MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 97323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011884	CCT	2	6	248142	248147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905888
4502	NC_011884	GAA	2	6	248189	248194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905888
4503	NC_011884	GCA	2	6	248206	248211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905888
4504	NC_011884	GTTGGA	2	12	248259	248270	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_011884	TGG	2	6	248305	248310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905889
4506	NC_011884	ATT	2	6	248502	248507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905889
4507	NC_011884	TGG	2	6	248540	248545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905889
4508	NC_011884	CTT	2	6	248596	248601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905889
4509	NC_011884	TGAT	2	8	248623	248630	25 %	50 %	25 %	0 %	220905889
4510	NC_011884	CAG	2	6	248703	248708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905889
4511	NC_011884	GCT	2	6	248739	248744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905889
4512	NC_011884	CGC	2	6	248757	248762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905889
4513	NC_011884	AGA	2	6	248924	248929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905889
4514	NC_011884	TGG	2	6	249001	249006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905889
4515	NC_011884	GAA	2	6	249129	249134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905889
4516	NC_011884	TGA	2	6	249167	249172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905889
4517	NC_011884	GATG	2	8	249265	249272	25 %	25 %	50 %	0 %	220905890
4518	NC_011884	GGT	2	6	249319	249324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905890
4519	NC_011884	G	6	6	249373	249378	0 %	0 %	100 %	0 %	220905890
4520	NC_011884	CGG	2	6	249399	249404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905890
4521	NC_011884	TGGG	2	8	249441	249448	0 %	25 %	75 %	0 %	220905890
4522	NC_011884	GCT	2	6	249583	249588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905890
4523	NC_011884	CTGGA	2	10	249597	249606	20 %	20 %	40 %	20 %	220905890
4524	NC_011884	CTG	2	6	249617	249622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905890
4525	NC_011884	ACA	2	6	249645	249650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905890
4526	NC_011884	CGT	2	6	249739	249744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905890
4527	NC_011884	T	6	6	249764	249769	0 %	100 %	0 %	0 %	220905890
4528	NC_011884	ATG	2	6	249782	249787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905890
4529	NC_011884	GCTGG	2	10	249800	249809	0 %	20 %	60 %	20 %	220905890
4530	NC_011884	CT	3	6	249883	249888	0 %	50 %	0 %	50 %	220905890
4531	NC_011884	CGTT	2	8	249902	249909	0 %	50 %	25 %	25 %	220905890
4532	NC_011884	AAC	2	6	249998	250003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905890
4533	NC_011884	CTT	2	6	250026	250031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905890
4534	NC_011884	CTT	2	6	250033	250038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905890
4535	NC_011884	ATC	2	6	250193	250198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905890
4536	NC_011884	CCG	2	6	250200	250205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905890
4537	NC_011884	GTT	3	9	250210	250218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905890
4538	NC_011884	CGAT	2	8	250236	250243	25 %	25 %	25 %	25 %	220905890
4539	NC_011884	GCT	2	6	250330	250335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_011884	T	6	6	250337	250342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_011884	CCG	2	6	250376	250381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905891
4542	NC_011884	GCT	2	6	250466	250471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905891
4543	NC_011884	GATA	2	8	250495	250502	50 %	25 %	25 %	0 %	220905891
4544	NC_011884	TAA	2	6	250560	250565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905891
4545	NC_011884	AGT	2	6	250595	250600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905891
4546	NC_011884	GAT	2	6	250642	250647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905891
4547	NC_011884	AGT	2	6	250705	250710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905891
4548	NC_011884	TGT	2	6	250857	250862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905891
4549	NC_011884	AGT	2	6	250947	250952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_011884	CTTC	2	8	250962	250969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4551	NC_011884	GCT	2	6	250997	251002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_011884	AGG	2	6	251029	251034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_011884	A	6	6	251047	251052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_011884	GAT	2	6	251121	251126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_011884	AGC	2	6	251173	251178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_011884	AGT	2	6	251225	251230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_011884	GAA	2	6	251318	251323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_011884	AAG	2	6	251362	251367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_011884	ATTT	2	8	251460	251467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_011884	CAT	2	6	251550	251555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905892
4561	NC_011884	TCG	3	9	251598	251606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905892
4562	NC_011884	GAT	2	6	251625	251630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905892
4563	NC_011884	GTT	2	6	251764	251769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905892
4564	NC_011884	CAA	2	6	251827	251832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905892
4565	NC_011884	AGA	2	6	251838	251843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905892
4566	NC_011884	GCC	2	6	251877	251882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905892
4567	NC_011884	AGA	2	6	251946	251951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905892
4568	NC_011884	TC	3	6	251978	251983	0 %	50 %	0 %	50 %	220905892
4569	NC_011884	GGAT	2	8	251990	251997	25 %	25 %	50 %	0 %	220905892
4570	NC_011884	GAA	2	6	251998	252003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905892
4571	NC_011884	GCC	2	6	252006	252011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905892
4572	NC_011884	TGC	2	6	252069	252074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905892
4573	NC_011884	TTG	2	6	252085	252090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905892
4574	NC_011884	TTG	2	6	252094	252099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905892
4575	NC_011884	TCAA	2	8	252107	252114	50 %	25 %	0 %	25 %	220905892
4576	NC_011884	TATT	2	8	252177	252184	25 %	75 %	0 %	0 %	220905892
4577	NC_011884	ATC	2	6	252303	252308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905892
4578	NC_011884	GTT	2	6	252475	252480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905892
4579	NC_011884	AAC	2	6	252509	252514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905892
4580	NC_011884	AGT	2	6	252616	252621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_011884	TGG	2	6	252624	252629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_011884	GCT	2	6	252682	252687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905893
4583	NC_011884	GTA	2	6	252713	252718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905893
4584	NC_011884	TTG	2	6	252747	252752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905893
4585	NC_011884	TTG	2	6	252834	252839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905893
4586	NC_011884	GCT	2	6	252856	252861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905893
4587	NC_011884	TC	3	6	252874	252879	0 %	50 %	0 %	50 %	220905893
4588	NC_011884	CT	3	6	253077	253082	0 %	50 %	0 %	50 %	220905893
4589	NC_011884	ATT	2	6	253136	253141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905893
4590	NC_011884	CAAG	2	8	253147	253154	50 %	0 %	25 %	25 %	220905893
4591	NC_011884	TCAA	2	8	253158	253165	50 %	25 %	0 %	25 %	220905893
4592	NC_011884	CA	3	6	253225	253230	50 %	0 %	0 %	50 %	220905893
4593	NC_011884	CTT	2	6	253303	253308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905893
4594	NC_011884	TGG	2	6	253321	253326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905893
4595	NC_011884	GGGT	2	8	253348	253355	0 %	25 %	75 %	0 %	220905893
4596	NC_011884	GAA	2	6	253391	253396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905893
4597	NC_011884	TTG	2	6	253407	253412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905893
4598	NC_011884	AGG	2	6	253558	253563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905893
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4600	NC_011884	GCA	2	6	253747	253752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905893
4601	NC_011884	ACA	2	6	253813	253818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905893
4602	NC_011884	GGTGTG	2	12	253950	253961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_011884	GCT	2	6	254030	254035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_011884	A	6	6	254063	254068	100 %	0 %	0 %	0 %	220905894
4605	NC_011884	TTC	2	6	254074	254079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905894
4606	NC_011884	GAT	2	6	254095	254100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905894
4607	NC_011884	TTC	2	6	254117	254122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905894
4608	NC_011884	T	6	6	254183	254188	0 %	100 %	0 %	0 %	220905894
4609	NC_011884	CAG	2	6	254278	254283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_011884	TCGA	2	8	254304	254311	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4611	NC_011884	CCTA	2	8	254344	254351	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4612	NC_011884	CCCT	2	8	254432	254439	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4613	NC_011884	ACC	2	6	254470	254475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4614	NC_011884	GGCA	2	8	254598	254605	25 %	0 %	50 %	25 %	220905895
4615	NC_011884	TCA	2	6	254637	254642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905895
4616	NC_011884	TGG	2	6	254742	254747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905895
4617	NC_011884	TCA	2	6	254765	254770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905895
4618	NC_011884	CTA	2	6	254803	254808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905895
4619	NC_011884	GCG	2	6	254821	254826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905895
4620	NC_011884	TGT	2	6	254883	254888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905895
4621	NC_011884	TGT	2	6	254895	254900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905895
4622	NC_011884	GGAA	2	8	255080	255087	50 %	0 %	50 %	0 %	220905895
4623	NC_011884	GCTT	2	8	255176	255183	0 %	50 %	25 %	25 %	220905895
4624	NC_011884	ACT	2	6	255206	255211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_011884	CAT	2	6	255259	255264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4627	NC_011884	GA	3	6	255281	255286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_011884	TTG	2	6	255291	255296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4743	NC_011884	GCCT	2	8	261220	261227	0 %	25 %	25 %	50 %	220905903
4744	NC_011884	ATTT	2	8	261317	261324	25 %	75 %	0 %	0 %	220905903
4745	NC_011884	TCC	2	6	261494	261499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905903
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4747	NC_011884	C	7	7	261561	261567	0 %	0 %	0 %	100 %	220905903
4748	NC_011884	GCC	2	6	261569	261574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905903
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4750	NC_011884	GCC	2	6	261620	261625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4751	NC_011884	CCTG	2	8	261687	261694	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4752	NC_011884	TCC	2	6	261808	261813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4753	NC_011884	TTC	2	6	261822	261827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4868	NC_011884	CAT	2	6	268279	268284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905911
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4872	NC_011884	A	6	6	268572	268577	100 %	0 %	0 %	0 %	220905911
4873	NC_011884	TTTG	2	8	268583	268590	0 %	75 %	25 %	0 %	220905911
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4877	NC_011884	CGAT	2	8	268718	268725	25 %	25 %	25 %	25 %	220905911
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