MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 chromosome

Total Repeats: 3872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011565	CAAA	2	8	213	220	75 %	0 %	0 %	25 %	212550358
2	NC_011565	ATTT	2	8	575	582	25 %	75 %	0 %	0 %	212550358
3	NC_011565	ATTC	2	8	1144	1151	25 %	50 %	0 %	25 %	212550358
4	NC_011565	CATG	2	8	1279	1286	25 %	25 %	25 %	25 %	212550358
5	NC_011565	AACA	2	8	1868	1875	75 %	0 %	0 %	25 %	212550359
6	NC_011565	AACA	2	8	2460	2467	75 %	0 %	0 %	25 %	212550359
7	NC_011565	AAAC	2	8	2999	3006	75 %	0 %	0 %	25 %	212550359
8	NC_011565	CAAT	2	8	3345	3352	50 %	25 %	0 %	25 %	212550359
9	NC_011565	TTTA	2	8	4028	4035	25 %	75 %	0 %	0 %	212550360
10	NC_011565	TCAA	2	8	4146	4153	50 %	25 %	0 %	25 %	212550360
11	NC_011565	GACT	2	8	4932	4939	25 %	25 %	25 %	25 %	212550360
12	NC_011565	ATAA	2	8	5153	5160	75 %	25 %	0 %	0 %	212550360
13	NC_011565	CAAA	2	8	5303	5310	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011565	CCGA	2	8	5910	5917	25 %	0 %	25 %	50 %	212550361
15	NC_011565	CTTT	2	8	6716	6723	0 %	75 %	0 %	25 %	212550361
16	NC_011565	TACC	2	8	6862	6869	25 %	25 %	0 %	50 %	212550362
17	NC_011565	TTCA	2	8	6899	6906	25 %	50 %	0 %	25 %	212550362
18	NC_011565	ACTT	2	8	7166	7173	25 %	50 %	0 %	25 %	212550362
19	NC_011565	TTCA	2	8	7316	7323	25 %	50 %	0 %	25 %	212550362
20	NC_011565	ATTC	2	8	7834	7841	25 %	50 %	0 %	25 %	212550362
21	NC_011565	AGAA	2	8	8714	8721	75 %	0 %	25 %	0 %	212550362
22	NC_011565	TCCC	2	8	9750	9757	0 %	25 %	0 %	75 %	212550362
23	NC_011565	CCAT	2	8	10252	10259	25 %	25 %	0 %	50 %	212550362
24	NC_011565	TAAT	2	8	10866	10873	50 %	50 %	0 %	0 %	212550362
25	NC_011565	AGTA	2	8	11220	11227	50 %	25 %	25 %	0 %	212550363
26	NC_011565	GCAT	2	8	11362	11369	25 %	25 %	25 %	25 %	212550363
27	NC_011565	ATAA	2	8	11403	11410	75 %	25 %	0 %	0 %	212550363
28	NC_011565	CACC	2	8	11744	11751	25 %	0 %	0 %	75 %	212550363
29	NC_011565	CAAT	2	8	12332	12339	50 %	25 %	0 %	25 %	212550363
30	NC_011565	TTAC	2	8	13216	13223	25 %	50 %	0 %	25 %	212550363
31	NC_011565	TCAA	2	8	13702	13709	50 %	25 %	0 %	25 %	212550363
32	NC_011565	TTTC	2	8	14292	14299	0 %	75 %	0 %	25 %	212550363
33	NC_011565	CAAA	2	8	14988	14995	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011565	CCTT	2	8	15134	15141	0 %	50 %	0 %	50 %	212550364
35	NC_011565	TAGC	2	8	15330	15337	25 %	25 %	25 %	25 %	212550364
36	NC_011565	ACTT	2	8	15376	15383	25 %	50 %	0 %	25 %	212550364
37	NC_011565	ATTT	2	8	15451	15458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011565	GTCT	2	8	15544	15551	0 %	50 %	25 %	25 %	212550365
39	NC_011565	TCTT	2	8	16009	16016	0 %	75 %	0 %	25 %	212550365
40	NC_011565	TCCA	2	8	16040	16047	25 %	25 %	0 %	50 %	212550366
41	NC_011565	TCCA	2	8	16408	16415	25 %	25 %	0 %	50 %	212550366
42	NC_011565	CTTA	2	8	16691	16698	25 %	50 %	0 %	25 %	212550366
43	NC_011565	CTCA	2	8	17253	17260	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011565	ACAA	2	8	17265	17272	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011565	ACTT	2	8	17663	17670	25 %	50 %	0 %	25 %	212550368
46	NC_011565	TCCC	2	8	17698	17705	0 %	25 %	0 %	75 %	212550368
47	NC_011565	GGAA	2	8	17787	17794	50 %	0 %	50 %	0 %	212550368
48	NC_011565	TTTA	2	8	18004	18011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011565	GTAC	2	8	18038	18045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011565	TTTA	2	8	18098	18105	25 %	75 %	0 %	0 %	212550369
51	NC_011565	CATA	2	8	18334	18341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011565	ATAC	2	8	18342	18349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011565	AATT	2	8	18614	18621	50 %	50 %	0 %	0 %	212550370
54	NC_011565	CATC	2	8	19126	19133	25 %	25 %	0 %	50 %	212550370
55	NC_011565	AACT	2	8	19313	19320	50 %	25 %	0 %	25 %	212550370
56	NC_011565	CCAT	2	8	19407	19414	25 %	25 %	0 %	50 %	212550370
57	NC_011565	CTTT	2	8	19533	19540	0 %	75 %	0 %	25 %	212550370
58	NC_011565	ATTT	2	8	19710	19717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011565	CAAT	2	8	20026	20033	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011565	ATAA	2	8	20068	20075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011565	TTCT	2	8	22029	22036	0 %	75 %	0 %	25 %	212550371
62	NC_011565	AAAG	2	8	22176	22183	75 %	0 %	25 %	0 %	212550372
63	NC_011565	CATT	2	8	22202	22209	25 %	50 %	0 %	25 %	212550372
64	NC_011565	CATC	2	8	22577	22584	25 %	25 %	0 %	50 %	212550372
65	NC_011565	TTTC	2	8	22811	22818	0 %	75 %	0 %	25 %	212550372
66	NC_011565	GTAA	2	8	23060	23067	50 %	25 %	25 %	0 %	212550373
67	NC_011565	TTAA	2	8	23088	23095	50 %	50 %	0 %	0 %	212550373
68	NC_011565	AAAC	2	8	23688	23695	75 %	0 %	0 %	25 %	212550373
69	NC_011565	AACA	2	8	23866	23873	75 %	0 %	0 %	25 %	212550373
70	NC_011565	ACAA	2	8	24624	24631	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011565	AAAG	2	8	24798	24805	75 %	0 %	25 %	0 %	212550374
72	NC_011565	AGAA	2	8	25060	25067	75 %	0 %	25 %	0 %	212550375
73	NC_011565	AAAG	2	8	25422	25429	75 %	0 %	25 %	0 %	212550376
74	NC_011565	AAAT	2	8	25500	25507	75 %	25 %	0 %	0 %	212550376
75	NC_011565	CGAA	2	8	25620	25627	50 %	0 %	25 %	25 %	212550376
76	NC_011565	AAGC	2	8	25834	25841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011565	CTCA	2	8	25892	25899	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011565	TGAT	2	8	25909	25916	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011565	ATAC	2	8	25977	25984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011565	CACC	2	8	26269	26276	25 %	0 %	0 %	75 %	212550377
81	NC_011565	CATC	2	8	26954	26961	25 %	25 %	0 %	50 %	212550377
82	NC_011565	AATC	2	8	27571	27578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011565	CCAC	2	8	27586	27593	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_011565	TTCA	2	8	27596	27603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011565	ATCG	2	8	27963	27970	25 %	25 %	25 %	25 %	212550378
86	NC_011565	TTCA	2	8	28879	28886	25 %	50 %	0 %	25 %	212550380
87	NC_011565	AAAT	2	8	28943	28950	75 %	25 %	0 %	0 %	212550380
88	NC_011565	TCTT	2	8	28985	28992	0 %	75 %	0 %	25 %	212550380
89	NC_011565	AATC	2	8	29205	29212	50 %	25 %	0 %	25 %	212550380
90	NC_011565	ACTT	2	8	29407	29414	25 %	50 %	0 %	25 %	212550380
91	NC_011565	TTTG	2	8	29492	29499	0 %	75 %	25 %	0 %	212550380
92	NC_011565	TTGG	2	8	30490	30497	0 %	50 %	50 %	0 %	212550381
93	NC_011565	TTTG	2	8	30886	30893	0 %	75 %	25 %	0 %	212550381
94	NC_011565	AAGT	2	8	30942	30949	50 %	25 %	25 %	0 %	212550381
95	NC_011565	ATAA	2	8	30973	30980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011565	TTGG	2	8	31360	31367	0 %	50 %	50 %	0 %	212550382
97	NC_011565	CATC	2	8	32076	32083	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011565	CATT	2	8	32432	32439	25 %	50 %	0 %	25 %	212550383
99	NC_011565	TTTC	2	8	32866	32873	0 %	75 %	0 %	25 %	212550383
100	NC_011565	CTTC	2	8	33080	33087	0 %	50 %	0 %	50 %	212550383
101	NC_011565	TAAA	2	8	33099	33106	75 %	25 %	0 %	0 %	212550383
102	NC_011565	GATA	2	8	33207	33214	50 %	25 %	25 %	0 %	212550383
103	NC_011565	AATA	2	8	33669	33676	75 %	25 %	0 %	0 %	212550383
104	NC_011565	CGTC	2	8	33973	33980	0 %	25 %	25 %	50 %	212550383
105	NC_011565	TAAT	2	8	34422	34429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011565	TTGC	2	8	34485	34492	0 %	50 %	25 %	25 %	212550384
107	NC_011565	TATT	2	8	34540	34547	25 %	75 %	0 %	0 %	212550384
108	NC_011565	ATAA	2	8	34808	34815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011565	AATA	2	8	34822	34829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011565	CAAA	2	8	35109	35116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011565	AGAA	2	8	35208	35215	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011565	GTAT	2	8	35299	35306	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011565	TCGT	2	8	35322	35329	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011565	TTAT	2	8	35451	35458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011565	TAAA	2	8	35500	35507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011565	CAGA	2	8	35580	35587	50 %	0 %	25 %	25 %	212550385
117	NC_011565	ATTT	2	8	35830	35837	25 %	75 %	0 %	0 %	212550385
118	NC_011565	TTGC	2	8	36474	36481	0 %	50 %	25 %	25 %	212550385
119	NC_011565	AAGA	2	8	36502	36509	75 %	0 %	25 %	0 %	212550385
120	NC_011565	TGAT	2	8	36529	36536	25 %	50 %	25 %	0 %	212550385
121	NC_011565	TAAG	2	8	37863	37870	50 %	25 %	25 %	0 %	212550386
122	NC_011565	TAAA	2	8	38057	38064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011565	TTTA	2	8	38127	38134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011565	TCTT	2	8	38163	38170	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011565	TAAA	2	8	38206	38213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011565	GACC	2	8	38331	38338	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011565	ACTC	2	8	38642	38649	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_011565	ATTT	2	8	38769	38776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011565	TAGA	2	8	38949	38956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011565	ATAA	2	8	39193	39200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011565	GTTA	4	16	39478	39493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011565	GTCA	2	8	39494	39501	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011565	CAAA	2	8	39531	39538	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011565	AAAG	2	8	39730	39737	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011565	AATA	2	8	39807	39814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011565	CAAA	2	8	39881	39888	75 %	0 %	0 %	25 %	212550387
137	NC_011565	CATT	2	8	40606	40613	25 %	50 %	0 %	25 %	212550387
138	NC_011565	CCAA	2	8	41822	41829	50 %	0 %	0 %	50 %	212550388
139	NC_011565	TAAT	2	8	42014	42021	50 %	50 %	0 %	0 %	212550388
140	NC_011565	AGAA	2	8	42096	42103	75 %	0 %	25 %	0 %	212550389
141	NC_011565	TAAA	2	8	42538	42545	75 %	25 %	0 %	0 %	212550389
142	NC_011565	TAAA	2	8	42814	42821	75 %	25 %	0 %	0 %	212550389
143	NC_011565	TTAC	2	8	42870	42877	25 %	50 %	0 %	25 %	212550389
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