MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742401

Total Repeats: 4196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011738	TCA	2	6	82	87	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011738	CTT	2	6	252	257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011738	GAC	2	6	371	376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442612
4	NC_011738	ATA	2	6	472	477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442612
5	NC_011738	ACC	2	6	659	664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442612
6	NC_011738	TAA	2	6	786	791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442612
7	NC_011738	TTC	2	6	831	836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011738	CAA	2	6	875	880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011738	AAG	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011738	TCC	2	6	1277	1282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011738	GAG	2	6	1289	1294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011738	AGA	2	6	1530	1535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442613
13	NC_011738	AAT	2	6	1537	1542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442613
14	NC_011738	AAT	2	6	1634	1639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011738	ATC	2	6	1828	1833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442614
16	NC_011738	CCT	2	6	2052	2057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442614
17	NC_011738	ATT	2	6	2077	2082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442614
18	NC_011738	TCA	2	6	2249	2254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442614
19	NC_011738	ACT	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442614
20	NC_011738	CCT	2	6	2327	2332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442614
21	NC_011738	ATC	4	12	2392	2403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442614
22	NC_011738	CGA	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442614
23	NC_011738	TAC	2	6	2662	2667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442614
24	NC_011738	TGA	2	6	2738	2743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442614
25	NC_011738	TCA	2	6	2808	2813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442614
26	NC_011738	GGC	2	6	2919	2924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442614
27	NC_011738	ATC	2	6	2978	2983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442614
28	NC_011738	GTA	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442614
29	NC_011738	GCT	2	6	3015	3020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442614
30	NC_011738	TCC	2	6	3082	3087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442614
31	NC_011738	ATT	2	6	3107	3112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442614
32	NC_011738	TCT	2	6	3155	3160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442614
33	NC_011738	TAA	2	6	3291	3296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442614
34	NC_011738	GAT	2	6	3325	3330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442614
35	NC_011738	AAT	2	6	3491	3496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442614
36	NC_011738	GTT	2	6	3501	3506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442614
37	NC_011738	TCT	3	9	3588	3596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442614
38	NC_011738	ATA	2	6	3658	3663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442614
39	NC_011738	TTC	2	6	3715	3720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442614
40	NC_011738	TAG	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442614
41	NC_011738	AAG	2	6	3920	3925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442614
42	NC_011738	TCT	3	9	3929	3937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442614
43	NC_011738	TCA	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442614
44	NC_011738	GCT	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442614
45	NC_011738	CCG	2	6	4217	4222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442614
46	NC_011738	TGG	2	6	4428	4433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442614
47	NC_011738	ATT	2	6	4538	4543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442614
48	NC_011738	ATG	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442614
49	NC_011738	ATA	2	6	4645	4650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442614
50	NC_011738	TTG	2	6	4672	4677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442614
51	NC_011738	CAA	2	6	4738	4743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442614
52	NC_011738	CCT	2	6	4780	4785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442614
53	NC_011738	CCG	2	6	4875	4880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442614
54	NC_011738	CGG	2	6	5032	5037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442614
55	NC_011738	GTT	2	6	5186	5191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442614
56	NC_011738	TGT	2	6	5282	5287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011738	GTT	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011738	AGG	2	6	5397	5402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011738	CCT	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_011738	TTA	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011738	GAA	2	6	5729	5734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011738	ATT	2	6	5815	5820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011738	ATT	2	6	5838	5843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011738	ATT	2	6	5876	5881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442615
65	NC_011738	ATT	2	6	5938	5943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442615
66	NC_011738	ACG	2	6	6006	6011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011738	GCT	2	6	6029	6034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011738	CGC	2	6	6068	6073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_011738	AGT	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442616
70	NC_011738	TAA	2	6	6330	6335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442616
71	NC_011738	AAT	2	6	6442	6447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442616
72	NC_011738	ACT	2	6	6478	6483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442616
73	NC_011738	TCT	2	6	6493	6498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442616
74	NC_011738	TAA	2	6	6546	6551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442616
75	NC_011738	TTC	2	6	6715	6720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442616
76	NC_011738	CTT	2	6	6774	6779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442616
77	NC_011738	CAA	2	6	6795	6800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442616
78	NC_011738	GAA	2	6	6989	6994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442616
79	NC_011738	TTC	2	6	7084	7089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442616
80	NC_011738	ATA	2	6	7250	7255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442616
81	NC_011738	TCT	2	6	7276	7281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442616
82	NC_011738	AAT	2	6	7311	7316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442616
83	NC_011738	AAT	2	6	7349	7354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011738	ATA	2	6	7370	7375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011738	TTC	2	6	7458	7463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011738	TAA	2	6	7510	7515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011738	AAT	2	6	7638	7643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442617
88	NC_011738	ATC	2	6	7647	7652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442617
89	NC_011738	TGG	2	6	7885	7890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442617
90	NC_011738	CGC	2	6	7969	7974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442617
91	NC_011738	GTC	2	6	8034	8039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442617
92	NC_011738	TTA	2	6	8086	8091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442617
93	NC_011738	AAG	2	6	8149	8154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011738	TTA	2	6	8173	8178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011738	ATC	2	6	8264	8269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011738	TGG	2	6	8622	8627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442618
97	NC_011738	ATG	2	6	8633	8638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442618
98	NC_011738	GGC	2	6	8646	8651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442618
99	NC_011738	ATT	2	6	8699	8704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442618
100	NC_011738	AGA	2	6	8786	8791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442618
101	NC_011738	CTT	3	9	8820	8828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442618
102	NC_011738	ATT	2	6	8873	8878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442618
103	NC_011738	TGA	2	6	8937	8942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442618
104	NC_011738	TGA	2	6	9064	9069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442618
105	NC_011738	AAC	2	6	9216	9221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442618
106	NC_011738	TGA	2	6	9222	9227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442618
107	NC_011738	TTG	2	6	9264	9269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442618
108	NC_011738	GAT	2	6	9380	9385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442618
109	NC_011738	ATT	2	6	9396	9401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442618
110	NC_011738	GCT	2	6	9409	9414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442618
111	NC_011738	TCA	2	6	9465	9470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442618
112	NC_011738	ATT	2	6	9735	9740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442618
113	NC_011738	AAT	2	6	9923	9928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442618
114	NC_011738	GAA	2	6	9950	9955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442618
115	NC_011738	AGT	2	6	9976	9981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442618
116	NC_011738	TCA	2	6	10152	10157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442618
117	NC_011738	CCA	2	6	10372	10377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442618
118	NC_011738	TGG	2	6	10477	10482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442618
119	NC_011738	GAT	2	6	10523	10528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442618
120	NC_011738	GCA	2	6	10564	10569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442618
121	NC_011738	GCC	2	6	10709	10714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442618
122	NC_011738	GCC	2	6	10725	10730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442618
123	NC_011738	TAA	2	6	10786	10791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442618
124	NC_011738	TCC	2	6	10932	10937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442618
125	NC_011738	GGT	2	6	11081	11086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442618
126	NC_011738	GCA	2	6	11094	11099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442618
127	NC_011738	AGG	2	6	11289	11294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442618
128	NC_011738	GGC	2	6	11399	11404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442618
129	NC_011738	AAT	2	6	11442	11447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442618
130	NC_011738	AGC	2	6	11524	11529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442618
131	NC_011738	ACC	2	6	11581	11586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442618
132	NC_011738	TTC	2	6	11635	11640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442618
133	NC_011738	GAT	2	6	11753	11758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442618
134	NC_011738	TAA	2	6	11851	11856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011738	GCT	2	6	11918	11923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011738	TGT	2	6	12012	12017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011738	AGG	2	6	12056	12061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011738	AGG	2	6	12063	12068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011738	AGG	2	6	12070	12075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011738	TTC	2	6	12081	12086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011738	CGG	2	6	12172	12177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011738	CCT	2	6	12218	12223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_011738	CCT	2	6	12225	12230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_011738	CCT	2	6	12246	12251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_011738	ATG	2	6	12372	12377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442619
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151	NC_011738	TTC	2	6	12938	12943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442621
152	NC_011738	TTC	2	6	13031	13036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442621
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164	NC_011738	CTT	2	6	13636	13641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442621
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171	NC_011738	TTA	2	6	14152	14157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_011738	AGA	2	6	19235	19240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442626
240	NC_011738	TCC	2	6	19277	19282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442626
241	NC_011738	CTG	2	6	19360	19365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442626
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257	NC_011738	TAA	2	6	20330	20335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442626
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380	NC_011738	TTC	2	6	29673	29678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
381	NC_011738	CTT	2	6	29739	29744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
382	NC_011738	GAG	2	6	30179	30184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
383	NC_011738	TTA	2	6	30209	30214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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385	NC_011738	TTG	2	6	30258	30263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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