MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 96488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011726	TTC	2	6	289333	289338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245183
6002	NC_011726	ATT	2	6	289348	289353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245183
6003	NC_011726	CT	3	6	289401	289406	0 %	50 %	0 %	50 %	218245184
6004	NC_011726	GAA	2	6	289408	289413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245184
6005	NC_011726	A	6	6	289441	289446	100 %	0 %	0 %	0 %	218245184
6006	NC_011726	AGC	2	6	289530	289535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245184
6007	NC_011726	AGTT	2	8	289565	289572	25 %	50 %	25 %	0 %	218245184
6008	NC_011726	ATT	2	6	289687	289692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245184
6009	NC_011726	TTA	2	6	289792	289797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245184
6010	NC_011726	GAA	2	6	289810	289815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245184
6011	NC_011726	C	6	6	289819	289824	0 %	0 %	0 %	100 %	218245184
6012	NC_011726	GATT	2	8	289947	289954	25 %	50 %	25 %	0 %	218245184
6013	NC_011726	ACC	2	6	289993	289998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245184
6014	NC_011726	CCA	2	6	290110	290115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245185
6015	NC_011726	AGG	2	6	290121	290126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245185
6016	NC_011726	GAA	2	6	290135	290140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245185
6017	NC_011726	CATAA	2	10	290173	290182	60 %	20 %	0 %	20 %	218245185
6018	NC_011726	CGA	2	6	290214	290219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245185
6019	NC_011726	T	6	6	290261	290266	0 %	100 %	0 %	0 %	218245185
6020	NC_011726	A	6	6	290300	290305	100 %	0 %	0 %	0 %	218245185
6021	NC_011726	CTC	2	6	290339	290344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245185
6022	NC_011726	GTTC	2	8	290350	290357	0 %	50 %	25 %	25 %	218245185
6023	NC_011726	TC	3	6	290356	290361	0 %	50 %	0 %	50 %	218245185
6024	NC_011726	A	6	6	290406	290411	100 %	0 %	0 %	0 %	218245185
6025	NC_011726	TTA	2	6	290420	290425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245185
6026	NC_011726	A	6	6	290470	290475	100 %	0 %	0 %	0 %	218245185
6027	NC_011726	ATT	2	6	290488	290493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245185
6028	NC_011726	TTG	2	6	290630	290635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245185
6029	NC_011726	CAC	2	6	290637	290642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245185
6030	NC_011726	GATGAA	2	12	290644	290655	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218245185
6031	NC_011726	CAT	2	6	290755	290760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245185
6032	NC_011726	GATTA	2	10	290777	290786	40 %	40 %	20 %	0 %	218245185
6033	NC_011726	T	8	8	290810	290817	0 %	100 %	0 %	0 %	218245185
6034	NC_011726	AAG	2	6	290822	290827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245185
6035	NC_011726	ACA	2	6	290841	290846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245185
6036	NC_011726	ACCTTA	2	12	290863	290874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245185
6037	NC_011726	TGT	2	6	291054	291059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245185
6038	NC_011726	AT	3	6	291144	291149	50 %	50 %	0 %	0 %	218245185
6039	NC_011726	AAC	2	6	291173	291178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245185
6040	NC_011726	AGA	2	6	291189	291194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245185
6041	NC_011726	GAC	2	6	291209	291214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245185
6042	NC_011726	GAA	2	6	291223	291228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245185
6043	NC_011726	GGGT	2	8	291290	291297	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_011726	ATA	2	6	291466	291471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245186
6045	NC_011726	TAC	2	6	291486	291491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245186
6046	NC_011726	AGA	2	6	291515	291520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245186
6047	NC_011726	TCAAT	2	10	291525	291534	40 %	40 %	0 %	20 %	218245186
6048	NC_011726	ATA	2	6	291556	291561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245186
6049	NC_011726	ATT	2	6	291566	291571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245186
6050	NC_011726	TGT	2	6	291577	291582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245186
6051	NC_011726	AAAT	2	8	291600	291607	75 %	25 %	0 %	0 %	218245186
6052	NC_011726	AAAT	2	8	291619	291626	75 %	25 %	0 %	0 %	218245186
6053	NC_011726	C	6	6	291641	291646	0 %	0 %	0 %	100 %	218245186
6054	NC_011726	A	6	6	291731	291736	100 %	0 %	0 %	0 %	218245186
6055	NC_011726	A	6	6	291753	291758	100 %	0 %	0 %	0 %	218245186
6056	NC_011726	GAA	2	6	291762	291767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245186
6057	NC_011726	TTA	2	6	291822	291827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245186
6058	NC_011726	TAAT	2	8	291933	291940	50 %	50 %	0 %	0 %	218245186
6059	NC_011726	ACT	2	6	291946	291951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245186
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6061	NC_011726	AG	3	6	292011	292016	50 %	0 %	50 %	0 %	218245186
6062	NC_011726	CAA	2	6	292065	292070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245186
6063	NC_011726	AAT	2	6	292075	292080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245186
6064	NC_011726	CCA	2	6	292098	292103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245186
6065	NC_011726	ACG	2	6	292168	292173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245186
6066	NC_011726	GAT	2	6	292188	292193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245186
6067	NC_011726	CAT	2	6	292260	292265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245186
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6070	NC_011726	TAA	2	6	292428	292433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245186
6071	NC_011726	GAG	2	6	292437	292442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245186
6072	NC_011726	A	6	6	292476	292481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_011726	TAA	2	6	292483	292488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_011726	CAA	2	6	292515	292520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_011726	TGT	2	6	292555	292560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_011726	TG	3	6	292586	292591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_011726	TTA	2	6	292627	292632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_011726	ATTC	2	8	292860	292867	25 %	50 %	0 %	25 %	218245187
6079	NC_011726	GTG	2	6	292873	292878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245187
6080	NC_011726	ATG	2	6	293071	293076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245187
6081	NC_011726	CGA	2	6	293102	293107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245187
6082	NC_011726	CCA	2	6	293170	293175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245187
6083	NC_011726	AAG	2	6	293209	293214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245187
6084	NC_011726	ACCC	2	8	293265	293272	25 %	0 %	0 %	75 %	218245187
6085	NC_011726	GAA	2	6	293283	293288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245187
6086	NC_011726	ATC	2	6	293325	293330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245187
6087	NC_011726	CCG	2	6	293362	293367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218245187
6088	NC_011726	CAA	2	6	293420	293425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245187
6089	NC_011726	CAA	2	6	293694	293699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245188
6090	NC_011726	TTA	2	6	293836	293841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245188
6091	NC_011726	AAG	2	6	293842	293847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245188
6092	NC_011726	TCAAG	2	10	293870	293879	40 %	20 %	20 %	20 %	218245188
6093	NC_011726	CAAA	2	8	293894	293901	75 %	0 %	0 %	25 %	218245188
6094	NC_011726	GCA	2	6	293964	293969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245188
6095	NC_011726	AAT	2	6	293977	293982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245188
6096	NC_011726	TGA	2	6	293983	293988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_011726	GCT	2	6	294085	294090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245189
6098	NC_011726	TCCAAG	2	12	294186	294197	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218245189
6099	NC_011726	GGC	2	6	294303	294308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218245189
6100	NC_011726	T	6	6	294325	294330	0 %	100 %	0 %	0 %	218245189
6101	NC_011726	CGCC	2	8	294340	294347	0 %	0 %	25 %	75 %	218245189
6102	NC_011726	ACAACG	2	12	294358	294369	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	218245189
6103	NC_011726	CAGGT	2	10	294390	294399	20 %	20 %	40 %	20 %	218245189
6104	NC_011726	T	6	6	294535	294540	0 %	100 %	0 %	0 %	218245189
6105	NC_011726	GTG	2	6	294687	294692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245189
6106	NC_011726	CTA	2	6	294835	294840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245189
6107	NC_011726	GTG	2	6	294857	294862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245189
6108	NC_011726	CTA	2	6	294874	294879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245189
6109	NC_011726	CCT	2	6	294907	294912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245189
6110	NC_011726	ATTTT	2	10	294967	294976	20 %	80 %	0 %	0 %	218245189
6111	NC_011726	T	7	7	294973	294979	0 %	100 %	0 %	0 %	218245189
6112	NC_011726	GCT	2	6	295010	295015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245189
6113	NC_011726	TTA	2	6	295048	295053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245189
6114	NC_011726	C	6	6	295116	295121	0 %	0 %	0 %	100 %	218245189
6115	NC_011726	ACA	2	6	295129	295134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245189
6116	NC_011726	GAC	2	6	295150	295155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245189
6117	NC_011726	TCT	2	6	295173	295178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245189
6118	NC_011726	GTG	3	9	295247	295255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245189
6119	NC_011726	CAA	2	6	295337	295342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245189
6120	NC_011726	GAA	2	6	295499	295504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245189
6121	NC_011726	GAA	2	6	295553	295558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245189
6122	NC_011726	AGA	2	6	295609	295614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245189
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6124	NC_011726	AAG	2	6	295763	295768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245189
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