MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 96488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011726	GGT	2	6	169440	169445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245054
3502	NC_011726	G	6	6	169446	169451	0 %	0 %	100 %	0 %	218245054
3503	NC_011726	TTC	2	6	169537	169542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245054
3504	NC_011726	TAA	2	6	169598	169603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245054
3505	NC_011726	G	6	6	169613	169618	0 %	0 %	100 %	0 %	218245054
3506	NC_011726	TTA	2	6	169633	169638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245054
3507	NC_011726	CGT	2	6	169651	169656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245054
3508	NC_011726	TCC	2	6	169680	169685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245054
3509	NC_011726	AAG	2	6	169748	169753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245054
3510	NC_011726	GGAT	2	8	169828	169835	25 %	25 %	50 %	0 %	218245054
3511	NC_011726	CAA	2	6	169879	169884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245054
3512	NC_011726	GAG	2	6	169967	169972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245054
3513	NC_011726	TTAA	2	8	169990	169997	50 %	50 %	0 %	0 %	218245054
3514	NC_011726	A	6	6	170026	170031	100 %	0 %	0 %	0 %	218245054
3515	NC_011726	GAA	2	6	170035	170040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245054
3516	NC_011726	AG	3	6	170067	170072	50 %	0 %	50 %	0 %	218245054
3517	NC_011726	ATT	2	6	170079	170084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245054
3518	NC_011726	TTA	2	6	170185	170190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245054
3519	NC_011726	TTTA	2	8	170222	170229	25 %	75 %	0 %	0 %	218245054
3520	NC_011726	TTA	2	6	170245	170250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245054
3521	NC_011726	GATAC	2	10	170378	170387	40 %	20 %	20 %	20 %	218245054
3522	NC_011726	ATTA	2	8	170469	170476	50 %	50 %	0 %	0 %	218245054
3523	NC_011726	TGA	2	6	170481	170486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245054
3524	NC_011726	CAAA	2	8	170505	170512	75 %	0 %	0 %	25 %	218245054
3525	NC_011726	CG	3	6	170535	170540	0 %	0 %	50 %	50 %	218245054
3526	NC_011726	GAG	2	6	170558	170563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245054
3527	NC_011726	CTCC	2	8	170600	170607	0 %	25 %	0 %	75 %	218245054
3528	NC_011726	C	7	7	170675	170681	0 %	0 %	0 %	100 %	218245054
3529	NC_011726	CTA	2	6	170694	170699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245054
3530	NC_011726	TCC	2	6	170736	170741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245054
3531	NC_011726	TCAT	2	8	170799	170806	25 %	50 %	0 %	25 %	218245054
3532	NC_011726	AGA	2	6	170829	170834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245054
3533	NC_011726	A	9	9	170836	170844	100 %	0 %	0 %	0 %	218245054
3534	NC_011726	TCG	2	6	170865	170870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245054
3535	NC_011726	ATT	2	6	170990	170995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245054
3536	NC_011726	ATT	2	6	170999	171004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245054
3537	NC_011726	T	6	6	171055	171060	0 %	100 %	0 %	0 %	218245054
3538	NC_011726	ACC	2	6	171139	171144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245054
3539	NC_011726	TTA	2	6	171169	171174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245054
3540	NC_011726	AT	3	6	171200	171205	50 %	50 %	0 %	0 %	218245054
3541	NC_011726	GTT	2	6	171265	171270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245054
3542	NC_011726	ATT	2	6	171282	171287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245054
3543	NC_011726	TGA	2	6	171363	171368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245054
3544	NC_011726	ATT	2	6	171382	171387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245054
3545	NC_011726	AG	3	6	171472	171477	50 %	0 %	50 %	0 %	218245054
3546	NC_011726	TCC	2	6	171489	171494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245054
3547	NC_011726	TTAG	2	8	171511	171518	25 %	50 %	25 %	0 %	218245054
3548	NC_011726	T	6	6	171575	171580	0 %	100 %	0 %	0 %	218245054
3549	NC_011726	ACCTGC	2	12	171615	171626	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218245054
3550	NC_011726	TTA	2	6	171667	171672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245054
3551	NC_011726	ATT	2	6	171697	171702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245054
3552	NC_011726	A	6	6	171720	171725	100 %	0 %	0 %	0 %	218245054
3553	NC_011726	GATT	2	8	171774	171781	25 %	50 %	25 %	0 %	218245054
3554	NC_011726	TGT	2	6	171805	171810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_011726	TGC	2	6	171884	171889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245055
3556	NC_011726	ATT	2	6	171896	171901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245055
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3558	NC_011726	TCA	2	6	171964	171969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245055
3559	NC_011726	ACA	2	6	172005	172010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245055
3560	NC_011726	CAA	2	6	172048	172053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245055
3561	NC_011726	AAAC	2	8	172086	172093	75 %	0 %	0 %	25 %	218245055
3562	NC_011726	TGT	2	6	172110	172115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245055
3563	NC_011726	TTC	2	6	172160	172165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245055
3564	NC_011726	GGTC	2	8	172269	172276	0 %	25 %	50 %	25 %	218245055
3565	NC_011726	TTG	2	6	172365	172370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245056
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3567	NC_011726	TCT	2	6	172511	172516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245057
3568	NC_011726	ATTG	2	8	172539	172546	25 %	50 %	25 %	0 %	218245057
3569	NC_011726	TCATCT	2	12	172550	172561	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	218245057
3570	NC_011726	TTC	2	6	172582	172587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245057
3571	NC_011726	TTC	2	6	172651	172656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245057
3572	NC_011726	TAT	2	6	172657	172662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245057
3573	NC_011726	AGGT	2	8	172670	172677	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_011726	AG	3	6	172706	172711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_011726	TTGC	2	8	172889	172896	0 %	50 %	25 %	25 %	218245058
3576	NC_011726	CT	3	6	172923	172928	0 %	50 %	0 %	50 %	218245058
3577	NC_011726	TAA	2	6	172939	172944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245058
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3579	NC_011726	TGC	2	6	173094	173099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245058
3580	NC_011726	TGA	2	6	173130	173135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245058
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3583	NC_011726	TAG	2	6	173199	173204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245058
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3585	NC_011726	T	6	6	173223	173228	0 %	100 %	0 %	0 %	218245058
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3588	NC_011726	GA	3	6	173396	173401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_011726	TCA	2	6	173454	173459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3591	NC_011726	TAA	2	6	173558	173563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245059
3592	NC_011726	ATC	2	6	173571	173576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245059
3593	NC_011726	G	6	6	173597	173602	0 %	0 %	100 %	0 %	218245059
3594	NC_011726	AG	3	6	173709	173714	50 %	0 %	50 %	0 %	218245059
3595	NC_011726	AGA	2	6	173732	173737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245059
3596	NC_011726	TGG	2	6	173761	173766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245059
3597	NC_011726	TGA	2	6	173796	173801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_011726	TTAA	2	8	173825	173832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_011726	TTAG	2	8	173836	173843	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_011726	A	6	6	173874	173879	100 %	0 %	0 %	0 %	218245060
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3603	NC_011726	ATTT	2	8	173931	173938	25 %	75 %	0 %	0 %	218245060
3604	NC_011726	AAT	2	6	173944	173949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245060
3605	NC_011726	AGA	2	6	173962	173967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245060
3606	NC_011726	AAG	2	6	173991	173996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245060
3607	NC_011726	GAA	2	6	174020	174025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245060
3608	NC_011726	ATGA	2	8	174054	174061	50 %	25 %	25 %	0 %	218245060
3609	NC_011726	AAATT	2	10	174062	174071	60 %	40 %	0 %	0 %	218245061
3610	NC_011726	ATTG	2	8	174178	174185	25 %	50 %	25 %	0 %	218245061
3611	NC_011726	A	7	7	174189	174195	100 %	0 %	0 %	0 %	218245061
3612	NC_011726	GAATAG	2	12	174242	174253	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_011726	ATA	2	6	174263	174268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_011726	TAT	2	6	174270	174275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_011726	T	6	6	174313	174318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_011726	ATT	2	6	174324	174329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_011726	TCG	2	6	174386	174391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_011726	TCT	2	6	174434	174439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_011726	CG	3	6	174471	174476	0 %	0 %	50 %	50 %	218245062
3620	NC_011726	TTGG	2	8	174486	174493	0 %	50 %	50 %	0 %	218245062
3621	NC_011726	TTGG	2	8	174515	174522	0 %	50 %	50 %	0 %	218245062
3622	NC_011726	TTGAA	2	10	174538	174547	40 %	40 %	20 %	0 %	218245062
3623	NC_011726	TCT	2	6	174793	174798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245063
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3625	NC_011726	AGG	2	6	174816	174821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245063
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