MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 96488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011726	AGA	2	6	543200	543205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245401
11002	NC_011726	TAT	3	9	543226	543234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245401
11003	NC_011726	TTA	2	6	543273	543278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245401
11004	NC_011726	AGAA	2	8	543293	543300	75 %	0 %	25 %	0 %	218245401
11005	NC_011726	TAAT	2	8	543303	543310	50 %	50 %	0 %	0 %	218245401
11006	NC_011726	TAA	2	6	543320	543325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_011726	TTG	2	6	543385	543390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245402
11008	NC_011726	ATA	2	6	543391	543396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245402
11009	NC_011726	TGT	2	6	543456	543461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245402
11010	NC_011726	CAC	2	6	543494	543499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245402
11011	NC_011726	CGA	2	6	543546	543551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245402
11012	NC_011726	T	7	7	543603	543609	0 %	100 %	0 %	0 %	218245402
11013	NC_011726	ATA	2	6	543626	543631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245402
11014	NC_011726	CGG	2	6	543658	543663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218245402
11015	NC_011726	T	7	7	543768	543774	0 %	100 %	0 %	0 %	218245402
11016	NC_011726	GGT	2	6	543830	543835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245402
11017	NC_011726	TAA	2	6	543859	543864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245402
11018	NC_011726	TGT	2	6	543900	543905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245402
11019	NC_011726	GGC	2	6	543912	543917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218245402
11020	NC_011726	AGG	2	6	543987	543992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245402
11021	NC_011726	TGA	2	6	543996	544001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245402
11022	NC_011726	T	6	6	544126	544131	0 %	100 %	0 %	0 %	218245402
11023	NC_011726	AAT	2	6	544133	544138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245402
11024	NC_011726	A	6	6	544331	544336	100 %	0 %	0 %	0 %	218245402
11025	NC_011726	GCT	2	6	544419	544424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245402
11026	NC_011726	TCC	2	6	544460	544465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245402
11027	NC_011726	C	6	6	544479	544484	0 %	0 %	0 %	100 %	218245402
11028	NC_011726	ACG	2	6	544506	544511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245402
11029	NC_011726	TAT	2	6	544633	544638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_011726	TTA	2	6	544710	544715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_011726	A	6	6	544722	544727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_011726	T	7	7	544771	544777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_011726	T	8	8	544783	544790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_011726	CAT	2	6	544791	544796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_011726	CAAGT	2	10	544802	544811	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11036	NC_011726	CCCGA	2	10	544970	544979	20 %	0 %	20 %	60 %	218245403
11037	NC_011726	ATA	2	6	545025	545030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245403
11038	NC_011726	CTA	2	6	545189	545194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245403
11039	NC_011726	ATC	2	6	545199	545204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245403
11040	NC_011726	TAA	2	6	545217	545222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245403
11041	NC_011726	GGA	3	9	545239	545247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245403
11042	NC_011726	AGT	2	6	545256	545261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245403
11043	NC_011726	TTTG	2	8	545417	545424	0 %	75 %	25 %	0 %	218245403
11044	NC_011726	CTT	2	6	545447	545452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245403
11045	NC_011726	AAC	2	6	545463	545468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245403
11046	NC_011726	TAT	2	6	545471	545476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245403
11047	NC_011726	CGT	2	6	545515	545520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245403
11048	NC_011726	TCT	2	6	545521	545526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245403
11049	NC_011726	TGT	2	6	545566	545571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245403
11050	NC_011726	GTT	2	6	545573	545578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245403
11051	NC_011726	TCT	2	6	545625	545630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245403
11052	NC_011726	TTGTTT	2	12	545643	545654	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	218245403
11053	NC_011726	CTT	2	6	545681	545686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245403
11054	NC_011726	TAA	2	6	545688	545693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245403
11055	NC_011726	T	6	6	545704	545709	0 %	100 %	0 %	0 %	218245403
11056	NC_011726	CTT	2	6	545717	545722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245403
11057	NC_011726	GTT	2	6	545768	545773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245403
11058	NC_011726	ATC	2	6	545796	545801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245403
11059	NC_011726	GTT	2	6	545861	545866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245403
11060	NC_011726	AGC	2	6	545880	545885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245403
11061	NC_011726	GCT	2	6	545914	545919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245403
11062	NC_011726	AGC	2	6	546030	546035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245403
11063	NC_011726	G	6	6	546043	546048	0 %	0 %	100 %	0 %	218245403
11064	NC_011726	TCA	2	6	546101	546106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245403
11065	NC_011726	TTG	2	6	546129	546134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245403
11066	NC_011726	TAG	2	6	546176	546181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245403
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11068	NC_011726	GAG	2	6	546266	546271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245403
11069	NC_011726	TGG	2	6	546335	546340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245403
11070	NC_011726	GTT	2	6	546367	546372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245403
11071	NC_011726	T	6	6	546577	546582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_011726	TAG	2	6	546642	546647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245404
11073	NC_011726	TTC	2	6	546671	546676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245404
11074	NC_011726	CATC	2	8	546706	546713	25 %	25 %	0 %	50 %	218245404
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11076	NC_011726	TAA	2	6	546791	546796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245404
11077	NC_011726	TGT	2	6	546810	546815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245404
11078	NC_011726	TGG	2	6	546838	546843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245404
11079	NC_011726	ATA	2	6	546972	546977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245404
11080	NC_011726	GCT	2	6	546990	546995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245404
11081	NC_011726	CGC	2	6	547001	547006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218245404
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11083	NC_011726	GAC	2	6	547108	547113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245404
11084	NC_011726	AATT	2	8	547193	547200	50 %	50 %	0 %	0 %	218245404
11085	NC_011726	CAA	2	6	547234	547239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245404
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11087	NC_011726	TGT	2	6	547299	547304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245404
11088	NC_011726	CTT	2	6	547384	547389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245404
11089	NC_011726	GGTGA	2	10	547476	547485	20 %	20 %	60 %	0 %	218245404
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11091	NC_011726	CTAAG	2	10	547522	547531	40 %	20 %	20 %	20 %	218245404
11092	NC_011726	CCCA	2	8	547557	547564	25 %	0 %	0 %	75 %	218245404
11093	NC_011726	TTG	2	6	547587	547592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245404
11094	NC_011726	GCCG	2	8	547643	547650	0 %	0 %	50 %	50 %	218245404
11095	NC_011726	TTGCCA	2	12	547673	547684	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218245404
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11097	NC_011726	TTCG	2	8	547768	547775	0 %	50 %	25 %	25 %	218245404
11098	NC_011726	TGG	2	6	547801	547806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245404
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11102	NC_011726	TGG	2	6	548083	548088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245404
11103	NC_011726	CAA	2	6	548092	548097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245404
11104	NC_011726	GGT	2	6	548114	548119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245404
11105	NC_011726	GAT	2	6	548207	548212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245404
11106	NC_011726	ATC	2	6	548220	548225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245404
11107	NC_011726	GA	3	6	548303	548308	50 %	0 %	50 %	0 %	218245404
11108	NC_011726	T	6	6	548349	548354	0 %	100 %	0 %	0 %	218245404
11109	NC_011726	GTA	2	6	548362	548367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245404
11110	NC_011726	CCGT	2	8	548617	548624	0 %	25 %	25 %	50 %	218245404
11111	NC_011726	CGG	2	6	548661	548666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218245404
11112	NC_011726	CCTTT	2	10	548752	548761	0 %	60 %	0 %	40 %	218245404
11113	NC_011726	CGG	2	6	548836	548841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218245404
11114	NC_011726	TCA	2	6	548848	548853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245404
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11116	NC_011726	TTGA	2	8	549002	549009	25 %	50 %	25 %	0 %	218245404
11117	NC_011726	TCC	2	6	549041	549046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245404
11118	NC_011726	CACT	2	8	549049	549056	25 %	25 %	0 %	50 %	218245404
11119	NC_011726	GGA	2	6	549142	549147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245404
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11121	NC_011726	GTT	2	6	549199	549204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245404
11122	NC_011726	AAT	2	6	549219	549224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245404
11123	NC_011726	GTC	2	6	549239	549244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245404
11124	NC_011726	CTC	2	6	549355	549360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245404
11125	NC_011726	TGA	2	6	549361	549366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245404
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11130	NC_011726	ACTG	2	8	549564	549571	25 %	25 %	25 %	25 %	218245404
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11133	NC_011726	GTC	2	6	549711	549716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11134	NC_011726	CTC	2	6	549722	549727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11135	NC_011726	GTC	2	6	549839	549844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245405
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11152	NC_011726	CTC	2	6	550858	550863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11224	NC_011726	AATC	2	8	554094	554101	50 %	25 %	0 %	25 %	218245412
11225	NC_011726	G	6	6	554131	554136	0 %	0 %	100 %	0 %	218245412
11226	NC_011726	ATC	2	6	554149	554154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245412
11227	NC_011726	G	7	7	554238	554244	0 %	0 %	100 %	0 %	218245412
11228	NC_011726	GTA	2	6	554274	554279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245412
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11230	NC_011726	TAT	2	6	554374	554379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245412
11231	NC_011726	TTA	2	6	554464	554469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245412
11232	NC_011726	AATT	2	8	554527	554534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11233	NC_011726	ATT	2	6	554538	554543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11234	NC_011726	A	6	6	554578	554583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11235	NC_011726	AAT	2	6	554590	554595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11236	NC_011726	ATA	2	6	554596	554601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11237	NC_011726	ATC	2	6	554698	554703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245413
11238	NC_011726	AAG	2	6	554707	554712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245413
11239	NC_011726	GAT	2	6	554739	554744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245413
11240	NC_011726	AGA	2	6	554765	554770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245413
11241	NC_011726	TGTGC	2	10	554820	554829	0 %	40 %	40 %	20 %	218245413
11242	NC_011726	GAAA	2	8	554885	554892	75 %	0 %	25 %	0 %	218245413
11243	NC_011726	TTA	2	6	554904	554909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245413
11244	NC_011726	GTTA	2	8	554913	554920	25 %	50 %	25 %	0 %	218245413
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11352	NC_011726	ACTTA	2	10	560718	560727	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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11354	NC_011726	GAT	2	6	560885	560890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245419
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11489	NC_011726	A	6	6	567884	567889	100 %	0 %	0 %	0 %	218245425
11490	NC_011726	TAT	2	6	567932	567937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245425
11491	NC_011726	TAAAT	2	10	567976	567985	60 %	40 %	0 %	0 %	218245425
11492	NC_011726	TCA	4	12	568078	568089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245425
11493	NC_011726	CTGA	2	8	568107	568114	25 %	25 %	25 %	25 %	218245425
11494	NC_011726	ATC	2	6	568170	568175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245425
11495	NC_011726	AAT	2	6	568176	568181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245425
11496	NC_011726	CAG	2	6	568235	568240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245425
11497	NC_011726	TA	3	6	568289	568294	50 %	50 %	0 %	0 %	218245425
11498	NC_011726	TGAG	2	8	568316	568323	25 %	25 %	50 %	0 %	218245425
11499	NC_011726	TAA	2	6	568361	568366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245425
11500	NC_011726	TGA	2	6	568399	568404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245425

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