MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 96488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011726	TCT	2	6	145141	145146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245027
3002	NC_011726	GAA	2	6	145151	145156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245027
3003	NC_011726	AAT	2	6	145240	145245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245027
3004	NC_011726	TCC	2	6	145285	145290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_011726	GGT	2	6	145327	145332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_011726	CAA	2	6	145367	145372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_011726	TC	3	6	145408	145413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_011726	TCG	2	6	145466	145471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245028
3009	NC_011726	CTT	2	6	145579	145584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245028
3010	NC_011726	TTC	2	6	145622	145627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245028
3011	NC_011726	GA	3	6	145628	145633	50 %	0 %	50 %	0 %	218245028
3012	NC_011726	TAA	2	6	145700	145705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245028
3013	NC_011726	AGT	2	6	145725	145730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245028
3014	NC_011726	TGGGA	2	10	145741	145750	20 %	20 %	60 %	0 %	218245028
3015	NC_011726	ATG	2	6	145818	145823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_011726	AGTA	2	8	146096	146103	50 %	25 %	25 %	0 %	218245029
3017	NC_011726	ATA	2	6	146110	146115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245029
3018	NC_011726	TTG	2	6	146148	146153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245029
3019	NC_011726	ACA	2	6	146191	146196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245029
3020	NC_011726	T	6	6	146216	146221	0 %	100 %	0 %	0 %	218245029
3021	NC_011726	T	7	7	146251	146257	0 %	100 %	0 %	0 %	218245029
3022	NC_011726	TAA	2	6	146274	146279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245029
3023	NC_011726	AAT	2	6	146301	146306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245029
3024	NC_011726	TTCAT	2	10	146308	146317	20 %	60 %	0 %	20 %	218245029
3025	NC_011726	A	6	6	146439	146444	100 %	0 %	0 %	0 %	218245029
3026	NC_011726	TTTA	2	8	146496	146503	25 %	75 %	0 %	0 %	218245029
3027	NC_011726	TTC	2	6	146559	146564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245029
3028	NC_011726	TTC	2	6	146619	146624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245029
3029	NC_011726	A	6	6	146636	146641	100 %	0 %	0 %	0 %	218245029
3030	NC_011726	TTG	2	6	146649	146654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245029
3031	NC_011726	AGAT	2	8	146690	146697	50 %	25 %	25 %	0 %	218245029
3032	NC_011726	GA	4	8	146795	146802	50 %	0 %	50 %	0 %	218245029
3033	NC_011726	GAC	2	6	146849	146854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245029
3034	NC_011726	TAA	2	6	146922	146927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245029
3035	NC_011726	TTAA	2	8	146944	146951	50 %	50 %	0 %	0 %	218245029
3036	NC_011726	CAA	2	6	146966	146971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245029
3037	NC_011726	TTA	2	6	146974	146979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245029
3038	NC_011726	GAT	2	6	147016	147021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245029
3039	NC_011726	C	7	7	147100	147106	0 %	0 %	0 %	100 %	218245029
3040	NC_011726	AAC	2	6	147135	147140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245029
3041	NC_011726	TCA	2	6	147143	147148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245029
3042	NC_011726	AT	3	6	147264	147269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_011726	TAA	2	6	147351	147356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_011726	ACA	2	6	147387	147392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245031
3045	NC_011726	GCG	2	6	147453	147458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218245031
3046	NC_011726	AATTT	2	10	147468	147477	40 %	60 %	0 %	0 %	218245031
3047	NC_011726	TTGAGG	2	12	147541	147552	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	218245031
3048	NC_011726	CAA	2	6	147583	147588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245031
3049	NC_011726	TAA	2	6	147641	147646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245031
3050	NC_011726	GAT	2	6	147704	147709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245031
3051	NC_011726	GCA	2	6	147764	147769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245031
3052	NC_011726	G	6	6	147780	147785	0 %	0 %	100 %	0 %	218245031
3053	NC_011726	ATT	2	6	147786	147791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245031
3054	NC_011726	GGT	2	6	148022	148027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245031
3055	NC_011726	CAAT	2	8	148055	148062	50 %	25 %	0 %	25 %	218245031
3056	NC_011726	ATTG	2	8	148094	148101	25 %	50 %	25 %	0 %	218245031
3057	NC_011726	AGTT	2	8	148188	148195	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_011726	TGAT	2	8	148276	148283	25 %	50 %	25 %	0 %	218245032
3059	NC_011726	ATA	2	6	148335	148340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245032
3060	NC_011726	GCCAT	2	10	148371	148380	20 %	20 %	20 %	40 %	218245032
3061	NC_011726	TAG	2	6	148521	148526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245032
3062	NC_011726	GAG	2	6	148578	148583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245032
3063	NC_011726	TCA	2	6	148657	148662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245032
3064	NC_011726	TAA	2	6	148680	148685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245032
3065	NC_011726	ATT	2	6	148774	148779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245033
3066	NC_011726	A	8	8	148826	148833	100 %	0 %	0 %	0 %	218245033
3067	NC_011726	TAA	2	6	148843	148848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245033
3068	NC_011726	A	6	6	148896	148901	100 %	0 %	0 %	0 %	218245033
3069	NC_011726	CAAA	2	8	148915	148922	75 %	0 %	0 %	25 %	218245033
3070	NC_011726	CGAT	2	8	148926	148933	25 %	25 %	25 %	25 %	218245033
3071	NC_011726	AAAT	2	8	148957	148964	75 %	25 %	0 %	0 %	218245033
3072	NC_011726	ACC	2	6	148997	149002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245033
3073	NC_011726	CCA	2	6	149003	149008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245033
3074	NC_011726	A	7	7	149075	149081	100 %	0 %	0 %	0 %	218245033
3075	NC_011726	ACT	2	6	149156	149161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245033
3076	NC_011726	AAT	2	6	149198	149203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245033
3077	NC_011726	A	8	8	149227	149234	100 %	0 %	0 %	0 %	218245033
3078	NC_011726	T	8	8	149238	149245	0 %	100 %	0 %	0 %	218245033
3079	NC_011726	TAA	2	6	149295	149300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_011726	TTAAT	2	10	149310	149319	40 %	60 %	0 %	0 %	218245034
3081	NC_011726	CA	3	6	149360	149365	50 %	0 %	0 %	50 %	218245034
3082	NC_011726	AAT	2	6	149366	149371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245034
3083	NC_011726	AAT	2	6	149401	149406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245034
3084	NC_011726	GTT	2	6	149442	149447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245034
3085	NC_011726	CA	3	6	149485	149490	50 %	0 %	0 %	50 %	218245034
3086	NC_011726	AAT	2	6	149626	149631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245034
3087	NC_011726	ACC	2	6	149636	149641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245034
3088	NC_011726	A	7	7	149676	149682	100 %	0 %	0 %	0 %	218245034
3089	NC_011726	T	6	6	149712	149717	0 %	100 %	0 %	0 %	218245034
3090	NC_011726	CAA	2	6	149735	149740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245034
3091	NC_011726	TGT	2	6	149790	149795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245034
3092	NC_011726	TAA	2	6	149852	149857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245034
3093	NC_011726	ATT	2	6	149865	149870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245034
3094	NC_011726	TGG	2	6	150027	150032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245035
3095	NC_011726	GTT	2	6	150043	150048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245035
3096	NC_011726	AGCAT	2	10	150064	150073	40 %	20 %	20 %	20 %	218245035
3097	NC_011726	TTG	2	6	150147	150152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245035
3098	NC_011726	GAG	2	6	150246	150251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245035
3099	NC_011726	CCCATG	2	12	150325	150336	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218245035
3100	NC_011726	CCG	2	6	150340	150345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218245035
3101	NC_011726	GCT	2	6	150364	150369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245035
3102	NC_011726	GCA	2	6	150525	150530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245035
3103	NC_011726	CGG	2	6	150548	150553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218245035
3104	NC_011726	CTGA	2	8	150627	150634	25 %	25 %	25 %	25 %	218245035
3105	NC_011726	ACTG	2	8	150742	150749	25 %	25 %	25 %	25 %	218245035
3106	NC_011726	CAA	2	6	150826	150831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245035
3107	NC_011726	GCT	2	6	150850	150855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245035
3108	NC_011726	GAT	2	6	150936	150941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245035
3109	NC_011726	T	6	6	150941	150946	0 %	100 %	0 %	0 %	218245035
3110	NC_011726	GAA	2	6	151016	151021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245035
3111	NC_011726	AAT	2	6	151110	151115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_011726	TCTT	3	12	151149	151160	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3113	NC_011726	GATT	2	8	151241	151248	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_011726	AGG	2	6	151275	151280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_011726	ACT	2	6	151353	151358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245036
3116	NC_011726	ACA	4	12	151385	151396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245036
3117	NC_011726	TCC	2	6	151433	151438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245036
3118	NC_011726	TAC	2	6	151478	151483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245036
3119	NC_011726	ACA	2	6	151519	151524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245036
3120	NC_011726	GAA	2	6	151537	151542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245036
3121	NC_011726	TCA	2	6	151577	151582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245036
3122	NC_011726	ATGAAC	2	12	151671	151682	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218245036
3123	NC_011726	TCTAA	2	10	151814	151823	40 %	40 %	0 %	20 %	218245036
3124	NC_011726	TAG	2	6	151824	151829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_011726	A	7	7	151861	151867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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