MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 97323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011884	TTGC	2	8	355952	355959	0 %	50 %	25 %	25 %	220905987
6502	NC_011884	GGC	2	6	356009	356014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905987
6503	NC_011884	GCT	2	6	356045	356050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905987
6504	NC_011884	TCA	2	6	356066	356071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905987
6505	NC_011884	CTG	2	6	356092	356097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905987
6506	NC_011884	TGG	2	6	356278	356283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905987
6507	NC_011884	GCA	2	6	356321	356326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905987
6508	NC_011884	TAT	2	6	356345	356350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905987
6509	NC_011884	TCCTG	2	10	356399	356408	0 %	40 %	20 %	40 %	220905987
6510	NC_011884	G	9	9	356426	356434	0 %	0 %	100 %	0 %	220905987
6511	NC_011884	CG	3	6	356453	356458	0 %	0 %	50 %	50 %	220905987
6512	NC_011884	CAA	3	9	356472	356480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905987
6513	NC_011884	CTG	2	6	356481	356486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905987
6514	NC_011884	AACTGC	2	12	356527	356538	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220905987
6515	NC_011884	TTA	2	6	356541	356546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905987
6516	NC_011884	AGC	2	6	356585	356590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905987
6517	NC_011884	TCAC	2	8	356643	356650	25 %	25 %	0 %	50 %	220905987
6518	NC_011884	CAG	2	6	356685	356690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905987
6519	NC_011884	AACA	2	8	356740	356747	75 %	0 %	0 %	25 %	220905987
6520	NC_011884	GAG	2	6	356829	356834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905987
6521	NC_011884	GGC	2	6	356870	356875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905987
6522	NC_011884	CCG	2	6	356989	356994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905987
6523	NC_011884	GTG	2	6	357094	357099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905987
6524	NC_011884	GGT	2	6	357101	357106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905987
6525	NC_011884	C	6	6	357124	357129	0 %	0 %	0 %	100 %	220905987
6526	NC_011884	GGC	2	6	357158	357163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905987
6527	NC_011884	TGG	2	6	357310	357315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905987
6528	NC_011884	GGC	2	6	357335	357340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905987
6529	NC_011884	GCA	2	6	357370	357375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905987
6530	NC_011884	AAG	2	6	357376	357381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905987
6531	NC_011884	ATT	2	6	357402	357407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905987
6532	NC_011884	ACC	2	6	357535	357540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905987
6533	NC_011884	TC	3	6	357720	357725	0 %	50 %	0 %	50 %	220905987
6534	NC_011884	CCG	2	6	357754	357759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905987
6535	NC_011884	GAT	2	6	357777	357782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905987
6536	NC_011884	ATC	2	6	357831	357836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905987
6537	NC_011884	TTG	2	6	357945	357950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905987
6538	NC_011884	TCCG	2	8	357967	357974	0 %	25 %	25 %	50 %	220905987
6539	NC_011884	C	7	7	357999	358005	0 %	0 %	0 %	100 %	220905987
6540	NC_011884	AGGA	2	8	358030	358037	50 %	0 %	50 %	0 %	220905987
6541	NC_011884	ACCC	2	8	358134	358141	25 %	0 %	0 %	75 %	220905988
6542	NC_011884	ATC	2	6	358144	358149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905988
6543	NC_011884	CAG	2	6	358224	358229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905988
6544	NC_011884	GAT	2	6	358233	358238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905988
6545	NC_011884	TCG	2	6	358255	358260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905988
6546	NC_011884	CAGAT	2	10	358363	358372	40 %	20 %	20 %	20 %	220905988
6547	NC_011884	GTG	2	6	358401	358406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905988
6548	NC_011884	ATCGG	2	10	358414	358423	20 %	20 %	40 %	20 %	220905988
6549	NC_011884	GCC	2	6	358491	358496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905988
6550	NC_011884	AGC	2	6	358522	358527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905988
6551	NC_011884	GAA	2	6	358541	358546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905988
6552	NC_011884	TTG	2	6	358583	358588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905988
6553	NC_011884	T	6	6	358630	358635	0 %	100 %	0 %	0 %	220905989
6554	NC_011884	GTT	2	6	358680	358685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905989
6555	NC_011884	GA	3	6	358745	358750	50 %	0 %	50 %	0 %	220905989
6556	NC_011884	C	6	6	358768	358773	0 %	0 %	0 %	100 %	220905989
6557	NC_011884	TCA	2	6	358891	358896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905989
6558	NC_011884	TGGG	2	8	359007	359014	0 %	25 %	75 %	0 %	220905989
6559	NC_011884	CCT	2	6	359044	359049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905989
6560	NC_011884	GCT	2	6	359056	359061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905989
6561	NC_011884	TTC	2	6	359117	359122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905989
6562	NC_011884	CAG	3	9	359156	359164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905989
6563	NC_011884	CAG	2	6	359177	359182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905989
6564	NC_011884	A	6	6	359255	359260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_011884	AGC	2	6	359302	359307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_011884	CGG	2	6	359451	359456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905990
6567	NC_011884	AGC	2	6	359464	359469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905990
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6569	NC_011884	C	6	6	359702	359707	0 %	0 %	0 %	100 %	220905990
6570	NC_011884	TGCC	2	8	359838	359845	0 %	25 %	25 %	50 %	220905990
6571	NC_011884	G	6	6	359865	359870	0 %	0 %	100 %	0 %	220905990
6572	NC_011884	TGGC	2	8	359997	360004	0 %	25 %	50 %	25 %	220905990
6573	NC_011884	TCAA	2	8	360104	360111	50 %	25 %	0 %	25 %	220905990
6574	NC_011884	TGC	2	6	360279	360284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_011884	GAT	2	6	360295	360300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_011884	AAT	2	6	360330	360335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_011884	TCC	2	6	360342	360347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6578	NC_011884	TAT	2	6	360409	360414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_011884	CAGA	2	8	360500	360507	50 %	0 %	25 %	25 %	220905991
6580	NC_011884	AGTTG	2	10	360508	360517	20 %	40 %	40 %	0 %	220905991
6581	NC_011884	ACTT	2	8	360534	360541	25 %	50 %	0 %	25 %	220905991
6582	NC_011884	CAAACC	2	12	360637	360648	50 %	0 %	0 %	50 %	220905991
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6591	NC_011884	TTC	2	6	360948	360953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905992
6592	NC_011884	TGG	2	6	361006	361011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905993
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6597	NC_011884	TGT	2	6	361279	361284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905993
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6604	NC_011884	C	6	6	361587	361592	0 %	0 %	0 %	100 %	220905994
6605	NC_011884	GGCT	2	8	361605	361612	0 %	25 %	50 %	25 %	220905994
6606	NC_011884	GT	3	6	361638	361643	0 %	50 %	50 %	0 %	220905994
6607	NC_011884	TCCAA	2	10	361708	361717	40 %	20 %	0 %	40 %	220905994
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6609	NC_011884	G	6	6	361843	361848	0 %	0 %	100 %	0 %	220905995
6610	NC_011884	CGG	2	6	361883	361888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905995
6611	NC_011884	TGA	2	6	361890	361895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905995
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6618	NC_011884	GCCA	2	8	362300	362307	25 %	0 %	25 %	50 %	220905995
6619	NC_011884	TGG	2	6	362356	362361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905995
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6621	NC_011884	GGC	2	6	362479	362484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905995
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6997	NC_011884	GAA	2	6	383135	383140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220906015
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6999	NC_011884	TGTTTG	2	12	383251	383262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220906016
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