MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 126376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_011729	TTTAG	2	10	232712	232721	20 %	60 %	20 %	0 %	218437219
5003	NC_011729	GA	3	6	232729	232734	50 %	0 %	50 %	0 %	218437219
5004	NC_011729	CTC	2	6	232757	232762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437219
5005	NC_011729	CGG	2	6	232770	232775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437219
5006	NC_011729	TAG	2	6	232803	232808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437219
5007	NC_011729	CTC	2	6	232824	232829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437219
5008	NC_011729	ATT	2	6	232838	232843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437219
5009	NC_011729	ATT	2	6	232866	232871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437219
5010	NC_011729	TTA	2	6	232955	232960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437219
5011	NC_011729	CT	3	6	233001	233006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_011729	A	6	6	233184	233189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_011729	TAA	2	6	233191	233196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_011729	TC	3	6	233317	233322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_011729	A	6	6	233334	233339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_011729	GCT	2	6	233348	233353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_011729	T	7	7	233353	233359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_011729	TTTC	2	8	233363	233370	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_011729	AGAGGT	2	12	233371	233382	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_011729	ATT	2	6	233391	233396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_011729	T	6	6	233447	233452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_011729	TTA	2	6	233468	233473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_011729	A	7	7	233473	233479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_011729	ACA	2	6	233546	233551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437220
5025	NC_011729	ATT	2	6	233577	233582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437220
5026	NC_011729	TAAT	2	8	233704	233711	50 %	50 %	0 %	0 %	218437220
5027	NC_011729	GAA	3	9	233751	233759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437220
5028	NC_011729	CAACT	2	10	233764	233773	40 %	20 %	0 %	40 %	218437220
5029	NC_011729	CT	3	6	233782	233787	0 %	50 %	0 %	50 %	218437220
5030	NC_011729	GAA	2	6	233871	233876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437220
5031	NC_011729	GGA	2	6	233919	233924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437220
5032	NC_011729	TCT	2	6	233951	233956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437220
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5037	NC_011729	ACC	2	6	234104	234109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218437220
5038	NC_011729	ATT	2	6	234123	234128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437220
5039	NC_011729	AATT	2	8	234157	234164	50 %	50 %	0 %	0 %	218437220
5040	NC_011729	TAT	2	6	234182	234187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437220
5041	NC_011729	AAT	2	6	234407	234412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437221
5042	NC_011729	AAT	2	6	234461	234466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437221
5043	NC_011729	GT	3	6	234501	234506	0 %	50 %	50 %	0 %	218437221
5044	NC_011729	GAA	2	6	234553	234558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437221
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5046	NC_011729	ATC	2	6	234644	234649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437221
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5048	NC_011729	TTC	2	6	234683	234688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437221
5049	NC_011729	TCA	2	6	234780	234785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437221
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5051	NC_011729	TGT	2	6	234819	234824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437221
5052	NC_011729	AT	3	6	234951	234956	50 %	50 %	0 %	0 %	218437221
5053	NC_011729	TGC	2	6	234968	234973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437221
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5055	NC_011729	C	6	6	235009	235014	0 %	0 %	0 %	100 %	218437221
5056	NC_011729	CTCG	2	8	235050	235057	0 %	25 %	25 %	50 %	218437221
5057	NC_011729	TAA	2	6	235073	235078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437221
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5059	NC_011729	TAA	2	6	235097	235102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437221
5060	NC_011729	CTG	2	6	235139	235144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437221
5061	NC_011729	TCT	2	6	235158	235163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437221
5062	NC_011729	TCT	2	6	235188	235193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437221
5063	NC_011729	TGA	2	6	235215	235220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437221
5064	NC_011729	TTC	2	6	235238	235243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437221
5065	NC_011729	TTG	2	6	235247	235252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437221
5066	NC_011729	TCG	2	6	235298	235303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437221
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5075	NC_011729	TCA	2	6	236036	236041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437222
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5077	NC_011729	TTA	3	9	236124	236132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5079	NC_011729	TGA	2	6	236293	236298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_011729	GTAA	2	8	236304	236311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_011729	T	7	7	236388	236394	0 %	100 %	0 %	0 %	218437224
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5089	NC_011729	CTTT	2	8	236877	236884	0 %	75 %	0 %	25 %	218437224
5090	NC_011729	GTT	2	6	237038	237043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437224
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5092	NC_011729	ATG	2	6	237164	237169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437224
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5095	NC_011729	AAT	2	6	237282	237287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_011729	TCG	2	6	237336	237341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5099	NC_011729	ATTA	2	8	237429	237436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_011729	ATTG	2	8	237478	237485	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_011729	T	7	7	237495	237501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5105	NC_011729	CAA	2	6	237745	237750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437225
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5108	NC_011729	CTT	2	6	237802	237807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437225
5109	NC_011729	TTAA	2	8	237821	237828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_011729	A	7	7	237827	237833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_011729	ATT	2	6	237929	237934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_011729	T	7	7	238009	238015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_011729	A	6	6	238098	238103	100 %	0 %	0 %	0 %	218437226
5114	NC_011729	ACG	2	6	238130	238135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437226
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5118	NC_011729	TTA	2	6	238230	238235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437226
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5120	NC_011729	ATA	2	6	238289	238294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437226
5121	NC_011729	A	6	6	238316	238321	100 %	0 %	0 %	0 %	218437226
5122	NC_011729	A	7	7	238344	238350	100 %	0 %	0 %	0 %	218437226
5123	NC_011729	ACA	2	6	238450	238455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437226
5124	NC_011729	TTC	2	6	238490	238495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437226
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5253	NC_011729	GCG	2	6	244077	244082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437231
5254	NC_011729	ACC	2	6	244087	244092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218437231
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5369	NC_011729	CTTTTA	2	12	248562	248573	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218437236
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5371	NC_011729	A	7	7	248688	248694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5372	NC_011729	AACT	2	8	248699	248706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5373	NC_011729	CAA	2	6	248970	248975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437237
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