MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 97323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_011884	TCT	2	6	112388	112393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_011884	AGC	2	6	112416	112421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_011884	TAGAT	2	10	112429	112438	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_011884	TCA	2	6	112444	112449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_011884	TTA	2	6	112469	112474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_011884	CAC	2	6	112493	112498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2007	NC_011884	CTC	2	6	112582	112587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2008	NC_011884	A	7	7	112667	112673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_011884	CTG	2	6	112676	112681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_011884	AGT	2	6	112706	112711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_011884	GCA	2	6	112754	112759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905756
2012	NC_011884	CAT	2	6	112837	112842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905756
2013	NC_011884	ACCAA	2	10	112850	112859	60 %	0 %	0 %	40 %	220905756
2014	NC_011884	GGT	2	6	112900	112905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905756
2015	NC_011884	CTCAT	2	10	112930	112939	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2016	NC_011884	AGT	2	6	113088	113093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905757
2017	NC_011884	GGT	2	6	113188	113193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905757
2018	NC_011884	CAG	3	9	113223	113231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905757
2019	NC_011884	TGG	2	6	113262	113267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905757
2020	NC_011884	GT	3	6	113330	113335	0 %	50 %	50 %	0 %	220905758
2021	NC_011884	GT	3	6	113352	113357	0 %	50 %	50 %	0 %	220905758
2022	NC_011884	TGGG	2	8	113447	113454	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_011884	GTACG	2	10	113466	113475	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2024	NC_011884	GCT	2	6	113476	113481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2025	NC_011884	GCA	2	6	113483	113488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2026	NC_011884	GTTCA	2	10	113519	113528	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2027	NC_011884	CTGA	2	8	113579	113586	25 %	25 %	25 %	25 %	220905759
2028	NC_011884	ATCG	2	8	113588	113595	25 %	25 %	25 %	25 %	220905759
2029	NC_011884	TCA	3	9	113736	113744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905759
2030	NC_011884	TGAT	2	8	113763	113770	25 %	50 %	25 %	0 %	220905759
2031	NC_011884	GCC	2	6	113801	113806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905759
2032	NC_011884	TCG	2	6	113890	113895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905759
2033	NC_011884	CTGAGC	2	12	113973	113984	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220905759
2034	NC_011884	GGAA	2	8	114019	114026	50 %	0 %	50 %	0 %	220905759
2035	NC_011884	CAA	2	6	114056	114061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905759
2036	NC_011884	TGAA	2	8	114096	114103	50 %	25 %	25 %	0 %	220905759
2037	NC_011884	CGA	2	6	114163	114168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905759
2038	NC_011884	ATG	2	6	114270	114275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905759
2039	NC_011884	CAG	2	6	114506	114511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2040	NC_011884	TGCT	2	8	114621	114628	0 %	50 %	25 %	25 %	220905760
2041	NC_011884	GTG	2	6	114630	114635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905760
2042	NC_011884	CCA	3	9	114664	114672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905760
2043	NC_011884	GTG	2	6	114787	114792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905760
2044	NC_011884	CCA	2	6	114799	114804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905760
2045	NC_011884	CAG	2	6	114825	114830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905760
2046	NC_011884	CTG	2	6	114975	114980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905760
2047	NC_011884	TGC	2	6	115094	115099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905760
2048	NC_011884	GCAG	2	8	115243	115250	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2049	NC_011884	CCTC	2	8	115411	115418	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2050	NC_011884	TGG	2	6	115438	115443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_011884	TGG	2	6	115510	115515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_011884	TC	3	6	115635	115640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2053	NC_011884	AC	4	8	115688	115695	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2054	NC_011884	TGG	2	6	115758	115763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_011884	GCT	2	6	115894	115899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2056	NC_011884	CGC	2	6	115950	115955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2057	NC_011884	TC	3	6	116087	116092	0 %	50 %	0 %	50 %	220905762
2058	NC_011884	CCT	2	6	116116	116121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905762
2059	NC_011884	TGA	3	9	116154	116162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905762
2060	NC_011884	TCC	2	6	116258	116263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905762
2061	NC_011884	CCA	3	9	116425	116433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905762
2062	NC_011884	CAC	2	6	116516	116521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905762
2063	NC_011884	GGTGA	2	10	116537	116546	20 %	20 %	60 %	0 %	220905762
2064	NC_011884	G	6	6	116555	116560	0 %	0 %	100 %	0 %	220905762
2065	NC_011884	CGT	2	6	116643	116648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905763
2066	NC_011884	G	8	8	116707	116714	0 %	0 %	100 %	0 %	220905763
2067	NC_011884	T	6	6	116771	116776	0 %	100 %	0 %	0 %	220905763
2068	NC_011884	TCA	2	6	116956	116961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905763
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2071	NC_011884	GCTCCC	2	12	117253	117264	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	220905763
2072	NC_011884	GC	3	6	117279	117284	0 %	0 %	50 %	50 %	220905763
2073	NC_011884	CTG	2	6	117311	117316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905763
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2075	NC_011884	TGGCA	2	10	117339	117348	20 %	20 %	40 %	20 %	220905763
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2088	NC_011884	TGT	2	6	117807	117812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905763
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2092	NC_011884	ATGGT	2	10	118066	118075	20 %	40 %	40 %	0 %	220905763
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2096	NC_011884	GGT	2	6	118379	118384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905763
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2104	NC_011884	GCCGT	2	10	118862	118871	0 %	20 %	40 %	40 %	220905763
2105	NC_011884	GGAA	2	8	118875	118882	50 %	0 %	50 %	0 %	220905763
2106	NC_011884	CAC	2	6	118893	118898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905763
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2108	NC_011884	AGT	2	6	118951	118956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905763
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2110	NC_011884	TGT	2	6	118974	118979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905763
2111	NC_011884	GGA	2	6	119174	119179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2112	NC_011884	GCA	2	6	119289	119294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905764
2113	NC_011884	C	6	6	119298	119303	0 %	0 %	0 %	100 %	220905764
2114	NC_011884	ACC	2	6	119320	119325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905764
2115	NC_011884	C	6	6	119324	119329	0 %	0 %	0 %	100 %	220905764
2116	NC_011884	GTG	2	6	119374	119379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905764
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2121	NC_011884	GCGG	2	8	119689	119696	0 %	0 %	75 %	25 %	220905764
2122	NC_011884	GAA	2	6	119713	119718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905764
2123	NC_011884	CGG	2	6	119781	119786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905764
2124	NC_011884	CGC	2	6	119856	119861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905764
2125	NC_011884	ATC	2	6	119884	119889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905764
2126	NC_011884	CCT	2	6	119897	119902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905764
2127	NC_011884	TGC	2	6	119928	119933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905764
2128	NC_011884	CCG	2	6	119963	119968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905764
2129	NC_011884	CTG	2	6	119995	120000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905764
2130	NC_011884	ATG	2	6	120119	120124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905764
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2132	NC_011884	TGC	2	6	120198	120203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2133	NC_011884	GCAG	2	8	120320	120327	25 %	0 %	50 %	25 %	220905765
2134	NC_011884	GCC	2	6	120355	120360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905765
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2139	NC_011884	CTG	2	6	120541	120546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905765
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2141	NC_011884	CTGG	2	8	120568	120575	0 %	25 %	50 %	25 %	220905765
2142	NC_011884	G	6	6	120614	120619	0 %	0 %	100 %	0 %	220905765
2143	NC_011884	TGC	2	6	120638	120643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905765
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2151	NC_011884	GATT	2	8	121055	121062	25 %	50 %	25 %	0 %	220905766
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2157	NC_011884	CTG	2	6	121627	121632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905766
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2162	NC_011884	CTG	2	6	121837	121842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905766
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2185	NC_011884	GTC	3	9	122892	122900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905766
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2189	NC_011884	CT	4	8	123101	123108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2190	NC_011884	CTGT	2	8	123129	123136	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2213	NC_011884	TGGG	2	8	124203	124210	0 %	25 %	75 %	0 %	220905768
2214	NC_011884	CGAT	2	8	124257	124264	25 %	25 %	25 %	25 %	220905768
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2221	NC_011884	TAT	2	6	124695	124700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905769
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2236	NC_011884	TTC	2	6	125567	125572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2237	NC_011884	GTA	2	6	125589	125594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2238	NC_011884	TTAAAA	2	12	125602	125613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2240	NC_011884	GTT	2	6	125657	125662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2241	NC_011884	CTT	2	6	125736	125741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2242	NC_011884	A	6	6	125808	125813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2243	NC_011884	AAAGAG	2	12	125823	125834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2244	NC_011884	TCGA	2	8	125989	125996	25 %	25 %	25 %	25 %	220905770
2245	NC_011884	A	6	6	126077	126082	100 %	0 %	0 %	0 %	220905770
2246	NC_011884	GGC	2	6	126117	126122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905770
2247	NC_011884	T	6	6	126127	126132	0 %	100 %	0 %	0 %	220905770
2248	NC_011884	ACG	2	6	126178	126183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905770
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2252	NC_011884	TAC	2	6	126380	126385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2253	NC_011884	CTT	2	6	126405	126410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2254	NC_011884	AGC	2	6	126462	126467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2255	NC_011884	TG	3	6	126539	126544	0 %	50 %	50 %	0 %	220905771
2256	NC_011884	TGC	2	6	126553	126558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905771
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2286	NC_011884	AGCG	2	8	127931	127938	25 %	0 %	50 %	25 %	220905772
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2291	NC_011884	TTAG	2	8	128292	128299	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2292	NC_011884	TGT	2	6	128353	128358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2355	NC_011884	T	6	6	132230	132235	0 %	100 %	0 %	0 %	220905776
2356	NC_011884	G	7	7	132236	132242	0 %	0 %	100 %	0 %	220905776
2357	NC_011884	AAT	2	6	132264	132269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905776
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2360	NC_011884	GCT	2	6	132478	132483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2361	NC_011884	ACG	2	6	132570	132575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905777
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2365	NC_011884	ATCG	2	8	132743	132750	25 %	25 %	25 %	25 %	220905777
2366	NC_011884	CTGGAA	2	12	132789	132800	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220905777
2367	NC_011884	ACAGC	2	10	132831	132840	40 %	0 %	20 %	40 %	220905777
2368	NC_011884	CCA	2	6	132852	132857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905777
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2370	NC_011884	CGG	2	6	133062	133067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905777
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2485	NC_011884	CACT	2	8	138567	138574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2491	NC_011884	CAA	2	6	138929	138934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905782
2492	NC_011884	GCT	2	6	138946	138951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905782
2493	NC_011884	GCC	2	6	139086	139091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905782
2494	NC_011884	CCA	2	6	139138	139143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905782
2495	NC_011884	TCC	2	6	139280	139285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905783
2496	NC_011884	T	7	7	139399	139405	0 %	100 %	0 %	0 %	220905783
2497	NC_011884	CTGT	2	8	139485	139492	0 %	50 %	25 %	25 %	220905783
2498	NC_011884	TGG	2	6	139584	139589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905783
2499	NC_011884	G	6	6	139616	139621	0 %	0 %	100 %	0 %	220905783
2500	NC_011884	T	6	6	139632	139637	0 %	100 %	0 %	0 %	220905783

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