MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 chromosome

Total Repeats: 1122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011565	TATTT	2	10	1599	1608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011565	CTTTC	2	10	3569	3578	0 %	60 %	0 %	40 %	212550360
3	NC_011565	TTGTA	2	10	3941	3950	20 %	60 %	20 %	0 %	212550360
4	NC_011565	TAAAT	2	10	4340	4349	60 %	40 %	0 %	0 %	212550360
5	NC_011565	ATGAA	2	10	5282	5291	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011565	ATTTT	2	10	5776	5785	20 %	80 %	0 %	0 %	212550361
7	NC_011565	TCTTG	2	10	6229	6238	0 %	60 %	20 %	20 %	212550361
8	NC_011565	AAAGT	2	10	6326	6335	60 %	20 %	20 %	0 %	212550361
9	NC_011565	ACTAC	2	10	8145	8154	40 %	20 %	0 %	40 %	212550362
10	NC_011565	AAATA	2	10	8674	8683	80 %	20 %	0 %	0 %	212550362
11	NC_011565	ATCAC	2	10	9156	9165	40 %	20 %	0 %	40 %	212550362
12	NC_011565	TATTT	2	10	10631	10640	20 %	80 %	0 %	0 %	212550362
13	NC_011565	TCCAC	2	10	10731	10740	20 %	20 %	0 %	60 %	212550362
14	NC_011565	TTTTC	2	10	10968	10977	0 %	80 %	0 %	20 %	212550362
15	NC_011565	CTCAT	2	10	11104	11113	20 %	40 %	0 %	40 %	212550363
16	NC_011565	TTCTT	2	10	11835	11844	0 %	80 %	0 %	20 %	212550363
17	NC_011565	GATTT	2	10	12134	12143	20 %	60 %	20 %	0 %	212550363
18	NC_011565	AATCA	2	10	13524	13533	60 %	20 %	0 %	20 %	212550363
19	NC_011565	TACAT	2	10	14317	14326	40 %	40 %	0 %	20 %	212550363
20	NC_011565	CGCTC	2	10	14464	14473	0 %	20 %	20 %	60 %	212550363
21	NC_011565	AAGTA	2	10	16142	16151	60 %	20 %	20 %	0 %	212550366
22	NC_011565	ATCTA	2	10	17307	17316	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011565	CTTTA	2	10	18788	18797	20 %	60 %	0 %	20 %	212550370
24	NC_011565	CTTCA	2	10	18842	18851	20 %	40 %	0 %	40 %	212550370
25	NC_011565	ATTTC	2	10	22286	22295	20 %	60 %	0 %	20 %	212550372
26	NC_011565	GAAAA	2	10	22685	22694	80 %	0 %	20 %	0 %	212550372
27	NC_011565	ATTTC	2	10	23254	23263	20 %	60 %	0 %	20 %	212550373
28	NC_011565	ATTTA	2	10	23453	23462	40 %	60 %	0 %	0 %	212550373
29	NC_011565	TTTCC	2	10	23974	23983	0 %	60 %	0 %	40 %	212550373
30	NC_011565	TATTT	2	10	24130	24139	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011565	AACAA	2	10	25736	25745	80 %	0 %	0 %	20 %	212550376
32	NC_011565	ACATG	2	10	25846	25855	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011565	AATAC	2	10	26186	26195	60 %	20 %	0 %	20 %	212550377
34	NC_011565	ACGAA	2	10	26688	26697	60 %	0 %	20 %	20 %	212550377
35	NC_011565	TCATT	2	10	26999	27008	20 %	60 %	0 %	20 %	212550377
36	NC_011565	TTTTC	2	10	27080	27089	0 %	80 %	0 %	20 %	212550377
37	NC_011565	TAGAA	2	10	29458	29467	60 %	20 %	20 %	0 %	212550380
38	NC_011565	GTATT	2	10	29544	29553	20 %	60 %	20 %	0 %	212550380
39	NC_011565	GAAGC	2	10	30307	30316	40 %	0 %	40 %	20 %	212550381
40	NC_011565	TTGTT	2	10	30658	30667	0 %	80 %	20 %	0 %	212550381
41	NC_011565	TCCAT	2	10	30716	30725	20 %	40 %	0 %	40 %	212550381
42	NC_011565	GTTAT	2	10	31265	31274	20 %	60 %	20 %	0 %	212550382
43	NC_011565	CAAAG	2	10	31902	31911	60 %	0 %	20 %	20 %	212550382
44	NC_011565	TTTTA	2	10	34402	34411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011565	TAAAT	2	10	36659	36668	60 %	40 %	0 %	0 %	212550385
46	NC_011565	ATGGA	2	10	36980	36989	40 %	20 %	40 %	0 %	212550385
47	NC_011565	TAGGA	2	10	38469	38478	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011565	TAATG	2	10	39149	39158	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011565	TAAAA	2	10	39850	39859	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011565	AAAAC	2	10	44414	44423	80 %	0 %	0 %	20 %	212550391
51	NC_011565	GCAAT	2	10	46151	46160	40 %	20 %	20 %	20 %	212550393
52	NC_011565	AAGAA	2	10	46532	46541	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011565	TATCT	2	10	48893	48902	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011565	GATTA	2	10	51742	51751	40 %	40 %	20 %	0 %	212550398
55	NC_011565	AGCAA	2	10	51782	51791	60 %	0 %	20 %	20 %	212550398
56	NC_011565	AAACA	2	10	52028	52037	80 %	0 %	0 %	20 %	212550399
57	NC_011565	TTTTC	2	10	56030	56039	0 %	80 %	0 %	20 %	212550401
58	NC_011565	CCTCC	2	10	59120	59129	0 %	20 %	0 %	80 %	212550405
59	NC_011565	CCAAT	2	10	59528	59537	40 %	20 %	0 %	40 %	212550405
60	NC_011565	GTGTA	2	10	62245	62254	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011565	GATTT	2	10	63615	63624	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011565	ATTTT	2	10	64055	64064	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011565	TATCT	2	10	65042	65051	20 %	60 %	0 %	20 %	212550407
64	NC_011565	AAAAT	2	10	65632	65641	80 %	20 %	0 %	0 %	212550407
65	NC_011565	CACCT	2	10	66232	66241	20 %	20 %	0 %	60 %	212550408
66	NC_011565	TTAAA	2	10	67819	67828	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011565	TAGTT	2	10	67935	67944	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011565	AAGAG	2	10	67980	67989	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011565	TAAAA	2	10	68086	68095	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011565	TACTT	2	10	68157	68166	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011565	TCAAA	2	10	68216	68225	60 %	20 %	0 %	20 %	212550409
72	NC_011565	AAGGG	2	10	71221	71230	40 %	0 %	60 %	0 %	212550410
73	NC_011565	ACAAA	2	10	72148	72157	80 %	0 %	0 %	20 %	212550410
74	NC_011565	CGAAT	2	10	73406	73415	40 %	20 %	20 %	20 %	212550411
75	NC_011565	TAATT	2	10	75803	75812	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011565	TACAA	2	10	76966	76975	60 %	20 %	0 %	20 %	212550414
77	NC_011565	AAAAC	2	10	78836	78845	80 %	0 %	0 %	20 %	212550415
78	NC_011565	CCCAA	2	10	79842	79851	40 %	0 %	0 %	60 %	212550416
79	NC_011565	ATCAA	2	10	80187	80196	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_011565	TCTAA	2	10	80584	80593	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_011565	TAATT	2	10	80982	80991	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011565	TCATT	2	10	81821	81830	20 %	60 %	0 %	20 %	212550417
83	NC_011565	TTTTA	2	10	82991	83000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011565	ATCCC	2	10	83368	83377	20 %	20 %	0 %	60 %	212550418
85	NC_011565	TGACA	2	10	85322	85331	40 %	20 %	20 %	20 %	212550419
86	NC_011565	AGTTT	2	10	87900	87909	20 %	60 %	20 %	0 %	212550422
87	NC_011565	CAATT	2	10	88461	88470	40 %	40 %	0 %	20 %	212550422
88	NC_011565	AAAAG	2	10	88863	88872	80 %	0 %	20 %	0 %	212550423
89	NC_011565	ATATT	2	10	90132	90141	40 %	60 %	0 %	0 %	212550424
90	NC_011565	ATTCT	2	10	91353	91362	20 %	60 %	0 %	20 %	212550424
91	NC_011565	TACTT	2	10	91559	91568	20 %	60 %	0 %	20 %	212550424
92	NC_011565	GAATT	2	10	94284	94293	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011565	GAAAT	2	10	94849	94858	60 %	20 %	20 %	0 %	212550430
94	NC_011565	AATAA	2	10	96587	96596	80 %	20 %	0 %	0 %	212550432
95	NC_011565	CTCTA	2	10	98903	98912	20 %	40 %	0 %	40 %	212550436
96	NC_011565	TACCC	2	10	99099	99108	20 %	20 %	0 %	60 %	212550436
97	NC_011565	TTTTC	2	10	99199	99208	0 %	80 %	0 %	20 %	212550436
98	NC_011565	TTAAC	2	10	99805	99814	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011565	CTTTC	2	10	103968	103977	0 %	60 %	0 %	40 %	212550446
100	NC_011565	TCTTT	2	10	107305	107314	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_011565	ACTTC	2	10	109995	110004	20 %	40 %	0 %	40 %	212550454
102	NC_011565	ATTTC	2	10	110310	110319	20 %	60 %	0 %	20 %	212550455
103	NC_011565	CTTCC	2	10	110695	110704	0 %	40 %	0 %	60 %	212550455
104	NC_011565	ATATA	2	10	110930	110939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011565	CAAAC	2	10	113478	113487	60 %	0 %	0 %	40 %	212550457
106	NC_011565	GGGTA	2	10	113704	113713	20 %	20 %	60 %	0 %	212550457
107	NC_011565	TATAA	2	10	114315	114324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011565	ATTGC	2	10	114452	114461	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_011565	CACCC	2	10	114547	114556	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
110	NC_011565	AAACG	2	10	116370	116379	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_011565	ATTTC	2	10	116548	116557	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_011565	CAACG	2	10	116823	116832	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_011565	ACACT	2	10	117329	117338	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_011565	TGCAG	2	10	117393	117402	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_011565	ACTAG	2	10	118022	118031	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_011565	CTTTT	2	10	118389	118398	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_011565	TAGGA	2	10	118399	118408	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011565	TGGCA	2	10	119443	119452	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_011565	ATTTT	2	10	121714	121723	20 %	80 %	0 %	0 %	212550461
120	NC_011565	TTTTC	2	10	122728	122737	0 %	80 %	0 %	20 %	212550461
121	NC_011565	AACAT	2	10	123682	123691	60 %	20 %	0 %	20 %	212550462
122	NC_011565	AATTA	2	10	124302	124311	60 %	40 %	0 %	0 %	212550462
123	NC_011565	TGAAT	2	10	124769	124778	40 %	40 %	20 %	0 %	212550462
124	NC_011565	AAACA	2	10	125003	125012	80 %	0 %	0 %	20 %	212550462
125	NC_011565	AACAA	2	10	125164	125173	80 %	0 %	0 %	20 %	212550463
126	NC_011565	GCTTT	2	10	126761	126770	0 %	60 %	20 %	20 %	212550465
127	NC_011565	GAATA	2	10	129350	129359	60 %	20 %	20 %	0 %	212550467
128	NC_011565	GATAG	2	10	129978	129987	40 %	20 %	40 %	0 %	212550467
129	NC_011565	AATAT	2	10	132669	132678	60 %	40 %	0 %	0 %	212550469
130	NC_011565	GATTC	2	10	133044	133053	20 %	40 %	20 %	20 %	212550469
131	NC_011565	ATAGA	2	10	134692	134701	60 %	20 %	20 %	0 %	212550472
132	NC_011565	CGATT	2	10	135491	135500	20 %	40 %	20 %	20 %	212550473
133	NC_011565	TGGTA	2	10	135985	135994	20 %	40 %	40 %	0 %	212550473
134	NC_011565	TTCTT	2	10	137339	137348	0 %	80 %	0 %	20 %	212550474
135	NC_011565	AAAAG	2	10	137349	137358	80 %	0 %	20 %	0 %	212550474
136	NC_011565	GTATT	2	10	139463	139472	20 %	60 %	20 %	0 %	212550476
137	NC_011565	AGCAA	2	10	141417	141426	60 %	0 %	20 %	20 %	212550478
138	NC_011565	TGGAT	2	10	142684	142693	20 %	40 %	40 %	0 %	212550479
139	NC_011565	AGTAT	2	10	143038	143047	40 %	40 %	20 %	0 %	212550479
140	NC_011565	TAATG	2	10	143246	143255	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011565	TGATT	2	10	145589	145598	20 %	60 %	20 %	0 %	212550484
142	NC_011565	ATAAG	2	10	145638	145647	60 %	20 %	20 %	0 %	212550484
143	NC_011565	ACAAT	2	10	146270	146279	60 %	20 %	0 %	20 %	212550484
144	NC_011565	CAAAA	2	10	146332	146341	80 %	0 %	0 %	20 %	212550484
145	NC_011565	ATTTC	2	10	146503	146512	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_011565	CAAAA	2	10	147419	147428	80 %	0 %	0 %	20 %	212550485
147	NC_011565	TTAAG	8	40	148990	149029	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011565	AAACA	2	10	149868	149877	80 %	0 %	0 %	20 %	212550487
149	NC_011565	AAACC	2	10	150295	150304	60 %	0 %	0 %	40 %	212550487
150	NC_011565	TTGTA	2	10	157863	157872	20 %	60 %	20 %	0 %	212550495
151	NC_011565	ACAAT	2	10	157882	157891	60 %	20 %	0 %	20 %	212550495
152	NC_011565	TCTGA	2	10	158790	158799	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_011565	CTATC	2	10	160350	160359	20 %	40 %	0 %	40 %	212550496
155	NC_011565	ATGAG	2	10	160361	160370	40 %	20 %	40 %	0 %	212550496
156	NC_011565	TTTTA	2	10	162270	162279	20 %	80 %	0 %	0 %	212550497
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158	NC_011565	ACTAA	2	10	166156	166165	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_011565	ATATA	2	10	166703	166712	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011565	ATTTT	2	10	169364	169373	20 %	80 %	0 %	0 %	212550501
161	NC_011565	TATCA	2	10	170339	170348	40 %	40 %	0 %	20 %	212550502
162	NC_011565	ATTTA	2	10	170456	170465	40 %	60 %	0 %	0 %	212550502
163	NC_011565	TTCAA	2	10	170499	170508	40 %	40 %	0 %	20 %	212550502
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165	NC_011565	GAATA	2	10	173948	173957	60 %	20 %	20 %	0 %	212550504
166	NC_011565	TGTAC	2	10	174321	174330	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
167	NC_011565	AAAAT	2	10	174539	174548	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_011565	TAAAA	2	10	175397	175406	80 %	20 %	0 %	0 %	212550505
169	NC_011565	GTATT	2	10	176317	176326	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
170	NC_011565	GACTT	2	10	177559	177568	20 %	40 %	20 %	20 %	212550506
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174	NC_011565	AATTG	2	10	181629	181638	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
175	NC_011565	ATTTT	2	10	182308	182317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_011565	TTATT	2	10	183256	183265	20 %	80 %	0 %	0 %	212550510
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179	NC_011565	ATGTA	2	10	186229	186238	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
180	NC_011565	TGGAA	2	10	186919	186928	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
181	NC_011565	TGGAT	2	10	188903	188912	20 %	40 %	40 %	0 %	212550513
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184	NC_011565	TTTTA	2	10	195161	195170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_011565	CTATA	2	10	196199	196208	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
186	NC_011565	AATCT	2	10	196783	196792	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
187	NC_011565	CTTAT	2	10	196826	196835	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_011565	TTCAA	2	10	197670	197679	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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195	NC_011565	GTTAA	2	10	207361	207370	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
196	NC_011565	TACAA	2	10	207628	207637	60 %	20 %	0 %	20 %	212550524
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201	NC_011565	CTTTC	2	10	211127	211136	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
202	NC_011565	TTTGA	2	10	211180	211189	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
203	NC_011565	ACAAT	2	10	211389	211398	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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211	NC_011565	TCTCC	2	10	220206	220215	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
212	NC_011565	AGAAA	2	10	221123	221132	80 %	0 %	20 %	0 %	212550530
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214	NC_011565	AATTC	2	10	223381	223390	40 %	40 %	0 %	20 %	212550532
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217	NC_011565	GAAAA	2	10	225370	225379	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
218	NC_011565	ATTTA	2	10	225632	225641	40 %	60 %	0 %	0 %	212550534
219	NC_011565	ATTTT	2	10	226227	226236	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
220	NC_011565	AGAAA	2	10	227867	227876	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
221	NC_011565	ATATC	2	10	228579	228588	40 %	40 %	0 %	20 %	212550535
222	NC_011565	TAAAA	2	10	229109	229118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
223	NC_011565	TCCTT	2	10	230679	230688	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
224	NC_011565	ATTTT	2	10	231650	231659	20 %	80 %	0 %	0 %	212550536
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242	NC_011565	TAAAA	2	10	255309	255318	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_011565	AAAAC	2	10	255446	255455	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
244	NC_011565	TTTCT	2	10	255773	255782	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
245	NC_011565	ATAAA	2	10	255926	255935	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_011565	ATTCA	2	10	256081	256090	40 %	40 %	0 %	20 %	212550551
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248	NC_011565	AGTTT	2	10	257785	257794	20 %	60 %	20 %	0 %	212550553
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251	NC_011565	AATTG	2	10	260002	260011	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
252	NC_011565	TATTT	2	10	263187	263196	20 %	80 %	0 %	0 %	212550556
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255	NC_011565	ATTTT	2	10	265178	265187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_011565	AGAAA	2	10	269404	269413	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
261	NC_011565	CTATA	2	10	269853	269862	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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264	NC_011565	TTCAT	2	10	272212	272221	20 %	60 %	0 %	20 %	212550562
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266	NC_011565	TAAAA	2	10	272865	272874	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_011565	ACTTG	2	10	273143	273152	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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270	NC_011565	GTAAA	2	10	277397	277406	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
271	NC_011565	TAAAA	2	10	278392	278401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_011565	TAAAT	2	10	278492	278501	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_011565	TTTTA	2	10	278773	278782	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_011565	CCAAT	2	10	279027	279036	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
275	NC_011565	TAATT	2	10	282795	282804	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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