MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 96488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011726	GTT	2	6	193644	193649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245086
4002	NC_011726	TTG	2	6	193704	193709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245086
4003	NC_011726	GTT	2	6	193721	193726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245086
4004	NC_011726	CTT	2	6	193748	193753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245086
4005	NC_011726	TAAA	2	8	193863	193870	75 %	25 %	0 %	0 %	218245086
4006	NC_011726	AAAG	2	8	193876	193883	75 %	0 %	25 %	0 %	218245086
4007	NC_011726	G	6	6	193908	193913	0 %	0 %	100 %	0 %	218245086
4008	NC_011726	TTAA	2	8	193936	193943	50 %	50 %	0 %	0 %	218245086
4009	NC_011726	CTA	2	6	194024	194029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245086
4010	NC_011726	CTT	2	6	194078	194083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245086
4011	NC_011726	A	7	7	194098	194104	100 %	0 %	0 %	0 %	218245086
4012	NC_011726	CCA	2	6	194163	194168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_011726	TAT	2	6	194175	194180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_011726	ATT	2	6	194193	194198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_011726	TTC	2	6	194242	194247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_011726	TAA	2	6	194260	194265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_011726	AAAG	2	8	194326	194333	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_011726	AGATG	2	10	194361	194370	40 %	20 %	40 %	0 %	218245087
4019	NC_011726	T	7	7	194474	194480	0 %	100 %	0 %	0 %	218245087
4020	NC_011726	TCT	2	6	194482	194487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245087
4021	NC_011726	ATC	2	6	194492	194497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245087
4022	NC_011726	A	6	6	194521	194526	100 %	0 %	0 %	0 %	218245087
4023	NC_011726	GAA	2	6	194548	194553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245087
4024	NC_011726	ATT	2	6	194573	194578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245087
4025	NC_011726	ATT	2	6	194608	194613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245087
4026	NC_011726	TGA	2	6	194628	194633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245087
4027	NC_011726	AC	3	6	194694	194699	50 %	0 %	0 %	50 %	218245087
4028	NC_011726	GTTT	2	8	194841	194848	0 %	75 %	25 %	0 %	218245087
4029	NC_011726	TTA	2	6	194849	194854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245087
4030	NC_011726	AGA	2	6	194880	194885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245087
4031	NC_011726	ACC	2	6	195022	195027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245087
4032	NC_011726	GCC	2	6	195083	195088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218245087
4033	NC_011726	G	7	7	195181	195187	0 %	0 %	100 %	0 %	218245087
4034	NC_011726	ATA	2	6	195215	195220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245087
4035	NC_011726	TGC	2	6	195237	195242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245087
4036	NC_011726	TTATT	2	10	195327	195336	20 %	80 %	0 %	0 %	218245087
4037	NC_011726	TAT	2	6	195420	195425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245087
4038	NC_011726	CCTC	2	8	195463	195470	0 %	25 %	0 %	75 %	218245087
4039	NC_011726	G	6	6	195528	195533	0 %	0 %	100 %	0 %	218245087
4040	NC_011726	TCGGT	2	10	195536	195545	0 %	40 %	40 %	20 %	218245087
4041	NC_011726	GGT	2	6	195793	195798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245088
4042	NC_011726	G	6	6	195821	195826	0 %	0 %	100 %	0 %	218245088
4043	NC_011726	GAA	2	6	195878	195883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245088
4044	NC_011726	GGA	2	6	195934	195939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245088
4045	NC_011726	GGT	2	6	195961	195966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245088
4046	NC_011726	AAG	2	6	196011	196016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245088
4047	NC_011726	CCG	2	6	196045	196050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218245088
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4049	NC_011726	A	6	6	196113	196118	100 %	0 %	0 %	0 %	218245088
4050	NC_011726	ATT	2	6	196159	196164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245088
4051	NC_011726	GTC	2	6	196167	196172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245088
4052	NC_011726	ATC	2	6	196185	196190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245088
4053	NC_011726	AGT	2	6	196214	196219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245088
4054	NC_011726	GCA	3	9	196238	196246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245088
4055	NC_011726	AGA	2	6	196291	196296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245088
4056	NC_011726	CAA	2	6	196343	196348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245088
4057	NC_011726	ACTT	2	8	196362	196369	25 %	50 %	0 %	25 %	218245088
4058	NC_011726	ATT	2	6	196376	196381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245088
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4060	NC_011726	A	6	6	196535	196540	100 %	0 %	0 %	0 %	218245088
4061	NC_011726	AAT	2	6	196575	196580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_011726	AAC	2	6	196588	196593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_011726	CTT	4	12	196639	196650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245089
4064	NC_011726	TCA	2	6	196696	196701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245089
4065	NC_011726	GTA	2	6	196707	196712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245089
4066	NC_011726	TACC	2	8	196774	196781	25 %	25 %	0 %	50 %	218245089
4067	NC_011726	GTT	2	6	196803	196808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245089
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4074	NC_011726	ATT	2	6	197057	197062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245089
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4076	NC_011726	ATA	2	6	197083	197088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245089
4077	NC_011726	A	7	7	197122	197128	100 %	0 %	0 %	0 %	218245089
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4079	NC_011726	TA	3	6	197198	197203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_011726	ACAA	2	8	197223	197230	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4081	NC_011726	ATA	2	6	197257	197262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_011726	ATTG	2	8	197406	197413	25 %	50 %	25 %	0 %	218245090
4083	NC_011726	TTC	2	6	197500	197505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245090
4084	NC_011726	CAAT	2	8	197600	197607	50 %	25 %	0 %	25 %	218245090
4085	NC_011726	TTGTT	2	10	197617	197626	0 %	80 %	20 %	0 %	218245090
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4087	NC_011726	ATT	2	6	197778	197783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_011726	AT	3	6	197795	197800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_011726	TAA	2	6	197819	197824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_011726	GTTTC	2	10	197901	197910	0 %	60 %	20 %	20 %	218245091
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4092	NC_011726	A	7	7	197935	197941	100 %	0 %	0 %	0 %	218245091
4093	NC_011726	TAAT	2	8	197955	197962	50 %	50 %	0 %	0 %	218245091
4094	NC_011726	CGT	2	6	198086	198091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245091
4095	NC_011726	TTCGG	2	10	198113	198122	0 %	40 %	40 %	20 %	218245091
4096	NC_011726	ATA	2	6	198128	198133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245091
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4099	NC_011726	C	7	7	198285	198291	0 %	0 %	0 %	100 %	218245091
4100	NC_011726	AAT	2	6	198301	198306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245091
4101	NC_011726	TCAA	2	8	198338	198345	50 %	25 %	0 %	25 %	218245091
4102	NC_011726	CAC	2	6	198364	198369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245091
4103	NC_011726	C	6	6	198383	198388	0 %	0 %	0 %	100 %	218245091
4104	NC_011726	GTCG	2	8	198539	198546	0 %	25 %	50 %	25 %	218245091
4105	NC_011726	TC	3	6	198573	198578	0 %	50 %	0 %	50 %	218245091
4106	NC_011726	TCA	2	6	198602	198607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245091
4107	NC_011726	ATG	2	6	198622	198627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245091
4108	NC_011726	TTGA	2	8	198649	198656	25 %	50 %	25 %	0 %	218245091
4109	NC_011726	TTG	2	6	198736	198741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245091
4110	NC_011726	T	6	6	198759	198764	0 %	100 %	0 %	0 %	218245091
4111	NC_011726	GTC	2	6	198823	198828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_011726	T	10	10	198841	198850	0 %	100 %	0 %	0 %	218245092
4113	NC_011726	TCT	2	6	198853	198858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245092
4114	NC_011726	AGA	2	6	198894	198899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245092
4115	NC_011726	GCT	2	6	198913	198918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245092
4116	NC_011726	AAG	2	6	198980	198985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245092
4117	NC_011726	TGC	2	6	198994	198999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245092
4118	NC_011726	TTG	2	6	199025	199030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245092
4119	NC_011726	TTTTA	2	10	199057	199066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_011726	GAA	2	6	199121	199126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245093
4121	NC_011726	TAAG	2	8	199133	199140	50 %	25 %	25 %	0 %	218245093
4122	NC_011726	C	6	6	199156	199161	0 %	0 %	0 %	100 %	218245093
4123	NC_011726	GCT	2	6	199179	199184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245093
4124	NC_011726	A	6	6	199191	199196	100 %	0 %	0 %	0 %	218245093
4125	NC_011726	GAC	2	6	199216	199221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245093
4126	NC_011726	CTC	2	6	199252	199257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245093
4127	NC_011726	GTG	2	6	199290	199295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245093
4128	NC_011726	TAA	2	6	199298	199303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245093
4129	NC_011726	ATC	2	6	199329	199334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245093
4130	NC_011726	CTG	2	6	199367	199372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245093
4131	NC_011726	AAC	2	6	199410	199415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245093
4132	NC_011726	CCA	2	6	199434	199439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245093
4133	NC_011726	ACT	2	6	199586	199591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245093
4134	NC_011726	GCT	2	6	199665	199670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245093
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4136	NC_011726	C	6	6	199721	199726	0 %	0 %	0 %	100 %	218245093
4137	NC_011726	GGGA	2	8	199795	199802	25 %	0 %	75 %	0 %	218245093
4138	NC_011726	ATA	2	6	199807	199812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245093
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4140	NC_011726	CTAC	2	8	199857	199864	25 %	25 %	0 %	50 %	218245093
4141	NC_011726	GGTAA	2	10	199890	199899	40 %	20 %	40 %	0 %	218245093
4142	NC_011726	ATT	2	6	200000	200005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245094
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4144	NC_011726	CAA	2	6	200090	200095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245094
4145	NC_011726	CTA	2	6	200175	200180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245094
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4147	NC_011726	CG	3	6	200243	200248	0 %	0 %	50 %	50 %	218245094
4148	NC_011726	ATGTTA	2	12	200414	200425	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218245094
4149	NC_011726	A	6	6	200454	200459	100 %	0 %	0 %	0 %	218245094
4150	NC_011726	TCG	2	6	200460	200465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245094
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4153	NC_011726	TC	3	6	200507	200512	0 %	50 %	0 %	50 %	218245094
4154	NC_011726	GCG	2	6	200573	200578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218245094
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4156	NC_011726	CCG	2	6	200691	200696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218245094
4157	NC_011726	AGC	2	6	200746	200751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245094
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4159	NC_011726	CAG	2	6	200790	200795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245094
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4161	NC_011726	CAGT	2	8	200836	200843	25 %	25 %	25 %	25 %	218245094
4162	NC_011726	GCAA	2	8	200880	200887	50 %	0 %	25 %	25 %	218245094
4163	NC_011726	ATT	2	6	200921	200926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245094
4164	NC_011726	TTA	2	6	201047	201052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245094
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4169	NC_011726	TGTT	2	8	201316	201323	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4170	NC_011726	ATT	2	6	201347	201352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4171	NC_011726	ACT	2	6	201364	201369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4172	NC_011726	TAAA	2	8	201408	201415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4173	NC_011726	GGTAG	2	10	201426	201435	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4174	NC_011726	A	6	6	201516	201521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4175	NC_011726	TAA	2	6	201585	201590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245095
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4195	NC_011726	TAATA	2	10	202181	202190	60 %	40 %	0 %	0 %	218245095
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4198	NC_011726	TAA	2	6	202380	202385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245095
4199	NC_011726	ATG	2	6	202406	202411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245095
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4204	NC_011726	AACG	2	8	202579	202586	50 %	0 %	25 %	25 %	218245095
4205	NC_011726	TCA	2	6	202618	202623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245095
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4210	NC_011726	ATA	2	6	202821	202826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4211	NC_011726	TTTA	2	8	202836	202843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4212	NC_011726	TGA	2	6	202850	202855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4213	NC_011726	TTG	2	6	202866	202871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4214	NC_011726	T	7	7	202911	202917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4215	NC_011726	ATC	2	6	202922	202927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4216	NC_011726	T	6	6	202945	202950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4217	NC_011726	CTA	2	6	202959	202964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245096
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4231	NC_011726	A	6	6	203772	203777	100 %	0 %	0 %	0 %	218245096
4232	NC_011726	TA	3	6	203876	203881	50 %	50 %	0 %	0 %	218245096
4233	NC_011726	TGA	2	6	203968	203973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245096
4234	NC_011726	GTTCCC	2	12	203987	203998	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	218245096
4235	NC_011726	A	6	6	204003	204008	100 %	0 %	0 %	0 %	218245096
4236	NC_011726	CAG	2	6	204105	204110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245096
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4238	NC_011726	TC	3	6	204146	204151	0 %	50 %	0 %	50 %	218245096
4239	NC_011726	T	6	6	204189	204194	0 %	100 %	0 %	0 %	218245096
4240	NC_011726	TTGAC	2	10	204217	204226	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4241	NC_011726	CTAT	2	8	204382	204389	25 %	50 %	0 %	25 %	218245097
4242	NC_011726	CCA	2	6	204459	204464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245097
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4245	NC_011726	G	6	6	204589	204594	0 %	0 %	100 %	0 %	218245097
4246	NC_011726	GGA	2	6	204631	204636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245097
4247	NC_011726	AGA	2	6	204652	204657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245097
4248	NC_011726	A	6	6	204665	204670	100 %	0 %	0 %	0 %	218245097
4249	NC_011726	GAT	2	6	204704	204709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245097
4250	NC_011726	GGA	2	6	204854	204859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245097
4251	NC_011726	AAG	2	6	204864	204869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245097
4252	NC_011726	TAT	2	6	204997	205002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245097
4253	NC_011726	ACC	2	6	205055	205060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245097
4254	NC_011726	CAA	2	6	205093	205098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245097
4255	NC_011726	AAC	2	6	205236	205241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245097
4256	NC_011726	ATC	2	6	205338	205343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245097
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4263	NC_011726	AG	3	6	205504	205509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_011726	AAT	2	6	205512	205517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_011726	TGAT	2	8	205524	205531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_011726	TGA	2	6	205540	205545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_011726	TAA	2	6	205598	205603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_011726	TGAAA	2	10	205612	205621	60 %	20 %	20 %	0 %	218245098
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4279	NC_011726	CTTGA	2	10	206083	206092	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4280	NC_011726	AAT	2	6	206107	206112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4281	NC_011726	ATA	2	6	206169	206174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4282	NC_011726	CAA	2	6	206178	206183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4291	NC_011726	CTTGA	2	10	206654	206663	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4293	NC_011726	ATG	2	6	206864	206869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4322	NC_011726	GTTT	2	8	208245	208252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4323	NC_011726	CGT	2	6	208253	208258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4327	NC_011726	CTA	2	6	208424	208429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4367	NC_011726	ATA	2	6	209763	209768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4374	NC_011726	TAAA	2	8	210129	210136	75 %	25 %	0 %	0 %	218245102
4375	NC_011726	A	8	8	210134	210141	100 %	0 %	0 %	0 %	218245102
4376	NC_011726	A	6	6	210159	210164	100 %	0 %	0 %	0 %	218245103
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