MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742402

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011737	AGTTA	2	10	709	718	40 %	40 %	20 %	0 %	218442436
2	NC_011737	TACCT	2	10	853	862	20 %	40 %	0 %	40 %	218442436
3	NC_011737	CTTTG	2	10	1931	1940	0 %	60 %	20 %	20 %	218442436
4	NC_011737	GTACA	2	10	3096	3105	40 %	20 %	20 %	20 %	218442436
5	NC_011737	AATAC	2	10	4437	4446	60 %	20 %	0 %	20 %	218442436
6	NC_011737	GAAAC	2	10	5572	5581	60 %	0 %	20 %	20 %	218442438
7	NC_011737	CAGAA	2	10	5655	5664	60 %	0 %	20 %	20 %	218442438
8	NC_011737	AATCA	2	10	5715	5724	60 %	20 %	0 %	20 %	218442439
9	NC_011737	GATAT	2	10	6561	6570	40 %	40 %	20 %	0 %	218442439
10	NC_011737	TTTAA	2	10	9938	9947	40 %	60 %	0 %	0 %	218442441
11	NC_011737	AAATC	2	10	11340	11349	60 %	20 %	0 %	20 %	218442443
12	NC_011737	TCATT	2	10	16205	16214	20 %	60 %	0 %	20 %	218442448
13	NC_011737	AAAAT	2	10	19688	19697	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011737	GCGCC	2	10	21662	21671	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_011737	CCCAA	2	10	21936	21945	40 %	0 %	0 %	60 %	218442452
16	NC_011737	CTCGA	2	10	22403	22412	20 %	20 %	20 %	40 %	218442453
17	NC_011737	TTTGG	2	10	23851	23860	0 %	60 %	40 %	0 %	218442455
18	NC_011737	ATTTT	2	10	26509	26518	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011737	AAATG	2	10	27316	27325	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011737	ACCCA	2	10	28960	28969	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_011737	ATTTA	2	10	31983	31992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011737	ATTAG	2	10	32374	32383	40 %	40 %	20 %	0 %	218442465
23	NC_011737	TAAAT	2	10	32574	32583	60 %	40 %	0 %	0 %	218442465
24	NC_011737	TGATA	2	10	34234	34243	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011737	TCGGC	2	10	34525	34534	0 %	20 %	40 %	40 %	218442468
26	NC_011737	TTGAG	2	10	38315	38324	20 %	40 %	40 %	0 %	218442470
27	NC_011737	TAATA	2	10	39918	39927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011737	GATAG	2	10	42142	42151	40 %	20 %	40 %	0 %	218442474
29	NC_011737	AAAAT	2	10	43862	43871	80 %	20 %	0 %	0 %	218442476
30	NC_011737	GGGAT	2	10	45327	45336	20 %	20 %	60 %	0 %	218442477
31	NC_011737	AACTT	2	10	45671	45680	40 %	40 %	0 %	20 %	218442478
32	NC_011737	TGTGA	2	10	46596	46605	20 %	40 %	40 %	0 %	218442479
33	NC_011737	ACCTA	2	10	47769	47778	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_011737	TAAAT	2	10	48299	48308	60 %	40 %	0 %	0 %	218442480
35	NC_011737	GATTT	2	10	48829	48838	20 %	60 %	20 %	0 %	218442480
36	NC_011737	AATGA	2	10	49062	49071	60 %	20 %	20 %	0 %	218442480
37	NC_011737	ATCTT	2	10	49483	49492	20 %	60 %	0 %	20 %	218442481
38	NC_011737	ATTTT	2	10	49957	49966	20 %	80 %	0 %	0 %	218442481
39	NC_011737	AACGC	2	10	51075	51084	40 %	0 %	20 %	40 %	218442481
40	NC_011737	ATTAT	2	10	52853	52862	40 %	60 %	0 %	0 %	218442482
41	NC_011737	ATTAT	2	10	52885	52894	40 %	60 %	0 %	0 %	218442482
42	NC_011737	CTTGG	2	10	53863	53872	0 %	40 %	40 %	20 %	218442482
43	NC_011737	GGATG	2	10	53907	53916	20 %	20 %	60 %	0 %	218442482
44	NC_011737	ATTGT	2	10	54174	54183	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011737	TAAGG	2	10	55618	55627	40 %	20 %	40 %	0 %	218442483
46	NC_011737	AAAAT	2	10	56650	56659	80 %	20 %	0 %	0 %	218442484
47	NC_011737	AACGA	2	10	56989	56998	60 %	0 %	20 %	20 %	218442485
48	NC_011737	CCAAG	2	10	60099	60108	40 %	0 %	20 %	40 %	218442487
49	NC_011737	GACAG	2	10	60673	60682	40 %	0 %	40 %	20 %	218442487
50	NC_011737	GAAAA	2	10	61299	61308	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011737	AAGGG	2	10	62502	62511	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011737	ATCGC	2	10	62565	62574	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_011737	TCTTT	2	10	62716	62725	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011737	AAAAT	2	10	65075	65084	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011737	GTTTA	2	10	69409	69418	20 %	60 %	20 %	0 %	218442493
56	NC_011737	TCAAA	2	10	70400	70409	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_011737	CAATT	2	10	71368	71377	40 %	40 %	0 %	20 %	218442496
58	NC_011737	TTTCA	2	10	71630	71639	20 %	60 %	0 %	20 %	218442496
59	NC_011737	TAAAT	2	10	73346	73355	60 %	40 %	0 %	0 %	218442496
60	NC_011737	AAATT	2	10	73543	73552	60 %	40 %	0 %	0 %	218442496
61	NC_011737	AAACT	2	10	74533	74542	60 %	20 %	0 %	20 %	218442496
62	NC_011737	AATAA	2	10	77664	77673	80 %	20 %	0 %	0 %	218442496
63	NC_011737	TACGG	2	10	78072	78081	20 %	20 %	40 %	20 %	218442496
64	NC_011737	TAATT	2	10	79727	79736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011737	TAATT	2	10	80387	80396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011737	TTAAT	2	10	80772	80781	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011737	AATTT	2	10	81075	81084	40 %	60 %	0 %	0 %	218442500
68	NC_011737	TAAAA	2	10	81940	81949	80 %	20 %	0 %	0 %	218442501
69	NC_011737	ATATT	2	10	82596	82605	40 %	60 %	0 %	0 %	218442502
70	NC_011737	TAAAT	2	10	82977	82986	60 %	40 %	0 %	0 %	218442502
71	NC_011737	GGGAA	2	10	83952	83961	40 %	0 %	60 %	0 %	218442503
72	NC_011737	AGGTA	2	10	84853	84862	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011737	GGGAT	2	10	85729	85738	20 %	20 %	60 %	0 %	218442504
74	NC_011737	GATCG	2	10	86095	86104	20 %	20 %	40 %	20 %	218442505
75	NC_011737	GAAAA	2	10	87341	87350	80 %	0 %	20 %	0 %	218442509
76	NC_011737	AAGCA	2	10	92683	92692	60 %	0 %	20 %	20 %	218442515
77	NC_011737	TATAA	2	10	95803	95812	60 %	40 %	0 %	0 %	218442518
78	NC_011737	AATTA	2	10	95816	95825	60 %	40 %	0 %	0 %	218442518
79	NC_011737	ATTAA	2	10	95943	95952	60 %	40 %	0 %	0 %	218442518
80	NC_011737	ACCTA	2	10	96827	96836	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_011737	TTCTA	2	10	97987	97996	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011737	TAAAT	2	10	99032	99041	60 %	40 %	0 %	0 %	218442520
83	NC_011737	GAGTG	2	10	100319	100328	20 %	20 %	60 %	0 %	218442521
84	NC_011737	ATCCC	2	10	101912	101921	20 %	20 %	0 %	60 %	218442522
85	NC_011737	ACCAT	2	10	104590	104599	40 %	20 %	0 %	40 %	218442524
86	NC_011737	CGTAT	2	10	104989	104998	20 %	40 %	20 %	20 %	218442524
87	NC_011737	TTGAT	2	10	106370	106379	20 %	60 %	20 %	0 %	218442526
88	NC_011737	CCATT	2	10	106550	106559	20 %	40 %	0 %	40 %	218442526
89	NC_011737	CTTAT	2	10	107634	107643	20 %	60 %	0 %	20 %	218442526
90	NC_011737	CCTGT	2	10	110110	110119	0 %	40 %	20 %	40 %	218442529
91	NC_011737	TCGCC	2	10	113402	113411	0 %	20 %	20 %	60 %	218442531
92	NC_011737	TCTGT	2	10	116447	116456	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011737	GAAAT	2	10	116932	116941	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011737	TAGAC	2	10	117638	117647	40 %	20 %	20 %	20 %	218442534
95	NC_011737	CTTTA	2	10	118690	118699	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_011737	AAGAT	2	10	118789	118798	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011737	TCTCG	2	10	119776	119785	0 %	40 %	20 %	40 %	218442535
98	NC_011737	ATTTT	2	10	121287	121296	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011737	TTAAA	2	10	121977	121986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011737	TTTAA	2	10	122797	122806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011737	GCCAA	2	10	123094	123103	40 %	0 %	20 %	40 %	218442541
102	NC_011737	GGATG	2	10	123883	123892	20 %	20 %	60 %	0 %	218442542
103	NC_011737	ATTAG	2	10	124525	124534	40 %	40 %	20 %	0 %	218442542
104	NC_011737	GGGTC	2	10	124871	124880	0 %	20 %	60 %	20 %	218442542
105	NC_011737	GTTGA	2	10	128469	128478	20 %	40 %	40 %	0 %	218442544
106	NC_011737	ATCTT	2	10	129684	129693	20 %	60 %	0 %	20 %	218442544
107	NC_011737	ATTAG	2	10	131348	131357	40 %	40 %	20 %	0 %	218442546
108	NC_011737	ATAAA	2	10	131623	131632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011737	TTCCT	2	10	131949	131958	0 %	60 %	0 %	40 %	218442547
110	NC_011737	GATTG	2	10	136418	136427	20 %	40 %	40 %	0 %	218442549
111	NC_011737	ATAGC	2	10	137680	137689	40 %	20 %	20 %	20 %	218442550
112	NC_011737	AAATT	2	10	140177	140186	60 %	40 %	0 %	0 %	218442552
113	NC_011737	GTTCT	2	10	140534	140543	0 %	60 %	20 %	20 %	218442552
114	NC_011737	GATTA	2	10	140642	140651	40 %	40 %	20 %	0 %	218442552
115	NC_011737	TATAT	2	10	141682	141691	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011737	AAATT	2	10	141850	141859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011737	ATCAA	2	10	143664	143673	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_011737	GTTTT	2	10	144810	144819	0 %	80 %	20 %	0 %	218442555
119	NC_011737	AGTCG	2	10	148465	148474	20 %	20 %	40 %	20 %	218442561
120	NC_011737	TCGAT	2	10	151156	151165	20 %	40 %	20 %	20 %	218442564
121	NC_011737	ATTTA	2	10	152539	152548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011737	AAAGA	2	10	155073	155082	80 %	0 %	20 %	0 %	218442569
123	NC_011737	AAATT	2	10	156047	156056	60 %	40 %	0 %	0 %	218442569
124	NC_011737	ATTGC	2	10	157142	157151	20 %	40 %	20 %	20 %	218442569
125	NC_011737	ATTTA	2	10	158941	158950	40 %	60 %	0 %	0 %	218442573
126	NC_011737	ATTTA	2	10	159511	159520	40 %	60 %	0 %	0 %	218442573
127	NC_011737	ACCGA	2	10	161098	161107	40 %	0 %	20 %	40 %	218442574
128	NC_011737	TAGAA	2	10	163076	163085	60 %	20 %	20 %	0 %	218442576
129	NC_011737	GAAAT	2	10	163251	163260	60 %	20 %	20 %	0 %	218442576
130	NC_011737	TAAAC	2	10	163526	163535	60 %	20 %	0 %	20 %	218442576
131	NC_011737	TCTTA	2	10	163931	163940	20 %	60 %	0 %	20 %	218442576
132	NC_011737	AAATC	2	10	166940	166949	60 %	20 %	0 %	20 %	218442581
133	NC_011737	TTAAT	2	10	167788	167797	40 %	60 %	0 %	0 %	218442581
134	NC_011737	ATTTA	2	10	169852	169861	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011737	ATTAG	2	10	170243	170252	40 %	40 %	20 %	0 %	218442582
136	NC_011737	TAAAT	2	10	170443	170452	60 %	40 %	0 %	0 %	218442582
137	NC_011737	TAATT	2	10	172044	172053	40 %	60 %	0 %	0 %	218442583
138	NC_011737	GACTT	2	10	172197	172206	20 %	40 %	20 %	20 %	218442583
139	NC_011737	AGGTA	2	10	178306	178315	40 %	20 %	40 %	0 %	218442589
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.