MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880101

Total Repeats: 1049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011721	AT	3	6	23254	23259	50 %	50 %	0 %	0 %	218203873
502	NC_011721	AG	3	6	23362	23367	50 %	0 %	50 %	0 %	218203873
503	NC_011721	CAAA	2	8	23390	23397	75 %	0 %	0 %	25 %	218203873
504	NC_011721	GAAA	2	8	23422	23429	75 %	0 %	25 %	0 %	218203873
505	NC_011721	AG	3	6	23537	23542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011721	AAC	2	6	23543	23548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_011721	TCA	2	6	23614	23619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203874
508	NC_011721	CTT	2	6	23683	23688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203874
509	NC_011721	TAA	2	6	23690	23695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203874
510	NC_011721	T	6	6	23766	23771	0 %	100 %	0 %	0 %	218203874
511	NC_011721	TGA	2	6	23793	23798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203874
512	NC_011721	ATA	2	6	23811	23816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203874
513	NC_011721	TA	3	6	23856	23861	50 %	50 %	0 %	0 %	218203874
514	NC_011721	GAG	2	6	23870	23875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203874
515	NC_011721	ATCC	2	8	23878	23885	25 %	25 %	0 %	50 %	218203874
516	NC_011721	T	6	6	23957	23962	0 %	100 %	0 %	0 %	218203874
517	NC_011721	TCTA	2	8	23996	24003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
518	NC_011721	TAA	2	6	24034	24039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011721	ATT	2	6	24202	24207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_011721	TGGA	2	8	24210	24217	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011721	TCA	2	6	24235	24240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_011721	T	6	6	24274	24279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_011721	TAA	2	6	24309	24314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011721	TTTTA	2	10	24328	24337	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_011721	GAA	2	6	24366	24371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011721	AAC	2	6	24400	24405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_011721	AAG	2	6	24464	24469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011721	TCTA	2	8	24491	24498	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
529	NC_011721	A	6	6	24596	24601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_011721	A	6	6	24689	24694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011721	TTA	2	6	24697	24702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011721	TTCT	2	8	24722	24729	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
533	NC_011721	TGA	2	6	24780	24785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011721	TCT	2	6	24852	24857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_011721	AAG	2	6	24859	24864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011721	GTT	2	6	25022	25027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203875
537	NC_011721	AAT	2	6	25045	25050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203875
538	NC_011721	TCCAA	2	10	25054	25063	40 %	20 %	0 %	40 %	218203875
539	NC_011721	TCC	2	6	25178	25183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203875
540	NC_011721	TCT	2	6	25262	25267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203875
541	NC_011721	TCT	2	6	25316	25321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203875
542	NC_011721	CTT	2	6	25491	25496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203875
543	NC_011721	CTA	2	6	25575	25580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203875
544	NC_011721	CTC	2	6	25584	25589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203875
545	NC_011721	TC	3	6	25588	25593	0 %	50 %	0 %	50 %	218203875
546	NC_011721	ACA	2	6	25607	25612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203875
547	NC_011721	TAA	2	6	25613	25618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203875
548	NC_011721	TCA	2	6	25646	25651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203875
549	NC_011721	TCT	2	6	25694	25699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203875
550	NC_011721	CTT	2	6	25782	25787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203875
551	NC_011721	ATT	2	6	25790	25795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203875
552	NC_011721	TTCT	2	8	25796	25803	0 %	75 %	0 %	25 %	218203875
553	NC_011721	TC	3	6	25807	25812	0 %	50 %	0 %	50 %	218203875
554	NC_011721	T	7	7	25824	25830	0 %	100 %	0 %	0 %	218203875
555	NC_011721	CGA	2	6	25889	25894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203875
556	NC_011721	TAAA	2	8	25903	25910	75 %	25 %	0 %	0 %	218203875
557	NC_011721	TGA	2	6	25958	25963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203875
558	NC_011721	TAT	2	6	26047	26052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203875
559	NC_011721	TGA	2	6	26061	26066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203875
560	NC_011721	ACT	2	6	26164	26169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_011721	ACA	2	6	26215	26220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_011721	ATTTT	2	10	26226	26235	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011721	T	6	6	26259	26264	0 %	100 %	0 %	0 %	218203876
564	NC_011721	AT	3	6	26293	26298	50 %	50 %	0 %	0 %	218203876
565	NC_011721	ACA	2	6	26326	26331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203876
566	NC_011721	ATTC	2	8	26342	26349	25 %	50 %	0 %	25 %	218203876
567	NC_011721	TCA	2	6	26418	26423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203877
568	NC_011721	CTC	2	6	26447	26452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203877
569	NC_011721	AAT	2	6	26454	26459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203877
570	NC_011721	AAC	2	6	26521	26526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203877
571	NC_011721	T	6	6	26548	26553	0 %	100 %	0 %	0 %	218203877
572	NC_011721	AAT	2	6	26569	26574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203877
573	NC_011721	ATC	2	6	26636	26641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203877
574	NC_011721	GCA	2	6	26649	26654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203877
575	NC_011721	T	6	6	26731	26736	0 %	100 %	0 %	0 %	218203877
576	NC_011721	GTTG	2	8	26764	26771	0 %	50 %	50 %	0 %	218203877
577	NC_011721	A	7	7	26811	26817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011721	TCT	2	6	26880	26885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_011721	AAC	2	6	26953	26958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_011721	T	7	7	26971	26977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011721	AG	3	6	26988	26993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011721	GTA	2	6	27045	27050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011721	GGCT	2	8	27133	27140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
584	NC_011721	GACA	2	8	27202	27209	50 %	0 %	25 %	25 %	218203878
585	NC_011721	GCAG	2	8	27270	27277	25 %	0 %	50 %	25 %	218203878
586	NC_011721	ATCTCG	2	12	27290	27301	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218203878
587	NC_011721	AAG	2	6	27325	27330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203878
588	NC_011721	AGC	2	6	27392	27397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203878
589	NC_011721	CGC	2	6	27411	27416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218203878
590	NC_011721	TC	3	6	27418	27423	0 %	50 %	0 %	50 %	218203878
591	NC_011721	GTT	2	6	27434	27439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203878
592	NC_011721	CTTG	2	8	27472	27479	0 %	50 %	25 %	25 %	218203878
593	NC_011721	TCTG	2	8	27568	27575	0 %	50 %	25 %	25 %	218203878
594	NC_011721	TTG	2	6	27586	27591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203878
595	NC_011721	CTG	2	6	27620	27625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203878
596	NC_011721	ATT	2	6	27632	27637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203878
597	NC_011721	AAC	2	6	27698	27703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203878
598	NC_011721	CAA	2	6	27757	27762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203878
599	NC_011721	ACA	2	6	27763	27768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203878
600	NC_011721	AATC	2	8	27915	27922	50 %	25 %	0 %	25 %	218203879
601	NC_011721	AAG	2	6	27947	27952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203879
602	NC_011721	GAC	2	6	27961	27966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203879
603	NC_011721	AAT	2	6	28026	28031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203879
604	NC_011721	CTGTC	2	10	28048	28057	0 %	40 %	20 %	40 %	218203879
605	NC_011721	TGA	2	6	28084	28089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203879
606	NC_011721	GCTCC	2	10	28126	28135	0 %	20 %	20 %	60 %	218203879
607	NC_011721	ATT	2	6	28330	28335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203879
608	NC_011721	TTCA	2	8	28474	28481	25 %	50 %	0 %	25 %	218203879
609	NC_011721	GTC	2	6	28578	28583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203879
610	NC_011721	CTGA	2	8	28676	28683	25 %	25 %	25 %	25 %	218203879
611	NC_011721	TGGG	2	8	28727	28734	0 %	25 %	75 %	0 %	218203879
612	NC_011721	CAA	2	6	28746	28751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203879
613	NC_011721	TGG	2	6	28876	28881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203879
614	NC_011721	GTTT	2	8	28903	28910	0 %	75 %	25 %	0 %	218203879
615	NC_011721	CCA	2	6	29010	29015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203879
616	NC_011721	G	6	6	29061	29066	0 %	0 %	100 %	0 %	218203879
617	NC_011721	AGT	2	6	29135	29140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203879
618	NC_011721	AGTCG	2	10	29262	29271	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
619	NC_011721	ATAA	2	8	29352	29359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011721	GCT	2	6	29440	29445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203880
621	NC_011721	AAGCA	2	10	29544	29553	60 %	0 %	20 %	20 %	218203880
622	NC_011721	ATTT	2	8	29555	29562	25 %	75 %	0 %	0 %	218203880
623	NC_011721	GATCA	2	10	29593	29602	40 %	20 %	20 %	20 %	218203880
624	NC_011721	ACT	2	6	29673	29678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203880
625	NC_011721	ACC	2	6	29759	29764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203880
626	NC_011721	GTC	2	6	29858	29863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203880
627	NC_011721	ATT	2	6	29953	29958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203880
628	NC_011721	GTT	2	6	29996	30001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203880
629	NC_011721	AGT	2	6	30002	30007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203880
630	NC_011721	AGC	2	6	30083	30088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_011721	ACG	2	6	30100	30105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_011721	ATG	2	6	30155	30160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_011721	A	6	6	30257	30262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_011721	TCTA	2	8	30297	30304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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