MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 97323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_011884	CTG	2	6	329691	329696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905967
6003	NC_011884	CCG	2	6	329732	329737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905967
6004	NC_011884	GAGTT	2	10	329845	329854	20 %	40 %	40 %	0 %	220905967
6005	NC_011884	TCT	2	6	329881	329886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905967
6006	NC_011884	GTG	2	6	329914	329919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905967
6007	NC_011884	AGG	2	6	330001	330006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905967
6008	NC_011884	GTC	2	6	330039	330044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905967
6009	NC_011884	GGTT	2	8	330057	330064	0 %	50 %	50 %	0 %	220905967
6010	NC_011884	CCT	2	6	330071	330076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905967
6011	NC_011884	TGT	2	6	330133	330138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905967
6012	NC_011884	GGTG	2	8	330147	330154	0 %	25 %	75 %	0 %	220905967
6013	NC_011884	GCA	2	6	330269	330274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905967
6014	NC_011884	ATC	2	6	330301	330306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905967
6015	NC_011884	CAA	2	6	330377	330382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905967
6016	NC_011884	GCGG	2	8	330411	330418	0 %	0 %	75 %	25 %	220905967
6017	NC_011884	CAC	2	6	330450	330455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905967
6018	NC_011884	GTA	2	6	330513	330518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905967
6019	NC_011884	CAA	2	6	330530	330535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905967
6020	NC_011884	ATC	2	6	330589	330594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905967
6021	NC_011884	CAG	2	6	330627	330632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905967
6022	NC_011884	TTC	2	6	330693	330698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905967
6023	NC_011884	GGC	2	6	330732	330737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905967
6024	NC_011884	ATC	2	6	330745	330750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905967
6025	NC_011884	GGT	2	6	330854	330859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905967
6026	NC_011884	CCG	2	6	330920	330925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905967
6027	NC_011884	GGC	2	6	330950	330955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905967
6028	NC_011884	CCAGC	2	10	331164	331173	20 %	0 %	20 %	60 %	220905967
6029	NC_011884	TTC	2	6	331185	331190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905967
6030	NC_011884	CGG	2	6	331241	331246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905967
6031	NC_011884	CAG	2	6	331323	331328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905967
6032	NC_011884	AGCC	2	8	331349	331356	25 %	0 %	25 %	50 %	220905967
6033	NC_011884	C	6	6	331388	331393	0 %	0 %	0 %	100 %	220905967
6034	NC_011884	TGGC	2	8	331441	331448	0 %	25 %	50 %	25 %	220905967
6035	NC_011884	CTG	2	6	331455	331460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905967
6036	NC_011884	TCC	2	6	331495	331500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905967
6037	NC_011884	C	6	6	331636	331641	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6038	NC_011884	A	7	7	331676	331682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_011884	TAA	2	6	331725	331730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_011884	CCT	2	6	331813	331818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6041	NC_011884	GGC	2	6	331847	331852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_011884	AG	3	6	331871	331876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_011884	T	6	6	331897	331902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_011884	CAA	2	6	332033	332038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905968
6045	NC_011884	TGC	3	9	332050	332058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905968
6046	NC_011884	GTGGC	2	10	332086	332095	0 %	20 %	60 %	20 %	220905968
6047	NC_011884	T	6	6	332312	332317	0 %	100 %	0 %	0 %	220905968
6048	NC_011884	AAG	2	6	332323	332328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905968
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6050	NC_011884	CGA	2	6	332377	332382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905968
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6053	NC_011884	CAAG	2	8	332483	332490	50 %	0 %	25 %	25 %	220905968
6054	NC_011884	AG	3	6	332489	332494	50 %	0 %	50 %	0 %	220905968
6055	NC_011884	GTCTG	2	10	332497	332506	0 %	40 %	40 %	20 %	220905968
6056	NC_011884	C	6	6	332515	332520	0 %	0 %	0 %	100 %	220905968
6057	NC_011884	GGC	2	6	332522	332527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905968
6058	NC_011884	TTGA	2	8	332538	332545	25 %	50 %	25 %	0 %	220905968
6059	NC_011884	TGAA	2	8	332581	332588	50 %	25 %	25 %	0 %	220905968
6060	NC_011884	ATT	2	6	332589	332594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905968
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6062	NC_011884	GGGCA	2	10	332638	332647	20 %	0 %	60 %	20 %	220905968
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6102	NC_011884	TAG	2	6	334661	334666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6106	NC_011884	G	7	7	334857	334863	0 %	0 %	100 %	0 %	220905970
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6119	NC_011884	CGAT	2	8	335280	335287	25 %	25 %	25 %	25 %	220905970
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6123	NC_011884	CAC	2	6	335512	335517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905970
6124	NC_011884	CAT	2	6	335522	335527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905970
6125	NC_011884	AG	3	6	335554	335559	50 %	0 %	50 %	0 %	220905970
6126	NC_011884	CGA	2	6	335624	335629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905971
6127	NC_011884	GCT	2	6	335680	335685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905971
6128	NC_011884	GCCC	2	8	335796	335803	0 %	0 %	25 %	75 %	220905971
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6131	NC_011884	GCA	2	6	335990	335995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905971
6132	NC_011884	C	6	6	336013	336018	0 %	0 %	0 %	100 %	220905971
6133	NC_011884	AAT	2	6	336033	336038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905971
6134	NC_011884	CAT	2	6	336054	336059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905971
6135	NC_011884	AGATCG	2	12	336151	336162	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220905971
6136	NC_011884	GCA	2	6	336254	336259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905971
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6138	NC_011884	TGC	2	6	336355	336360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905971
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6147	NC_011884	TCT	2	6	336694	336699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905971
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6149	NC_011884	TGC	3	9	336860	336868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905972
6150	NC_011884	TCG	2	6	336881	336886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905972
6151	NC_011884	CTGG	2	8	336957	336964	0 %	25 %	50 %	25 %	220905972
6152	NC_011884	TCGGCT	2	12	337021	337032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905972
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6156	NC_011884	GCT	2	6	337117	337122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905972
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6167	NC_011884	TTCC	2	8	337786	337793	0 %	50 %	0 %	50 %	220905973
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6171	NC_011884	CATC	2	8	337933	337940	25 %	25 %	0 %	50 %	220905973
6172	NC_011884	GGGAC	2	10	337970	337979	20 %	0 %	60 %	20 %	220905973
6173	NC_011884	CCAG	2	8	338005	338012	25 %	0 %	25 %	50 %	220905973
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6180	NC_011884	AGG	2	6	338389	338394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6182	NC_011884	ACA	2	6	338420	338425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6183	NC_011884	ATCG	2	8	338464	338471	25 %	25 %	25 %	25 %	220905974
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6188	NC_011884	CTG	2	6	338683	338688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905974
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6232	NC_011884	C	6	6	341185	341190	0 %	0 %	0 %	100 %	220905975
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6235	NC_011884	CTA	2	6	341398	341403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905976
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6242	NC_011884	TAAT	2	8	341948	341955	50 %	50 %	0 %	0 %	220905976
6243	NC_011884	TGG	2	6	341961	341966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905976
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6491	NC_011884	TCC	2	6	355387	355392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905986
6492	NC_011884	CTGC	2	8	355432	355439	0 %	25 %	25 %	50 %	220905986
6493	NC_011884	TCC	2	6	355440	355445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905986
6494	NC_011884	TC	4	8	355627	355634	0 %	50 %	0 %	50 %	220905986
6495	NC_011884	CTGA	2	8	355649	355656	25 %	25 %	25 %	25 %	220905986
6496	NC_011884	GAGCA	2	10	355677	355686	40 %	0 %	40 %	20 %	220905986
6497	NC_011884	TCCT	2	8	355817	355824	0 %	50 %	0 %	50 %	220905987
6498	NC_011884	CGG	2	6	355849	355854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905987
6499	NC_011884	GAGGTT	2	12	355875	355886	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	220905987
6500	NC_011884	CCGG	2	8	355900	355907	0 %	0 %	50 %	50 %	220905987

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