MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 97323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011884	TGA	2	6	54337	54342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011884	CAG	2	6	54438	54443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_011884	TGA	2	6	54503	54508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011884	GTT	3	9	54569	54577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011884	TTC	2	6	54600	54605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_011884	G	6	6	54743	54748	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011884	CCT	2	6	54829	54834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_011884	CCG	2	6	54843	54848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_011884	GGT	2	6	54906	54911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011884	CTG	2	6	54945	54950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_011884	GGA	2	6	55042	55047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011884	TGA	2	6	55123	55128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011884	GCC	2	6	55174	55179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_011884	A	6	6	55201	55206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011884	CTG	2	6	55311	55316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905699
1016	NC_011884	CCG	2	6	55357	55362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905699
1017	NC_011884	AG	3	6	55387	55392	50 %	0 %	50 %	0 %	220905699
1018	NC_011884	GTA	2	6	55546	55551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905699
1019	NC_011884	CGA	2	6	55578	55583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905699
1020	NC_011884	AGC	2	6	55722	55727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905699
1021	NC_011884	ATC	2	6	55750	55755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905699
1022	NC_011884	TGG	2	6	55761	55766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905699
1023	NC_011884	CCA	2	6	55770	55775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905699
1024	NC_011884	TGA	2	6	55818	55823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905699
1025	NC_011884	GATT	2	8	55983	55990	25 %	50 %	25 %	0 %	220905699
1026	NC_011884	ACA	2	6	56006	56011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905699
1027	NC_011884	GCC	2	6	56186	56191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905699
1028	NC_011884	ACC	2	6	56249	56254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905699
1029	NC_011884	CTG	2	6	56266	56271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905699
1030	NC_011884	GCC	2	6	56299	56304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905699
1031	NC_011884	GAT	2	6	56361	56366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905699
1032	NC_011884	TGA	2	6	56415	56420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905699
1033	NC_011884	G	6	6	56433	56438	0 %	0 %	100 %	0 %	220905699
1034	NC_011884	CTG	2	6	56482	56487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_011884	CTG	2	6	56491	56496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_011884	AAGATT	2	12	56516	56527	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011884	CCCT	2	8	56576	56583	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1038	NC_011884	CCT	2	6	56699	56704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905700
1039	NC_011884	GAG	2	6	56770	56775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905700
1040	NC_011884	A	7	7	56778	56784	100 %	0 %	0 %	0 %	220905700
1041	NC_011884	TTC	2	6	56851	56856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905700
1042	NC_011884	TTA	2	6	56868	56873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905700
1043	NC_011884	TCC	2	6	56879	56884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905700
1044	NC_011884	CTG	2	6	56893	56898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905700
1045	NC_011884	TGAA	2	8	57013	57020	50 %	25 %	25 %	0 %	220905700
1046	NC_011884	ACC	2	6	57036	57041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905700
1047	NC_011884	GCT	2	6	57047	57052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905700
1048	NC_011884	AGG	2	6	57055	57060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905700
1049	NC_011884	AGG	2	6	57112	57117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905700
1050	NC_011884	CTC	2	6	57156	57161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905700
1051	NC_011884	TTG	2	6	57251	57256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905700
1052	NC_011884	AAC	2	6	57298	57303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905700
1053	NC_011884	AAG	2	6	57331	57336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905700
1054	NC_011884	AGC	3	9	57410	57418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905700
1055	NC_011884	TTC	2	6	57508	57513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905700
1056	NC_011884	T	6	6	57537	57542	0 %	100 %	0 %	0 %	220905700
1057	NC_011884	GCA	2	6	57630	57635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905701
1058	NC_011884	AGG	2	6	57699	57704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905701
1059	NC_011884	CTG	2	6	57730	57735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905701
1060	NC_011884	TGC	2	6	57788	57793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905701
1061	NC_011884	GAA	2	6	57808	57813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905701
1062	NC_011884	AGG	2	6	57815	57820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905701
1063	NC_011884	AAC	3	9	57842	57850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905701
1064	NC_011884	ATT	2	6	57862	57867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905701
1065	NC_011884	TTC	2	6	57872	57877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905701
1066	NC_011884	ATGGG	2	10	57947	57956	20 %	20 %	60 %	0 %	220905701
1067	NC_011884	G	6	6	57954	57959	0 %	0 %	100 %	0 %	220905701
1068	NC_011884	CAA	2	6	57994	57999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905701
1069	NC_011884	GCA	2	6	58023	58028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905701
1070	NC_011884	GGGCT	2	10	58054	58063	0 %	20 %	60 %	20 %	220905701
1071	NC_011884	T	8	8	58068	58075	0 %	100 %	0 %	0 %	220905701
1072	NC_011884	CAG	2	6	58124	58129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905701
1073	NC_011884	TCT	2	6	58133	58138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905701
1074	NC_011884	G	6	6	58158	58163	0 %	0 %	100 %	0 %	220905701
1075	NC_011884	AGA	2	6	58180	58185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905701
1076	NC_011884	GAT	2	6	58206	58211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905701
1077	NC_011884	TCC	2	6	58238	58243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905701
1078	NC_011884	GTT	2	6	58380	58385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905701
1079	NC_011884	GTG	2	6	58390	58395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905701
1080	NC_011884	TGG	2	6	58446	58451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905701
1081	NC_011884	TAGC	2	8	58623	58630	25 %	25 %	25 %	25 %	220905701
1082	NC_011884	CCCAG	2	10	58634	58643	20 %	0 %	20 %	60 %	220905701
1083	NC_011884	AAT	2	6	58687	58692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905701
1084	NC_011884	C	6	6	58821	58826	0 %	0 %	0 %	100 %	220905701
1085	NC_011884	TCC	2	6	58856	58861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905701
1086	NC_011884	TAC	2	6	58899	58904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905701
1087	NC_011884	CCT	2	6	58932	58937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905701
1088	NC_011884	CATTTT	2	12	58948	58959	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	220905701
1089	NC_011884	T	6	6	58956	58961	0 %	100 %	0 %	0 %	220905701
1090	NC_011884	GAAA	2	8	58979	58986	75 %	0 %	25 %	0 %	220905701
1091	NC_011884	CAG	2	6	59011	59016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905701
1092	NC_011884	CAG	2	6	59089	59094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905701
1093	NC_011884	AGA	2	6	59116	59121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905701
1094	NC_011884	GGA	2	6	59366	59371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011884	A	6	6	59413	59418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_011884	TCT	2	6	59480	59485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_011884	TCG	2	6	59587	59592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905702
1098	NC_011884	TAA	2	6	59673	59678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011884	T	7	7	59695	59701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011884	TTC	2	6	59817	59822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905703
1101	NC_011884	ATCT	2	8	59838	59845	25 %	50 %	0 %	25 %	220905703
1102	NC_011884	GAA	2	6	60023	60028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905703
1103	NC_011884	GTC	2	6	60043	60048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905703
1104	NC_011884	CGG	2	6	60051	60056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905703
1105	NC_011884	CGA	2	6	60128	60133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905703
1106	NC_011884	GCC	2	6	60568	60573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905704
1107	NC_011884	TTC	2	6	60576	60581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905704
1108	NC_011884	G	6	6	60604	60609	0 %	0 %	100 %	0 %	220905704
1109	NC_011884	CTG	2	6	60662	60667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905704
1110	NC_011884	T	6	6	60674	60679	0 %	100 %	0 %	0 %	220905704
1111	NC_011884	AAT	2	6	60682	60687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905704
1112	NC_011884	ATGATC	2	12	60751	60762	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	220905704
1113	NC_011884	G	6	6	60842	60847	0 %	0 %	100 %	0 %	220905704
1114	NC_011884	TTC	2	6	60852	60857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905704
1115	NC_011884	GCT	2	6	60897	60902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905704
1116	NC_011884	CAA	2	6	61039	61044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_011884	T	6	6	61094	61099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011884	TGC	2	6	61163	61168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_011884	GCAG	2	8	61172	61179	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_011884	ACC	2	6	61205	61210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_011884	TGG	2	6	61239	61244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_011884	TTCC	2	8	61279	61286	0 %	50 %	0 %	50 %	220905705
1123	NC_011884	AAG	2	6	61299	61304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905705
1124	NC_011884	G	6	6	61450	61455	0 %	0 %	100 %	0 %	220905705
1125	NC_011884	GGGA	2	8	61486	61493	25 %	0 %	75 %	0 %	220905705
1126	NC_011884	ACCTGC	2	12	61566	61577	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220905705
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1128	NC_011884	AGC	2	6	61712	61717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905705
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