MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 97323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011884	CA	3	6	28196	28201	50 %	0 %	0 %	50 %	220905668
502	NC_011884	TTC	2	6	28271	28276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905668
503	NC_011884	CCAG	2	8	28309	28316	25 %	0 %	25 %	50 %	220905668
504	NC_011884	GCT	2	6	28396	28401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905668
505	NC_011884	GAC	2	6	28424	28429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905668
506	NC_011884	CTT	2	6	28432	28437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905668
507	NC_011884	GCG	2	6	28482	28487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905668
508	NC_011884	AAT	2	6	28547	28552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905668
509	NC_011884	CGG	2	6	28621	28626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905668
510	NC_011884	TGA	2	6	28666	28671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905668
511	NC_011884	TC	3	6	28696	28701	0 %	50 %	0 %	50 %	220905668
512	NC_011884	TCC	2	6	28754	28759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905668
513	NC_011884	GCA	2	6	28780	28785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905668
514	NC_011884	CGA	2	6	28836	28841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905668
515	NC_011884	GGTT	2	8	28882	28889	0 %	50 %	50 %	0 %	220905668
516	NC_011884	G	7	7	28909	28915	0 %	0 %	100 %	0 %	220905668
517	NC_011884	GAC	2	6	28937	28942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_011884	GGC	2	6	28985	28990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905669
519	NC_011884	ATCG	2	8	29048	29055	25 %	25 %	25 %	25 %	220905669
520	NC_011884	GCGGG	2	10	29070	29079	0 %	0 %	80 %	20 %	220905669
521	NC_011884	GAA	2	6	29088	29093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905669
522	NC_011884	GGT	2	6	29099	29104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905669
523	NC_011884	GTG	2	6	29157	29162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905669
524	NC_011884	GTT	2	6	29182	29187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905669
525	NC_011884	CATC	2	8	29218	29225	25 %	25 %	0 %	50 %	220905669
526	NC_011884	CAG	2	6	29257	29262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905669
527	NC_011884	A	7	7	29276	29282	100 %	0 %	0 %	0 %	220905669
528	NC_011884	GAA	2	6	29287	29292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905669
529	NC_011884	ATGGG	2	10	29304	29313	20 %	20 %	60 %	0 %	220905669
530	NC_011884	CT	3	6	29314	29319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_011884	CCTC	2	8	29345	29352	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
532	NC_011884	TGC	2	6	29356	29361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_011884	TTTC	2	8	29367	29374	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
534	NC_011884	TTCA	2	8	29579	29586	25 %	50 %	0 %	25 %	220905670
535	NC_011884	CTTG	2	8	29599	29606	0 %	50 %	25 %	25 %	220905670
536	NC_011884	GATA	2	8	29626	29633	50 %	25 %	25 %	0 %	220905670
537	NC_011884	CTT	2	6	29638	29643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905670
538	NC_011884	GCA	2	6	29710	29715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905670
539	NC_011884	C	6	6	29717	29722	0 %	0 %	0 %	100 %	220905670
540	NC_011884	GCA	2	6	29808	29813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905670
541	NC_011884	CAGC	2	8	29830	29837	25 %	0 %	25 %	50 %	220905670
542	NC_011884	A	7	7	29887	29893	100 %	0 %	0 %	0 %	220905670
543	NC_011884	TCC	2	6	29898	29903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905670
544	NC_011884	T	6	6	29972	29977	0 %	100 %	0 %	0 %	220905670
545	NC_011884	TCAA	2	8	29985	29992	50 %	25 %	0 %	25 %	220905670
546	NC_011884	CTTCTG	2	12	29995	30006	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	220905670
547	NC_011884	A	7	7	30164	30170	100 %	0 %	0 %	0 %	220905670
548	NC_011884	G	6	6	30250	30255	0 %	0 %	100 %	0 %	220905670
549	NC_011884	AGC	2	6	30351	30356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_011884	AAC	2	6	30539	30544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905671
551	NC_011884	TTTGAT	2	12	30561	30572	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	220905671
552	NC_011884	GGC	2	6	30573	30578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905671
553	NC_011884	CT	3	6	30590	30595	0 %	50 %	0 %	50 %	220905671
554	NC_011884	CGG	2	6	30617	30622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905671
555	NC_011884	GCCT	2	8	30698	30705	0 %	25 %	25 %	50 %	220905671
556	NC_011884	GCA	2	6	30780	30785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905671
557	NC_011884	CCA	3	9	30800	30808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905671
558	NC_011884	TCGG	2	8	30816	30823	0 %	25 %	50 %	25 %	220905671
559	NC_011884	C	7	7	30881	30887	0 %	0 %	0 %	100 %	220905671
560	NC_011884	CTG	2	6	30932	30937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905671
561	NC_011884	CTTC	2	8	30940	30947	0 %	50 %	0 %	50 %	220905671
562	NC_011884	CAG	2	6	31034	31039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_011884	A	6	6	31061	31066	100 %	0 %	0 %	0 %	220905672
564	NC_011884	GCG	2	6	31169	31174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905672
565	NC_011884	CGG	2	6	31180	31185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905672
566	NC_011884	GGA	2	6	31276	31281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905672
567	NC_011884	TGCC	2	8	31289	31296	0 %	25 %	25 %	50 %	220905672
568	NC_011884	TTC	2	6	31307	31312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905672
569	NC_011884	TGC	2	6	31349	31354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905672
570	NC_011884	G	7	7	31400	31406	0 %	0 %	100 %	0 %	220905672
571	NC_011884	T	7	7	31428	31434	0 %	100 %	0 %	0 %	220905672
572	NC_011884	TGA	2	6	31446	31451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905672
573	NC_011884	CTG	2	6	31471	31476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_011884	TA	3	6	31550	31555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011884	CCA	2	6	31621	31626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_011884	CT	4	8	31655	31662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_011884	CTG	2	6	31684	31689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905673
578	NC_011884	GAG	2	6	31832	31837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905673
579	NC_011884	TGC	2	6	31894	31899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905673
580	NC_011884	AGGT	2	8	31914	31921	25 %	25 %	50 %	0 %	220905673
581	NC_011884	CCT	2	6	31985	31990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905673
582	NC_011884	CTG	3	9	32073	32081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905673
583	NC_011884	GTG	2	6	32240	32245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905673
584	NC_011884	GAG	2	6	32250	32255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905673
585	NC_011884	ACT	2	6	32275	32280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905673
586	NC_011884	G	6	6	32358	32363	0 %	0 %	100 %	0 %	220905673
587	NC_011884	A	7	7	32397	32403	100 %	0 %	0 %	0 %	220905673
588	NC_011884	GTA	2	6	32407	32412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905673
589	NC_011884	TCC	2	6	32428	32433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905673
590	NC_011884	GT	4	8	32464	32471	0 %	50 %	50 %	0 %	220905673
591	NC_011884	AGC	2	6	32478	32483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905673
592	NC_011884	GGAG	2	8	32486	32493	25 %	0 %	75 %	0 %	220905673
593	NC_011884	CAG	2	6	32631	32636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905673
594	NC_011884	G	6	6	32680	32685	0 %	0 %	100 %	0 %	220905673
595	NC_011884	GCT	2	6	32703	32708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905673
596	NC_011884	G	6	6	32718	32723	0 %	0 %	100 %	0 %	220905673
597	NC_011884	GCA	2	6	32741	32746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905673
598	NC_011884	GAC	2	6	32813	32818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905673
599	NC_011884	CCATTT	2	12	32852	32863	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	220905673
600	NC_011884	GAG	2	6	32923	32928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905673
601	NC_011884	TGGC	2	8	32966	32973	0 %	25 %	50 %	25 %	220905673
602	NC_011884	TCC	2	6	32982	32987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905673
603	NC_011884	CAG	2	6	33078	33083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905673
604	NC_011884	CAGCAA	2	12	33105	33116	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	220905673
605	NC_011884	AGG	2	6	33122	33127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905673
606	NC_011884	A	6	6	33154	33159	100 %	0 %	0 %	0 %	220905673
607	NC_011884	GAG	2	6	33215	33220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905673
608	NC_011884	GCT	2	6	33226	33231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905673
609	NC_011884	CAC	2	6	33267	33272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905673
610	NC_011884	GCT	2	6	33280	33285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905673
611	NC_011884	CAG	2	6	33320	33325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905673
612	NC_011884	AGACC	2	10	33346	33355	40 %	0 %	20 %	40 %	220905673
613	NC_011884	CAA	2	6	33374	33379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905673
614	NC_011884	ATA	2	6	33562	33567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011884	T	6	6	33597	33602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_011884	TGA	2	6	33634	33639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905674
617	NC_011884	TTAC	2	8	33666	33673	25 %	50 %	0 %	25 %	220905674
618	NC_011884	ATT	2	6	33677	33682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905674
619	NC_011884	CTT	2	6	33683	33688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905674
620	NC_011884	TCTT	2	8	33737	33744	0 %	75 %	0 %	25 %	220905674
621	NC_011884	TGT	2	6	33757	33762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905674
622	NC_011884	CCTG	2	8	33815	33822	0 %	25 %	25 %	50 %	220905674
623	NC_011884	TCC	2	6	33846	33851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905674
624	NC_011884	CGG	2	6	33853	33858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905674
625	NC_011884	AAT	2	6	33905	33910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905674
626	NC_011884	TTCC	2	8	34011	34018	0 %	50 %	0 %	50 %	220905674
627	NC_011884	T	6	6	34109	34114	0 %	100 %	0 %	0 %	220905674
628	NC_011884	CAC	2	6	34117	34122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905674
629	NC_011884	T	6	6	34142	34147	0 %	100 %	0 %	0 %	220905674
630	NC_011884	GCA	2	6	34165	34170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905674
631	NC_011884	CT	3	6	34173	34178	0 %	50 %	0 %	50 %	220905674
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771	NC_011884	TCT	2	6	41739	41744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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