MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 96488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011726	AAT	2	6	120753	120758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245007
2502	NC_011726	TC	3	6	120767	120772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2503	NC_011726	TAA	2	6	120786	120791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_011726	TCA	2	6	120792	120797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_011726	TCT	2	6	120828	120833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_011726	ATTA	2	8	120878	120885	50 %	50 %	0 %	0 %	218245008
2507	NC_011726	ACCCC	2	10	120987	120996	20 %	0 %	0 %	80 %	218245008
2508	NC_011726	CGA	2	6	121029	121034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245008
2509	NC_011726	C	6	6	121126	121131	0 %	0 %	0 %	100 %	218245008
2510	NC_011726	TCA	2	6	121172	121177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245008
2511	NC_011726	TGG	2	6	121263	121268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245008
2512	NC_011726	TGT	2	6	121322	121327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245008
2513	NC_011726	CAA	2	6	121440	121445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245008
2514	NC_011726	ATA	2	6	121484	121489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245008
2515	NC_011726	AAT	2	6	121582	121587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245008
2516	NC_011726	C	6	6	121598	121603	0 %	0 %	0 %	100 %	218245008
2517	NC_011726	GAA	2	6	121644	121649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245008
2518	NC_011726	GGC	2	6	121819	121824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218245008
2519	NC_011726	CTA	2	6	121872	121877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245008
2520	NC_011726	GGTT	2	8	121968	121975	0 %	50 %	50 %	0 %	218245008
2521	NC_011726	CGG	2	6	122022	122027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218245008
2522	NC_011726	ATA	2	6	122029	122034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245008
2523	NC_011726	TTG	2	6	122074	122079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245008
2524	NC_011726	TTC	2	6	122131	122136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245008
2525	NC_011726	GCT	2	6	122207	122212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245008
2526	NC_011726	TGC	2	6	122215	122220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245008
2527	NC_011726	ATA	2	6	122306	122311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245008
2528	NC_011726	AAT	2	6	122421	122426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245008
2529	NC_011726	CTT	2	6	122463	122468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245008
2530	NC_011726	AGG	2	6	122494	122499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245008
2531	NC_011726	TTC	2	6	122509	122514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245008
2532	NC_011726	TCTT	2	8	122521	122528	0 %	75 %	0 %	25 %	218245008
2533	NC_011726	CGG	2	6	122576	122581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218245008
2534	NC_011726	CCCAT	2	10	122675	122684	20 %	20 %	0 %	60 %	218245008
2535	NC_011726	ACG	2	6	122707	122712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245008
2536	NC_011726	GCGATC	2	12	122732	122743	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218245008
2537	NC_011726	AGC	2	6	122779	122784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245008
2538	NC_011726	TGA	2	6	122795	122800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245008
2539	NC_011726	TGC	2	6	122845	122850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245008
2540	NC_011726	GTT	2	6	122955	122960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245008
2541	NC_011726	ACG	2	6	123148	123153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245008
2542	NC_011726	AAT	2	6	123155	123160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245008
2543	NC_011726	CTTC	2	8	123191	123198	0 %	50 %	0 %	50 %	218245008
2544	NC_011726	TTG	2	6	123316	123321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245008
2545	NC_011726	TTC	2	6	123328	123333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245008
2546	NC_011726	TAA	2	6	123381	123386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245008
2547	NC_011726	T	6	6	123420	123425	0 %	100 %	0 %	0 %	218245008
2548	NC_011726	TGA	2	6	123450	123455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245008
2549	NC_011726	CTG	2	6	123457	123462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245008
2550	NC_011726	TC	3	6	123468	123473	0 %	50 %	0 %	50 %	218245008
2551	NC_011726	AT	3	6	123479	123484	50 %	50 %	0 %	0 %	218245008
2552	NC_011726	TGC	3	9	123520	123528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245008
2553	NC_011726	ATG	2	6	123625	123630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245008
2554	NC_011726	TGC	2	6	123645	123650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245008
2555	NC_011726	AAT	2	6	123680	123685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245008
2556	NC_011726	CCCAT	2	10	123714	123723	20 %	20 %	0 %	60 %	218245008
2557	NC_011726	ATC	2	6	123730	123735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245008
2558	NC_011726	ATTG	2	8	123809	123816	25 %	50 %	25 %	0 %	218245008
2559	NC_011726	GTTTT	2	10	123818	123827	0 %	80 %	20 %	0 %	218245008
2560	NC_011726	TG	3	6	123848	123853	0 %	50 %	50 %	0 %	218245008
2561	NC_011726	TCC	2	6	123868	123873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2562	NC_011726	AGT	2	6	123887	123892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_011726	AGG	2	6	123910	123915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_011726	TGAG	2	8	123918	123925	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_011726	CCTT	2	8	123961	123968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2566	NC_011726	AGG	2	6	123978	123983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_011726	T	7	7	124046	124052	0 %	100 %	0 %	0 %	218245009
2568	NC_011726	GT	3	6	124055	124060	0 %	50 %	50 %	0 %	218245009
2569	NC_011726	TCA	2	6	124100	124105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245009
2570	NC_011726	TTG	2	6	124121	124126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_011726	TGT	2	6	124253	124258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_011726	CAT	2	6	124306	124311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_011726	TAC	2	6	124313	124318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_011726	AGA	2	6	124376	124381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_011726	CAT	2	6	124437	124442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_011726	TAC	2	6	124444	124449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_011726	TAA	2	6	124501	124506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_011726	CAA	2	6	124658	124663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245010
2579	NC_011726	GCA	2	6	124694	124699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245010
2580	NC_011726	GTT	2	6	124738	124743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245010
2581	NC_011726	ACACTA	2	12	124828	124839	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218245011
2582	NC_011726	GTT	2	6	124897	124902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245011
2583	NC_011726	TTAA	2	8	124909	124916	50 %	50 %	0 %	0 %	218245011
2584	NC_011726	T	6	6	124951	124956	0 %	100 %	0 %	0 %	218245011
2585	NC_011726	A	6	6	124970	124975	100 %	0 %	0 %	0 %	218245011
2586	NC_011726	GTTTC	2	10	124985	124994	0 %	60 %	20 %	20 %	218245011
2587	NC_011726	ATA	2	6	125001	125006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245011
2588	NC_011726	ACT	2	6	125173	125178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_011726	T	6	6	125259	125264	0 %	100 %	0 %	0 %	218245012
2590	NC_011726	TAG	2	6	125384	125389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245012
2591	NC_011726	GTTGA	2	10	125393	125402	20 %	40 %	40 %	0 %	218245012
2592	NC_011726	TAA	2	6	125416	125421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245012
2593	NC_011726	GTT	2	6	125446	125451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245012
2594	NC_011726	CTT	2	6	125474	125479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245012
2595	NC_011726	TAA	2	6	125492	125497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245012
2596	NC_011726	ACG	3	9	125511	125519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245012
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2598	NC_011726	TTA	2	6	125557	125562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245012
2599	NC_011726	AAT	2	6	125592	125597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245012
2600	NC_011726	ATAAA	2	10	125611	125620	80 %	20 %	0 %	0 %	218245012
2601	NC_011726	A	6	6	125627	125632	100 %	0 %	0 %	0 %	218245012
2602	NC_011726	AAC	2	6	125700	125705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245012
2603	NC_011726	CTT	2	6	125714	125719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245012
2604	NC_011726	AAT	2	6	125721	125726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245012
2605	NC_011726	GAC	2	6	125787	125792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245012
2606	NC_011726	ACG	2	6	125799	125804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245012
2607	NC_011726	A	6	6	125832	125837	100 %	0 %	0 %	0 %	218245012
2608	NC_011726	ACG	2	6	125865	125870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245012
2609	NC_011726	TAA	2	6	125982	125987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245012
2610	NC_011726	AAT	2	6	126027	126032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245012
2611	NC_011726	TCA	2	6	126046	126051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245012
2612	NC_011726	TCT	2	6	126064	126069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245012
2613	NC_011726	GGA	3	9	126070	126078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245012
2614	NC_011726	ATC	2	6	126093	126098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245012
2615	NC_011726	TAG	2	6	126099	126104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245012
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2617	NC_011726	TGG	2	6	126278	126283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245012
2618	NC_011726	CGA	3	9	126299	126307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245012
2619	NC_011726	ATC	3	9	126375	126383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245012
2620	NC_011726	TCC	2	6	126393	126398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245012
2621	NC_011726	TCA	2	6	126472	126477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245012
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2623	NC_011726	AAT	2	6	126546	126551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245012
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2747	NC_011726	GAT	2	6	133054	133059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245018
2748	NC_011726	ACCG	2	8	133097	133104	25 %	0 %	25 %	50 %	218245019
2749	NC_011726	ATGG	2	8	133146	133153	25 %	25 %	50 %	0 %	218245019
2750	NC_011726	G	6	6	133207	133212	0 %	0 %	100 %	0 %	218245019
2751	NC_011726	GAC	2	6	133300	133305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245019
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2759	NC_011726	CCA	2	6	133498	133503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245019
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2764	NC_011726	TA	3	6	133615	133620	50 %	50 %	0 %	0 %	218245019
2765	NC_011726	TTA	2	6	133644	133649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245019
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2767	NC_011726	TCA	2	6	133760	133765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245019
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2784	NC_011726	ATG	2	6	134346	134351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245020
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2868	NC_011726	TAA	2	6	138787	138792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245024
2869	NC_011726	TTGGTA	2	12	138806	138817	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	218245024
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2873	NC_011726	TAC	2	6	138918	138923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245024
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2955	NC_011726	CTC	2	6	142298	142303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2956	NC_011726	TTAAT	2	10	142320	142329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2957	NC_011726	TAAT	2	8	142342	142349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2958	NC_011726	T	6	6	142476	142481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2959	NC_011726	TGAA	2	8	142500	142507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2960	NC_011726	TAG	2	6	142583	142588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2962	NC_011726	CAT	2	6	142743	142748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2963	NC_011726	CTAC	2	8	142765	142772	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2964	NC_011726	GATCGC	2	12	142823	142834	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2966	NC_011726	AACT	2	8	142867	142874	50 %	25 %	0 %	25 %	218245025
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2982	NC_011726	A	6	6	144036	144041	100 %	0 %	0 %	0 %	218245025
2983	NC_011726	CAT	2	6	144070	144075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245025
2984	NC_011726	GTT	2	6	144187	144192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2985	NC_011726	GCCA	2	8	144242	144249	25 %	0 %	25 %	50 %	218245026
2986	NC_011726	AAT	2	6	144441	144446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245026
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