MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011831	TG	3	6	227744	227749	0 %	50 %	50 %	0 %	219847131
4502	NC_011831	CAC	3	9	227761	227769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847131
4503	NC_011831	CTT	2	6	227899	227904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847131
4504	NC_011831	GCG	2	6	227951	227956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847131
4505	NC_011831	CAC	2	6	227986	227991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847131
4506	NC_011831	ATC	2	6	227997	228002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847131
4507	NC_011831	CCGT	2	8	228049	228056	0 %	25 %	25 %	50 %	219847131
4508	NC_011831	CG	3	6	228152	228157	0 %	0 %	50 %	50 %	219847131
4509	NC_011831	CGC	2	6	228278	228283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847131
4510	NC_011831	CGT	2	6	228288	228293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847131
4511	NC_011831	CCG	2	6	228297	228302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847131
4512	NC_011831	CTC	2	6	228404	228409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847131
4513	NC_011831	CCGG	2	8	228417	228424	0 %	0 %	50 %	50 %	219847131
4514	NC_011831	AAC	2	6	228483	228488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_011831	TTG	2	6	228602	228607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_011831	TCC	2	6	228619	228624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4517	NC_011831	ATCT	2	8	228632	228639	25 %	50 %	0 %	25 %	219847132
4518	NC_011831	GCT	2	6	228691	228696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847132
4519	NC_011831	GC	3	6	228715	228720	0 %	0 %	50 %	50 %	219847132
4520	NC_011831	GCT	2	6	228747	228752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847132
4521	NC_011831	AGC	2	6	228828	228833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847132
4522	NC_011831	AAC	2	6	228880	228885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847132
4523	NC_011831	GTG	2	6	229058	229063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847132
4524	NC_011831	TGC	2	6	229077	229082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847132
4525	NC_011831	GCG	2	6	229090	229095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847132
4526	NC_011831	CTC	2	6	229195	229200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847132
4527	NC_011831	AAC	2	6	229217	229222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847132
4528	NC_011831	CGG	2	6	229304	229309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847132
4529	NC_011831	TCA	2	6	229319	229324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847132
4530	NC_011831	GGC	2	6	229348	229353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847132
4531	NC_011831	TCGT	2	8	229390	229397	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4532	NC_011831	GTA	2	6	229426	229431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_011831	TCT	2	6	229458	229463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847133
4534	NC_011831	TGC	2	6	229630	229635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847133
4535	NC_011831	TTG	2	6	229690	229695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847133
4536	NC_011831	GTT	2	6	229970	229975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847133
4537	NC_011831	CCG	2	6	230074	230079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847133
4538	NC_011831	CGAG	2	8	230084	230091	25 %	0 %	50 %	25 %	219847133
4539	NC_011831	CT	3	6	230136	230141	0 %	50 %	0 %	50 %	219847133
4540	NC_011831	AGT	2	6	230199	230204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847133
4541	NC_011831	TGG	2	6	230224	230229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847133
4542	NC_011831	ATGC	2	8	230292	230299	25 %	25 %	25 %	25 %	219847133
4543	NC_011831	TTG	2	6	230335	230340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847133
4544	NC_011831	GGT	2	6	230355	230360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847133
4545	NC_011831	TGG	2	6	230410	230415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847133
4546	NC_011831	CGT	2	6	230505	230510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847133
4547	NC_011831	CTG	2	6	230588	230593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_011831	ACGA	2	8	230610	230617	50 %	0 %	25 %	25 %	219847134
4549	NC_011831	GCCA	2	8	230642	230649	25 %	0 %	25 %	50 %	219847134
4550	NC_011831	GAT	2	6	230719	230724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847134
4551	NC_011831	CCT	2	6	230803	230808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4552	NC_011831	GTAT	2	8	230809	230816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_011831	CATG	2	8	230883	230890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4554	NC_011831	GCT	2	6	230949	230954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_011831	TTGT	2	8	231018	231025	0 %	75 %	25 %	0 %	219847135
4556	NC_011831	TGG	2	6	231061	231066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847135
4557	NC_011831	AACCCC	2	12	231134	231145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847135
4558	NC_011831	ACCCCG	2	12	231153	231164	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	219847135
4559	NC_011831	CGG	2	6	231181	231186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847135
4560	NC_011831	CGG	2	6	231193	231198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847135
4561	NC_011831	GTG	2	6	231433	231438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847135
4562	NC_011831	GC	3	6	231472	231477	0 %	0 %	50 %	50 %	219847135
4563	NC_011831	CGA	2	6	231479	231484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847135
4564	NC_011831	TG	3	6	231485	231490	0 %	50 %	50 %	0 %	219847135
4565	NC_011831	CCG	2	6	231502	231507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847135
4566	NC_011831	CAC	2	6	231526	231531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847135
4567	NC_011831	CGACA	2	10	231542	231551	40 %	0 %	20 %	40 %	219847135
4568	NC_011831	GAC	2	6	231797	231802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847135
4569	NC_011831	TGAG	2	8	231856	231863	25 %	25 %	50 %	0 %	219847135
4570	NC_011831	ATTACG	2	12	231876	231887	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	219847135
4571	NC_011831	TAC	2	6	231926	231931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847135
4572	NC_011831	CGT	2	6	231962	231967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_011831	TA	3	6	231987	231992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_011831	TGGT	2	8	232064	232071	0 %	50 %	50 %	0 %	219847136
4575	NC_011831	CGAC	2	8	232136	232143	25 %	0 %	25 %	50 %	219847136
4576	NC_011831	GGC	2	6	232163	232168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847136
4577	NC_011831	TGC	2	6	232180	232185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4578	NC_011831	CGT	2	6	232211	232216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4579	NC_011831	TGA	2	6	232352	232357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847136
4580	NC_011831	ACC	2	6	232408	232413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847136
4581	NC_011831	GCC	2	6	232428	232433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847136
4582	NC_011831	CCG	2	6	232494	232499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847136
4583	NC_011831	GGT	2	6	232506	232511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847136
4584	NC_011831	ATC	2	6	232521	232526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847136
4585	NC_011831	GTC	2	6	232542	232547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4586	NC_011831	CTGCGG	2	12	232573	232584	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219847136
4587	NC_011831	GCT	2	6	232629	232634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4588	NC_011831	AGC	2	6	232636	232641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4589	NC_011831	TGA	2	6	232820	232825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847136
4590	NC_011831	CGT	2	6	232858	232863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4591	NC_011831	GCC	2	6	232866	232871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847136
4592	NC_011831	CGG	2	6	232879	232884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847136
4593	NC_011831	CGT	2	6	232919	232924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4594	NC_011831	AACG	2	8	232926	232933	50 %	0 %	25 %	25 %	219847136
4595	NC_011831	AAC	2	6	232948	232953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847136
4596	NC_011831	AGG	2	6	232990	232995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847136
4597	NC_011831	A	7	7	233009	233015	100 %	0 %	0 %	0 %	219847136
4598	NC_011831	GCT	2	6	233118	233123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4599	NC_011831	TGC	2	6	233144	233149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4600	NC_011831	GCG	2	6	233166	233171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847136
4601	NC_011831	GCA	2	6	233298	233303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4602	NC_011831	GCA	2	6	233367	233372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4603	NC_011831	CGA	2	6	233374	233379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4604	NC_011831	TCAT	2	8	233380	233387	25 %	50 %	0 %	25 %	219847136
4605	NC_011831	CG	4	8	233409	233416	0 %	0 %	50 %	50 %	219847136
4606	NC_011831	AAG	2	6	233419	233424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847136
4607	NC_011831	TCG	2	6	233536	233541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4608	NC_011831	GAAGCC	2	12	233589	233600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4609	NC_011831	AGCA	2	8	233629	233636	50 %	0 %	25 %	25 %	219847136
4610	NC_011831	GGC	2	6	233639	233644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847136
4611	NC_011831	TGC	2	6	233693	233698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4612	NC_011831	ACCG	2	8	233742	233749	25 %	0 %	25 %	50 %	219847136
4613	NC_011831	TGCG	2	8	233752	233759	0 %	25 %	50 %	25 %	219847136
4614	NC_011831	GCT	3	9	233889	233897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4615	NC_011831	TGA	2	6	234011	234016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847136
4616	NC_011831	GCA	2	6	234050	234055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4617	NC_011831	CAA	2	6	234060	234065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847136
4618	NC_011831	CTGAC	2	10	234118	234127	20 %	20 %	20 %	40 %	219847136
4619	NC_011831	CAG	2	6	234141	234146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4620	NC_011831	GCG	2	6	234174	234179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847136
4621	NC_011831	CCG	2	6	234191	234196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847136
4622	NC_011831	TGC	2	6	234215	234220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847136
4623	NC_011831	GGC	2	6	234272	234277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847136
4624	NC_011831	GAA	2	6	234321	234326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847136
4625	NC_011831	TAC	2	6	234448	234453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847136
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4627	NC_011831	TGC	2	6	234503	234508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847136
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4646	NC_011831	CGC	2	6	235024	235029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4647	NC_011831	GCG	2	6	235047	235052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4649	NC_011831	TC	3	6	235085	235090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4650	NC_011831	ATT	2	6	235108	235113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4656	NC_011831	CAGTG	2	10	235409	235418	20 %	20 %	40 %	20 %	219847139
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4661	NC_011831	GAGCG	2	10	235511	235520	20 %	0 %	60 %	20 %	219847139
4662	NC_011831	GC	3	6	235538	235543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4681	NC_011831	ACAGT	2	10	236370	236379	40 %	20 %	20 %	20 %	219847141
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4685	NC_011831	CAGTG	2	10	236569	236578	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4688	NC_011831	TCG	2	6	236633	236638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4691	NC_011831	GC	3	6	236699	236704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4692	NC_011831	ACAGT	2	10	236786	236795	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4693	NC_011831	TCG	2	6	236798	236803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4695	NC_011831	CG	3	6	236835	236840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4696	NC_011831	C	6	6	236874	236879	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4697	NC_011831	GAGCG	2	10	236890	236899	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4698	NC_011831	GC	3	6	236917	236922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4699	NC_011831	ACAGT	2	10	237003	237012	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4700	NC_011831	ACAGT	2	10	237056	237065	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4703	NC_011831	GAGCG	2	10	237106	237115	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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4705	NC_011831	CAGTG	2	10	237221	237230	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4706	NC_011831	TCG	2	6	237232	237237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4716	NC_011831	ACCTTT	2	12	237648	237659	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4717	NC_011831	TGA	2	6	237748	237753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847143
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4719	NC_011831	GCTG	2	8	237998	238005	0 %	25 %	50 %	25 %	219847143
4720	NC_011831	ACG	2	6	238054	238059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847143
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4737	NC_011831	GCAC	2	8	239096	239103	25 %	0 %	25 %	50 %	219847144
4738	NC_011831	GAT	2	6	239222	239227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847144
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4741	NC_011831	GGC	2	6	239305	239310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847144
4742	NC_011831	TCT	2	6	239403	239408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847144
4743	NC_011831	GGT	2	6	239486	239491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847144
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4991	NC_011831	CGGT	2	8	252386	252393	0 %	25 %	50 %	25 %	219847152
4992	NC_011831	GGCT	2	8	252398	252405	0 %	25 %	50 %	25 %	219847152
4993	NC_011831	CA	3	6	252436	252441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4994	NC_011831	CTC	2	6	252517	252522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847153
4995	NC_011831	CAG	2	6	252554	252559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847153
4996	NC_011831	GT	3	6	252691	252696	0 %	50 %	50 %	0 %	219847153
4997	NC_011831	AGC	3	9	252746	252754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847153
4998	NC_011831	TGA	2	6	252795	252800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847153
4999	NC_011831	CAG	2	6	252847	252852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847153
5000	NC_011831	GGC	2	6	252860	252865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847153

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