MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880102

Total Repeats: 831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011723	AAG	2	6	24611	24616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203956
502	NC_011723	AGA	2	6	24702	24707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203956
503	NC_011723	A	6	6	24718	24723	100 %	0 %	0 %	0 %	218203956
504	NC_011723	TC	3	6	24725	24730	0 %	50 %	0 %	50 %	218203956
505	NC_011723	TGA	2	6	24828	24833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203956
506	NC_011723	TTA	2	6	24856	24861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203956
507	NC_011723	TCA	2	6	24865	24870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203956
508	NC_011723	CTC	2	6	24916	24921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203956
509	NC_011723	A	6	6	25084	25089	100 %	0 %	0 %	0 %	218203956
510	NC_011723	ATA	2	6	25121	25126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203956
511	NC_011723	CAC	2	6	25143	25148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203956
512	NC_011723	AGAA	2	8	25157	25164	75 %	0 %	25 %	0 %	218203956
513	NC_011723	A	6	6	25207	25212	100 %	0 %	0 %	0 %	218203956
514	NC_011723	ACC	2	6	25234	25239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203956
515	NC_011723	AAG	2	6	25241	25246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203956
516	NC_011723	A	6	6	25288	25293	100 %	0 %	0 %	0 %	218203956
517	NC_011723	TAC	2	6	25314	25319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203956
518	NC_011723	AAG	2	6	25397	25402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203956
519	NC_011723	TTAAC	2	10	25433	25442	40 %	40 %	0 %	20 %	218203956
520	NC_011723	TCCT	2	8	25497	25504	0 %	50 %	0 %	50 %	218203956
521	NC_011723	CCT	3	9	25502	25510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203956
522	NC_011723	AT	3	6	25635	25640	50 %	50 %	0 %	0 %	218203956
523	NC_011723	ATG	2	6	25721	25726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203956
524	NC_011723	ATT	2	6	25850	25855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203956
525	NC_011723	AGA	2	6	25911	25916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203956
526	NC_011723	AAG	2	6	25925	25930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203956
527	NC_011723	CAGG	2	8	26008	26015	25 %	0 %	50 %	25 %	218203956
528	NC_011723	GAA	2	6	26032	26037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203956
529	NC_011723	AGA	2	6	26058	26063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203956
530	NC_011723	A	6	6	26095	26100	100 %	0 %	0 %	0 %	218203956
531	NC_011723	AGC	2	6	26130	26135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203956
532	NC_011723	AGA	2	6	26151	26156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203956
533	NC_011723	CGT	2	6	26199	26204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203956
534	NC_011723	ATC	2	6	26210	26215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203956
535	NC_011723	A	6	6	26284	26289	100 %	0 %	0 %	0 %	218203956
536	NC_011723	TGC	2	6	26473	26478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203956
537	NC_011723	GAC	2	6	26489	26494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203956
538	NC_011723	TCCCA	2	10	26530	26539	20 %	20 %	0 %	60 %	218203956
539	NC_011723	TTTGG	2	10	26569	26578	0 %	60 %	40 %	0 %	218203956
540	NC_011723	CAG	2	6	26590	26595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203956
541	NC_011723	TA	3	6	26755	26760	50 %	50 %	0 %	0 %	218203956
542	NC_011723	ACCG	2	8	27081	27088	25 %	0 %	25 %	50 %	218203956
543	NC_011723	CTTT	2	8	27104	27111	0 %	75 %	0 %	25 %	218203956
544	NC_011723	CGA	2	6	27148	27153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203956
545	NC_011723	GTT	2	6	27212	27217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203956
546	NC_011723	ACA	2	6	27228	27233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203956
547	NC_011723	AATT	2	8	27287	27294	50 %	50 %	0 %	0 %	218203956
548	NC_011723	ATC	2	6	27329	27334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_011723	CAAA	2	8	27345	27352	75 %	0 %	0 %	25 %	218203957
550	NC_011723	A	6	6	27350	27355	100 %	0 %	0 %	0 %	218203957
551	NC_011723	TAG	2	6	27380	27385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203957
552	NC_011723	TAA	2	6	27429	27434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203957
553	NC_011723	GA	3	6	27452	27457	50 %	0 %	50 %	0 %	218203957
554	NC_011723	GCC	2	6	27481	27486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218203957
555	NC_011723	GAA	2	6	27493	27498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203957
556	NC_011723	AGA	2	6	27501	27506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203957
557	NC_011723	CTTG	2	8	27654	27661	0 %	50 %	25 %	25 %	218203958
558	NC_011723	CAG	2	6	27763	27768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203958
559	NC_011723	ATT	2	6	27844	27849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203958
560	NC_011723	GACTT	2	10	27917	27926	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
561	NC_011723	TTA	2	6	27943	27948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011723	TAT	2	6	27970	27975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011723	T	7	7	28016	28022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011723	ATT	3	9	28025	28033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011723	A	6	6	28044	28049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011723	CGA	2	6	28105	28110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_011723	CAA	2	6	28200	28205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203959
568	NC_011723	TCT	2	6	28273	28278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203959
569	NC_011723	AT	3	6	28308	28313	50 %	50 %	0 %	0 %	218203959
570	NC_011723	TAA	2	6	28381	28386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203959
571	NC_011723	TCC	2	6	28438	28443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203959
572	NC_011723	TAA	2	6	28530	28535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203959
573	NC_011723	TTC	3	9	28543	28551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203959
574	NC_011723	TCT	2	6	28572	28577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203959
575	NC_011723	T	7	7	28631	28637	0 %	100 %	0 %	0 %	218203959
576	NC_011723	TTC	2	6	28688	28693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203959
577	NC_011723	CTT	2	6	28697	28702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203959
578	NC_011723	GTTTC	2	10	28762	28771	0 %	60 %	20 %	20 %	218203959
579	NC_011723	TAA	2	6	28822	28827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203959
580	NC_011723	AAT	2	6	28841	28846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203959
581	NC_011723	TGC	2	6	28887	28892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203959
582	NC_011723	T	6	6	28897	28902	0 %	100 %	0 %	0 %	218203959
583	NC_011723	CT	3	6	28932	28937	0 %	50 %	0 %	50 %	218203959
584	NC_011723	CTA	2	6	29034	29039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203959
585	NC_011723	ATA	2	6	29061	29066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203959
586	NC_011723	TCT	2	6	29106	29111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203959
587	NC_011723	AGGAAG	2	12	29134	29145	50 %	0 %	50 %	0 %	218203959
588	NC_011723	TTCTA	2	10	29161	29170	20 %	60 %	0 %	20 %	218203959
589	NC_011723	GTAAAA	2	12	29208	29219	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218203959
590	NC_011723	A	6	6	29267	29272	100 %	0 %	0 %	0 %	218203959
591	NC_011723	GAT	3	9	29279	29287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_011723	ATG	2	6	29296	29301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011723	TAGA	2	8	29375	29382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011723	T	6	6	29417	29422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_011723	TAC	2	6	29504	29509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_011723	CAG	2	6	29554	29559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_011723	TAC	2	6	29568	29573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_011723	GCT	2	6	29603	29608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_011723	G	6	6	29613	29618	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
600	NC_011723	C	6	6	29623	29628	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
601	NC_011723	C	6	6	29632	29637	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
602	NC_011723	TTG	2	6	29666	29671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011723	TAA	2	6	29677	29682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011723	ACA	2	6	29719	29724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_011723	AATC	2	8	29731	29738	50 %	25 %	0 %	25 %	218203960
606	NC_011723	AAT	2	6	29769	29774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203960
607	NC_011723	ATA	2	6	29813	29818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203960
608	NC_011723	T	6	6	29819	29824	0 %	100 %	0 %	0 %	218203960
609	NC_011723	ACAA	2	8	29847	29854	75 %	0 %	0 %	25 %	218203960
610	NC_011723	CAAC	2	8	29905	29912	50 %	0 %	0 %	50 %	218203960
611	NC_011723	CTT	2	6	29942	29947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203960
612	NC_011723	TTC	2	6	29997	30002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203960
613	NC_011723	CA	3	6	30037	30042	50 %	0 %	0 %	50 %	218203960
614	NC_011723	A	6	6	30053	30058	100 %	0 %	0 %	0 %	218203960
615	NC_011723	GGA	2	6	30281	30286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203961
616	NC_011723	CTT	2	6	30366	30371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203961
617	NC_011723	CTG	2	6	30375	30380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203961
618	NC_011723	GTG	2	6	30464	30469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203961
619	NC_011723	TAA	2	6	30503	30508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011723	TTTC	2	8	30519	30526	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_011723	TGA	3	9	30648	30656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203962
622	NC_011723	GAA	2	6	30665	30670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203962
623	NC_011723	ATTG	2	8	30680	30687	25 %	50 %	25 %	0 %	218203962
624	NC_011723	TAA	2	6	30783	30788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203962
625	NC_011723	TGT	2	6	30805	30810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203962
626	NC_011723	CTAT	2	8	30817	30824	25 %	50 %	0 %	25 %	218203962
627	NC_011723	TAA	2	6	30833	30838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203962
628	NC_011723	TCT	2	6	30842	30847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203962
629	NC_011723	TTG	2	6	30848	30853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011723	ATCTTC	2	12	30890	30901	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	218203963
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632	NC_011723	GAT	2	6	30922	30927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203963
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757	NC_011723	A	7	7	37273	37279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
758	NC_011723	GTA	2	6	37302	37307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
759	NC_011723	TCT	2	6	37322	37327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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