MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 126376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011729	AGC	2	6	161623	161628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437157
3502	NC_011729	TGA	2	6	161634	161639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437157
3503	NC_011729	TAT	2	6	161647	161652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437157
3504	NC_011729	CT	3	6	161682	161687	0 %	50 %	0 %	50 %	218437157
3505	NC_011729	ACC	2	6	161716	161721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218437157
3506	NC_011729	ACT	2	6	161722	161727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437157
3507	NC_011729	CTATA	2	10	161784	161793	40 %	40 %	0 %	20 %	218437157
3508	NC_011729	ACC	2	6	161920	161925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218437157
3509	NC_011729	TAG	2	6	161987	161992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437157
3510	NC_011729	TGC	2	6	162045	162050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437157
3511	NC_011729	GA	3	6	162065	162070	50 %	0 %	50 %	0 %	218437157
3512	NC_011729	GA	3	6	162105	162110	50 %	0 %	50 %	0 %	218437157
3513	NC_011729	GAA	2	6	162118	162123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437157
3514	NC_011729	ATTT	2	8	162127	162134	25 %	75 %	0 %	0 %	218437157
3515	NC_011729	TCA	2	6	162137	162142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437157
3516	NC_011729	TAA	2	6	162171	162176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437157
3517	NC_011729	AGA	2	6	162225	162230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437157
3518	NC_011729	GAG	2	6	162242	162247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437157
3519	NC_011729	GGATT	2	10	162337	162346	20 %	40 %	40 %	0 %	218437157
3520	NC_011729	TAAT	2	8	162422	162429	50 %	50 %	0 %	0 %	218437157
3521	NC_011729	ATT	2	6	162454	162459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437157
3522	NC_011729	GATC	2	8	162513	162520	25 %	25 %	25 %	25 %	218437157
3523	NC_011729	CAA	2	6	162556	162561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437157
3524	NC_011729	ATTA	2	8	162568	162575	50 %	50 %	0 %	0 %	218437157
3525	NC_011729	GATAAT	2	12	162625	162636	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218437157
3526	NC_011729	GATC	2	8	162699	162706	25 %	25 %	25 %	25 %	218437157
3527	NC_011729	ATC	2	6	162794	162799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437157
3528	NC_011729	CT	3	6	162837	162842	0 %	50 %	0 %	50 %	218437157
3529	NC_011729	ATTAT	2	10	162905	162914	40 %	60 %	0 %	0 %	218437157
3530	NC_011729	G	6	6	163076	163081	0 %	0 %	100 %	0 %	218437157
3531	NC_011729	GAT	2	6	163093	163098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437157
3532	NC_011729	TGG	2	6	163123	163128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437157
3533	NC_011729	GAT	2	6	163144	163149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437157
3534	NC_011729	ATG	2	6	163322	163327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437157
3535	NC_011729	CGCTTC	2	12	163348	163359	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	218437157
3536	NC_011729	ATGG	2	8	163371	163378	25 %	25 %	50 %	0 %	218437157
3537	NC_011729	CGG	2	6	163379	163384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437157
3538	NC_011729	GAA	2	6	163438	163443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437157
3539	NC_011729	CTC	2	6	163463	163468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437157
3540	NC_011729	ATT	2	6	163474	163479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437157
3541	NC_011729	ATG	2	6	163484	163489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437157
3542	NC_011729	ATC	2	6	163526	163531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437157
3543	NC_011729	TGA	3	9	163533	163541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437157
3544	NC_011729	TCG	2	6	163602	163607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437157
3545	NC_011729	CCTGC	2	10	163615	163624	0 %	20 %	20 %	60 %	218437157
3546	NC_011729	TAA	2	6	163686	163691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437157
3547	NC_011729	GGT	2	6	163707	163712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437157
3548	NC_011729	TGG	2	6	163725	163730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437157
3549	NC_011729	ACA	2	6	163953	163958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_011729	AAAAT	2	10	163961	163970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_011729	T	6	6	164013	164018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_011729	AT	3	6	164023	164028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_011729	TC	3	6	164031	164036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_011729	A	6	6	164043	164048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_011729	T	6	6	164067	164072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_011729	A	6	6	164077	164082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_011729	T	7	7	164097	164103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_011729	AATT	2	8	164167	164174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_011729	TCT	2	6	164242	164247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437158
3560	NC_011729	GAT	2	6	164273	164278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437158
3561	NC_011729	GACT	2	8	164298	164305	25 %	25 %	25 %	25 %	218437158
3562	NC_011729	ATG	2	6	164340	164345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437158
3563	NC_011729	ATT	2	6	164359	164364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437158
3564	NC_011729	TTG	2	6	164469	164474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437158
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3566	NC_011729	GTA	2	6	164571	164576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437158
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3571	NC_011729	GCA	2	6	164712	164717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437158
3572	NC_011729	ATTT	2	8	164748	164755	25 %	75 %	0 %	0 %	218437158
3573	NC_011729	AGA	2	6	164779	164784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437158
3574	NC_011729	ATT	2	6	164790	164795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437158
3575	NC_011729	T	6	6	164794	164799	0 %	100 %	0 %	0 %	218437158
3576	NC_011729	CCG	2	6	164868	164873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218437158
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3578	NC_011729	ATTTA	2	10	165088	165097	40 %	60 %	0 %	0 %	218437158
3579	NC_011729	GACT	2	8	165151	165158	25 %	25 %	25 %	25 %	218437158
3580	NC_011729	TGGTT	2	10	165167	165176	0 %	60 %	40 %	0 %	218437158
3581	NC_011729	TGT	2	6	165180	165185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437158
3582	NC_011729	TA	5	10	165199	165208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_011729	TTA	2	6	165245	165250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_011729	C	6	6	165383	165388	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3585	NC_011729	C	6	6	165391	165396	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3586	NC_011729	G	6	6	165404	165409	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_011729	AAAT	2	8	165420	165427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_011729	TCTA	2	8	165463	165470	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3589	NC_011729	A	6	6	165488	165493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_011729	TAA	2	6	165498	165503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_011729	CTA	2	6	165531	165536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_011729	A	6	6	165551	165556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_011729	TCT	3	9	165559	165567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_011729	C	7	7	165570	165576	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3595	NC_011729	GAAA	2	8	165580	165587	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_011729	CT	3	6	165596	165601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3597	NC_011729	CCT	2	6	165632	165637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_011729	ATT	2	6	165659	165664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437159
3599	NC_011729	GATA	2	8	165710	165717	50 %	25 %	25 %	0 %	218437159
3600	NC_011729	ATC	2	6	165727	165732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437159
3601	NC_011729	CTG	3	9	165785	165793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437159
3602	NC_011729	AAT	2	6	165819	165824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437159
3603	NC_011729	CAAA	2	8	165883	165890	75 %	0 %	0 %	25 %	218437159
3604	NC_011729	TTCT	2	8	165896	165903	0 %	75 %	0 %	25 %	218437159
3605	NC_011729	AGTAA	2	10	165928	165937	60 %	20 %	20 %	0 %	218437159
3606	NC_011729	TAG	2	6	166007	166012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437159
3607	NC_011729	A	6	6	166019	166024	100 %	0 %	0 %	0 %	218437159
3608	NC_011729	AGT	2	6	166062	166067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437159
3609	NC_011729	T	6	6	166100	166105	0 %	100 %	0 %	0 %	218437159
3610	NC_011729	TTAAAG	2	12	166166	166177	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218437159
3611	NC_011729	CAT	2	6	166235	166240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437159
3612	NC_011729	GCG	2	6	166291	166296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437159
3613	NC_011729	A	7	7	166328	166334	100 %	0 %	0 %	0 %	218437159
3614	NC_011729	CAT	2	6	166395	166400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437159
3615	NC_011729	GCC	2	6	166464	166469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218437159
3616	NC_011729	C	6	6	166468	166473	0 %	0 %	0 %	100 %	218437159
3617	NC_011729	CGT	2	6	166537	166542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437159
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3619	NC_011729	AG	4	8	166561	166568	50 %	0 %	50 %	0 %	218437159
3620	NC_011729	ACCAA	2	10	166632	166641	60 %	0 %	0 %	40 %	218437159
3621	NC_011729	A	6	6	166651	166656	100 %	0 %	0 %	0 %	218437159
3622	NC_011729	TGAA	2	8	166722	166729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_011729	AAT	2	6	166743	166748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437160
3624	NC_011729	TGT	2	6	166752	166757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437160
3625	NC_011729	TCA	2	6	166773	166778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437160
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