MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 96488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011726	ATC	2	6	241859	241864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245146
5002	NC_011726	AAC	2	6	241919	241924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245146
5003	NC_011726	AG	3	6	241960	241965	50 %	0 %	50 %	0 %	218245146
5004	NC_011726	GCA	2	6	242030	242035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245146
5005	NC_011726	T	6	6	242068	242073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_011726	ATT	2	6	242121	242126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_011726	AAC	2	6	242220	242225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_011726	TAT	2	6	242234	242239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_011726	CCA	2	6	242256	242261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_011726	ACC	2	6	242265	242270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_011726	A	6	6	242480	242485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_011726	TC	3	6	242511	242516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5013	NC_011726	ATC	2	6	242575	242580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_011726	TTG	2	6	242583	242588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_011726	TCA	2	6	242665	242670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245147
5016	NC_011726	AGA	2	6	242713	242718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245147
5017	NC_011726	CAA	2	6	242750	242755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245147
5018	NC_011726	GCG	2	6	242768	242773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218245147
5019	NC_011726	GCG	2	6	242822	242827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218245147
5020	NC_011726	CGG	2	6	242898	242903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218245147
5021	NC_011726	A	6	6	243017	243022	100 %	0 %	0 %	0 %	218245147
5022	NC_011726	CAA	2	6	243167	243172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245147
5023	NC_011726	ATC	2	6	243255	243260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245147
5024	NC_011726	GTC	2	6	243306	243311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245147
5025	NC_011726	ATG	2	6	243314	243319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245147
5026	NC_011726	CTGT	2	8	243548	243555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_011726	AAG	2	6	243569	243574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_011726	GTCAT	2	10	243634	243643	20 %	40 %	20 %	20 %	218245148
5029	NC_011726	TTA	2	6	243663	243668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245148
5030	NC_011726	TTG	2	6	243757	243762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245148
5031	NC_011726	AGT	2	6	243765	243770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245148
5032	NC_011726	TTC	2	6	243781	243786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245148
5033	NC_011726	T	6	6	243863	243868	0 %	100 %	0 %	0 %	218245148
5034	NC_011726	ATC	2	6	243928	243933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245148
5035	NC_011726	ATT	2	6	243969	243974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245148
5036	NC_011726	AGA	2	6	244031	244036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245148
5037	NC_011726	TTG	2	6	244065	244070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245148
5038	NC_011726	CGA	2	6	244179	244184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245148
5039	NC_011726	CT	4	8	244185	244192	0 %	50 %	0 %	50 %	218245148
5040	NC_011726	ATT	2	6	244266	244271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245148
5041	NC_011726	CA	3	6	244322	244327	50 %	0 %	0 %	50 %	218245148
5042	NC_011726	TTA	2	6	244390	244395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245148
5043	NC_011726	CTTT	2	8	244436	244443	0 %	75 %	0 %	25 %	218245148
5044	NC_011726	CCT	2	6	244478	244483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245148
5045	NC_011726	TATT	2	8	244511	244518	25 %	75 %	0 %	0 %	218245148
5046	NC_011726	ACTTAA	2	12	244578	244589	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218245148
5047	NC_011726	TAA	2	6	244691	244696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_011726	AAC	2	6	244742	244747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_011726	AAT	3	9	244963	244971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_011726	TGT	2	6	244979	244984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_011726	AGT	2	6	245079	245084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245149
5052	NC_011726	GCT	2	6	245214	245219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245149
5053	NC_011726	GAT	2	6	245247	245252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245149
5054	NC_011726	CAT	2	6	245277	245282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245149
5055	NC_011726	TTC	2	6	245293	245298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245149
5056	NC_011726	TGA	2	6	245375	245380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245149
5057	NC_011726	AGC	2	6	245405	245410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245149
5058	NC_011726	GGA	2	6	245595	245600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245149
5059	NC_011726	ATCTT	2	10	245692	245701	20 %	60 %	0 %	20 %	218245149
5060	NC_011726	ATTGA	2	10	245766	245775	40 %	40 %	20 %	0 %	218245149
5061	NC_011726	AC	3	6	245885	245890	50 %	0 %	0 %	50 %	218245149
5062	NC_011726	GAT	2	6	245916	245921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245149
5063	NC_011726	A	6	6	245953	245958	100 %	0 %	0 %	0 %	218245149
5064	NC_011726	GCA	3	9	246090	246098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245149
5065	NC_011726	TAC	2	6	246106	246111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245149
5066	NC_011726	GCT	2	6	246153	246158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245149
5067	NC_011726	GA	3	6	246169	246174	50 %	0 %	50 %	0 %	218245149
5068	NC_011726	GAA	2	6	246198	246203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245149
5069	NC_011726	GAA	2	6	246210	246215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245149
5070	NC_011726	ACC	2	6	246257	246262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245149
5071	NC_011726	AAC	2	6	246277	246282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245149
5072	NC_011726	ATCA	2	8	246314	246321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5073	NC_011726	ACA	2	6	246330	246335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_011726	ATA	2	6	246339	246344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_011726	ATT	2	6	246373	246378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_011726	TTC	2	6	246386	246391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_011726	CATT	2	8	246392	246399	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5078	NC_011726	ATT	2	6	246403	246408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_011726	AGA	2	6	246427	246432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_011726	TTG	2	6	246455	246460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_011726	A	6	6	246485	246490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_011726	CAC	2	6	246538	246543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5083	NC_011726	AAT	2	6	246545	246550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_011726	AT	3	6	246558	246563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_011726	TTA	2	6	246612	246617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_011726	ATT	2	6	246656	246661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_011726	AG	3	6	246668	246673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_011726	TAA	2	6	246706	246711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_011726	AGC	3	9	246824	246832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245150
5090	NC_011726	CAA	2	6	246905	246910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245150
5091	NC_011726	TTC	2	6	246923	246928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245150
5092	NC_011726	C	6	6	246984	246989	0 %	0 %	0 %	100 %	218245150
5093	NC_011726	TGC	2	6	246992	246997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245150
5094	NC_011726	CTT	2	6	247021	247026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245150
5095	NC_011726	ACC	2	6	247056	247061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245150
5096	NC_011726	CAG	2	6	247171	247176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245150
5097	NC_011726	CTG	2	6	247245	247250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245150
5098	NC_011726	TGA	2	6	247320	247325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245150
5099	NC_011726	TCC	2	6	247328	247333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245150
5100	NC_011726	TTGA	2	8	247343	247350	25 %	50 %	25 %	0 %	218245150
5101	NC_011726	TCA	2	6	247368	247373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245150
5102	NC_011726	GCT	2	6	247395	247400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245150
5103	NC_011726	CAT	2	6	247423	247428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245150
5104	NC_011726	TGC	2	6	247481	247486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245150
5105	NC_011726	GAC	2	6	247498	247503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245150
5106	NC_011726	CTT	3	9	247525	247533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245150
5107	NC_011726	CAA	2	6	247552	247557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245150
5108	NC_011726	TGA	2	6	247565	247570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245150
5109	NC_011726	CCT	2	6	247577	247582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245150
5110	NC_011726	ATA	2	6	247647	247652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245150
5111	NC_011726	TAA	2	6	247665	247670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_011726	CAA	2	6	247689	247694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_011726	AAC	2	6	247695	247700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_011726	AAT	2	6	247752	247757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_011726	GCT	2	6	247772	247777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_011726	TCA	2	6	247818	247823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_011726	TGA	2	6	247947	247952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245151
5118	NC_011726	GCA	2	6	247968	247973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245151
5119	NC_011726	T	6	6	248025	248030	0 %	100 %	0 %	0 %	218245151
5120	NC_011726	TCC	2	6	248148	248153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245151
5121	NC_011726	AGA	2	6	248163	248168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245151
5122	NC_011726	ATT	2	6	248192	248197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245151
5123	NC_011726	CTGAAA	2	12	248222	248233	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218245151
5124	NC_011726	GAT	2	6	248238	248243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245151
5125	NC_011726	AG	3	6	248244	248249	50 %	0 %	50 %	0 %	218245151
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5230	NC_011726	TA	3	6	253769	253774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5231	NC_011726	CAA	2	6	253789	253794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5232	NC_011726	TAT	2	6	253847	253852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5233	NC_011726	AAAT	2	8	253853	253860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5234	NC_011726	ATTA	2	8	253867	253874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5235	NC_011726	AGG	2	6	253919	253924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5236	NC_011726	TCT	2	6	253935	253940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5237	NC_011726	A	7	7	253948	253954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5238	NC_011726	TTAAG	2	10	253969	253978	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5239	NC_011726	AT	3	6	254052	254057	50 %	50 %	0 %	0 %	218245157
5240	NC_011726	AACAA	2	10	254150	254159	80 %	0 %	0 %	20 %	218245157
5241	NC_011726	TC	3	6	254175	254180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5242	NC_011726	G	6	6	254191	254196	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_011726	CTA	2	6	254241	254246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5244	NC_011726	TGG	2	6	254248	254253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5245	NC_011726	ACTG	2	8	254285	254292	25 %	25 %	25 %	25 %	218245158
5246	NC_011726	TCC	2	6	254326	254331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245158
5247	NC_011726	GAC	2	6	254393	254398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245158
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5374	NC_011726	A	6	6	260181	260186	100 %	0 %	0 %	0 %	218245163
5375	NC_011726	TTG	2	6	260221	260226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245163
5376	NC_011726	T	6	6	260247	260252	0 %	100 %	0 %	0 %	218245163
5377	NC_011726	TTA	2	6	260296	260301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245163
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5410	NC_011726	TGAAT	2	10	262046	262055	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5411	NC_011726	T	6	6	262074	262079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5412	NC_011726	TTA	2	6	262199	262204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5413	NC_011726	TGT	2	6	262208	262213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5415	NC_011726	TCCCCC	2	12	262270	262281	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
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5497	NC_011726	A	6	6	266282	266287	100 %	0 %	0 %	0 %	218245167
5498	NC_011726	TTG	3	9	266404	266412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245167
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