MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742501

Total Repeats: 3393

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011880	CAAG	2	8	26653	26660	50 %	0 %	25 %	25 %	219883118
502	NC_011880	TTGC	2	8	26862	26869	0 %	50 %	25 %	25 %	219883119
503	NC_011880	CAG	2	6	26887	26892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883119
504	NC_011880	AAT	2	6	26904	26909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883119
505	NC_011880	TTGG	2	8	26922	26929	0 %	50 %	50 %	0 %	219883119
506	NC_011880	A	6	6	26934	26939	100 %	0 %	0 %	0 %	219883119
507	NC_011880	A	7	7	26967	26973	100 %	0 %	0 %	0 %	219883119
508	NC_011880	ATA	2	6	26992	26997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883119
509	NC_011880	AT	3	6	27058	27063	50 %	50 %	0 %	0 %	219883119
510	NC_011880	CCA	2	6	27072	27077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883119
511	NC_011880	A	7	7	27121	27127	100 %	0 %	0 %	0 %	219883119
512	NC_011880	ATGG	2	8	27196	27203	25 %	25 %	50 %	0 %	219883119
513	NC_011880	TAA	2	6	27209	27214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883119
514	NC_011880	AAT	2	6	27346	27351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011880	GAT	2	6	27438	27443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883120
516	NC_011880	GAG	2	6	27556	27561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883120
517	NC_011880	TGC	2	6	27581	27586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883120
518	NC_011880	AGGAGA	2	12	27671	27682	50 %	0 %	50 %	0 %	219883120
519	NC_011880	AGA	3	9	27680	27688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883120
520	NC_011880	GGAG	2	8	27796	27803	25 %	0 %	75 %	0 %	219883120
521	NC_011880	TCC	2	6	27852	27857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883120
522	NC_011880	AGT	2	6	27858	27863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883120
523	NC_011880	TGT	2	6	27907	27912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883120
524	NC_011880	TCA	3	9	27941	27949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883120
525	NC_011880	GTT	2	6	28047	28052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883120
526	NC_011880	GCA	2	6	28073	28078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883120
527	NC_011880	CAAC	2	8	28080	28087	50 %	0 %	0 %	50 %	219883120
528	NC_011880	GGA	2	6	28125	28130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883120
529	NC_011880	CAC	2	6	28135	28140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883120
530	NC_011880	AGCAAG	2	12	28151	28162	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	219883120
531	NC_011880	CAA	2	6	28194	28199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883120
532	NC_011880	GTTG	2	8	28229	28236	0 %	50 %	50 %	0 %	219883120
533	NC_011880	GT	3	6	28273	28278	0 %	50 %	50 %	0 %	219883120
534	NC_011880	CAG	2	6	28303	28308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883120
535	NC_011880	TTG	2	6	28309	28314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883120
536	NC_011880	GT	3	6	28390	28395	0 %	50 %	50 %	0 %	219883120
537	NC_011880	AAC	2	6	28475	28480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883120
538	NC_011880	TTG	2	6	28663	28668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883120
539	NC_011880	GAC	2	6	28698	28703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883120
540	NC_011880	CAA	2	6	28722	28727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883120
541	NC_011880	GCG	2	6	28729	28734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883120
542	NC_011880	AGGC	2	8	28793	28800	25 %	0 %	50 %	25 %	219883120
543	NC_011880	GTTT	2	8	28802	28809	0 %	75 %	25 %	0 %	219883120
544	NC_011880	TC	3	6	28811	28816	0 %	50 %	0 %	50 %	219883120
545	NC_011880	CAC	2	6	28830	28835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883120
546	NC_011880	CAGG	2	8	28896	28903	25 %	0 %	50 %	25 %	219883120
547	NC_011880	AGT	2	6	29010	29015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883121
548	NC_011880	ATCA	2	8	29044	29051	50 %	25 %	0 %	25 %	219883121
549	NC_011880	CAT	2	6	29088	29093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883121
550	NC_011880	ACAGGG	2	12	29097	29108	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	219883121
551	NC_011880	TGC	2	6	29121	29126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883121
552	NC_011880	CAT	2	6	29304	29309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883121
553	NC_011880	CCCA	2	8	29311	29318	25 %	0 %	0 %	75 %	219883121
554	NC_011880	TGGC	2	8	29333	29340	0 %	25 %	50 %	25 %	219883121
555	NC_011880	CGG	2	6	29343	29348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883121
556	NC_011880	CTG	2	6	29353	29358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883121
557	NC_011880	TGC	2	6	29363	29368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883121
558	NC_011880	TGA	2	6	29448	29453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883121
559	NC_011880	TTG	2	6	29571	29576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883121
560	NC_011880	TTG	2	6	29614	29619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011880	CCAC	2	8	29705	29712	25 %	0 %	0 %	75 %	219883122
562	NC_011880	GCCTGG	2	12	29749	29760	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219883122
563	NC_011880	CTG	2	6	29778	29783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883122
564	NC_011880	TCAGC	2	10	29864	29873	20 %	20 %	20 %	40 %	219883122
565	NC_011880	CAG	2	6	29891	29896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883122
566	NC_011880	TCA	2	6	29945	29950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883122
567	NC_011880	TCC	2	6	29955	29960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_011880	TTG	2	6	29978	29983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_011880	GAC	2	6	30027	30032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_011880	GTT	2	6	30132	30137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011880	A	7	7	30145	30151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_011880	CA	3	6	30168	30173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
573	NC_011880	GACT	2	8	30249	30256	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
574	NC_011880	GCG	2	6	30377	30382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_011880	GCG	2	6	30505	30510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_011880	TGT	2	6	30654	30659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011880	G	7	7	30710	30716	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011880	GCC	2	6	30806	30811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_011880	TAA	2	6	30898	30903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011880	TG	3	6	31181	31186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011880	TGG	2	6	31209	31214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011880	GTC	2	6	31277	31282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_011880	CAT	2	6	31304	31309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_011880	TC	3	6	31461	31466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_011880	GAT	2	6	31469	31474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_011880	GCC	2	6	31508	31513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_011880	GGC	2	6	31528	31533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_011880	ACC	2	6	31682	31687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_011880	C	7	7	31715	31721	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
590	NC_011880	CTG	3	9	31737	31745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_011880	TC	3	6	31757	31762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
592	NC_011880	TGC	2	6	31834	31839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883123
593	NC_011880	CGC	2	6	31863	31868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883123
594	NC_011880	TC	3	6	31892	31897	0 %	50 %	0 %	50 %	219883123
595	NC_011880	CGC	2	6	31913	31918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883123
596	NC_011880	CGAC	2	8	31993	32000	25 %	0 %	25 %	50 %	219883123
597	NC_011880	CTG	2	6	32028	32033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883123
598	NC_011880	GCC	2	6	32064	32069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883123
599	NC_011880	CAG	2	6	32136	32141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883123
600	NC_011880	CTCCAA	2	12	32157	32168	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	219883123
601	NC_011880	GCT	2	6	32177	32182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883123
602	NC_011880	GAA	2	6	32183	32188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883123
603	NC_011880	AAG	2	6	32235	32240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883123
604	NC_011880	CCT	2	6	32300	32305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883123
605	NC_011880	TCAG	2	8	32326	32333	25 %	25 %	25 %	25 %	219883123
606	NC_011880	ATG	2	6	32358	32363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883123
607	NC_011880	CGC	2	6	32369	32374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883123
608	NC_011880	CAT	2	6	32391	32396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883123
609	NC_011880	ATT	2	6	32403	32408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883123
610	NC_011880	GCC	2	6	32439	32444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883123
611	NC_011880	CTG	2	6	32464	32469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883123
612	NC_011880	GTC	2	6	32520	32525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_011880	GTC	2	6	32539	32544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_011880	GTC	2	6	32654	32659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883124
615	NC_011880	TCAT	2	8	32722	32729	25 %	50 %	0 %	25 %	219883124
616	NC_011880	ACC	2	6	32743	32748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883124
617	NC_011880	TCCTGT	2	12	32767	32778	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	219883124
618	NC_011880	CAG	2	6	32915	32920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883124
619	NC_011880	GCA	2	6	33002	33007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883124
620	NC_011880	GGC	2	6	33087	33092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883124
621	NC_011880	TCC	2	6	33180	33185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883124
622	NC_011880	TTCA	2	8	33267	33274	25 %	50 %	0 %	25 %	219883124
623	NC_011880	ATTGC	2	10	33296	33305	20 %	40 %	20 %	20 %	219883124
624	NC_011880	CAT	2	6	33306	33311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883124
625	NC_011880	GAG	2	6	33395	33400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883125
626	NC_011880	TGT	2	6	33403	33408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883125
627	NC_011880	G	6	6	33409	33414	0 %	0 %	100 %	0 %	219883125
628	NC_011880	AGC	2	6	33418	33423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883125
629	NC_011880	CTT	2	6	33462	33467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883125
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631	NC_011880	CTG	2	6	33613	33618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883125
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