MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011831	GAG	2	6	304349	304354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_011831	TG	3	6	304399	304404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_011831	GA	3	6	304414	304419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_011831	ACT	2	6	304430	304435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847193
6005	NC_011831	TGCG	2	8	304538	304545	0 %	25 %	50 %	25 %	219847193
6006	NC_011831	TGA	2	6	304584	304589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847193
6007	NC_011831	GTTGG	2	10	304600	304609	0 %	40 %	60 %	0 %	219847193
6008	NC_011831	TGGTTG	2	12	304661	304672	0 %	50 %	50 %	0 %	219847193
6009	NC_011831	TGT	2	6	304674	304679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847193
6010	NC_011831	CGC	2	6	304713	304718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847193
6011	NC_011831	T	6	6	304734	304739	0 %	100 %	0 %	0 %	219847193
6012	NC_011831	AGT	2	6	304776	304781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847193
6013	NC_011831	GTT	2	6	304809	304814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847193
6014	NC_011831	TCG	2	6	304945	304950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_011831	CTT	2	6	304951	304956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_011831	TGC	2	6	305079	305084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_011831	AGC	2	6	305091	305096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847194
6018	NC_011831	TGG	2	6	305105	305110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847194
6019	NC_011831	TGA	3	9	305112	305120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847194
6020	NC_011831	AGT	2	6	305143	305148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847194
6021	NC_011831	TGC	2	6	305252	305257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847194
6022	NC_011831	GAT	2	6	305377	305382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847194
6023	NC_011831	CG	3	6	305405	305410	0 %	0 %	50 %	50 %	219847194
6024	NC_011831	TGG	2	6	305414	305419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847194
6025	NC_011831	TCA	2	6	305472	305477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847194
6026	NC_011831	CTG	2	6	305503	305508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847194
6027	NC_011831	CCGGG	2	10	305602	305611	0 %	0 %	60 %	40 %	219847194
6028	NC_011831	TGC	2	6	305630	305635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847194
6029	NC_011831	TGA	3	9	305712	305720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847194
6030	NC_011831	CGC	2	6	305732	305737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847194
6031	NC_011831	GCG	2	6	305753	305758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847194
6032	NC_011831	CGG	2	6	305775	305780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847194
6033	NC_011831	TTA	2	6	305836	305841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847195
6034	NC_011831	GCT	2	6	305931	305936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847195
6035	NC_011831	CAG	2	6	306015	306020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847195
6036	NC_011831	GCC	2	6	306042	306047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847195
6037	NC_011831	TGC	3	9	306050	306058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847195
6038	NC_011831	CGG	2	6	306084	306089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847195
6039	NC_011831	CGAA	2	8	306152	306159	50 %	0 %	25 %	25 %	219847195
6040	NC_011831	ATC	2	6	306162	306167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847195
6041	NC_011831	GAT	2	6	306174	306179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847195
6042	NC_011831	CGG	2	6	306302	306307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847195
6043	NC_011831	GTTG	2	8	306320	306327	0 %	50 %	50 %	0 %	219847195
6044	NC_011831	GC	4	8	306453	306460	0 %	0 %	50 %	50 %	219847195
6045	NC_011831	GAG	2	6	306483	306488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847195
6046	NC_011831	GTT	2	6	306509	306514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847195
6047	NC_011831	AGT	2	6	306516	306521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847195
6048	NC_011831	CCGATC	2	12	306574	306585	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219847195
6049	NC_011831	GGT	2	6	306642	306647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847195
6050	NC_011831	GTG	2	6	306787	306792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847195
6051	NC_011831	TTAT	2	8	306826	306833	25 %	75 %	0 %	0 %	219847195
6052	NC_011831	GTG	2	6	306841	306846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847195
6053	NC_011831	GC	3	6	306882	306887	0 %	0 %	50 %	50 %	219847195
6054	NC_011831	CGC	2	6	306910	306915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847195
6055	NC_011831	TGG	2	6	307002	307007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847196
6056	NC_011831	TGG	2	6	307009	307014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847196
6057	NC_011831	TAT	2	6	307036	307041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847196
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6059	NC_011831	ACG	2	6	307124	307129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847196
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6061	NC_011831	CCA	2	6	307136	307141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847196
6062	NC_011831	CCA	2	6	307163	307168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847196
6063	NC_011831	CTC	2	6	307214	307219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847196
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6065	NC_011831	GGC	2	6	307258	307263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847196
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6075	NC_011831	TTCG	2	8	307593	307600	0 %	50 %	25 %	25 %	219847196
6076	NC_011831	TGC	2	6	307690	307695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847196
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6087	NC_011831	ATGGTG	2	12	308532	308543	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	219847196
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6091	NC_011831	TGG	2	6	308847	308852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847196
6092	NC_011831	TCT	2	6	308907	308912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847196
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6094	NC_011831	T	6	6	308959	308964	0 %	100 %	0 %	0 %	219847196
6095	NC_011831	CGG	2	6	308970	308975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847196
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6098	NC_011831	CG	3	6	309119	309124	0 %	0 %	50 %	50 %	219847196
6099	NC_011831	AGCG	2	8	309154	309161	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6100	NC_011831	TTGC	2	8	309175	309182	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6101	NC_011831	GAA	2	6	309214	309219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_011831	ATG	2	6	309244	309249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847197
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6105	NC_011831	ATC	2	6	309362	309367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847197
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6118	NC_011831	TCAGC	2	10	310392	310401	20 %	20 %	20 %	40 %	219847197
6119	NC_011831	ATCG	2	8	310410	310417	25 %	25 %	25 %	25 %	219847197
6120	NC_011831	TCGTA	2	10	310490	310499	20 %	40 %	20 %	20 %	219847197
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6122	NC_011831	CGG	2	6	310533	310538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847197
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6240	NC_011831	AAGTT	2	10	316488	316497	40 %	40 %	20 %	0 %	219847201
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6243	NC_011831	GTC	2	6	316636	316641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847201
6244	NC_011831	GGT	2	6	316643	316648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847201
6245	NC_011831	GCT	2	6	316687	316692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847201
6246	NC_011831	CGTC	2	8	316693	316700	0 %	25 %	25 %	50 %	219847201
6247	NC_011831	CCG	2	6	316717	316722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847201
6248	NC_011831	GGT	2	6	316727	316732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847201
6249	NC_011831	TTC	3	9	316898	316906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847201
6250	NC_011831	TGA	2	6	316915	316920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847201
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6252	NC_011831	CGG	2	6	316964	316969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847201
6253	NC_011831	CGGC	2	8	317092	317099	0 %	0 %	50 %	50 %	219847201
6254	NC_011831	CAA	2	6	317135	317140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847201
6255	NC_011831	TAG	2	6	317342	317347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847202
6256	NC_011831	GAT	2	6	317396	317401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847202
6257	NC_011831	CGCAG	2	10	317412	317421	20 %	0 %	40 %	40 %	219847202
6258	NC_011831	GC	3	6	317519	317524	0 %	0 %	50 %	50 %	219847202
6259	NC_011831	CCG	2	6	317599	317604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847202
6260	NC_011831	TGG	2	6	317644	317649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847202
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6262	NC_011831	GCC	2	6	317795	317800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847202
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6265	NC_011831	ACCG	2	8	317962	317969	25 %	0 %	25 %	50 %	219847202
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6271	NC_011831	CAC	2	6	318334	318339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847202
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6273	NC_011831	GCTC	2	8	318430	318437	0 %	25 %	25 %	50 %	219847202
6274	NC_011831	GGT	2	6	318480	318485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847202
6275	NC_011831	GCG	2	6	318493	318498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847202
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6279	NC_011831	CT	3	6	318766	318771	0 %	50 %	0 %	50 %	219847203
6280	NC_011831	CAC	2	6	318797	318802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847203
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6282	NC_011831	TACA	2	8	318897	318904	50 %	25 %	0 %	25 %	219847203
6283	NC_011831	TGC	2	6	318922	318927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847203
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6286	NC_011831	GGGT	2	8	319177	319184	0 %	25 %	75 %	0 %	219847204
6287	NC_011831	GGC	2	6	319288	319293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847204
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6289	NC_011831	TCGTC	2	10	319396	319405	0 %	40 %	20 %	40 %	219847204
6290	NC_011831	GCGA	2	8	319577	319584	25 %	0 %	50 %	25 %	219847204
6291	NC_011831	GTC	2	6	319608	319613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847204
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6294	NC_011831	GGT	2	6	319757	319762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847204
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6330	NC_011831	CG	3	6	321007	321012	0 %	0 %	50 %	50 %	219847205
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6335	NC_011831	GCTGCC	2	12	321165	321176	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219847205
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6338	NC_011831	TACT	2	8	321309	321316	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6339	NC_011831	TCCGG	2	10	321409	321418	0 %	20 %	40 %	40 %	219847206
6340	NC_011831	GACCG	2	10	321449	321458	20 %	0 %	40 %	40 %	219847206
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6345	NC_011831	CGA	2	6	321740	321745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847206
6346	NC_011831	CGC	2	6	321921	321926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847206
6347	NC_011831	ACGAG	2	10	321958	321967	40 %	0 %	40 %	20 %	219847206
6348	NC_011831	GGTAC	2	10	322113	322122	20 %	20 %	40 %	20 %	219847206
6349	NC_011831	GGTAC	2	10	322160	322169	20 %	20 %	40 %	20 %	219847206
6350	NC_011831	TCT	3	9	322210	322218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847206
6351	NC_011831	CATC	2	8	322241	322248	25 %	25 %	0 %	50 %	219847206
6352	NC_011831	CAGC	2	8	322301	322308	25 %	0 %	25 %	50 %	219847206
6353	NC_011831	CGG	2	6	322316	322321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847206
6354	NC_011831	GATG	2	8	322331	322338	25 %	25 %	50 %	0 %	219847206
6355	NC_011831	GAT	2	6	322373	322378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847206
6356	NC_011831	AGC	2	6	322384	322389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847206
6357	NC_011831	GC	3	6	322399	322404	0 %	0 %	50 %	50 %	219847206
6358	NC_011831	AGC	2	6	322416	322421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847206
6359	NC_011831	GGA	2	6	322424	322429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847206
6360	NC_011831	CAG	2	6	322490	322495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847206
6361	NC_011831	TCG	2	6	322598	322603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847206
6362	NC_011831	ATT	2	6	322629	322634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847206
6363	NC_011831	TCA	2	6	322720	322725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847206
6364	NC_011831	CCA	2	6	322794	322799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847206
6365	NC_011831	CG	3	6	323008	323013	0 %	0 %	50 %	50 %	219847206
6366	NC_011831	ACC	2	6	323064	323069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847206
6367	NC_011831	ATC	2	6	323119	323124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847206
6368	NC_011831	TCG	2	6	323146	323151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847206
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6384	NC_011831	ATC	2	6	324135	324140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847207
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6395	NC_011831	CGG	2	6	324604	324609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6396	NC_011831	CG	3	6	324640	324645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6397	NC_011831	TAT	2	6	324650	324655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6399	NC_011831	TA	3	6	324808	324813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6477	NC_011831	CGG	2	6	328536	328541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847209
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6485	NC_011831	TCGTAG	2	12	328678	328689	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219847209
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6500	NC_011831	ACA	2	6	329584	329589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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