MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742406

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011734	TAGT	2	8	155	162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011734	GGGT	2	8	1060	1067	0 %	25 %	75 %	0 %	218442344
3	NC_011734	TCCA	2	8	1722	1729	25 %	25 %	0 %	50 %	218442344
4	NC_011734	AGTT	2	8	2091	2098	25 %	50 %	25 %	0 %	218442344
5	NC_011734	GCTA	2	8	2369	2376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011734	TAAT	2	8	2699	2706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011734	ACTT	2	8	2728	2735	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011734	AAAG	2	8	2761	2768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011734	TTGA	2	8	3380	3387	25 %	50 %	25 %	0 %	218442345
10	NC_011734	TAAA	2	8	4325	4332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011734	AAGT	2	8	5622	5629	50 %	25 %	25 %	0 %	218442347
12	NC_011734	TAGA	2	8	5642	5649	50 %	25 %	25 %	0 %	218442347
13	NC_011734	GATT	2	8	5652	5659	25 %	50 %	25 %	0 %	218442347
14	NC_011734	TAAT	2	8	6086	6093	50 %	50 %	0 %	0 %	218442347
15	NC_011734	ATGG	2	8	7778	7785	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011734	TAAA	2	8	7810	7817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011734	CCAA	2	8	8848	8855	50 %	0 %	0 %	50 %	218442348
18	NC_011734	TCTT	2	8	8964	8971	0 %	75 %	0 %	25 %	218442348
19	NC_011734	GTTG	2	8	9046	9053	0 %	50 %	50 %	0 %	218442348
20	NC_011734	TTGG	2	8	9219	9226	0 %	50 %	50 %	0 %	218442348
21	NC_011734	CTAA	2	8	9697	9704	50 %	25 %	0 %	25 %	218442348
22	NC_011734	CTAG	2	8	9757	9764	25 %	25 %	25 %	25 %	218442348
23	NC_011734	TTTC	2	8	10052	10059	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011734	AGGA	2	8	10442	10449	50 %	0 %	50 %	0 %	218442349
25	NC_011734	TTAG	2	8	10490	10497	25 %	50 %	25 %	0 %	218442349
26	NC_011734	CCTG	2	8	11123	11130	0 %	25 %	25 %	50 %	218442350
27	NC_011734	GAGG	2	8	11262	11269	25 %	0 %	75 %	0 %	218442350
28	NC_011734	TAAC	2	8	11598	11605	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011734	ATAA	2	8	12404	12411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011734	TAAA	2	8	12698	12705	75 %	25 %	0 %	0 %	218442351
31	NC_011734	GTAG	2	8	13099	13106	25 %	25 %	50 %	0 %	218442351
32	NC_011734	ACCC	2	8	13334	13341	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_011734	AGAC	2	8	14089	14096	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011734	GGGT	2	8	14419	14426	0 %	25 %	75 %	0 %	218442353
35	NC_011734	TAAT	2	8	14521	14528	50 %	50 %	0 %	0 %	218442353
36	NC_011734	AGAA	2	8	15034	15041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.