MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 126376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011729	AAC	2	6	184175	184180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437175
4002	NC_011729	GGC	2	6	184207	184212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437175
4003	NC_011729	GTG	2	6	184251	184256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437175
4004	NC_011729	TCC	2	6	184281	184286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437175
4005	NC_011729	ATG	2	6	184406	184411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437175
4006	NC_011729	CTG	2	6	184473	184478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437175
4007	NC_011729	AGT	2	6	184480	184485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437175
4008	NC_011729	GCG	2	6	184557	184562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437175
4009	NC_011729	ATT	2	6	184609	184614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437175
4010	NC_011729	TTG	2	6	184641	184646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437175
4011	NC_011729	GAA	2	6	184751	184756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437175
4012	NC_011729	TCT	3	9	184799	184807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437175
4013	NC_011729	TGG	2	6	184843	184848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437175
4014	NC_011729	GAA	2	6	184880	184885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437175
4015	NC_011729	GTG	2	6	184905	184910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437175
4016	NC_011729	CTG	2	6	185073	185078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437175
4017	NC_011729	TGC	2	6	185119	185124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437175
4018	NC_011729	TCT	2	6	185147	185152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437175
4019	NC_011729	AGG	2	6	185262	185267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_011729	AGA	2	6	185275	185280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_011729	CTT	2	6	185320	185325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_011729	AGC	2	6	185353	185358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_011729	AGA	2	6	185441	185446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437176
4024	NC_011729	AGA	2	6	185486	185491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437176
4025	NC_011729	CGG	2	6	185617	185622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437176
4026	NC_011729	ATT	2	6	185706	185711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437176
4027	NC_011729	AGC	2	6	185719	185724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_011729	TTAAAT	2	12	185765	185776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_011729	TTA	2	6	185777	185782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_011729	AT	3	6	185813	185818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_011729	TAGA	2	8	185829	185836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_011729	GAA	2	6	185942	185947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437177
4033	NC_011729	ATT	2	6	185975	185980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437177
4034	NC_011729	CTG	2	6	186002	186007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437177
4035	NC_011729	AAG	2	6	186012	186017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437177
4036	NC_011729	GAA	2	6	186068	186073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437177
4037	NC_011729	CATA	2	8	186390	186397	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_011729	CAT	2	6	186456	186461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_011729	AAAC	2	8	186462	186469	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_011729	ACT	3	9	186557	186565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437178
4041	NC_011729	CAA	2	6	186625	186630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437178
4042	NC_011729	GGTT	2	8	186644	186651	0 %	50 %	50 %	0 %	218437178
4043	NC_011729	TCA	2	6	186657	186662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437178
4044	NC_011729	CTA	2	6	186684	186689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437178
4045	NC_011729	TCA	2	6	186696	186701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437178
4046	NC_011729	GCT	2	6	186713	186718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437178
4047	NC_011729	CCT	2	6	186719	186724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437178
4048	NC_011729	ACA	2	6	186777	186782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437178
4049	NC_011729	GTT	2	6	186797	186802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437178
4050	NC_011729	CTT	2	6	186804	186809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437178
4051	NC_011729	TAG	2	6	186894	186899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437178
4052	NC_011729	CTT	2	6	186907	186912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437178
4053	NC_011729	GTC	2	6	186936	186941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437178
4054	NC_011729	TTCT	2	8	187051	187058	0 %	75 %	0 %	25 %	218437178
4055	NC_011729	ACA	2	6	187122	187127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437178
4056	NC_011729	GGT	2	6	187172	187177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437178
4057	NC_011729	AAG	3	9	187275	187283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437178
4058	NC_011729	ACA	2	6	187290	187295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437178
4059	NC_011729	AGC	2	6	187300	187305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437178
4060	NC_011729	CAA	2	6	187348	187353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437178
4061	NC_011729	CTT	3	9	187369	187377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437178
4062	NC_011729	TTCAAC	2	12	187451	187462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437178
4063	NC_011729	TCA	2	6	187491	187496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437178
4064	NC_011729	AAT	2	6	187646	187651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_011729	CT	3	6	187664	187669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4066	NC_011729	GTT	2	6	187693	187698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_011729	ATAA	2	8	187756	187763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_011729	TGG	2	6	187828	187833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_011729	ATTAT	2	10	187856	187865	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_011729	TAA	2	6	187944	187949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437179
4071	NC_011729	TGC	2	6	188014	188019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437179
4072	NC_011729	TCT	2	6	188045	188050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437179
4073	NC_011729	TTC	2	6	188065	188070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437179
4074	NC_011729	ATA	2	6	188080	188085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437179
4075	NC_011729	CGT	2	6	188099	188104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437179
4076	NC_011729	TTA	2	6	188105	188110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437179
4077	NC_011729	GTT	2	6	188162	188167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437179
4078	NC_011729	CTG	2	6	188175	188180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437179
4079	NC_011729	GTAAAA	2	12	188196	188207	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218437179
4080	NC_011729	ACTAAA	2	12	188212	188223	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218437179
4081	NC_011729	ATC	2	6	188239	188244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437179
4082	NC_011729	CAT	2	6	188283	188288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437179
4083	NC_011729	AAT	2	6	188303	188308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437179
4084	NC_011729	AAT	2	6	188324	188329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437179
4085	NC_011729	CT	3	6	188414	188419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_011729	AAT	2	6	188472	188477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_011729	T	7	7	188550	188556	0 %	100 %	0 %	0 %	218437180
4088	NC_011729	AG	3	6	188587	188592	50 %	0 %	50 %	0 %	218437180
4089	NC_011729	TCT	2	6	188610	188615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437180
4090	NC_011729	TCCCC	2	10	188751	188760	0 %	20 %	0 %	80 %	218437180
4091	NC_011729	AAT	2	6	188924	188929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437180
4092	NC_011729	CGG	2	6	188952	188957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437180
4093	NC_011729	C	6	6	189031	189036	0 %	0 %	0 %	100 %	218437180
4094	NC_011729	CGG	2	6	189109	189114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437180
4095	NC_011729	TCA	2	6	189210	189215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437180
4096	NC_011729	A	6	6	189224	189229	100 %	0 %	0 %	0 %	218437180
4097	NC_011729	T	7	7	189234	189240	0 %	100 %	0 %	0 %	218437180
4098	NC_011729	TTC	2	6	189248	189253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437180
4099	NC_011729	TCA	2	6	189297	189302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437180
4100	NC_011729	GGA	2	6	189332	189337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437180
4101	NC_011729	TGA	2	6	189402	189407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437180
4102	NC_011729	AAT	2	6	189424	189429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437180
4103	NC_011729	TTG	2	6	189551	189556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437180
4104	NC_011729	AGAT	2	8	189581	189588	50 %	25 %	25 %	0 %	218437180
4105	NC_011729	CCA	2	6	189600	189605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218437180
4106	NC_011729	TCC	2	6	189630	189635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437180
4107	NC_011729	GCG	3	9	189654	189662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437180
4108	NC_011729	TCA	2	6	189669	189674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437180
4109	NC_011729	CTT	2	6	189787	189792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437180
4110	NC_011729	T	6	6	189856	189861	0 %	100 %	0 %	0 %	218437180
4111	NC_011729	A	7	7	189920	189926	100 %	0 %	0 %	0 %	218437180
4112	NC_011729	CAT	2	6	189931	189936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437180
4113	NC_011729	CAA	2	6	189973	189978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437180
4114	NC_011729	TGA	2	6	190108	190113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437180
4115	NC_011729	TGT	3	9	190151	190159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_011729	AAT	2	6	190176	190181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_011729	CAA	2	6	190227	190232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_011729	CTT	2	6	190283	190288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437181
4119	NC_011729	GAC	2	6	190329	190334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437181
4120	NC_011729	TGC	2	6	190391	190396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437181
4121	NC_011729	TTCT	2	8	190444	190451	0 %	75 %	0 %	25 %	218437181
4122	NC_011729	T	7	7	190459	190465	0 %	100 %	0 %	0 %	218437181
4123	NC_011729	TGA	2	6	190470	190475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437181
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