MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011831	GCT	2	6	329695	329700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_011831	AAC	2	6	329741	329746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847210
6503	NC_011831	ATG	2	6	329794	329799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847210
6504	NC_011831	CGG	2	6	329852	329857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847210
6505	NC_011831	AGG	2	6	329903	329908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847210
6506	NC_011831	TCG	2	6	329936	329941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847210
6507	NC_011831	GTGC	2	8	329946	329953	0 %	25 %	50 %	25 %	219847210
6508	NC_011831	AGA	2	6	329955	329960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847210
6509	NC_011831	CA	3	6	330221	330226	50 %	0 %	0 %	50 %	219847210
6510	NC_011831	CAA	2	6	330369	330374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847210
6511	NC_011831	CGA	2	6	330398	330403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847210
6512	NC_011831	CG	3	6	330411	330416	0 %	0 %	50 %	50 %	219847210
6513	NC_011831	CCA	2	6	330517	330522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847210
6514	NC_011831	CAC	2	6	330555	330560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847210
6515	NC_011831	CCA	2	6	330571	330576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847210
6516	NC_011831	CAG	2	6	330699	330704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847210
6517	NC_011831	TCG	2	6	330713	330718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847210
6518	NC_011831	TGC	2	6	330857	330862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847210
6519	NC_011831	TGT	2	6	330889	330894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847210
6520	NC_011831	GC	3	6	330904	330909	0 %	0 %	50 %	50 %	219847210
6521	NC_011831	GCG	2	6	330921	330926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847210
6522	NC_011831	GCA	2	6	330929	330934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847210
6523	NC_011831	GTC	2	6	330939	330944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847210
6524	NC_011831	AGC	2	6	330947	330952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847210
6525	NC_011831	GCC	2	6	330971	330976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847210
6526	NC_011831	GAC	2	6	330994	330999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847210
6527	NC_011831	AGCGT	2	10	331027	331036	20 %	20 %	40 %	20 %	219847210
6528	NC_011831	CGGTGG	2	12	331054	331065	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	219847210
6529	NC_011831	CAT	2	6	331131	331136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847210
6530	NC_011831	CAA	2	6	331147	331152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847210
6531	NC_011831	CAT	2	6	331203	331208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847210
6532	NC_011831	GGACC	2	10	331352	331361	20 %	0 %	40 %	40 %	219847210
6533	NC_011831	CGGT	2	8	331451	331458	0 %	25 %	50 %	25 %	219847210
6534	NC_011831	CA	3	6	331527	331532	50 %	0 %	0 %	50 %	219847210
6535	NC_011831	CTA	2	6	331571	331576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847210
6536	NC_011831	TCC	2	6	331591	331596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847210
6537	NC_011831	ATCT	2	8	331621	331628	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6538	NC_011831	CGG	2	6	331643	331648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_011831	CAC	2	6	331763	331768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847211
6540	NC_011831	CGG	2	6	331773	331778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847211
6541	NC_011831	ACCA	2	8	331824	331831	50 %	0 %	0 %	50 %	219847211
6542	NC_011831	CG	3	6	331860	331865	0 %	0 %	50 %	50 %	219847211
6543	NC_011831	CGG	2	6	331928	331933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847211
6544	NC_011831	CTG	2	6	331979	331984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847211
6545	NC_011831	GCA	2	6	332137	332142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847211
6546	NC_011831	TGGT	2	8	332145	332152	0 %	50 %	50 %	0 %	219847211
6547	NC_011831	TACCG	2	10	332177	332186	20 %	20 %	20 %	40 %	219847211
6548	NC_011831	GCG	2	6	332308	332313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847211
6549	NC_011831	GTG	2	6	332375	332380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847211
6550	NC_011831	TCA	2	6	332405	332410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847211
6551	NC_011831	GCC	2	6	332412	332417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847211
6552	NC_011831	ACGC	2	8	332600	332607	25 %	0 %	25 %	50 %	219847211
6553	NC_011831	GGC	2	6	332697	332702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847211
6554	NC_011831	GGT	2	6	332707	332712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847211
6555	NC_011831	GTT	2	6	332744	332749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847211
6556	NC_011831	GAC	2	6	332757	332762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847211
6557	NC_011831	CGAGCA	2	12	332825	332836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847211
6558	NC_011831	AGC	2	6	332847	332852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847211
6559	NC_011831	TG	3	6	332874	332879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_011831	TCT	2	6	332908	332913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_011831	GAG	2	6	332935	332940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_011831	GGC	2	6	332997	333002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847212
6563	NC_011831	TCC	2	6	333008	333013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847212
6564	NC_011831	CGA	2	6	333060	333065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847212
6565	NC_011831	GCC	2	6	333073	333078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847212
6566	NC_011831	GGC	2	6	333111	333116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847212
6567	NC_011831	TTTG	2	8	333171	333178	0 %	75 %	25 %	0 %	219847212
6568	NC_011831	TGA	2	6	333218	333223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847212
6569	NC_011831	TGC	2	6	333264	333269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847212
6570	NC_011831	GGC	2	6	333316	333321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847212
6571	NC_011831	CCG	2	6	333368	333373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847212
6572	NC_011831	TGG	2	6	333432	333437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847212
6573	NC_011831	GTTT	2	8	333513	333520	0 %	75 %	25 %	0 %	219847212
6574	NC_011831	GCTG	2	8	333681	333688	0 %	25 %	50 %	25 %	219847212
6575	NC_011831	CCG	2	6	333689	333694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847212
6576	NC_011831	CGGT	2	8	333698	333705	0 %	25 %	50 %	25 %	219847212
6577	NC_011831	CACC	2	8	333832	333839	25 %	0 %	0 %	75 %	219847212
6578	NC_011831	GCA	2	6	333970	333975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847213
6579	NC_011831	GGC	2	6	334017	334022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847213
6580	NC_011831	CGA	2	6	334046	334051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847213
6581	NC_011831	CGC	2	6	334053	334058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847213
6582	NC_011831	CGA	2	6	334072	334077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847213
6583	NC_011831	AGC	2	6	334152	334157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847213
6584	NC_011831	GTC	2	6	334250	334255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_011831	TAC	2	6	334270	334275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_011831	ATC	2	6	334391	334396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847214
6587	NC_011831	AG	3	6	334527	334532	50 %	0 %	50 %	0 %	219847214
6588	NC_011831	ACG	2	6	334605	334610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847214
6589	NC_011831	GCAGC	2	10	334659	334668	20 %	0 %	40 %	40 %	219847214
6590	NC_011831	GCA	2	6	334746	334751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847214
6591	NC_011831	GCA	2	6	334763	334768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847214
6592	NC_011831	TAA	2	6	334769	334774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847214
6593	NC_011831	GGT	2	6	334871	334876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847214
6594	NC_011831	CTA	2	6	334904	334909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_011831	ACGA	2	8	334926	334933	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6596	NC_011831	CCG	2	6	335006	335011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847215
6597	NC_011831	AC	3	6	335058	335063	50 %	0 %	0 %	50 %	219847215
6598	NC_011831	GC	4	8	335136	335143	0 %	0 %	50 %	50 %	219847215
6599	NC_011831	CAT	2	6	335232	335237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847215
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6601	NC_011831	TCT	2	6	335469	335474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847215
6602	NC_011831	TCAC	2	8	335627	335634	25 %	25 %	0 %	50 %	219847215
6603	NC_011831	GCC	2	6	335651	335656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847215
6604	NC_011831	TCA	2	6	335660	335665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847215
6605	NC_011831	GTCG	2	8	335931	335938	0 %	25 %	50 %	25 %	219847215
6606	NC_011831	GC	3	6	335944	335949	0 %	0 %	50 %	50 %	219847215
6607	NC_011831	TCG	2	6	336049	336054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847215
6608	NC_011831	CCG	2	6	336060	336065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847215
6609	NC_011831	TCA	2	6	336077	336082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847215
6610	NC_011831	GGCA	2	8	336088	336095	25 %	0 %	50 %	25 %	219847215
6611	NC_011831	GCA	2	6	336149	336154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847215
6612	NC_011831	GC	3	6	336189	336194	0 %	0 %	50 %	50 %	219847215
6613	NC_011831	TGC	2	6	336207	336212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847215
6614	NC_011831	CCG	2	6	336235	336240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847215
6615	NC_011831	GGAA	2	8	336249	336256	50 %	0 %	50 %	0 %	219847215
6616	NC_011831	TCC	2	6	336301	336306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847215
6617	NC_011831	CTC	2	6	336333	336338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6618	NC_011831	TTG	2	6	336355	336360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_011831	TCG	2	6	336463	336468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_011831	ATG	2	6	336487	336492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6622	NC_011831	GCA	2	6	336654	336659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6991	NC_011831	CAC	2	6	355718	355723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847236
6992	NC_011831	CTA	2	6	355767	355772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847236
6993	NC_011831	AC	3	6	355793	355798	50 %	0 %	0 %	50 %	219847236
6994	NC_011831	CGA	2	6	355844	355849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847236
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