MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 chromosome

Total Repeats: 28312

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011565	CTA	2	6	21612	21617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550371
502	NC_011565	A	7	7	21718	21724	100 %	0 %	0 %	0 %	212550371
503	NC_011565	AAT	2	6	21726	21731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550371
504	NC_011565	T	6	6	21754	21759	0 %	100 %	0 %	0 %	212550371
505	NC_011565	TCC	2	6	21832	21837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550371
506	NC_011565	CTG	2	6	21843	21848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550371
507	NC_011565	ATC	2	6	21910	21915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550371
508	NC_011565	TAA	2	6	21931	21936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550371
509	NC_011565	ATC	2	6	21976	21981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550371
510	NC_011565	TAA	2	6	22007	22012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550371
511	NC_011565	T	6	6	22022	22027	0 %	100 %	0 %	0 %	212550371
512	NC_011565	TTCT	2	8	22029	22036	0 %	75 %	0 %	25 %	212550371
513	NC_011565	T	7	7	22123	22129	0 %	100 %	0 %	0 %	212550372
514	NC_011565	TA	3	6	22151	22156	50 %	50 %	0 %	0 %	212550372
515	NC_011565	AAAG	2	8	22176	22183	75 %	0 %	25 %	0 %	212550372
516	NC_011565	CATT	2	8	22202	22209	25 %	50 %	0 %	25 %	212550372
517	NC_011565	TAA	2	6	22232	22237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550372
518	NC_011565	ATA	2	6	22240	22245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550372
519	NC_011565	ATTTC	2	10	22286	22295	20 %	60 %	0 %	20 %	212550372
520	NC_011565	AGT	2	6	22380	22385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550372
521	NC_011565	TCT	2	6	22519	22524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550372
522	NC_011565	ATC	2	6	22551	22556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550372
523	NC_011565	CATC	2	8	22577	22584	25 %	25 %	0 %	50 %	212550372
524	NC_011565	ATAATC	2	12	22593	22604	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	212550372
525	NC_011565	TC	3	6	22665	22670	0 %	50 %	0 %	50 %	212550372
526	NC_011565	GAAAA	2	10	22685	22694	80 %	0 %	20 %	0 %	212550372
527	NC_011565	GCA	2	6	22720	22725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550372
528	NC_011565	ATC	2	6	22743	22748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550372
529	NC_011565	A	6	6	22781	22786	100 %	0 %	0 %	0 %	212550372
530	NC_011565	CGA	2	6	22789	22794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550372
531	NC_011565	TTTC	2	8	22811	22818	0 %	75 %	0 %	25 %	212550372
532	NC_011565	AAT	2	6	22833	22838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550372
533	NC_011565	TAG	2	6	22856	22861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550372
534	NC_011565	AGA	2	6	22883	22888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550373
535	NC_011565	TAA	2	6	22895	22900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550373
536	NC_011565	ATA	2	6	22964	22969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550373
537	NC_011565	T	6	6	22973	22978	0 %	100 %	0 %	0 %	212550373
538	NC_011565	AAT	2	6	23049	23054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550373
539	NC_011565	GTAA	2	8	23060	23067	50 %	25 %	25 %	0 %	212550373
540	NC_011565	TTAA	2	8	23088	23095	50 %	50 %	0 %	0 %	212550373
541	NC_011565	ATC	2	6	23165	23170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550373
542	NC_011565	CAT	2	6	23194	23199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550373
543	NC_011565	ATTTC	2	10	23254	23263	20 %	60 %	0 %	20 %	212550373
544	NC_011565	CAG	2	6	23272	23277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550373
545	NC_011565	ACA	2	6	23286	23291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550373
546	NC_011565	T	6	6	23303	23308	0 %	100 %	0 %	0 %	212550373
547	NC_011565	A	6	6	23336	23341	100 %	0 %	0 %	0 %	212550373
548	NC_011565	T	6	6	23360	23365	0 %	100 %	0 %	0 %	212550373
549	NC_011565	GAT	2	6	23413	23418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550373
550	NC_011565	ACA	2	6	23435	23440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550373
551	NC_011565	ATTTA	2	10	23453	23462	40 %	60 %	0 %	0 %	212550373
552	NC_011565	TAA	2	6	23515	23520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550373
553	NC_011565	AAAC	2	8	23688	23695	75 %	0 %	0 %	25 %	212550373
554	NC_011565	T	7	7	23750	23756	0 %	100 %	0 %	0 %	212550373
555	NC_011565	A	6	6	23784	23789	100 %	0 %	0 %	0 %	212550373
556	NC_011565	AACA	2	8	23866	23873	75 %	0 %	0 %	25 %	212550373
557	NC_011565	T	6	6	23889	23894	0 %	100 %	0 %	0 %	212550373
558	NC_011565	CAC	2	6	23940	23945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550373
559	NC_011565	AG	3	6	23952	23957	50 %	0 %	50 %	0 %	212550373
560	NC_011565	GTT	2	6	23960	23965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550373
561	NC_011565	TTTCC	2	10	23974	23983	0 %	60 %	0 %	40 %	212550373
562	NC_011565	TAT	2	6	23988	23993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011565	A	7	7	24052	24058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011565	TG	3	6	24060	24065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011565	TATTT	2	10	24130	24139	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011565	T	6	6	24137	24142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011565	TTG	2	6	24174	24179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011565	CAC	2	6	24245	24250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_011565	CTA	2	6	24329	24334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_011565	AGC	2	6	24347	24352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_011565	ATC	2	6	24387	24392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_011565	AAC	2	6	24409	24414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_011565	A	11	11	24513	24523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011565	AGC	2	6	24550	24555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_011565	A	7	7	24556	24562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011565	AGA	2	6	24577	24582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011565	AAG	2	6	24584	24589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011565	TCT	2	6	24595	24600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_011565	T	6	6	24602	24607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011565	ACAA	2	8	24624	24631	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
581	NC_011565	TAA	2	6	24709	24714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550374
582	NC_011565	GAA	2	6	24758	24763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550374
583	NC_011565	AAAG	2	8	24798	24805	75 %	0 %	25 %	0 %	212550374
584	NC_011565	TTA	2	6	24824	24829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550374
585	NC_011565	ATT	2	6	24851	24856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550374
586	NC_011565	AGA	2	6	24950	24955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550374
587	NC_011565	ACA	2	6	25004	25009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550375
588	NC_011565	AGAA	2	8	25060	25067	75 %	0 %	25 %	0 %	212550375
589	NC_011565	A	8	8	25081	25088	100 %	0 %	0 %	0 %	212550375
590	NC_011565	A	7	7	25128	25134	100 %	0 %	0 %	0 %	212550375
591	NC_011565	TGA	2	6	25262	25267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550375
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593	NC_011565	A	6	6	25356	25361	100 %	0 %	0 %	0 %	212550376
594	NC_011565	GAA	2	6	25370	25375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550376
595	NC_011565	T	6	6	25377	25382	0 %	100 %	0 %	0 %	212550376
596	NC_011565	A	8	8	25390	25397	100 %	0 %	0 %	0 %	212550376
597	NC_011565	AAAG	2	8	25422	25429	75 %	0 %	25 %	0 %	212550376
598	NC_011565	CAA	2	6	25450	25455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550376
599	NC_011565	A	6	6	25469	25474	100 %	0 %	0 %	0 %	212550376
600	NC_011565	A	6	6	25477	25482	100 %	0 %	0 %	0 %	212550376
601	NC_011565	AAAT	2	8	25500	25507	75 %	25 %	0 %	0 %	212550376
602	NC_011565	A	7	7	25602	25608	100 %	0 %	0 %	0 %	212550376
603	NC_011565	CGAA	2	8	25620	25627	50 %	0 %	25 %	25 %	212550376
604	NC_011565	AACAA	2	10	25736	25745	80 %	0 %	0 %	20 %	212550376
605	NC_011565	CTA	2	6	25785	25790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_011565	AAGC	2	8	25834	25841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
607	NC_011565	ACATG	2	10	25846	25855	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
608	NC_011565	CT	3	6	25882	25887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_011565	CTCA	2	8	25892	25899	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_011565	TGAT	2	8	25909	25916	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011565	CT	3	6	25954	25959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_011565	ATAC	2	8	25977	25984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
613	NC_011565	A	7	7	26020	26026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011565	T	6	6	26051	26056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011565	GCT	2	6	26098	26103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550377
616	NC_011565	TTA	2	6	26119	26124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550377
617	NC_011565	TCA	2	6	26146	26151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550377
618	NC_011565	TCCAGC	2	12	26169	26180	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212550377
619	NC_011565	AATAC	2	10	26186	26195	60 %	20 %	0 %	20 %	212550377
620	NC_011565	ATT	2	6	26196	26201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550377
621	NC_011565	CACC	2	8	26269	26276	25 %	0 %	0 %	75 %	212550377
622	NC_011565	CTC	2	6	26282	26287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550377
623	NC_011565	AG	3	6	26343	26348	50 %	0 %	50 %	0 %	212550377
624	NC_011565	CTG	2	6	26354	26359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550377
625	NC_011565	ACT	2	6	26413	26418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550377
626	NC_011565	AAT	2	6	26444	26449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550377
627	NC_011565	T	6	6	26457	26462	0 %	100 %	0 %	0 %	212550377
628	NC_011565	CTA	2	6	26519	26524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550377
629	NC_011565	CAA	2	6	26559	26564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550377
630	NC_011565	TCG	2	6	26590	26595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550377
631	NC_011565	ACG	2	6	26604	26609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550377
632	NC_011565	TA	3	6	26631	26636	50 %	50 %	0 %	0 %	212550377
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634	NC_011565	CAAAAT	2	12	26699	26710	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	212550377
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