MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011831	TTC	2	6	179572	179577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847085
3502	NC_011831	GC	3	6	179619	179624	0 %	0 %	50 %	50 %	219847085
3503	NC_011831	GTC	2	6	179704	179709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847085
3504	NC_011831	GC	3	6	179719	179724	0 %	0 %	50 %	50 %	219847085
3505	NC_011831	ATGCCG	2	12	179840	179851	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219847085
3506	NC_011831	GGT	2	6	179884	179889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847085
3507	NC_011831	TAG	2	6	180035	180040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_011831	TGG	2	6	180054	180059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_011831	CGA	2	6	180118	180123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_011831	TGG	2	6	180135	180140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_011831	GCT	3	9	180153	180161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_011831	GC	3	6	180219	180224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3513	NC_011831	TGA	2	6	180239	180244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_011831	GTG	2	6	180281	180286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_011831	TGG	2	6	180321	180326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_011831	CAA	2	6	180393	180398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_011831	GTA	2	6	180408	180413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_011831	ATC	2	6	180457	180462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_011831	GTG	2	6	180593	180598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_011831	ACT	2	6	180697	180702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_011831	CGG	2	6	180725	180730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_011831	GGT	2	6	180816	180821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_011831	TTG	2	6	180921	180926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847086
3524	NC_011831	TAC	2	6	181091	181096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847086
3525	NC_011831	AGC	2	6	181141	181146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847086
3526	NC_011831	CTT	2	6	181304	181309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847086
3527	NC_011831	ATC	2	6	181318	181323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847086
3528	NC_011831	TGAA	2	8	181353	181360	50 %	25 %	25 %	0 %	219847086
3529	NC_011831	TGA	2	6	181390	181395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847086
3530	NC_011831	CCG	2	6	181398	181403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847086
3531	NC_011831	TCG	2	6	181441	181446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847086
3532	NC_011831	CAC	2	6	181464	181469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847086
3533	NC_011831	GCC	2	6	181472	181477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847086
3534	NC_011831	TGA	2	6	181493	181498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847086
3535	NC_011831	GAT	2	6	181499	181504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847086
3536	NC_011831	CGAGG	2	10	181584	181593	20 %	0 %	60 %	20 %	219847086
3537	NC_011831	CGG	3	9	181700	181708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847086
3538	NC_011831	CAA	2	6	181737	181742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847086
3539	NC_011831	TAC	2	6	181841	181846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847086
3540	NC_011831	GC	3	6	181890	181895	0 %	0 %	50 %	50 %	219847086
3541	NC_011831	TCG	2	6	181909	181914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847086
3542	NC_011831	CGT	2	6	181943	181948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847086
3543	NC_011831	GCG	2	6	182153	182158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847086
3544	NC_011831	TGG	2	6	182164	182169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847086
3545	NC_011831	GTA	2	6	182251	182256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847086
3546	NC_011831	GAA	2	6	182277	182282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847086
3547	NC_011831	TCA	2	6	182284	182289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847086
3548	NC_011831	A	7	7	182354	182360	100 %	0 %	0 %	0 %	219847086
3549	NC_011831	CAA	3	9	182381	182389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847086
3550	NC_011831	GAG	2	6	182451	182456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847086
3551	NC_011831	ACC	2	6	182460	182465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847086
3552	NC_011831	CGT	2	6	182488	182493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847086
3553	NC_011831	CCT	2	6	182506	182511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3554	NC_011831	CTC	2	6	182604	182609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_011831	TC	3	6	182608	182613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3556	NC_011831	TGA	2	6	182617	182622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_011831	GAC	2	6	182677	182682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847087
3558	NC_011831	TGATC	2	10	182796	182805	20 %	40 %	20 %	20 %	219847087
3559	NC_011831	CGGC	2	8	182927	182934	0 %	0 %	50 %	50 %	219847087
3560	NC_011831	TAGGT	2	10	182991	183000	20 %	40 %	40 %	0 %	219847087
3561	NC_011831	CATT	2	8	183011	183018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3562	NC_011831	CAT	2	6	183100	183105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847088
3563	NC_011831	ATTC	2	8	183109	183116	25 %	50 %	0 %	25 %	219847088
3564	NC_011831	AT	3	6	183130	183135	50 %	50 %	0 %	0 %	219847088
3565	NC_011831	CTAT	2	8	183153	183160	25 %	50 %	0 %	25 %	219847088
3566	NC_011831	CCG	2	6	183208	183213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847088
3567	NC_011831	GCG	2	6	183220	183225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847088
3568	NC_011831	TC	3	6	183235	183240	0 %	50 %	0 %	50 %	219847088
3569	NC_011831	AAT	2	6	183242	183247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847088
3570	NC_011831	CCAA	2	8	183248	183255	50 %	0 %	0 %	50 %	219847088
3571	NC_011831	GCG	2	6	183283	183288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847088
3572	NC_011831	CGG	2	6	183330	183335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847088
3573	NC_011831	TGG	2	6	183339	183344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847088
3574	NC_011831	TTGC	2	8	183350	183357	0 %	50 %	25 %	25 %	219847088
3575	NC_011831	GTC	2	6	183383	183388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847088
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3578	NC_011831	TGAG	2	8	183435	183442	25 %	25 %	50 %	0 %	219847088
3579	NC_011831	TGT	2	6	183463	183468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847088
3580	NC_011831	TCG	2	6	183543	183548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847088
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3582	NC_011831	GCA	2	6	183599	183604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847088
3583	NC_011831	TGC	2	6	183613	183618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847088
3584	NC_011831	TCG	2	6	183654	183659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847088
3585	NC_011831	ACC	2	6	183709	183714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847088
3586	NC_011831	TAT	2	6	183724	183729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847088
3587	NC_011831	TGA	2	6	183868	183873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847088
3588	NC_011831	ACTAC	2	10	183913	183922	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3589	NC_011831	TAC	2	6	183926	183931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_011831	AG	3	6	183937	183942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_011831	TGC	4	12	184063	184074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847089
3592	NC_011831	GGCGT	2	10	184077	184086	0 %	20 %	60 %	20 %	219847089
3593	NC_011831	TTGCG	2	10	184132	184141	0 %	40 %	40 %	20 %	219847089
3594	NC_011831	TGC	2	6	184153	184158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847089
3595	NC_011831	TGA	2	6	184163	184168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847089
3596	NC_011831	CAT	2	6	184189	184194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_011831	TATC	2	8	184206	184213	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3598	NC_011831	TGC	2	6	184314	184319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_011831	TGC	2	6	184321	184326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_011831	TGA	2	6	184352	184357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_011831	GGT	2	6	184449	184454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847090
3602	NC_011831	GAC	2	6	184510	184515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847090
3603	NC_011831	TAC	2	6	184529	184534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847090
3604	NC_011831	GC	3	6	184544	184549	0 %	0 %	50 %	50 %	219847090
3605	NC_011831	CAC	2	6	184569	184574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847090
3606	NC_011831	AGT	2	6	184586	184591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847090
3607	NC_011831	CCG	2	6	184599	184604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847090
3608	NC_011831	TTA	2	6	184622	184627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847090
3609	NC_011831	CCT	2	6	184644	184649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847090
3610	NC_011831	TACC	2	8	184707	184714	25 %	25 %	0 %	50 %	219847090
3611	NC_011831	AGC	2	6	184721	184726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847090
3612	NC_011831	TGA	2	6	185032	185037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847090
3613	NC_011831	AGCG	2	8	185081	185088	25 %	0 %	50 %	25 %	219847090
3614	NC_011831	TGA	2	6	185098	185103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847090
3615	NC_011831	GC	3	6	185109	185114	0 %	0 %	50 %	50 %	219847090
3616	NC_011831	AGC	2	6	185121	185126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847090
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3619	NC_011831	AGC	2	6	185217	185222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847090
3620	NC_011831	CGA	2	6	185253	185258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847090
3621	NC_011831	CTC	2	6	185355	185360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847091
3622	NC_011831	GCT	2	6	185452	185457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847091
3623	NC_011831	GCT	2	6	185466	185471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847091
3624	NC_011831	GC	3	6	185562	185567	0 %	0 %	50 %	50 %	219847091
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