MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880102

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011723	AAAC	2	8	153	160	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011723	GCAG	2	8	451	458	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011723	TCTT	2	8	678	685	0 %	75 %	0 %	25 %	218203934
4	NC_011723	TCTT	2	8	760	767	0 %	75 %	0 %	25 %	218203934
5	NC_011723	CAAT	2	8	1070	1077	50 %	25 %	0 %	25 %	218203934
6	NC_011723	CAAT	2	8	1394	1401	50 %	25 %	0 %	25 %	218203934
7	NC_011723	TGTT	2	8	1440	1447	0 %	75 %	25 %	0 %	218203934
8	NC_011723	TTCA	2	8	1585	1592	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011723	AATT	2	8	1654	1661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011723	TTCT	2	8	1863	1870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011723	TCTT	2	8	2377	2384	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011723	AAAG	2	8	2458	2465	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011723	GAAT	2	8	2614	2621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011723	CAAT	2	8	2837	2844	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011723	GAAG	2	8	3074	3081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011723	CAAT	2	8	3086	3093	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011723	TTTA	2	8	3345	3352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011723	TAAT	2	8	3365	3372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011723	TGTT	2	8	4665	4672	0 %	75 %	25 %	0 %	218203936
20	NC_011723	AGCC	2	8	5947	5954	25 %	0 %	25 %	50 %	218203937
21	NC_011723	TTTA	2	8	6176	6183	25 %	75 %	0 %	0 %	218203938
22	NC_011723	TAGA	2	8	8582	8589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011723	TGCT	2	8	8857	8864	0 %	50 %	25 %	25 %	218203940
24	NC_011723	GGTA	2	8	8929	8936	25 %	25 %	50 %	0 %	218203940
25	NC_011723	TAAG	2	8	9103	9110	50 %	25 %	25 %	0 %	218203940
26	NC_011723	GCAC	2	8	9550	9557	25 %	0 %	25 %	50 %	218203941
27	NC_011723	AAGC	2	8	9691	9698	50 %	0 %	25 %	25 %	218203941
28	NC_011723	CAAA	2	8	10016	10023	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011723	AAAG	2	8	10062	10069	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011723	TTAT	2	8	10450	10457	25 %	75 %	0 %	0 %	218203942
31	NC_011723	TATT	2	8	10674	10681	25 %	75 %	0 %	0 %	218203942
32	NC_011723	TTTG	2	8	10922	10929	0 %	75 %	25 %	0 %	218203942
33	NC_011723	CTTT	2	8	11482	11489	0 %	75 %	0 %	25 %	218203943
34	NC_011723	AATT	2	8	11882	11889	50 %	50 %	0 %	0 %	218203944
35	NC_011723	AGCA	2	8	11960	11967	50 %	0 %	25 %	25 %	218203944
36	NC_011723	TGGG	2	8	12587	12594	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011723	AAAC	2	8	12679	12686	75 %	0 %	0 %	25 %	218203945
38	NC_011723	AACT	2	8	12755	12762	50 %	25 %	0 %	25 %	218203945
39	NC_011723	TAAG	2	8	12918	12925	50 %	25 %	25 %	0 %	218203945
40	NC_011723	TTGC	2	8	13811	13818	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011723	TTTC	2	8	14050	14057	0 %	75 %	0 %	25 %	218203946
42	NC_011723	GTCT	2	8	14183	14190	0 %	50 %	25 %	25 %	218203946
43	NC_011723	CAAT	2	8	14651	14658	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011723	TTGC	2	8	14887	14894	0 %	50 %	25 %	25 %	218203947
45	NC_011723	TTTG	2	8	15218	15225	0 %	75 %	25 %	0 %	218203947
46	NC_011723	CGAA	2	8	15664	15671	50 %	0 %	25 %	25 %	218203947
47	NC_011723	TTGC	2	8	15735	15742	0 %	50 %	25 %	25 %	218203947
48	NC_011723	GCTG	2	8	16233	16240	0 %	25 %	50 %	25 %	218203948
49	NC_011723	AGTT	2	8	17134	17141	25 %	50 %	25 %	0 %	218203950
50	NC_011723	ACTA	2	8	17149	17156	50 %	25 %	0 %	25 %	218203950
51	NC_011723	CCGT	2	8	18541	18548	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011723	ACGG	2	8	18552	18559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011723	CTTG	2	8	18896	18903	0 %	50 %	25 %	25 %	218203952
54	NC_011723	TAAA	2	8	19526	19533	75 %	25 %	0 %	0 %	218203953
55	NC_011723	CAAA	2	8	20278	20285	75 %	0 %	0 %	25 %	218203953
56	NC_011723	TTAT	2	8	20382	20389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011723	TAAA	2	8	20391	20398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011723	AGTT	2	8	20526	20533	25 %	50 %	25 %	0 %	218203954
59	NC_011723	TAGA	2	8	20914	20921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011723	TTGA	2	8	20996	21003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011723	TTAA	2	8	21231	21238	50 %	50 %	0 %	0 %	218203955
62	NC_011723	CAAA	2	8	21405	21412	75 %	0 %	0 %	25 %	218203955
63	NC_011723	TCAA	2	8	21425	21432	50 %	25 %	0 %	25 %	218203955
64	NC_011723	TCAA	2	8	21497	21504	50 %	25 %	0 %	25 %	218203955
65	NC_011723	CTCA	2	8	21577	21584	25 %	25 %	0 %	50 %	218203955
66	NC_011723	AATC	2	8	21606	21613	50 %	25 %	0 %	25 %	218203955
67	NC_011723	GAAA	2	8	21918	21925	75 %	0 %	25 %	0 %	218203955
68	NC_011723	CTTA	2	8	22617	22624	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011723	CTTA	2	8	22631	22638	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011723	AGAC	2	8	22847	22854	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011723	ACAG	2	8	23470	23477	50 %	0 %	25 %	25 %	218203956
72	NC_011723	TAAC	2	8	23579	23586	50 %	25 %	0 %	25 %	218203956
73	NC_011723	AGAA	2	8	25157	25164	75 %	0 %	25 %	0 %	218203956
74	NC_011723	TCCT	2	8	25497	25504	0 %	50 %	0 %	50 %	218203956
75	NC_011723	CAGG	2	8	26008	26015	25 %	0 %	50 %	25 %	218203956
76	NC_011723	ACCG	2	8	27081	27088	25 %	0 %	25 %	50 %	218203956
77	NC_011723	CTTT	2	8	27104	27111	0 %	75 %	0 %	25 %	218203956
78	NC_011723	AATT	2	8	27287	27294	50 %	50 %	0 %	0 %	218203956
79	NC_011723	CAAA	2	8	27345	27352	75 %	0 %	0 %	25 %	218203957
80	NC_011723	CTTG	2	8	27654	27661	0 %	50 %	25 %	25 %	218203958
81	NC_011723	TAGA	2	8	29375	29382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011723	AATC	2	8	29731	29738	50 %	25 %	0 %	25 %	218203960
83	NC_011723	ACAA	2	8	29847	29854	75 %	0 %	0 %	25 %	218203960
84	NC_011723	CAAC	2	8	29905	29912	50 %	0 %	0 %	50 %	218203960
85	NC_011723	TTTC	2	8	30519	30526	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011723	ATTG	2	8	30680	30687	25 %	50 %	25 %	0 %	218203962
87	NC_011723	CTAT	2	8	30817	30824	25 %	50 %	0 %	25 %	218203962
88	NC_011723	TAAC	2	8	31174	31181	50 %	25 %	0 %	25 %	218203963
89	NC_011723	TTTC	2	8	31334	31341	0 %	75 %	0 %	25 %	218203963
90	NC_011723	AATT	2	8	31404	31411	50 %	50 %	0 %	0 %	218203963
91	NC_011723	TCTG	2	8	31726	31733	0 %	50 %	25 %	25 %	218203963
92	NC_011723	TTTC	2	8	31804	31811	0 %	75 %	0 %	25 %	218203963
93	NC_011723	GTTT	2	8	32053	32060	0 %	75 %	25 %	0 %	218203963
94	NC_011723	CTTA	2	8	32824	32831	25 %	50 %	0 %	25 %	218203965
95	NC_011723	AGTA	2	8	33172	33179	50 %	25 %	25 %	0 %	218203965
96	NC_011723	TCAC	2	8	33203	33210	25 %	25 %	0 %	50 %	218203966
97	NC_011723	GATT	2	8	34659	34666	25 %	50 %	25 %	0 %	218203969
98	NC_011723	AATT	2	8	34822	34829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011723	ATCA	2	8	34867	34874	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011723	TAAC	2	8	35610	35617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011723	GATA	2	8	35935	35942	50 %	25 %	25 %	0 %	218203972
102	NC_011723	ATTA	2	8	36487	36494	50 %	50 %	0 %	0 %	218203973
103	NC_011723	TTGC	2	8	37540	37547	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011723	TCTA	2	8	37723	37730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011723	AGAA	2	8	37990	37997	75 %	0 %	25 %	0 %	218203974
106	NC_011723	TTGT	2	8	38896	38903	0 %	75 %	25 %	0 %	218203974
107	NC_011723	TTTA	2	8	39530	39537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011723	ATCT	2	8	40301	40308	25 %	50 %	0 %	25 %	218203977
109	NC_011723	TGAG	2	8	40365	40372	25 %	25 %	50 %	0 %	218203977

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.