MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880101

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011721	GGAA	2	8	5	12	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011721	TTTG	2	8	185	192	0 %	75 %	25 %	0 %	218203845
3	NC_011721	CAGT	2	8	831	838	25 %	25 %	25 %	25 %	218203846
4	NC_011721	ATTA	2	8	992	999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011721	AATA	2	8	1135	1142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011721	GGAT	2	8	1461	1468	25 %	25 %	50 %	0 %	218203847
7	NC_011721	TTGA	2	8	2035	2042	25 %	50 %	25 %	0 %	218203848
8	NC_011721	CAAG	2	8	2111	2118	50 %	0 %	25 %	25 %	218203848
9	NC_011721	TGAT	2	8	2243	2250	25 %	50 %	25 %	0 %	218203848
10	NC_011721	TCAA	2	8	2405	2412	50 %	25 %	0 %	25 %	218203848
11	NC_011721	CAAC	2	8	3686	3693	50 %	0 %	0 %	50 %	218203849
12	NC_011721	TTTG	2	8	4280	4287	0 %	75 %	25 %	0 %	218203849
13	NC_011721	ATTG	2	8	5201	5208	25 %	50 %	25 %	0 %	218203849
14	NC_011721	TGTC	2	8	5457	5464	0 %	50 %	25 %	25 %	218203850
15	NC_011721	GTCT	2	8	5626	5633	0 %	50 %	25 %	25 %	218203850
16	NC_011721	CTGT	2	8	6093	6100	0 %	50 %	25 %	25 %	218203850
17	NC_011721	TTAA	2	8	6255	6262	50 %	50 %	0 %	0 %	218203850
18	NC_011721	TCTA	2	8	6591	6598	25 %	50 %	0 %	25 %	218203851
19	NC_011721	TGGC	2	8	6625	6632	0 %	25 %	50 %	25 %	218203851
20	NC_011721	TCAA	2	8	6681	6688	50 %	25 %	0 %	25 %	218203851
21	NC_011721	GTGA	2	8	6854	6861	25 %	25 %	50 %	0 %	218203851
22	NC_011721	GGCG	2	8	7006	7013	0 %	0 %	75 %	25 %	218203851
23	NC_011721	TGGC	2	8	7240	7247	0 %	25 %	50 %	25 %	218203851
24	NC_011721	GCAG	2	8	7324	7331	25 %	0 %	50 %	25 %	218203851
25	NC_011721	TAGA	2	8	8351	8358	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011721	TCCA	2	8	8632	8639	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011721	TAGA	2	8	8846	8853	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011721	GGAT	2	8	8964	8971	25 %	25 %	50 %	0 %	218203852
29	NC_011721	TCAT	2	8	10126	10133	25 %	50 %	0 %	25 %	218203854
30	NC_011721	TTAT	2	8	10226	10233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011721	GACT	2	8	10244	10251	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011721	TCAG	2	8	10258	10265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011721	ATTA	2	8	10500	10507	50 %	50 %	0 %	0 %	218203855
34	NC_011721	TAAG	2	8	10550	10557	50 %	25 %	25 %	0 %	218203855
35	NC_011721	AGTA	2	8	10643	10650	50 %	25 %	25 %	0 %	218203855
36	NC_011721	GTTT	2	8	10750	10757	0 %	75 %	25 %	0 %	218203855
37	NC_011721	CACT	2	8	11330	11337	25 %	25 %	0 %	50 %	218203855
38	NC_011721	TAAT	2	8	11547	11554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011721	TTAA	2	8	11609	11616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011721	AATT	2	8	12234	12241	50 %	50 %	0 %	0 %	218203857
41	NC_011721	CTAA	2	8	12466	12473	50 %	25 %	0 %	25 %	218203858
42	NC_011721	ACCT	2	8	12665	12672	25 %	25 %	0 %	50 %	218203858
43	NC_011721	TACT	2	8	13278	13285	25 %	50 %	0 %	25 %	218203859
44	NC_011721	TCTA	2	8	13801	13808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011721	AGAA	2	8	14068	14075	75 %	0 %	25 %	0 %	218203860
46	NC_011721	TTGT	2	8	14974	14981	0 %	75 %	25 %	0 %	218203860
47	NC_011721	TTTG	2	8	15614	15621	0 %	75 %	25 %	0 %	218203861
48	NC_011721	TTAA	2	8	15757	15764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011721	CTGA	2	8	16506	16513	25 %	25 %	25 %	25 %	218203863
50	NC_011721	TAAT	2	8	16972	16979	50 %	50 %	0 %	0 %	218203864
51	NC_011721	AATT	2	8	17050	17057	50 %	50 %	0 %	0 %	218203864
52	NC_011721	ATTA	2	8	17408	17415	50 %	50 %	0 %	0 %	218203864
53	NC_011721	GAAT	2	8	17855	17862	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011721	ATAA	2	8	18328	18335	75 %	25 %	0 %	0 %	218203866
55	NC_011721	TAAT	2	8	19522	19529	50 %	50 %	0 %	0 %	218203868
56	NC_011721	ATTG	2	8	19764	19771	25 %	50 %	25 %	0 %	218203868
57	NC_011721	GATA	2	8	20151	20158	50 %	25 %	25 %	0 %	218203869
58	NC_011721	TAAA	2	8	20173	20180	75 %	25 %	0 %	0 %	218203869
59	NC_011721	ATAG	2	8	20647	20654	50 %	25 %	25 %	0 %	218203870
60	NC_011721	TCAA	2	8	20692	20699	50 %	25 %	0 %	25 %	218203870
61	NC_011721	TTGA	2	8	20723	20730	25 %	50 %	25 %	0 %	218203870
62	NC_011721	ATCT	2	8	21488	21495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011721	ATTT	2	8	21598	21605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011721	ATTT	2	8	21876	21883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011721	TTCA	2	8	22596	22603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011721	CAGA	2	8	22649	22656	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011721	CGTC	2	8	22740	22747	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011721	CAGA	2	8	22889	22896	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011721	ATAC	2	8	22944	22951	50 %	25 %	0 %	25 %	218203873
70	NC_011721	AAAG	2	8	23037	23044	75 %	0 %	25 %	0 %	218203873
71	NC_011721	GAAG	2	8	23174	23181	50 %	0 %	50 %	0 %	218203873
72	NC_011721	AAAG	2	8	23218	23225	75 %	0 %	25 %	0 %	218203873
73	NC_011721	CAAA	2	8	23390	23397	75 %	0 %	0 %	25 %	218203873
74	NC_011721	GAAA	2	8	23422	23429	75 %	0 %	25 %	0 %	218203873
75	NC_011721	ATCC	2	8	23878	23885	25 %	25 %	0 %	50 %	218203874
76	NC_011721	TCTA	2	8	23996	24003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011721	TGGA	2	8	24210	24217	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011721	TCTA	2	8	24491	24498	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011721	TTCT	2	8	24722	24729	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011721	TTCT	2	8	25796	25803	0 %	75 %	0 %	25 %	218203875
81	NC_011721	TAAA	2	8	25903	25910	75 %	25 %	0 %	0 %	218203875
82	NC_011721	ATTC	2	8	26342	26349	25 %	50 %	0 %	25 %	218203876
83	NC_011721	GTTG	2	8	26764	26771	0 %	50 %	50 %	0 %	218203877
84	NC_011721	GGCT	2	8	27133	27140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011721	GACA	2	8	27202	27209	50 %	0 %	25 %	25 %	218203878
86	NC_011721	GCAG	2	8	27270	27277	25 %	0 %	50 %	25 %	218203878
87	NC_011721	CTTG	2	8	27472	27479	0 %	50 %	25 %	25 %	218203878
88	NC_011721	TCTG	2	8	27568	27575	0 %	50 %	25 %	25 %	218203878
89	NC_011721	AATC	2	8	27915	27922	50 %	25 %	0 %	25 %	218203879
90	NC_011721	TTCA	2	8	28474	28481	25 %	50 %	0 %	25 %	218203879
91	NC_011721	CTGA	2	8	28676	28683	25 %	25 %	25 %	25 %	218203879
92	NC_011721	TGGG	2	8	28727	28734	0 %	25 %	75 %	0 %	218203879
93	NC_011721	GTTT	2	8	28903	28910	0 %	75 %	25 %	0 %	218203879
94	NC_011721	ATAA	2	8	29352	29359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011721	ATTT	2	8	29555	29562	25 %	75 %	0 %	0 %	218203880
96	NC_011721	TCTA	2	8	30297	30304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011721	AGAA	2	8	30564	30571	75 %	0 %	25 %	0 %	218203881
98	NC_011721	TTGT	2	8	31470	31477	0 %	75 %	25 %	0 %	218203881
99	NC_011721	ATCT	2	8	32016	32023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011721	AATC	2	8	32145	32152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011721	ACAA	2	8	32346	32353	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_011721	TTTG	2	8	33511	33518	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011721	TGAT	2	8	33712	33719	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011721	TCTT	2	8	34100	34107	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011721	TAAT	2	8	34662	34669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011721	GATA	2	8	34857	34864	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011721	ATCA	2	8	34896	34903	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011721	GACA	2	8	35382	35389	50 %	0 %	25 %	25 %	218203882
109	NC_011721	CCAC	2	8	36089	36096	25 %	0 %	0 %	75 %	218203882
110	NC_011721	CAGT	2	8	36237	36244	25 %	25 %	25 %	25 %	218203882
111	NC_011721	AGCC	2	8	36276	36283	25 %	0 %	25 %	50 %	218203882
112	NC_011721	CGTC	2	8	36573	36580	0 %	25 %	25 %	50 %	218203882
113	NC_011721	CCTT	2	8	37354	37361	0 %	50 %	0 %	50 %	218203882
114	NC_011721	AACC	2	8	37392	37399	50 %	0 %	0 %	50 %	218203882
115	NC_011721	CGAA	2	8	37447	37454	50 %	0 %	25 %	25 %	218203882
116	NC_011721	CAAC	2	8	37614	37621	50 %	0 %	0 %	50 %	218203882
117	NC_011721	ATCC	2	8	37775	37782	25 %	25 %	0 %	50 %	218203882
118	NC_011721	GATG	2	8	37824	37831	25 %	25 %	50 %	0 %	218203882
119	NC_011721	GATG	2	8	37867	37874	25 %	25 %	50 %	0 %	218203882
120	NC_011721	CATC	2	8	38047	38054	25 %	25 %	0 %	50 %	218203882
121	NC_011721	TGAT	2	8	38072	38079	25 %	50 %	25 %	0 %	218203882
122	NC_011721	CTTT	2	8	38584	38591	0 %	75 %	0 %	25 %	218203883
123	NC_011721	TGGC	2	8	39456	39463	0 %	25 %	50 %	25 %	218203883
124	NC_011721	TAAC	2	8	39844	39851	50 %	25 %	0 %	25 %	218203884
125	NC_011721	GGTT	2	8	39944	39951	0 %	50 %	50 %	0 %	218203884
126	NC_011721	ATCA	2	8	39983	39990	50 %	25 %	0 %	25 %	218203884
127	NC_011721	AAGA	2	8	40716	40723	75 %	0 %	25 %	0 %	218203885
128	NC_011721	GAAT	2	8	41256	41263	50 %	25 %	25 %	0 %	218203886
129	NC_011721	TTAC	2	8	42493	42500	25 %	50 %	0 %	25 %	218203887
130	NC_011721	AAAT	2	8	42805	42812	75 %	25 %	0 %	0 %	218203887
131	NC_011721	TAAA	2	8	43082	43089	75 %	25 %	0 %	0 %	218203887
132	NC_011721	AGAT	2	8	43193	43200	50 %	25 %	25 %	0 %	218203887
133	NC_011721	TAAA	2	8	43362	43369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011721	TGGC	2	8	43856	43863	0 %	25 %	50 %	25 %	218203888
135	NC_011721	TCTA	2	8	44045	44052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011721	AGAA	2	8	44312	44319	75 %	0 %	25 %	0 %	218203889
137	NC_011721	TTGT	2	8	45218	45225	0 %	75 %	25 %	0 %	218203889
138	NC_011721	AAAT	2	8	45646	45653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011721	TTCT	2	8	47266	47273	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011721	ACAA	2	8	47329	47336	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011721	GACT	2	8	47342	47349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011721	TTGC	2	8	47889	47896	0 %	50 %	25 %	25 %	218203891
143	NC_011721	CAAA	2	8	48114	48121	75 %	0 %	0 %	25 %	218203891
144	NC_011721	CTAT	2	8	48344	48351	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_011721	TTAA	2	8	48642	48649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011721	TTGA	2	8	48659	48666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011721	AACG	2	8	48876	48883	50 %	0 %	25 %	25 %	218203893
148	NC_011721	AATT	2	8	49045	49052	50 %	50 %	0 %	0 %	218203893

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.