MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742402

Total Repeats: 4420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011737	TAT	2	6	42466	42471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442474
1002	NC_011737	TTCT	2	8	42503	42510	0 %	75 %	0 %	25 %	218442474
1003	NC_011737	GTT	2	6	42556	42561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442474
1004	NC_011737	GAA	2	6	42733	42738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442474
1005	NC_011737	A	6	6	42737	42742	100 %	0 %	0 %	0 %	218442474
1006	NC_011737	TTA	2	6	42750	42755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442474
1007	NC_011737	T	7	7	42758	42764	0 %	100 %	0 %	0 %	218442474
1008	NC_011737	A	7	7	42767	42773	100 %	0 %	0 %	0 %	218442474
1009	NC_011737	ATAA	2	8	42815	42822	75 %	25 %	0 %	0 %	218442474
1010	NC_011737	A	6	6	42872	42877	100 %	0 %	0 %	0 %	218442474
1011	NC_011737	TCC	2	6	42944	42949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442474
1012	NC_011737	TGA	2	6	43092	43097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011737	TCTT	2	8	43138	43145	0 %	75 %	0 %	25 %	218442475
1014	NC_011737	CAG	2	6	43146	43151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442475
1015	NC_011737	AAG	2	6	43189	43194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442475
1016	NC_011737	TTC	2	6	43263	43268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442475
1017	NC_011737	GCA	2	6	43274	43279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442475
1018	NC_011737	TCT	3	9	43283	43291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442475
1019	NC_011737	A	7	7	43396	43402	100 %	0 %	0 %	0 %	218442475
1020	NC_011737	TAA	2	6	43467	43472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442475
1021	NC_011737	T	7	7	43475	43481	0 %	100 %	0 %	0 %	218442475
1022	NC_011737	TAA	2	6	43512	43517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442475
1023	NC_011737	GAGT	2	8	43584	43591	25 %	25 %	50 %	0 %	218442475
1024	NC_011737	AAC	2	6	43645	43650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442475
1025	NC_011737	TGA	2	6	43688	43693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_011737	ATT	2	6	43717	43722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011737	TGA	2	6	43772	43777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442476
1028	NC_011737	A	6	6	43777	43782	100 %	0 %	0 %	0 %	218442476
1029	NC_011737	GCA	2	6	43835	43840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442476
1030	NC_011737	AAAAT	2	10	43862	43871	80 %	20 %	0 %	0 %	218442476
1031	NC_011737	A	6	6	43886	43891	100 %	0 %	0 %	0 %	218442476
1032	NC_011737	TAA	2	6	43929	43934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442476
1033	NC_011737	TTA	2	6	44068	44073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011737	GAA	2	6	44120	44125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011737	AATT	2	8	44131	44138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011737	T	7	7	44171	44177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011737	ATT	2	6	44206	44211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011737	ATT	2	6	44229	44234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011737	ATT	2	6	44267	44272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442477
1040	NC_011737	GA	3	6	44299	44304	50 %	0 %	50 %	0 %	218442477
1041	NC_011737	ATT	2	6	44329	44334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442477
1042	NC_011737	A	7	7	44419	44425	100 %	0 %	0 %	0 %	218442477
1043	NC_011737	GAA	2	6	44494	44499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442477
1044	NC_011737	TTC	2	6	44589	44594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442477
1045	NC_011737	A	6	6	44683	44688	100 %	0 %	0 %	0 %	218442477
1046	NC_011737	TTG	2	6	44783	44788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442477
1047	NC_011737	AAG	2	6	44804	44809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442477
1048	NC_011737	AATC	2	8	44836	44843	50 %	25 %	0 %	25 %	218442477
1049	NC_011737	TA	3	6	44849	44854	50 %	50 %	0 %	0 %	218442477
1050	NC_011737	AGA	2	6	44862	44867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442477
1051	NC_011737	GA	3	6	44953	44958	50 %	0 %	50 %	0 %	218442477
1052	NC_011737	ATT	2	6	45031	45036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442477
1053	NC_011737	ATA	2	6	45080	45085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442477
1054	NC_011737	TAG	2	6	45099	45104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442477
1055	NC_011737	ATT	2	6	45136	45141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442477
1056	NC_011737	ATT	2	6	45247	45252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442477
1057	NC_011737	TTAA	2	8	45271	45278	50 %	50 %	0 %	0 %	218442477
1058	NC_011737	ACT	2	6	45286	45291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442477
1059	NC_011737	A	6	6	45295	45300	100 %	0 %	0 %	0 %	218442477
1060	NC_011737	GGGAT	2	10	45327	45336	20 %	20 %	60 %	0 %	218442477
1061	NC_011737	GC	3	6	45492	45497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_011737	GGC	2	6	45509	45514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_011737	AGC	2	6	45549	45554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_011737	CGT	2	6	45572	45577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442478
1065	NC_011737	ATT	2	6	45634	45639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442478
1066	NC_011737	ATT	2	6	45649	45654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442478
1067	NC_011737	AACTT	2	10	45671	45680	40 %	40 %	0 %	20 %	218442478
1068	NC_011737	AAAG	2	8	45712	45719	75 %	0 %	25 %	0 %	218442478
1069	NC_011737	ACAA	2	8	45772	45779	75 %	0 %	0 %	25 %	218442478
1070	NC_011737	ATT	2	6	45813	45818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442478
1071	NC_011737	AGT	2	6	45849	45854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442478
1072	NC_011737	AGAT	2	8	45866	45873	50 %	25 %	25 %	0 %	218442478
1073	NC_011737	A	6	6	45895	45900	100 %	0 %	0 %	0 %	218442478
1074	NC_011737	ATT	2	6	45933	45938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442478
1075	NC_011737	CAG	2	6	45971	45976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442478
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1077	NC_011737	GCTT	2	8	46081	46088	0 %	50 %	25 %	25 %	218442478
1078	NC_011737	T	7	7	46087	46093	0 %	100 %	0 %	0 %	218442478
1079	NC_011737	TCA	2	6	46118	46123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442478
1080	NC_011737	T	6	6	46183	46188	0 %	100 %	0 %	0 %	218442478
1081	NC_011737	T	6	6	46191	46196	0 %	100 %	0 %	0 %	218442478
1082	NC_011737	TAA	2	6	46220	46225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442478
1083	NC_011737	TTC	2	6	46236	46241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442478
1084	NC_011737	TAA	2	6	46272	46277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442478
1085	NC_011737	A	6	6	46311	46316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_011737	GAT	2	6	46317	46322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_011737	T	6	6	46346	46351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_011737	TAA	3	9	46359	46367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_011737	TTTA	2	8	46514	46521	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011737	TGTGA	2	10	46596	46605	20 %	40 %	40 %	0 %	218442479
1091	NC_011737	T	7	7	46616	46622	0 %	100 %	0 %	0 %	218442479
1092	NC_011737	TTA	2	6	46729	46734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442479
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1094	NC_011737	TAG	2	6	47020	47025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442479
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1097	NC_011737	CTT	2	6	47216	47221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442479
1098	NC_011737	GAA	2	6	47276	47281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442479
1099	NC_011737	AG	3	6	47333	47338	50 %	0 %	50 %	0 %	218442479
1100	NC_011737	TAA	2	6	47379	47384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442479
1101	NC_011737	ATGT	2	8	47474	47481	25 %	50 %	25 %	0 %	218442479
1102	NC_011737	CTT	3	9	47495	47503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442479
1103	NC_011737	AGA	2	6	47530	47535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442479
1104	NC_011737	ACTA	2	8	47759	47766	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_011737	ACCTA	2	10	47769	47778	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1106	NC_011737	GT	3	6	47935	47940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011737	CAG	2	6	47971	47976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_011737	ACT	2	6	47983	47988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_011737	GT	3	6	47992	47997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011737	AGT	2	6	48007	48012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011737	AG	3	6	48024	48029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011737	ATT	2	6	48043	48048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011737	AT	3	6	48096	48101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011737	GAA	2	6	48136	48141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011737	CTTA	2	8	48200	48207	25 %	50 %	0 %	25 %	218442480
1116	NC_011737	TAA	2	6	48269	48274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442480
1117	NC_011737	T	6	6	48276	48281	0 %	100 %	0 %	0 %	218442480
1118	NC_011737	TAAAT	2	10	48299	48308	60 %	40 %	0 %	0 %	218442480
1119	NC_011737	TCA	2	6	48323	48328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442480
1120	NC_011737	CAG	2	6	48382	48387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442480
1121	NC_011737	ATAG	2	8	48390	48397	50 %	25 %	25 %	0 %	218442480
1122	NC_011737	CCT	2	6	48402	48407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442480
1123	NC_011737	TGA	2	6	48464	48469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442480
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1125	NC_011737	AGGA	2	8	48553	48560	50 %	0 %	50 %	0 %	218442480
1126	NC_011737	TTTGAA	2	12	48570	48581	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218442480
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1129	NC_011737	TCC	2	6	48689	48694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442480
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