MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 97323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011884	TGA	2	6	303612	303617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905943
5502	NC_011884	T	7	7	303736	303742	0 %	100 %	0 %	0 %	220905943
5503	NC_011884	ATT	2	6	303801	303806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905943
5504	NC_011884	GAA	2	6	303915	303920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_011884	ATG	2	6	303927	303932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_011884	TGG	2	6	303963	303968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_011884	AT	3	6	304040	304045	50 %	50 %	0 %	0 %	220905944
5508	NC_011884	A	7	7	304171	304177	100 %	0 %	0 %	0 %	220905944
5509	NC_011884	ATT	2	6	304235	304240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905944
5510	NC_011884	T	6	6	304306	304311	0 %	100 %	0 %	0 %	220905944
5511	NC_011884	AAGC	2	8	304405	304412	50 %	0 %	25 %	25 %	220905944
5512	NC_011884	TGG	2	6	304413	304418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905944
5513	NC_011884	TTCT	2	8	304465	304472	0 %	75 %	0 %	25 %	220905944
5514	NC_011884	GGT	2	6	304534	304539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905944
5515	NC_011884	TA	3	6	304603	304608	50 %	50 %	0 %	0 %	220905944
5516	NC_011884	GAAAAT	2	12	304621	304632	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	220905944
5517	NC_011884	T	6	6	304653	304658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_011884	GGCGGG	2	12	304768	304779	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	220905945
5519	NC_011884	TCT	2	6	305004	305009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905945
5520	NC_011884	CTG	2	6	305033	305038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905945
5521	NC_011884	TTC	2	6	305096	305101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905945
5522	NC_011884	TAACTC	2	12	305144	305155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905945
5523	NC_011884	GGC	2	6	305165	305170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905945
5524	NC_011884	GGT	2	6	305183	305188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905945
5525	NC_011884	GAA	2	6	305206	305211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905945
5526	NC_011884	AGT	2	6	305256	305261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905945
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5529	NC_011884	GTT	2	6	305362	305367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905945
5530	NC_011884	T	6	6	305470	305475	0 %	100 %	0 %	0 %	220905945
5531	NC_011884	CTG	2	6	305476	305481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905945
5532	NC_011884	AGTCC	2	10	305581	305590	20 %	20 %	20 %	40 %	220905945
5533	NC_011884	AG	3	6	305601	305606	50 %	0 %	50 %	0 %	220905945
5534	NC_011884	GCG	2	6	305628	305633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905945
5535	NC_011884	CAG	2	6	305638	305643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905945
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5537	NC_011884	TCGA	2	8	305678	305685	25 %	25 %	25 %	25 %	220905945
5538	NC_011884	TAGATT	2	12	305843	305854	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	220905945
5539	NC_011884	T	7	7	305881	305887	0 %	100 %	0 %	0 %	220905945
5540	NC_011884	CTG	2	6	305893	305898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_011884	TTC	2	6	306014	306019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_011884	CATA	2	8	306071	306078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5543	NC_011884	A	7	7	306089	306095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_011884	TAT	2	6	306128	306133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905946
5545	NC_011884	GTG	2	6	306196	306201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905946
5546	NC_011884	TCGA	2	8	306237	306244	25 %	25 %	25 %	25 %	220905946
5547	NC_011884	TGAT	2	8	306331	306338	25 %	50 %	25 %	0 %	220905946
5548	NC_011884	ACA	2	6	306404	306409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905946
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5550	NC_011884	TGC	2	6	306509	306514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905946
5551	NC_011884	GGCT	2	8	306543	306550	0 %	25 %	50 %	25 %	220905946
5552	NC_011884	TTTCT	2	10	306559	306568	0 %	80 %	0 %	20 %	220905946
5553	NC_011884	TTG	2	6	306589	306594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905946
5554	NC_011884	GCG	2	6	306600	306605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905946
5555	NC_011884	T	6	6	306611	306616	0 %	100 %	0 %	0 %	220905946
5556	NC_011884	TCGA	2	8	306661	306668	25 %	25 %	25 %	25 %	220905946
5557	NC_011884	GTA	2	6	306685	306690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905946
5558	NC_011884	CGG	2	6	306729	306734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905946
5559	NC_011884	T	6	6	306741	306746	0 %	100 %	0 %	0 %	220905946
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5561	NC_011884	A	6	6	306779	306784	100 %	0 %	0 %	0 %	220905946
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5565	NC_011884	CTA	2	6	306861	306866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905946
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5574	NC_011884	GAA	2	6	307085	307090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905946
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5597	NC_011884	A	7	7	308375	308381	100 %	0 %	0 %	0 %	220905947
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5619	NC_011884	T	7	7	309935	309941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5624	NC_011884	CTT	3	9	310147	310155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905948
5625	NC_011884	TCA	2	6	310312	310317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905949
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5645	NC_011884	CTACA	2	10	311173	311182	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5646	NC_011884	ACTT	2	8	311232	311239	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5651	NC_011884	TAC	2	6	311414	311419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905950
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5653	NC_011884	TC	3	6	311531	311536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5654	NC_011884	CAC	2	6	311585	311590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5655	NC_011884	ATCG	2	8	311636	311643	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5656	NC_011884	TC	3	6	311673	311678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5657	NC_011884	CAA	2	6	311680	311685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5658	NC_011884	C	6	6	311696	311701	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5659	NC_011884	TTCC	2	8	311705	311712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5663	NC_011884	TAG	2	6	311910	311915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905951
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5733	NC_011884	CTC	2	6	315172	315177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5735	NC_011884	AGTTC	2	10	315211	315220	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5748	NC_011884	GAA	2	6	315735	315740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905959
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5997	NC_011884	AC	3	6	329463	329468	50 %	0 %	0 %	50 %	220905967
5998	NC_011884	CAGG	2	8	329490	329497	25 %	0 %	50 %	25 %	220905967
5999	NC_011884	TGG	2	6	329503	329508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905967
6000	NC_011884	TGG	2	6	329575	329580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905967

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