	145366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905787
2603	NC_011884	TTG	3	9	145367	145375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905787
2604	NC_011884	CGC	2	6	145410	145415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905787
2605	NC_011884	GCA	2	6	145459	145464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905787
2606	NC_011884	TGT	2	6	145515	145520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905787
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2608	NC_011884	GCA	2	6	145564	145569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905787
2609	NC_011884	CTG	2	6	145644	145649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905787
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2612	NC_011884	GCAG	2	8	145791	145798	25 %	0 %	50 %	25 %	220905787
2613	NC_011884	ACCAG	2	10	145950	145959	40 %	0 %	20 %	40 %	220905787
2614	NC_011884	CTC	2	6	145979	145984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905787
2615	NC_011884	GGAG	2	8	146021	146028	25 %	0 %	75 %	0 %	220905787
2616	NC_011884	CTG	2	6	146042	146047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905787
2617	NC_011884	AAGG	2	8	146090	146097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_011884	AGC	2	6	146129	146134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_011884	GCG	2	6	146155	146160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_011884	GAA	2	6	146179	146184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_011884	ATAAA	2	10	146188	146197	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2623	NC_011884	CTT	2	6	146222	146227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2990	NC_011884	CA	3	6	165898	165903	50 %	0 %	0 %	50 %	220905808
2991	NC_011884	TCA	2	6	165909	165914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905808
2992	NC_011884	TGGG	2	8	165929	165936	0 %	25 %	75 %	0 %	220905808
2993	NC_011884	GCA	2	6	165962	165967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905808
2994	NC_011884	GT	3	6	166001	166006	0 %	50 %	50 %	0 %	220905808
2995	NC_011884	GCA	4	12	166047	166058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905808
2996	NC_011884	GTG	2	6	166061	166066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905808
2997	NC_011884	T	7	7	166154	166160	0 %	100 %	0 %	0 %	220905808
2998	NC_011884	C	6	6	166237	166242	0 %	0 %	0 %	100 %	220905808
2999	NC_011884	CT	3	6	166259	166264	0 %	50 %	0 %	50 %	220905808
3000	NC_011884	T	6	6	166297	166302	0 %	100 %	0 %	0 %	220905808

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