MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742401

Total Repeats: 7144

< Previous123456789101112131415Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011738	TAT	2	6	46350	46355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011738	TCT	2	6	46392	46397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_011738	T	6	6	46397	46402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011738	TTC	2	6	46407	46412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_011738	A	6	6	46435	46440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011738	TAA	2	6	46443	46448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011738	T	6	6	46459	46464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011738	TTA	2	6	46514	46519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011738	AGTA	2	8	46589	46596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011738	GAG	2	6	46619	46624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011738	TCTG	2	8	46645	46652	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_011738	T	6	6	46663	46668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011738	TGA	2	6	46691	46696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011738	AAT	2	6	46736	46741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011738	TCC	2	6	46746	46751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_011738	A	6	6	46753	46758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_011738	A	6	6	46773	46778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011738	TGA	2	6	46789	46794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011738	GAT	2	6	46823	46828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011738	CAC	2	6	46842	46847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_011738	AAC	2	6	47010	47015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442641
1022	NC_011738	AAG	2	6	47091	47096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442641
1023	NC_011738	TCA	2	6	47110	47115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442641
1024	NC_011738	A	6	6	47123	47128	100 %	0 %	0 %	0 %	218442641
1025	NC_011738	TTC	2	6	47156	47161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_011738	ATA	2	6	47208	47213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011738	GTG	2	6	47219	47224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011738	ATA	2	6	47235	47240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011738	ATTA	2	8	47274	47281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011738	CAT	2	6	47448	47453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442642
1031	NC_011738	CAA	2	6	47500	47505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442642
1032	NC_011738	AATT	2	8	47528	47535	50 %	50 %	0 %	0 %	218442642
1033	NC_011738	CCT	2	6	47561	47566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442642
1034	NC_011738	CTC	2	6	47663	47668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442642
1035	NC_011738	TTGA	2	8	47788	47795	25 %	50 %	25 %	0 %	218442642
1036	NC_011738	CTC	2	6	47884	47889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442642
1037	NC_011738	GAA	2	6	47899	47904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442642
1038	NC_011738	CGC	2	6	47906	47911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442642
1039	NC_011738	TATT	2	8	47921	47928	25 %	75 %	0 %	0 %	218442642
1040	NC_011738	CAC	2	6	47934	47939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442642
1041	NC_011738	CTTTAA	2	12	47985	47996	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218442642
1042	NC_011738	TC	3	6	48004	48009	0 %	50 %	0 %	50 %	218442642
1043	NC_011738	TCA	2	6	48176	48181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442642
1044	NC_011738	A	6	6	48227	48232	100 %	0 %	0 %	0 %	218442642
1045	NC_011738	GAA	2	6	48283	48288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442642
1046	NC_011738	TCAA	2	8	48300	48307	50 %	25 %	0 %	25 %	218442642
1047	NC_011738	TAT	2	6	48341	48346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442642
1048	NC_011738	CTC	2	6	48387	48392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442642
1049	NC_011738	AAC	2	6	48410	48415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442642
1050	NC_011738	ACA	2	6	48456	48461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442642
1051	NC_011738	CAG	2	6	48604	48609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442642
1052	NC_011738	GGT	2	6	48642	48647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442642
1053	NC_011738	AAC	2	6	48664	48669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442642
1054	NC_011738	TGAT	2	8	48695	48702	25 %	50 %	25 %	0 %	218442642
1055	NC_011738	A	6	6	48743	48748	100 %	0 %	0 %	0 %	218442642
1056	NC_011738	AATT	2	8	48815	48822	50 %	50 %	0 %	0 %	218442642
1057	NC_011738	GAT	2	6	48880	48885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442643
1058	NC_011738	CAA	2	6	48988	48993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442643
1059	NC_011738	GGC	2	6	49017	49022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442643
1060	NC_011738	ATT	2	6	49054	49059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442643
1061	NC_011738	TCT	2	6	49145	49150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442643
1062	NC_011738	TC	3	6	49157	49162	0 %	50 %	0 %	50 %	218442643
1063	NC_011738	AGT	2	6	49179	49184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442643
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1066	NC_011738	GAA	2	6	49246	49251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442643
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1072	NC_011738	TCTG	2	8	49627	49634	0 %	50 %	25 %	25 %	218442643
1073	NC_011738	AAG	2	6	49673	49678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442643
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1075	NC_011738	T	6	6	49705	49710	0 %	100 %	0 %	0 %	218442643
1076	NC_011738	A	6	6	49747	49752	100 %	0 %	0 %	0 %	218442643
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1080	NC_011738	GAT	2	6	50213	50218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442644
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1083	NC_011738	T	8	8	50356	50363	0 %	100 %	0 %	0 %	218442644
1084	NC_011738	AGC	2	6	50374	50379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442644
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1088	NC_011738	TCC	2	6	50663	50668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442645
1089	NC_011738	TAT	2	6	50702	50707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442645
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1091	NC_011738	A	8	8	50829	50836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_011738	GC	3	6	50844	50849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_011738	ATT	2	6	50882	50887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_011738	A	6	6	50895	50900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011738	GCT	2	6	50957	50962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_011738	ATA	2	6	50970	50975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011738	TTA	2	6	50985	50990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_011738	GTTA	2	8	50998	51005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011738	T	8	8	51006	51013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011738	ATG	2	6	51083	51088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442646
1101	NC_011738	TTG	2	6	51096	51101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442646
1102	NC_011738	GAC	2	6	51110	51115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442646
1103	NC_011738	ATG	2	6	51116	51121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442646
1104	NC_011738	A	7	7	51148	51154	100 %	0 %	0 %	0 %	218442646
1105	NC_011738	GA	3	6	51261	51266	50 %	0 %	50 %	0 %	218442646
1106	NC_011738	CT	3	6	51281	51286	0 %	50 %	0 %	50 %	218442646
1107	NC_011738	TCT	2	6	51335	51340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442646
1108	NC_011738	TTAA	2	8	51389	51396	50 %	50 %	0 %	0 %	218442646
1109	NC_011738	AGG	2	6	51445	51450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442646
1110	NC_011738	GCA	2	6	51569	51574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442646
1111	NC_011738	TAA	2	6	51613	51618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442646
1112	NC_011738	CAT	2	6	51664	51669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442646
1113	NC_011738	ATT	2	6	51822	51827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011738	TGATT	2	10	51890	51899	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011738	TAA	2	6	51913	51918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011738	ATA	2	6	51936	51941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011738	ATT	2	6	51946	51951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011738	CAT	2	6	51954	51959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_011738	T	6	6	51959	51964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_011738	TTAAA	2	10	51974	51983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011738	ATT	2	6	51987	51992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_011738	T	8	8	51991	51998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011738	A	6	6	52019	52024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011738	AATA	2	8	52047	52054	75 %	25 %	0 %	0 %	218442647
1125	NC_011738	T	7	7	52073	52079	0 %	100 %	0 %	0 %	218442647
1126	NC_011738	T	6	6	52108	52113	0 %	100 %	0 %	0 %	218442647
1127	NC_011738	ATC	2	6	52190	52195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442647
1128	NC_011738	CT	3	6	52250	52255	0 %	50 %	0 %	50 %	218442647
1129	NC_011738	AAT	2	6	52269	52274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442647
1130	NC_011738	ATT	2	6	52280	52285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442647
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1132	NC_011738	TCT	2	6	52307	52312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442647
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