MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880102

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011723	AATTT	2	10	183	192	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011723	ACCAA	2	10	218	227	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011723	TCTTG	2	10	372	381	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011723	TTTGA	2	10	813	822	20 %	60 %	20 %	0 %	218203934
5	NC_011723	TTTTC	2	10	2351	2360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011723	GTGAC	2	10	2789	2798	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011723	TTGTC	2	10	3039	3048	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011723	CTATC	2	10	3752	3761	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_011723	GACTT	2	10	7124	7133	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011723	GTTTC	2	10	7969	7978	0 %	60 %	20 %	20 %	218203939
11	NC_011723	TTCTA	2	10	8368	8377	20 %	60 %	0 %	20 %	218203939
12	NC_011723	CTACG	2	10	8760	8769	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_011723	ATTTC	2	10	9294	9303	20 %	60 %	0 %	20 %	218203940
14	NC_011723	CAGAA	2	10	9384	9393	60 %	0 %	20 %	20 %	218203941
15	NC_011723	GAAAT	2	10	10635	10644	60 %	20 %	20 %	0 %	218203942
16	NC_011723	CCCAA	2	10	10774	10783	40 %	0 %	0 %	60 %	218203942
17	NC_011723	TAACG	2	10	13609	13618	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011723	ATCAG	2	10	13997	14006	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011723	TTAAT	2	10	14511	14520	40 %	60 %	0 %	0 %	218203946
20	NC_011723	ATTAA	2	10	17594	17603	60 %	40 %	0 %	0 %	218203950
21	NC_011723	TGACA	2	10	21167	21176	40 %	20 %	20 %	20 %	218203955
22	NC_011723	TCTTT	2	10	21817	21826	0 %	80 %	0 %	20 %	218203955
23	NC_011723	AAATC	2	10	22955	22964	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011723	GAGTA	2	10	23810	23819	40 %	20 %	40 %	0 %	218203956
25	NC_011723	TTAAC	2	10	25433	25442	40 %	40 %	0 %	20 %	218203956
26	NC_011723	TCCCA	2	10	26530	26539	20 %	20 %	0 %	60 %	218203956
27	NC_011723	TTTGG	2	10	26569	26578	0 %	60 %	40 %	0 %	218203956
28	NC_011723	GACTT	2	10	27917	27926	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011723	GTTTC	2	10	28762	28771	0 %	60 %	20 %	20 %	218203959
30	NC_011723	TTCTA	2	10	29161	29170	20 %	60 %	0 %	20 %	218203959
31	NC_011723	ATTAA	2	10	31381	31390	60 %	40 %	0 %	0 %	218203963
32	NC_011723	TCATA	2	10	34792	34801	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011723	CTTAA	2	10	36008	36017	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011723	ACAAA	2	10	36898	36907	80 %	0 %	0 %	20 %	218203973
35	NC_011723	TAGAA	2	10	37935	37944	60 %	20 %	20 %	0 %	218203974
36	NC_011723	GAAAC	2	10	38334	38343	60 %	0 %	20 %	20 %	218203974
37	NC_011723	AAGTC	2	10	39179	39188	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011723	CCTGT	2	10	39422	39431	0 %	40 %	20 %	40 %	218203975

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.