MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 96488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011726	AAT	2	6	46837	46842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244936
1002	NC_011726	GAT	3	9	46942	46950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244936
1003	NC_011726	ATC	2	6	47000	47005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244936
1004	NC_011726	TGT	2	6	47010	47015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244936
1005	NC_011726	TGA	2	6	47037	47042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244936
1006	NC_011726	AAT	2	6	47098	47103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244936
1007	NC_011726	GGA	2	6	47182	47187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218244936
1008	NC_011726	CCTAC	2	10	47268	47277	20 %	20 %	0 %	60 %	218244936
1009	NC_011726	TTTC	2	8	47280	47287	0 %	75 %	0 %	25 %	218244936
1010	NC_011726	TAA	2	6	47382	47387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244936
1011	NC_011726	A	7	7	47401	47407	100 %	0 %	0 %	0 %	218244936
1012	NC_011726	CAA	2	6	47438	47443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244936
1013	NC_011726	ATTT	2	8	47505	47512	25 %	75 %	0 %	0 %	218244936
1014	NC_011726	A	7	7	47545	47551	100 %	0 %	0 %	0 %	218244936
1015	NC_011726	CTT	2	6	47563	47568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244936
1016	NC_011726	ATT	2	6	47622	47627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244937
1017	NC_011726	ATG	2	6	47701	47706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244937
1018	NC_011726	TA	3	6	47712	47717	50 %	50 %	0 %	0 %	218244937
1019	NC_011726	CTC	2	6	47750	47755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218244937
1020	NC_011726	TACT	2	8	47773	47780	25 %	50 %	0 %	25 %	218244937
1021	NC_011726	CAA	2	6	47781	47786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244937
1022	NC_011726	A	6	6	47791	47796	100 %	0 %	0 %	0 %	218244937
1023	NC_011726	A	7	7	47863	47869	100 %	0 %	0 %	0 %	218244937
1024	NC_011726	AATGAA	2	12	47946	47957	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218244937
1025	NC_011726	ATT	2	6	47991	47996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244937
1026	NC_011726	ATA	2	6	48004	48009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244937
1027	NC_011726	CTA	2	6	48013	48018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244937
1028	NC_011726	TAT	2	6	48037	48042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244937
1029	NC_011726	TTTGG	2	10	48062	48071	0 %	60 %	40 %	0 %	218244937
1030	NC_011726	TTA	2	6	48115	48120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244937
1031	NC_011726	CAA	2	6	48129	48134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244937
1032	NC_011726	AAG	2	6	48177	48182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244937
1033	NC_011726	CTT	2	6	48205	48210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244937
1034	NC_011726	ATCAA	2	10	48257	48266	60 %	20 %	0 %	20 %	218244937
1035	NC_011726	A	6	6	48276	48281	100 %	0 %	0 %	0 %	218244937
1036	NC_011726	CTT	2	6	48320	48325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244937
1037	NC_011726	TATT	2	8	48381	48388	25 %	75 %	0 %	0 %	218244937
1038	NC_011726	AAT	2	6	48423	48428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244937
1039	NC_011726	ATTT	2	8	48532	48539	25 %	75 %	0 %	0 %	218244937
1040	NC_011726	A	6	6	48559	48564	100 %	0 %	0 %	0 %	218244937
1041	NC_011726	TGC	2	6	48578	48583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244937
1042	NC_011726	CTT	2	6	48604	48609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244937
1043	NC_011726	AGG	2	6	48680	48685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218244937
1044	NC_011726	GTT	2	6	48722	48727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244937
1045	NC_011726	CAG	2	6	48786	48791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244937
1046	NC_011726	CAA	2	6	48807	48812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244937
1047	NC_011726	CAT	2	6	48892	48897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244937
1048	NC_011726	AAT	2	6	48985	48990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244938
1049	NC_011726	GAA	2	6	48998	49003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244938
1050	NC_011726	GGC	2	6	49012	49017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218244938
1051	NC_011726	T	6	6	49042	49047	0 %	100 %	0 %	0 %	218244938
1052	NC_011726	TCA	2	6	49063	49068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244938
1053	NC_011726	GAT	2	6	49322	49327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244938
1054	NC_011726	GATTT	2	10	49407	49416	20 %	60 %	20 %	0 %	218244938
1055	NC_011726	TGA	2	6	49440	49445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244938
1056	NC_011726	TCA	2	6	49489	49494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244938
1057	NC_011726	CTC	2	6	49587	49592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218244938
1058	NC_011726	TCA	2	6	49630	49635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244938
1059	NC_011726	AATTT	2	10	49649	49658	40 %	60 %	0 %	0 %	218244938
1060	NC_011726	ATC	2	6	49674	49679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244938
1061	NC_011726	A	8	8	49720	49727	100 %	0 %	0 %	0 %	218244938
1062	NC_011726	CAA	2	6	49739	49744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244938
1063	NC_011726	TAATT	2	10	49798	49807	40 %	60 %	0 %	0 %	218244938
1064	NC_011726	AGCA	2	8	49811	49818	50 %	0 %	25 %	25 %	218244938
1065	NC_011726	GAA	2	6	49905	49910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244939
1066	NC_011726	GCA	2	6	49943	49948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244939
1067	NC_011726	ATT	2	6	49968	49973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244939
1068	NC_011726	GCA	3	9	50094	50102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244939
1069	NC_011726	TGA	2	6	50180	50185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244939
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1071	NC_011726	CAA	2	6	50247	50252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244939
1072	NC_011726	TTA	2	6	50257	50262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244939
1073	NC_011726	ATC	2	6	50275	50280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244939
1074	NC_011726	CAT	2	6	50285	50290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244939
1075	NC_011726	TAA	2	6	50312	50317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244939
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1078	NC_011726	ATT	2	6	50454	50459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244939
1079	NC_011726	ATG	2	6	50467	50472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244939
1080	NC_011726	CGC	2	6	50502	50507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218244939
1081	NC_011726	TTTA	2	8	50570	50577	25 %	75 %	0 %	0 %	218244939
1082	NC_011726	ATT	2	6	50596	50601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244939
1083	NC_011726	ATG	2	6	50614	50619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244939
1084	NC_011726	TAT	2	6	50623	50628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244939
1085	NC_011726	CAA	2	6	50697	50702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244939
1086	NC_011726	ACTCA	2	10	50715	50724	40 %	20 %	0 %	40 %	218244939
1087	NC_011726	TAT	2	6	50736	50741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244939
1088	NC_011726	CGAC	2	8	50790	50797	25 %	0 %	25 %	50 %	218244939
1089	NC_011726	CAA	2	6	50818	50823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244939
1090	NC_011726	ACC	2	6	50835	50840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218244939
1091	NC_011726	TCA	2	6	50841	50846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244939
1092	NC_011726	AAT	2	6	50997	51002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1095	NC_011726	TTA	2	6	51105	51110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244940
1096	NC_011726	TGAGG	2	10	51135	51144	20 %	20 %	60 %	0 %	218244940
1097	NC_011726	TCA	2	6	51165	51170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244940
1098	NC_011726	TCTA	2	8	51193	51200	25 %	50 %	0 %	25 %	218244940
1099	NC_011726	AAC	2	6	51263	51268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244940
1100	NC_011726	AAT	2	6	51387	51392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244940
1101	NC_011726	AT	3	6	51422	51427	50 %	50 %	0 %	0 %	218244940
1102	NC_011726	T	7	7	51432	51438	0 %	100 %	0 %	0 %	218244940
1103	NC_011726	ATG	2	6	51452	51457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244940
1104	NC_011726	TA	3	6	51475	51480	50 %	50 %	0 %	0 %	218244940
1105	NC_011726	TAGA	2	8	51554	51561	50 %	25 %	25 %	0 %	218244940
1106	NC_011726	TTG	2	6	51689	51694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244940
1107	NC_011726	GA	3	6	51702	51707	50 %	0 %	50 %	0 %	218244940
1108	NC_011726	A	8	8	51758	51765	100 %	0 %	0 %	0 %	218244940
1109	NC_011726	AATA	2	8	51772	51779	75 %	25 %	0 %	0 %	218244940
1110	NC_011726	CAA	2	6	51781	51786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244940
1111	NC_011726	AATCT	2	10	51913	51922	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1112	NC_011726	AT	3	6	51973	51978	50 %	50 %	0 %	0 %	218244941
1113	NC_011726	GTTTCT	2	12	51989	52000	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218244941
1114	NC_011726	TCC	2	6	52027	52032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218244941
1115	NC_011726	TTAGAT	2	12	52052	52063	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218244941
1116	NC_011726	TTA	2	6	52227	52232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244941
1117	NC_011726	TAG	2	6	52398	52403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244941
1118	NC_011726	GATT	2	8	52405	52412	25 %	50 %	25 %	0 %	218244941
1119	NC_011726	ATG	2	6	52434	52439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244941
1120	NC_011726	TTA	2	6	52460	52465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244941
1121	NC_011726	GGT	2	6	52474	52479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218244941
1122	NC_011726	TAT	2	6	52480	52485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244941
1123	NC_011726	TAAAG	2	10	52604	52613	60 %	20 %	20 %	0 %	218244941
1124	NC_011726	CAG	2	6	52681	52686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244942
1125	NC_011726	A	6	6	52705	52710	100 %	0 %	0 %	0 %	218244942
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1127	NC_011726	TATC	2	8	52767	52774	25 %	50 %	0 %	25 %	218244942
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1363	NC_011726	T	7	7	64367	64373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1375	NC_011726	AGA	2	6	64903	64908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244955
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1380	NC_011726	CAA	2	6	65303	65308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244955
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