MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 97323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011884	TTG	2	6	82609	82614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905722
1502	NC_011884	AGC	2	6	82685	82690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905722
1503	NC_011884	CCGT	2	8	82781	82788	0 %	25 %	25 %	50 %	220905722
1504	NC_011884	TCC	2	6	82851	82856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905723
1505	NC_011884	CAA	2	6	82871	82876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905723
1506	NC_011884	ATG	2	6	82974	82979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905723
1507	NC_011884	GCTAAA	2	12	83039	83050	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	220905723
1508	NC_011884	CTC	2	6	83120	83125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905723
1509	NC_011884	CCT	2	6	83210	83215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905723
1510	NC_011884	AGG	2	6	83245	83250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905723
1511	NC_011884	CCAT	2	8	83271	83278	25 %	25 %	0 %	50 %	220905723
1512	NC_011884	ATT	2	6	83357	83362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905723
1513	NC_011884	CCAG	2	8	83376	83383	25 %	0 %	25 %	50 %	220905723
1514	NC_011884	GAG	2	6	83416	83421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_011884	AT	3	6	83572	83577	50 %	50 %	0 %	0 %	220905724
1516	NC_011884	T	6	6	83591	83596	0 %	100 %	0 %	0 %	220905724
1517	NC_011884	CAA	2	6	83628	83633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905724
1518	NC_011884	TCA	2	6	83636	83641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905724
1519	NC_011884	TGT	2	6	83666	83671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905724
1520	NC_011884	TCCA	2	8	83758	83765	25 %	25 %	0 %	50 %	220905724
1521	NC_011884	GATC	2	8	83766	83773	25 %	25 %	25 %	25 %	220905724
1522	NC_011884	CCA	2	6	83775	83780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905724
1523	NC_011884	ATCCC	2	10	83836	83845	20 %	20 %	0 %	60 %	220905724
1524	NC_011884	TA	3	6	83853	83858	50 %	50 %	0 %	0 %	220905724
1525	NC_011884	GCTC	2	8	83894	83901	0 %	25 %	25 %	50 %	220905724
1526	NC_011884	GCT	2	6	83921	83926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905724
1527	NC_011884	CTCCAG	2	12	83932	83943	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220905724
1528	NC_011884	CTG	2	6	83988	83993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905724
1529	NC_011884	GTA	2	6	84011	84016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905724
1530	NC_011884	CA	3	6	84027	84032	50 %	0 %	0 %	50 %	220905724
1531	NC_011884	CAATC	2	10	84255	84264	40 %	20 %	0 %	40 %	220905724
1532	NC_011884	CCAT	2	8	84395	84402	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_011884	GCA	2	6	84452	84457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_011884	GAT	2	6	84545	84550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905725
1535	NC_011884	GCATCT	2	12	84583	84594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220905725
1536	NC_011884	TTG	2	6	84651	84656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905725
1537	NC_011884	CTCA	2	8	84773	84780	25 %	25 %	0 %	50 %	220905725
1538	NC_011884	TTG	2	6	84826	84831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905725
1539	NC_011884	GCCA	2	8	84866	84873	25 %	0 %	25 %	50 %	220905725
1540	NC_011884	ATGA	2	8	84879	84886	50 %	25 %	25 %	0 %	220905725
1541	NC_011884	C	6	6	84934	84939	0 %	0 %	0 %	100 %	220905725
1542	NC_011884	CTG	2	6	84950	84955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905725
1543	NC_011884	CTG	2	6	84966	84971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905725
1544	NC_011884	GAG	2	6	84975	84980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905725
1545	NC_011884	TGG	2	6	85161	85166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905726
1546	NC_011884	G	6	6	85186	85191	0 %	0 %	100 %	0 %	220905726
1547	NC_011884	GTT	2	6	85207	85212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905726
1548	NC_011884	TTCC	2	8	85251	85258	0 %	50 %	0 %	50 %	220905726
1549	NC_011884	GCA	2	6	85265	85270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905726
1550	NC_011884	GCA	2	6	85284	85289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905726
1551	NC_011884	AGC	2	6	85300	85305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905726
1552	NC_011884	ATT	2	6	85366	85371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905726
1553	NC_011884	GGGCAG	2	12	85476	85487	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	220905726
1554	NC_011884	GGA	2	6	85522	85527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905726
1555	NC_011884	CGT	2	6	85573	85578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905726
1556	NC_011884	A	6	6	85693	85698	100 %	0 %	0 %	0 %	220905726
1557	NC_011884	CGG	2	6	85710	85715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905726
1558	NC_011884	AGCAT	2	10	85805	85814	40 %	20 %	20 %	20 %	220905726
1559	NC_011884	CCG	2	6	85840	85845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905726
1560	NC_011884	TTCC	2	8	86028	86035	0 %	50 %	0 %	50 %	220905726
1561	NC_011884	CGG	2	6	86049	86054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905726
1562	NC_011884	AAAC	2	8	86089	86096	75 %	0 %	0 %	25 %	220905726
1563	NC_011884	CAG	2	6	86130	86135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905726
1564	NC_011884	CCAG	2	8	86145	86152	25 %	0 %	25 %	50 %	220905726
1565	NC_011884	CTC	2	6	86175	86180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905726
1566	NC_011884	CGG	2	6	86202	86207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905726
1567	NC_011884	GGC	2	6	86371	86376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905727
1568	NC_011884	TCC	2	6	86378	86383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905727
1569	NC_011884	ATCG	2	8	86534	86541	25 %	25 %	25 %	25 %	220905727
1570	NC_011884	ATCA	2	8	86605	86612	50 %	25 %	0 %	25 %	220905727
1571	NC_011884	TAAT	2	8	86645	86652	50 %	50 %	0 %	0 %	220905727
1572	NC_011884	GTG	2	6	86879	86884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905727
1573	NC_011884	GTT	2	6	86982	86987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905727
1574	NC_011884	CAA	2	6	87007	87012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905727
1575	NC_011884	CTG	3	9	87013	87021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905727
1576	NC_011884	TAAAA	2	10	87045	87054	80 %	20 %	0 %	0 %	220905727
1577	NC_011884	CGGGT	2	10	87143	87152	0 %	20 %	60 %	20 %	220905727
1578	NC_011884	AGG	2	6	87207	87212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905727
1579	NC_011884	CAG	2	6	87326	87331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905727
1580	NC_011884	GGGA	2	8	87333	87340	25 %	0 %	75 %	0 %	220905727
1581	NC_011884	TGC	2	6	87348	87353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905727
1582	NC_011884	CAG	2	6	87510	87515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905728
1583	NC_011884	TAA	2	6	87650	87655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905728
1584	NC_011884	GTT	2	6	87662	87667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905728
1585	NC_011884	TCCG	2	8	87736	87743	0 %	25 %	25 %	50 %	220905728
1586	NC_011884	GCC	2	6	87787	87792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905728
1587	NC_011884	CCA	2	6	87819	87824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905728
1588	NC_011884	TCT	2	6	87877	87882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905728
1589	NC_011884	GAT	2	6	87917	87922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905728
1590	NC_011884	CA	3	6	88029	88034	50 %	0 %	0 %	50 %	220905728
1591	NC_011884	CGC	2	6	88044	88049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905728
1592	NC_011884	CAC	2	6	88080	88085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905728
1593	NC_011884	CAG	2	6	88164	88169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905728
1594	NC_011884	GTT	2	6	88181	88186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905728
1595	NC_011884	CT	3	6	88279	88284	0 %	50 %	0 %	50 %	220905728
1596	NC_011884	GCA	2	6	88324	88329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905728
1597	NC_011884	CAA	2	6	88367	88372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_011884	G	6	6	88423	88428	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_011884	AGT	2	6	88599	88604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_011884	GAGATG	2	12	88608	88619	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_011884	CATTA	2	10	88631	88640	40 %	40 %	0 %	20 %	220905729
1602	NC_011884	GTAG	2	8	88650	88657	25 %	25 %	50 %	0 %	220905729
1603	NC_011884	AGT	2	6	88709	88714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905729
1604	NC_011884	A	6	6	88726	88731	100 %	0 %	0 %	0 %	220905729
1605	NC_011884	GAT	2	6	88746	88751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905729
1606	NC_011884	GAT	2	6	88788	88793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905729
1607	NC_011884	T	6	6	88797	88802	0 %	100 %	0 %	0 %	220905729
1608	NC_011884	AAC	2	6	88819	88824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905729
1609	NC_011884	TCGA	2	8	88928	88935	25 %	25 %	25 %	25 %	220905730
1610	NC_011884	ACTTT	2	10	88969	88978	20 %	60 %	0 %	20 %	220905730
1611	NC_011884	AGCA	2	8	89022	89029	50 %	0 %	25 %	25 %	220905730
1612	NC_011884	TGG	2	6	89125	89130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905730
1613	NC_011884	CAA	2	6	89164	89169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905730
1614	NC_011884	ATACTT	2	12	89324	89335	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1615	NC_011884	TGG	2	6	89435	89440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905731
1616	NC_011884	AAAAGC	2	12	89579	89590	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	220905731
1617	NC_011884	CTGAT	2	10	89681	89690	20 %	40 %	20 %	20 %	220905731
1618	NC_011884	GATC	2	8	89712	89719	25 %	25 %	25 %	25 %	220905731
1619	NC_011884	CA	3	6	89782	89787	50 %	0 %	0 %	50 %	220905731
1620	NC_011884	GTA	2	6	89815	89820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905731
1621	NC_011884	AGT	2	6	89825	89830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905731
1622	NC_011884	CCA	2	6	89851	89856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905732
1623	NC_011884	AGA	2	6	89915	89920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905732
1624	NC_011884	G	7	7	89930	89936	0 %	0 %	100 %	0 %	220905732
1625	NC_011884	TCGG	2	8	89959	89966	0 %	25 %	50 %	25 %	220905732
1626	NC_011884	TATC	2	8	89997	90004	25 %	50 %	0 %	25 %	220905732
1627	NC_011884	CCA	2	6	90008	90013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905732
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1753	NC_011884	TCC	2	6	97929	97934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905739
1754	NC_011884	GAC	2	6	97977	97982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905739
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1756	NC_011884	ATTA	2	8	98109	98116	50 %	50 %	0 %	0 %	220905739
1757	NC_011884	GCG	2	6	98191	98196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905739
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1760	NC_011884	GGA	2	6	98331	98336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1761	NC_011884	CTT	2	6	98413	98418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905740
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1767	NC_011884	TGC	2	6	98809	98814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905740
1768	NC_011884	CTC	2	6	98863	98868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1769	NC_011884	TAC	2	6	98882	98887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1770	NC_011884	TGT	2	6	98975	98980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905741
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1797	NC_011884	A	6	6	100399	100404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1822	NC_011884	AGCT	2	8	101885	101892	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1823	NC_011884	AAG	2	6	101922	101927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1824	NC_011884	GCA	2	6	101935	101940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1850	NC_011884	A	7	7	103419	103425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1851	NC_011884	CAG	2	6	103438	103443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1860	NC_011884	CTG	2	6	103924	103929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1864	NC_011884	ACCCA	2	10	104273	104282	40 %	0 %	0 %	60 %	220905746
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1869	NC_011884	CAAA	2	8	105002	105009	75 %	0 %	0 %	25 %	220905747
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1873	NC_011884	A	6	6	105132	105137	100 %	0 %	0 %	0 %	220905747
1874	NC_011884	AGA	2	6	105161	105166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905747
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