MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 97323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
63501	NC_011884	CTT	2	6	3515758	3515763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63502	NC_011884	CTC	2	6	3515918	3515923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63503	NC_011884	CCG	2	6	3515932	3515937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63504	NC_011884	A	6	6	3515939	3515944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63505	NC_011884	TCG	2	6	3515952	3515957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63506	NC_011884	TCC	2	6	3515999	3516004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63507	NC_011884	ACG	2	6	3516039	3516044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63508	NC_011884	A	6	6	3516047	3516052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63509	NC_011884	CT	3	6	3516068	3516073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63510	NC_011884	TC	3	6	3516104	3516109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63511	NC_011884	CTCA	2	8	3516133	3516140	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63512	NC_011884	CT	3	6	3516150	3516155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63513	NC_011884	ATCTT	2	10	3516173	3516182	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63514	NC_011884	GCT	2	6	3516185	3516190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63515	NC_011884	ATA	2	6	3516210	3516215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63516	NC_011884	GCCT	2	8	3516331	3516338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63517	NC_011884	CCT	2	6	3516412	3516417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63518	NC_011884	GA	3	6	3516463	3516468	50 %	0 %	50 %	0 %	220908932
63519	NC_011884	GCA	2	6	3516568	3516573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220908932
63520	NC_011884	ATG	2	6	3516632	3516637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220908932
63521	NC_011884	CAGG	2	8	3516664	3516671	25 %	0 %	50 %	25 %	220908932
63522	NC_011884	ATCG	2	8	3516688	3516695	25 %	25 %	25 %	25 %	220908932
63523	NC_011884	AGT	2	6	3516810	3516815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220908932
63524	NC_011884	TGA	2	6	3516822	3516827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220908932
63525	NC_011884	TCG	2	6	3516840	3516845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220908932
63526	NC_011884	AAG	2	6	3516942	3516947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220908932
63527	NC_011884	GAAA	2	8	3516961	3516968	75 %	0 %	25 %	0 %	220908932
63528	NC_011884	TAC	2	6	3517059	3517064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220908932
63529	NC_011884	TGT	2	6	3517110	3517115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220908932
63530	NC_011884	GCA	2	6	3517143	3517148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220908932
63531	NC_011884	TGC	2	6	3517224	3517229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220908932
63532	NC_011884	AATC	2	8	3517287	3517294	50 %	25 %	0 %	25 %	220908932
63533	NC_011884	CAG	2	6	3517379	3517384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220908932
63534	NC_011884	AGC	2	6	3517521	3517526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220908932
63535	NC_011884	GCA	2	6	3517561	3517566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220908932
63536	NC_011884	ATC	2	6	3517579	3517584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220908932
63537	NC_011884	CAG	2	6	3517686	3517691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220908932
63538	NC_011884	TAT	2	6	3517692	3517697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220908932
63539	NC_011884	ACCC	2	8	3517708	3517715	25 %	0 %	0 %	75 %	220908932
63540	NC_011884	TGA	2	6	3517716	3517721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220908932
63541	NC_011884	TGA	2	6	3517793	3517798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220908932
63542	NC_011884	GGAG	2	8	3517824	3517831	25 %	0 %	75 %	0 %	220908932
63543	NC_011884	AAGTCG	2	12	3517907	3517918	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220908932
63544	NC_011884	GC	3	6	3517936	3517941	0 %	0 %	50 %	50 %	220908932
63545	NC_011884	TGTC	2	8	3517974	3517981	0 %	50 %	25 %	25 %	220908932
63546	NC_011884	CTT	2	6	3518079	3518084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220908932
63547	NC_011884	GTG	2	6	3518138	3518143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220908932
63548	NC_011884	ATG	2	6	3518306	3518311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220908932
63549	NC_011884	ACG	2	6	3518318	3518323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220908932
63550	NC_011884	CTG	2	6	3518492	3518497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220908932
63551	NC_011884	TTG	2	6	3518537	3518542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220908932
63552	NC_011884	TGGG	2	8	3518549	3518556	0 %	25 %	75 %	0 %	220908932
63553	NC_011884	ATT	2	6	3518602	3518607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220908932
63554	NC_011884	TA	3	6	3518671	3518676	50 %	50 %	0 %	0 %	220908932
63555	NC_011884	GTATTG	2	12	3518684	3518695	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	220908932
63556	NC_011884	CGA	2	6	3518703	3518708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220908932
63557	NC_011884	CTA	2	6	3518731	3518736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220908932
63558	NC_011884	ATGC	2	8	3518809	3518816	25 %	25 %	25 %	25 %	220908932
63559	NC_011884	CCG	2	6	3518853	3518858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220908932
63560	NC_011884	TCC	2	6	3518882	3518887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220908932
63561	NC_011884	ACCA	2	8	3518891	3518898	50 %	0 %	0 %	50 %	220908932
63562	NC_011884	TTG	2	6	3518924	3518929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220908932
63563	NC_011884	GAA	2	6	3519004	3519009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220908932
63564	NC_011884	AGCT	2	8	3519062	3519069	25 %	25 %	25 %	25 %	220908932
63565	NC_011884	GCT	2	6	3519079	3519084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220908932
63566	NC_011884	AGTG	2	8	3519105	3519112	25 %	25 %	50 %	0 %	220908932
63567	NC_011884	AGA	2	6	3519153	3519158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220908932
63568	NC_011884	TGCTTA	2	12	3519199	3519210	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	220908932
63569	NC_011884	AAAG	2	8	3519274	3519281	75 %	0 %	25 %	0 %	220908932
63570	NC_011884	ATA	2	6	3519401	3519406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220908932
63571	NC_011884	TTG	2	6	3519419	3519424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220908932
63572	NC_011884	ATCGC	2	10	3519430	3519439	20 %	20 %	20 %	40 %	220908932
63573	NC_011884	CTG	2	6	3519580	3519585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220908932
63574	NC_011884	CAA	2	6	3519622	3519627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63575	NC_011884	ATCA	2	8	3519656	3519663	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63576	NC_011884	TCT	2	6	3519681	3519686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63577	NC_011884	TC	3	6	3519770	3519775	0 %	50 %	0 %	50 %	220908933
63578	NC_011884	CGGG	2	8	3519801	3519808	0 %	0 %	75 %	25 %	220908933
63579	NC_011884	TGT	2	6	3519861	3519866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220908933
63580	NC_011884	TTG	2	6	3519905	3519910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220908933
63581	NC_011884	CTG	2	6	3519967	3519972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220908933
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63584	NC_011884	TGAC	2	8	3520075	3520082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63585	NC_011884	ACC	2	6	3520235	3520240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220908934
63586	NC_011884	CTT	2	6	3520293	3520298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220908934
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63588	NC_011884	TAG	2	6	3520430	3520435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220908934
63589	NC_011884	CATG	2	8	3520485	3520492	25 %	25 %	25 %	25 %	220908934
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63591	NC_011884	GT	3	6	3520535	3520540	0 %	50 %	50 %	0 %	220908934
63592	NC_011884	ATC	2	6	3520558	3520563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220908934
63593	NC_011884	TCAT	2	8	3520625	3520632	25 %	50 %	0 %	25 %	220908934
63594	NC_011884	TGC	2	6	3520652	3520657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220908934
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63598	NC_011884	ATCA	2	8	3520972	3520979	50 %	25 %	0 %	25 %	220908935
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63601	NC_011884	TA	3	6	3521159	3521164	50 %	50 %	0 %	0 %	220908935
63602	NC_011884	ACC	2	6	3521198	3521203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220908935
63603	NC_011884	GCT	2	6	3521250	3521255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220908935
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63605	NC_011884	ATCG	2	8	3521350	3521357	25 %	25 %	25 %	25 %	220908935
63606	NC_011884	ATCGCC	2	12	3521366	3521377	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220908935
63607	NC_011884	TGTT	2	8	3521396	3521403	0 %	75 %	25 %	0 %	220908935
63608	NC_011884	GGT	2	6	3521668	3521673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220908935
63609	NC_011884	T	6	6	3521695	3521700	0 %	100 %	0 %	0 %	220908935
63610	NC_011884	GTT	2	6	3521733	3521738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220908935
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63613	NC_011884	ATTG	2	8	3521842	3521849	25 %	50 %	25 %	0 %	220908935
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63616	NC_011884	G	6	6	3521928	3521933	0 %	0 %	100 %	0 %	220908935
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63618	NC_011884	TGA	2	6	3522030	3522035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220908935
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