MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 126376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011729	ATT	2	6	138398	138403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437129
3002	NC_011729	TCC	2	6	138461	138466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437129
3003	NC_011729	GAT	2	6	138519	138524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437129
3004	NC_011729	TGA	2	6	138526	138531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437129
3005	NC_011729	GAT	2	6	138539	138544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437129
3006	NC_011729	TGGG	2	8	138594	138601	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_011729	AAT	3	9	138705	138713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437130
3008	NC_011729	GAA	2	6	138786	138791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437130
3009	NC_011729	GTT	2	6	138801	138806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437130
3010	NC_011729	T	6	6	138819	138824	0 %	100 %	0 %	0 %	218437130
3011	NC_011729	TCA	2	6	138827	138832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437130
3012	NC_011729	TGC	2	6	138842	138847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437130
3013	NC_011729	ATG	2	6	138850	138855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437130
3014	NC_011729	GTTG	2	8	138939	138946	0 %	50 %	50 %	0 %	218437130
3015	NC_011729	A	7	7	138983	138989	100 %	0 %	0 %	0 %	218437130
3016	NC_011729	AGT	2	6	139056	139061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437130
3017	NC_011729	TTG	2	6	139111	139116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437130
3018	NC_011729	TCT	2	6	139140	139145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437130
3019	NC_011729	T	6	6	139145	139150	0 %	100 %	0 %	0 %	218437130
3020	NC_011729	A	6	6	139156	139161	100 %	0 %	0 %	0 %	218437130
3021	NC_011729	TAAAAA	2	12	139166	139177	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	218437130
3022	NC_011729	T	6	6	139178	139183	0 %	100 %	0 %	0 %	218437130
3023	NC_011729	AATTC	2	10	139203	139212	40 %	40 %	0 %	20 %	218437130
3024	NC_011729	AGA	2	6	139270	139275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437130
3025	NC_011729	T	6	6	139285	139290	0 %	100 %	0 %	0 %	218437130
3026	NC_011729	ATT	2	6	139364	139369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437130
3027	NC_011729	ATA	2	6	139393	139398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437130
3028	NC_011729	TGA	2	6	139400	139405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437130
3029	NC_011729	TTGT	2	8	139474	139481	0 %	75 %	25 %	0 %	218437130
3030	NC_011729	TTTAAT	2	12	139499	139510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437130
3031	NC_011729	GAA	2	6	139512	139517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437130
3032	NC_011729	TCT	2	6	139581	139586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437130
3033	NC_011729	ATTT	2	8	139592	139599	25 %	75 %	0 %	0 %	218437130
3034	NC_011729	ATC	2	6	139639	139644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437130
3035	NC_011729	TAAA	2	8	139669	139676	75 %	25 %	0 %	0 %	218437130
3036	NC_011729	ATG	2	6	139708	139713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437130
3037	NC_011729	AATAGG	2	12	139727	139738	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218437130
3038	NC_011729	AGA	2	6	139760	139765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437130
3039	NC_011729	AGAA	2	8	139856	139863	75 %	0 %	25 %	0 %	218437131
3040	NC_011729	ATT	2	6	139872	139877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437131
3041	NC_011729	ATT	2	6	139950	139955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437131
3042	NC_011729	ACAA	2	8	140011	140018	75 %	0 %	0 %	25 %	218437131
3043	NC_011729	TAG	2	6	140036	140041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437131
3044	NC_011729	TTAT	2	8	140117	140124	25 %	75 %	0 %	0 %	218437131
3045	NC_011729	AAAC	2	8	140171	140178	75 %	0 %	0 %	25 %	218437131
3046	NC_011729	ATT	2	6	140185	140190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437131
3047	NC_011729	GTT	2	6	140295	140300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437131
3048	NC_011729	TGT	2	6	140303	140308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437131
3049	NC_011729	GCG	2	6	140337	140342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437131
3050	NC_011729	TAA	2	6	140369	140374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437131
3051	NC_011729	A	6	6	140373	140378	100 %	0 %	0 %	0 %	218437131
3052	NC_011729	AG	3	6	140382	140387	50 %	0 %	50 %	0 %	218437131
3053	NC_011729	GAT	2	6	140412	140417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437131
3054	NC_011729	TTTC	2	8	140424	140431	0 %	75 %	0 %	25 %	218437131
3055	NC_011729	GAT	3	9	140433	140441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437131
3056	NC_011729	A	9	9	140445	140453	100 %	0 %	0 %	0 %	218437131
3057	NC_011729	T	6	6	140462	140467	0 %	100 %	0 %	0 %	218437131
3058	NC_011729	TTA	2	6	140521	140526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437131
3059	NC_011729	TC	3	6	140535	140540	0 %	50 %	0 %	50 %	218437131
3060	NC_011729	AAAT	2	8	140556	140563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_011729	CCTA	2	8	140586	140593	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_011729	TGT	2	6	140600	140605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_011729	TAT	2	6	140620	140625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_011729	AGAA	2	8	140629	140636	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_011729	A	7	7	140635	140641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_011729	CCCCTT	2	12	140664	140675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_011729	CCCCA	2	10	140678	140687	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3068	NC_011729	GAATTT	2	12	140738	140749	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218437132
3069	NC_011729	CAT	2	6	140783	140788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437132
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3071	NC_011729	TTC	2	6	140865	140870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437132
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3073	NC_011729	CAT	2	6	140916	140921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437132
3074	NC_011729	TCT	2	6	140932	140937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437132
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3076	NC_011729	TGATAA	2	12	141145	141156	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218437132
3077	NC_011729	GTGG	2	8	141208	141215	0 %	25 %	75 %	0 %	218437132
3078	NC_011729	ATA	2	6	141302	141307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437132
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3080	NC_011729	GAA	2	6	141331	141336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_011729	AAT	2	6	141338	141343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_011729	ATG	2	6	141364	141369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_011729	GA	4	8	141400	141407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_011729	GCA	2	6	141421	141426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3088	NC_011729	TTA	2	6	141573	141578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437133
3089	NC_011729	ATT	2	6	141597	141602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437133
3090	NC_011729	CAA	2	6	141606	141611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437133
3091	NC_011729	TAA	2	6	141740	141745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437133
3092	NC_011729	A	6	6	141758	141763	100 %	0 %	0 %	0 %	218437133
3093	NC_011729	ATT	2	6	141831	141836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437133
3094	NC_011729	CCT	2	6	141839	141844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437133
3095	NC_011729	TTA	2	6	141885	141890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437133
3096	NC_011729	CAT	2	6	142039	142044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437133
3097	NC_011729	AAAG	2	8	142149	142156	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_011729	AAT	2	6	142184	142189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_011729	GAA	2	6	142216	142221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_011729	CAAA	2	8	142319	142326	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3101	NC_011729	T	7	7	142360	142366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_011729	A	7	7	142386	142392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_011729	TCT	2	6	142397	142402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_011729	CGG	2	6	142450	142455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_011729	CCT	2	6	142466	142471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_011729	CAAAA	2	10	142571	142580	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3107	NC_011729	ATA	2	6	142628	142633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437134
3108	NC_011729	CCA	2	6	142662	142667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218437134
3109	NC_011729	TTG	2	6	142725	142730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437134
3110	NC_011729	CCA	2	6	142736	142741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218437134
3111	NC_011729	TGA	2	6	142810	142815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437134
3112	NC_011729	CCG	2	6	142965	142970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218437134
3113	NC_011729	A	6	6	142992	142997	100 %	0 %	0 %	0 %	218437134
3114	NC_011729	CATT	2	8	143040	143047	25 %	50 %	0 %	25 %	218437134
3115	NC_011729	TAA	2	6	143110	143115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437134
3116	NC_011729	TCAAA	2	10	143122	143131	60 %	20 %	0 %	20 %	218437134
3117	NC_011729	AAT	2	6	143191	143196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437134
3118	NC_011729	TTTG	2	8	143291	143298	0 %	75 %	25 %	0 %	218437134
3119	NC_011729	A	6	6	143344	143349	100 %	0 %	0 %	0 %	218437135
3120	NC_011729	ATT	2	6	143458	143463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437135
3121	NC_011729	AAG	2	6	143494	143499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_011729	A	8	8	143545	143552	100 %	0 %	0 %	0 %	218437136
3123	NC_011729	TTG	2	6	143648	143653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437136
3124	NC_011729	T	7	7	143672	143678	0 %	100 %	0 %	0 %	218437136
3125	NC_011729	ACAAA	2	10	143709	143718	80 %	0 %	0 %	20 %	218437136
3126	NC_011729	AAC	2	6	143726	143731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437136
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