MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 96488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011726	TAA	2	6	23353	23358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244916
502	NC_011726	ATA	2	6	23392	23397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244916
503	NC_011726	TTC	2	6	23398	23403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244916
504	NC_011726	ATG	2	6	23410	23415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244916
505	NC_011726	GAC	2	6	23479	23484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244916
506	NC_011726	TCT	2	6	23501	23506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244916
507	NC_011726	TTG	2	6	23512	23517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244916
508	NC_011726	CT	3	6	23526	23531	0 %	50 %	0 %	50 %	218244916
509	NC_011726	GAC	2	6	23541	23546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244916
510	NC_011726	GAC	2	6	23551	23556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244916
511	NC_011726	ATA	2	6	23558	23563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244916
512	NC_011726	T	7	7	23577	23583	0 %	100 %	0 %	0 %	218244916
513	NC_011726	TTA	2	6	23585	23590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244916
514	NC_011726	TAT	2	6	23700	23705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244916
515	NC_011726	GATA	2	8	23733	23740	50 %	25 %	25 %	0 %	218244916
516	NC_011726	G	6	6	23753	23758	0 %	0 %	100 %	0 %	218244916
517	NC_011726	TTC	2	6	23847	23852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_011726	TGT	2	6	23868	23873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011726	CTA	2	6	23896	23901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_011726	TGT	2	6	23989	23994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244917
521	NC_011726	CAT	2	6	24023	24028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244917
522	NC_011726	TCT	2	6	24064	24069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244917
523	NC_011726	ATA	2	6	24079	24084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244917
524	NC_011726	AAC	2	6	24132	24137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244917
525	NC_011726	GTT	2	6	24179	24184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244917
526	NC_011726	ATA	2	6	24265	24270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244917
527	NC_011726	TCA	2	6	24271	24276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244917
528	NC_011726	ATT	2	6	24318	24323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244917
529	NC_011726	CAAACC	2	12	24377	24388	50 %	0 %	0 %	50 %	218244917
530	NC_011726	ACC	2	6	24393	24398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218244917
531	NC_011726	TTA	2	6	24448	24453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244917
532	NC_011726	TCT	2	6	24493	24498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244917
533	NC_011726	TCA	2	6	24547	24552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244917
534	NC_011726	CTT	2	6	24605	24610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244917
535	NC_011726	G	7	7	24628	24634	0 %	0 %	100 %	0 %	218244917
536	NC_011726	AATT	2	8	24639	24646	50 %	50 %	0 %	0 %	218244917
537	NC_011726	ATC	2	6	24691	24696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244917
538	NC_011726	AAAT	2	8	24711	24718	75 %	25 %	0 %	0 %	218244917
539	NC_011726	T	6	6	24802	24807	0 %	100 %	0 %	0 %	218244917
540	NC_011726	CTT	3	9	24854	24862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244917
541	NC_011726	AAC	2	6	24901	24906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244917
542	NC_011726	TTA	2	6	24931	24936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244917
543	NC_011726	CGA	2	6	24986	24991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244917
544	NC_011726	TAT	2	6	25031	25036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244917
545	NC_011726	TTTG	2	8	25057	25064	0 %	75 %	25 %	0 %	218244917
546	NC_011726	AATG	2	8	25079	25086	50 %	25 %	25 %	0 %	218244917
547	NC_011726	TCA	2	6	25099	25104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244917
548	NC_011726	AGGA	2	8	25125	25132	50 %	0 %	50 %	0 %	218244917
549	NC_011726	GCT	3	9	25165	25173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244917
550	NC_011726	GTC	2	6	25345	25350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244917
551	NC_011726	C	6	6	25367	25372	0 %	0 %	0 %	100 %	218244917
552	NC_011726	AGG	2	6	25390	25395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218244917
553	NC_011726	GCA	2	6	25399	25404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244917
554	NC_011726	GAT	2	6	25464	25469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244917
555	NC_011726	CGA	2	6	25493	25498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244917
556	NC_011726	TCTT	2	8	25509	25516	0 %	75 %	0 %	25 %	218244917
557	NC_011726	TTG	2	6	25606	25611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244917
558	NC_011726	ACG	2	6	25692	25697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244917
559	NC_011726	CCA	2	6	25739	25744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218244917
560	NC_011726	CTT	2	6	25760	25765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244917
561	NC_011726	GTG	2	6	25817	25822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218244917
562	NC_011726	AGC	2	6	25851	25856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244917
563	NC_011726	CTT	2	6	26012	26017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244917
564	NC_011726	TTA	2	6	26026	26031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244917
565	NC_011726	CCT	2	6	26095	26100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218244917
566	NC_011726	TTGT	2	8	26129	26136	0 %	75 %	25 %	0 %	218244917
567	NC_011726	TTCC	2	8	26183	26190	0 %	50 %	0 %	50 %	218244917
568	NC_011726	AGG	2	6	26206	26211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218244917
569	NC_011726	GCG	2	6	26241	26246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218244917
570	NC_011726	TTC	2	6	26335	26340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_011726	TCT	2	6	26431	26436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_011726	TAGT	2	8	26472	26479	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011726	CAAT	2	8	26504	26511	50 %	25 %	0 %	25 %	218244918
574	NC_011726	ATC	2	6	26562	26567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244918
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577	NC_011726	AACG	2	8	26654	26661	50 %	0 %	25 %	25 %	218244918
578	NC_011726	T	6	6	26750	26755	0 %	100 %	0 %	0 %	218244918
579	NC_011726	CTAT	2	8	26764	26771	25 %	50 %	0 %	25 %	218244918
580	NC_011726	A	6	6	26863	26868	100 %	0 %	0 %	0 %	218244918
581	NC_011726	A	6	6	26888	26893	100 %	0 %	0 %	0 %	218244918
582	NC_011726	TCG	2	6	26909	26914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244918
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584	NC_011726	TGA	2	6	27125	27130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244918
585	NC_011726	ATTTAG	2	12	27233	27244	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218244918
586	NC_011726	T	6	6	27252	27257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_011726	GAC	3	9	27326	27334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244919
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591	NC_011726	GAAA	2	8	27419	27426	75 %	0 %	25 %	0 %	218244919
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598	NC_011726	T	6	6	27602	27607	0 %	100 %	0 %	0 %	218244919
599	NC_011726	CTT	2	6	27629	27634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244919
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611	NC_011726	AGC	2	6	28146	28151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244919
612	NC_011726	TAA	2	6	28176	28181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244919
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615	NC_011726	CATA	2	8	28298	28305	50 %	25 %	0 %	25 %	218244919
616	NC_011726	T	7	7	28339	28345	0 %	100 %	0 %	0 %	218244919
617	NC_011726	T	8	8	28440	28447	0 %	100 %	0 %	0 %	218244919
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621	NC_011726	ATT	2	6	28636	28641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011726	TAA	2	6	28664	28669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011726	TCAT	2	8	28726	28733	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
624	NC_011726	T	7	7	28749	28755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_011726	A	7	7	28789	28795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_011726	AAT	2	6	28877	28882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_011726	A	6	6	28926	28931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_011726	TCA	2	6	29082	29087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244920
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