MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742404

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011732	T	6	6	100	105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011732	T	6	6	202	207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011732	A	7	7	1717	1723	100 %	0 %	0 %	0 %	218442306
4	NC_011732	T	6	6	2253	2258	0 %	100 %	0 %	0 %	218442306
5	NC_011732	T	6	6	2352	2357	0 %	100 %	0 %	0 %	218442306
6	NC_011732	T	6	6	2394	2399	0 %	100 %	0 %	0 %	218442306
7	NC_011732	C	6	6	2555	2560	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_011732	T	6	6	2665	2670	0 %	100 %	0 %	0 %	218442307
9	NC_011732	C	6	6	2776	2781	0 %	0 %	0 %	100 %	218442307
10	NC_011732	T	6	6	2988	2993	0 %	100 %	0 %	0 %	218442307
11	NC_011732	A	7	7	3139	3145	100 %	0 %	0 %	0 %	218442307
12	NC_011732	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	218442308
13	NC_011732	T	6	6	4240	4245	0 %	100 %	0 %	0 %	218442308
14	NC_011732	T	7	7	4685	4691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011732	T	6	6	5047	5052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011732	T	8	8	5057	5064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011732	A	9	9	5111	5119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011732	T	6	6	5287	5292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011732	T	6	6	5400	5405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011732	T	7	7	5999	6005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011732	A	6	6	6081	6086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011732	A	6	6	6356	6361	100 %	0 %	0 %	0 %	218442309
23	NC_011732	A	6	6	6440	6445	100 %	0 %	0 %	0 %	218442309
24	NC_011732	T	7	7	6594	6600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011732	T	6	6	7027	7032	0 %	100 %	0 %	0 %	218442310
26	NC_011732	T	6	6	7091	7096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011732	A	8	8	7320	7327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011732	A	9	9	7365	7373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011732	A	6	6	7383	7388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011732	A	6	6	7588	7593	100 %	0 %	0 %	0 %	218442311
31	NC_011732	T	6	6	7762	7767	0 %	100 %	0 %	0 %	218442311
32	NC_011732	A	7	7	7798	7804	100 %	0 %	0 %	0 %	218442311
33	NC_011732	C	6	6	7819	7824	0 %	0 %	0 %	100 %	218442311
34	NC_011732	A	6	6	7936	7941	100 %	0 %	0 %	0 %	218442311
35	NC_011732	A	7	7	8337	8343	100 %	0 %	0 %	0 %	218442311
36	NC_011732	A	6	6	9959	9964	100 %	0 %	0 %	0 %	218442311
37	NC_011732	A	6	6	10118	10123	100 %	0 %	0 %	0 %	218442311
38	NC_011732	C	6	6	10149	10154	0 %	0 %	0 %	100 %	218442311
39	NC_011732	T	8	8	10578	10585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011732	G	6	6	11504	11509	0 %	0 %	100 %	0 %	218442312
41	NC_011732	T	6	6	13021	13026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011732	A	6	6	13234	13239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011732	T	7	7	13277	13283	0 %	100 %	0 %	0 %	218442316
44	NC_011732	T	7	7	13339	13345	0 %	100 %	0 %	0 %	218442316
45	NC_011732	A	6	6	13760	13765	100 %	0 %	0 %	0 %	218442316
46	NC_011732	T	6	6	13799	13804	0 %	100 %	0 %	0 %	218442316
47	NC_011732	T	7	7	13916	13922	0 %	100 %	0 %	0 %	218442316
48	NC_011732	A	6	6	14090	14095	100 %	0 %	0 %	0 %	218442316
49	NC_011732	T	6	6	14430	14435	0 %	100 %	0 %	0 %	218442316
50	NC_011732	T	6	6	14576	14581	0 %	100 %	0 %	0 %	218442316
51	NC_011732	A	8	8	14877	14884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011732	A	7	7	14951	14957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011732	A	7	7	15023	15029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011732	T	6	6	15977	15982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011732	T	7	7	16191	16197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011732	A	6	6	16229	16234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011732	A	6	6	16262	16267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011732	T	6	6	16537	16542	0 %	100 %	0 %	0 %	218442318
59	NC_011732	T	6	6	16557	16562	0 %	100 %	0 %	0 %	218442318
60	NC_011732	T	7	7	16747	16753	0 %	100 %	0 %	0 %	218442319
61	NC_011732	T	8	8	16867	16874	0 %	100 %	0 %	0 %	218442319
62	NC_011732	T	7	7	16940	16946	0 %	100 %	0 %	0 %	218442319
63	NC_011732	T	6	6	17105	17110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011732	T	6	6	17218	17223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011732	A	6	6	17285	17290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011732	A	6	6	17402	17407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011732	T	6	6	17427	17432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011732	A	8	8	17567	17574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011732	T	6	6	17697	17702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011732	T	7	7	17915	17921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011732	T	8	8	18119	18126	0 %	100 %	0 %	0 %	218442320
72	NC_011732	A	6	6	18185	18190	100 %	0 %	0 %	0 %	218442320
73	NC_011732	T	6	6	18364	18369	0 %	100 %	0 %	0 %	218442320
74	NC_011732	T	6	6	18411	18416	0 %	100 %	0 %	0 %	218442320
75	NC_011732	A	6	6	19221	19226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011732	C	6	6	19463	19468	0 %	0 %	0 %	100 %	218442322
77	NC_011732	T	6	6	19569	19574	0 %	100 %	0 %	0 %	218442322
78	NC_011732	T	6	6	19979	19984	0 %	100 %	0 %	0 %	218442322
79	NC_011732	T	6	6	20951	20956	0 %	100 %	0 %	0 %	218442323
80	NC_011732	A	6	6	21209	21214	100 %	0 %	0 %	0 %	218442323
81	NC_011732	A	6	6	21371	21376	100 %	0 %	0 %	0 %	218442323
82	NC_011732	A	6	6	21727	21732	100 %	0 %	0 %	0 %	218442324

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.