MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742403

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011730	TAACT	2	10	1760	1769	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011730	ATATA	2	10	3119	3128	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011730	TTCTA	2	10	4698	4707	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011730	CAAAA	2	10	5290	5299	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011730	ACCAA	2	10	5679	5688	60 %	0 %	0 %	40 %	218442251
6	NC_011730	TCAAA	2	10	5860	5869	60 %	20 %	0 %	20 %	218442251
7	NC_011730	AAATT	2	10	8184	8193	60 %	40 %	0 %	0 %	218442251
8	NC_011730	GATGG	2	10	9739	9748	20 %	20 %	60 %	0 %	218442252
9	NC_011730	GGAAA	2	10	11562	11571	60 %	0 %	40 %	0 %	218442252
10	NC_011730	CATTT	2	10	13992	14001	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011730	TTGAG	2	10	16422	16431	20 %	40 %	40 %	0 %	218442258
12	NC_011730	TTTTG	2	10	18865	18874	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011730	AAAAG	2	10	20350	20359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011730	ATCAA	2	10	20548	20557	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011730	TATGT	2	10	21796	21805	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011730	CAAAA	2	10	24748	24757	80 %	0 %	0 %	20 %	218442266
17	NC_011730	TTTTG	2	10	25047	25056	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011730	AAGAA	2	10	27007	27016	80 %	0 %	20 %	0 %	218442267
19	NC_011730	GAGAT	2	10	27190	27199	40 %	20 %	40 %	0 %	218442267

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.