MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742402

Total Repeats: 4420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011737	T	6	6	13	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011737	GAG	2	6	28	33	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011737	TTA	2	6	64	69	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011737	TCC	2	6	109	114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011737	CTG	2	6	118	123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011737	CCT	2	6	132	137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_011737	A	8	8	196	203	100 %	0 %	0 %	0 %	218442436
8	NC_011737	TTGA	2	8	263	270	25 %	50 %	25 %	0 %	218442436
9	NC_011737	AG	3	6	296	301	50 %	0 %	50 %	0 %	218442436
10	NC_011737	ATT	2	6	314	319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
11	NC_011737	GGC	2	6	345	350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442436
12	NC_011737	AAC	2	6	375	380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442436
13	NC_011737	GTTG	2	8	411	418	0 %	50 %	50 %	0 %	218442436
14	NC_011737	T	6	6	473	478	0 %	100 %	0 %	0 %	218442436
15	NC_011737	AGC	2	6	493	498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442436
16	NC_011737	CT	3	6	564	569	0 %	50 %	0 %	50 %	218442436
17	NC_011737	GGA	2	6	590	595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442436
18	NC_011737	GTC	2	6	599	604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442436
19	NC_011737	AAT	2	6	632	637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442436
20	NC_011737	AGT	2	6	670	675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
21	NC_011737	AGTTA	2	10	709	718	40 %	40 %	20 %	0 %	218442436
22	NC_011737	ATT	2	6	725	730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
23	NC_011737	TTG	2	6	749	754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442436
24	NC_011737	AG	3	6	773	778	50 %	0 %	50 %	0 %	218442436
25	NC_011737	AGCA	2	8	828	835	50 %	0 %	25 %	25 %	218442436
26	NC_011737	TACCT	2	10	853	862	20 %	40 %	0 %	40 %	218442436
27	NC_011737	AGT	2	6	895	900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
28	NC_011737	TAT	2	6	1027	1032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
29	NC_011737	CAA	2	6	1110	1115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442436
30	NC_011737	ACC	2	6	1119	1124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442436
31	NC_011737	GAT	2	6	1142	1147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
32	NC_011737	ATT	2	6	1169	1174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
33	NC_011737	GA	3	6	1178	1183	50 %	0 %	50 %	0 %	218442436
34	NC_011737	TGC	2	6	1197	1202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442436
35	NC_011737	TAT	2	6	1273	1278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
36	NC_011737	GAT	2	6	1313	1318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
37	NC_011737	TTA	2	6	1319	1324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
38	NC_011737	TTGG	2	8	1342	1349	0 %	50 %	50 %	0 %	218442436
39	NC_011737	CAGGGA	2	12	1352	1363	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	218442436
40	NC_011737	ATA	2	6	1397	1402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442436
41	NC_011737	ACT	2	6	1404	1409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442436
42	NC_011737	TTA	2	6	1427	1432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
43	NC_011737	GAT	2	6	1439	1444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
44	NC_011737	AGA	2	6	1468	1473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442436
45	NC_011737	A	6	6	1478	1483	100 %	0 %	0 %	0 %	218442436
46	NC_011737	AAAT	2	8	1512	1519	75 %	25 %	0 %	0 %	218442436
47	NC_011737	GTT	2	6	1527	1532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442436
48	NC_011737	TAA	2	6	1536	1541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442436
49	NC_011737	GAA	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442436
50	NC_011737	TCA	2	6	1597	1602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442436
51	NC_011737	CTT	2	6	1637	1642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442436
52	NC_011737	AGA	2	6	1648	1653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442436
53	NC_011737	AGA	2	6	1681	1686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442436
54	NC_011737	TTA	2	6	1717	1722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
55	NC_011737	TGC	2	6	1750	1755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442436
56	NC_011737	TGG	2	6	1777	1782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442436
57	NC_011737	TAGA	2	8	1878	1885	50 %	25 %	25 %	0 %	218442436
58	NC_011737	GAA	2	6	1886	1891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442436
59	NC_011737	A	6	6	1890	1895	100 %	0 %	0 %	0 %	218442436
60	NC_011737	TTA	2	6	1896	1901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
61	NC_011737	CTTTG	2	10	1931	1940	0 %	60 %	20 %	20 %	218442436
62	NC_011737	GAAG	2	8	1948	1955	50 %	0 %	50 %	0 %	218442436
63	NC_011737	CGA	2	6	1972	1977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442436
64	NC_011737	ACA	2	6	2033	2038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442436
65	NC_011737	CCAA	2	8	2042	2049	50 %	0 %	0 %	50 %	218442436
66	NC_011737	AATT	2	8	2103	2110	50 %	50 %	0 %	0 %	218442436
67	NC_011737	AAT	2	6	2113	2118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442436
68	NC_011737	ATT	2	6	2162	2167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
69	NC_011737	CGT	2	6	2213	2218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442436
70	NC_011737	TAG	2	6	2295	2300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
71	NC_011737	AAC	2	6	2313	2318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442436
72	NC_011737	ATT	2	6	2348	2353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
73	NC_011737	AGT	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
74	NC_011737	GT	3	6	2505	2510	0 %	50 %	50 %	0 %	218442436
75	NC_011737	GCTT	2	8	2515	2522	0 %	50 %	25 %	25 %	218442436
76	NC_011737	A	6	6	2615	2620	100 %	0 %	0 %	0 %	218442436
77	NC_011737	A	8	8	2660	2667	100 %	0 %	0 %	0 %	218442436
78	NC_011737	G	6	6	2801	2806	0 %	0 %	100 %	0 %	218442436
79	NC_011737	CAAA	2	8	2924	2931	75 %	0 %	0 %	25 %	218442436
80	NC_011737	ATT	2	6	3035	3040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
81	NC_011737	GTACA	2	10	3096	3105	40 %	20 %	20 %	20 %	218442436
82	NC_011737	AGA	2	6	3241	3246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442436
83	NC_011737	TAG	2	6	3271	3276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
84	NC_011737	ACC	2	6	3281	3286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442436
85	NC_011737	GACATA	2	12	3300	3311	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218442436
86	NC_011737	AGC	2	6	3315	3320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442436
87	NC_011737	GTT	2	6	3324	3329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442436
88	NC_011737	GTG	2	6	3372	3377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442436
89	NC_011737	GAT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
90	NC_011737	GTA	2	6	3387	3392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
91	NC_011737	ATA	2	6	3702	3707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442436
92	NC_011737	G	8	8	3755	3762	0 %	0 %	100 %	0 %	218442436
93	NC_011737	TAG	2	6	3892	3897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
94	NC_011737	TGAA	2	8	3963	3970	50 %	25 %	25 %	0 %	218442436
95	NC_011737	TTAG	2	8	4022	4029	25 %	50 %	25 %	0 %	218442436
96	NC_011737	TTA	2	6	4080	4085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
97	NC_011737	A	6	6	4103	4108	100 %	0 %	0 %	0 %	218442436
98	NC_011737	GGA	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442436
99	NC_011737	AATAC	2	10	4437	4446	60 %	20 %	0 %	20 %	218442436
100	NC_011737	TAT	2	6	4514	4519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442437
101	NC_011737	AT	3	6	4518	4523	50 %	50 %	0 %	0 %	218442437
102	NC_011737	GT	3	6	4568	4573	0 %	50 %	50 %	0 %	218442437
103	NC_011737	TATCTT	2	12	4586	4597	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218442437
104	NC_011737	T	6	6	4752	4757	0 %	100 %	0 %	0 %	218442437
105	NC_011737	TGT	2	6	4879	4884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011737	TTA	2	6	4948	4953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011737	AGA	2	6	4972	4977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011737	TTGT	2	8	5024	5031	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011737	AACA	2	8	5104	5111	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011737	CAT	2	6	5117	5122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011737	TCT	2	6	5163	5168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011737	ATT	2	6	5193	5198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011737	CGA	2	6	5236	5241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011737	ATA	2	6	5246	5251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011737	ACT	2	6	5259	5264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011737	T	7	7	5288	5294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011737	TA	3	6	5428	5433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011737	TA	3	6	5450	5455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011737	GAC	2	6	5525	5530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442438
120	NC_011737	AGA	2	6	5538	5543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442438
121	NC_011737	GAAAC	2	10	5572	5581	60 %	0 %	20 %	20 %	218442438
122	NC_011737	AAG	2	6	5586	5591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442438
123	NC_011737	A	7	7	5639	5645	100 %	0 %	0 %	0 %	218442438
124	NC_011737	CAGAA	2	10	5655	5664	60 %	0 %	20 %	20 %	218442438
125	NC_011737	AATCA	2	10	5715	5724	60 %	20 %	0 %	20 %	218442439
126	NC_011737	AAT	2	6	5759	5764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
127	NC_011737	TCT	2	6	5815	5820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442439
128	NC_011737	A	6	6	5827	5832	100 %	0 %	0 %	0 %	218442439
129	NC_011737	CAA	2	6	5873	5878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442439
130	NC_011737	CT	3	6	5940	5945	0 %	50 %	0 %	50 %	218442439
131	NC_011737	AATT	2	8	5954	5961	50 %	50 %	0 %	0 %	218442439
132	NC_011737	A	6	6	5976	5981	100 %	0 %	0 %	0 %	218442439
133	NC_011737	TAA	2	6	6069	6074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
134	NC_011737	AGA	2	6	6168	6173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442439
135	NC_011737	TAAA	2	8	6257	6264	75 %	25 %	0 %	0 %	218442439
136	NC_011737	AAGA	2	8	6362	6369	75 %	0 %	25 %	0 %	218442439
137	NC_011737	ATTT	2	8	6431	6438	25 %	75 %	0 %	0 %	218442439
138	NC_011737	AAG	2	6	6441	6446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442439
139	NC_011737	AAT	2	6	6453	6458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
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