MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 chromosome

Total Repeats: 28312

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011565	CTT	2	6	197982	197987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_011565	TGCA	2	8	197997	198004	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5003	NC_011565	CATC	2	8	198157	198164	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5004	NC_011565	ATT	2	6	198406	198411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_011565	GCT	2	6	198465	198470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_011565	AT	3	6	198527	198532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_011565	TTC	2	6	198559	198564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_011565	TCC	2	6	198813	198818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_011565	CTG	2	6	198880	198885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_011565	TCGCTT	2	12	198908	198919	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_011565	CAA	2	6	198950	198955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_011565	CATAA	2	10	198996	199005	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5013	NC_011565	TC	3	6	199107	199112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_011565	CA	3	6	199150	199155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_011565	TAC	2	6	199185	199190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_011565	AT	3	6	199235	199240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_011565	TCGC	2	8	199338	199345	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_011565	ACT	2	6	199347	199352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_011565	TCC	2	6	199377	199382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_011565	CTT	2	6	199526	199531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_011565	TCTT	2	8	199577	199584	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5022	NC_011565	TTC	2	6	199589	199594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_011565	ACA	2	6	199751	199756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_011565	TAA	2	6	199817	199822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_011565	A	7	7	199826	199832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_011565	CAAC	2	8	199870	199877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_011565	AATT	2	8	199889	199896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_011565	TAT	2	6	199957	199962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_011565	A	6	6	200038	200043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_011565	AAT	2	6	200045	200050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_011565	TCC	2	6	200083	200088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_011565	TATT	2	8	200102	200109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_011565	CCATA	2	10	200116	200125	40 %	20 %	0 %	40 %	212550518
5034	NC_011565	TA	3	6	200140	200145	50 %	50 %	0 %	0 %	212550518
5035	NC_011565	TC	3	6	200150	200155	0 %	50 %	0 %	50 %	212550518
5036	NC_011565	AGC	2	6	200174	200179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550518
5037	NC_011565	ACG	2	6	200183	200188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550518
5038	NC_011565	TAT	2	6	200216	200221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550518
5039	NC_011565	TTCT	2	8	200264	200271	0 %	75 %	0 %	25 %	212550518
5040	NC_011565	TCA	2	6	200283	200288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550518
5041	NC_011565	AT	3	6	200325	200330	50 %	50 %	0 %	0 %	212550518
5042	NC_011565	TAT	2	6	200335	200340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550518
5043	NC_011565	AAG	2	6	200353	200358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550518
5044	NC_011565	CTG	2	6	200372	200377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550518
5045	NC_011565	TAA	2	6	200408	200413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550518
5046	NC_011565	AGA	2	6	200516	200521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550518
5047	NC_011565	AAT	2	6	200522	200527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550518
5048	NC_011565	GCAG	2	8	200529	200536	25 %	0 %	50 %	25 %	212550518
5049	NC_011565	AGA	2	6	200549	200554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550518
5050	NC_011565	TTC	2	6	200576	200581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550518
5051	NC_011565	TTA	2	6	200698	200703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550518
5052	NC_011565	AAAT	2	8	200754	200761	75 %	25 %	0 %	0 %	212550518
5053	NC_011565	TC	3	6	200775	200780	0 %	50 %	0 %	50 %	212550518
5054	NC_011565	AGG	2	6	200782	200787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550518
5055	NC_011565	T	6	6	200843	200848	0 %	100 %	0 %	0 %	212550518
5056	NC_011565	CAA	2	6	200858	200863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550518
5057	NC_011565	AGC	2	6	200876	200881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550518
5058	NC_011565	AAT	2	6	200882	200887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550518
5059	NC_011565	TTGG	2	8	201014	201021	0 %	50 %	50 %	0 %	212550518
5060	NC_011565	TC	3	6	201041	201046	0 %	50 %	0 %	50 %	212550518
5061	NC_011565	AT	3	6	201135	201140	50 %	50 %	0 %	0 %	212550518
5062	NC_011565	TGA	2	6	201165	201170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550518
5063	NC_011565	CTT	2	6	201187	201192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550518
5064	NC_011565	CT	3	6	201204	201209	0 %	50 %	0 %	50 %	212550518
5065	NC_011565	TAAT	2	8	201214	201221	50 %	50 %	0 %	0 %	212550518
5066	NC_011565	CAA	2	6	201245	201250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550518
5067	NC_011565	TAAA	2	8	201271	201278	75 %	25 %	0 %	0 %	212550518
5068	NC_011565	AAT	2	6	201290	201295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550518
5069	NC_011565	CTG	2	6	201314	201319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550518
5070	NC_011565	ATT	2	6	201336	201341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550518
5071	NC_011565	GAT	2	6	201343	201348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_011565	AAT	3	9	201349	201357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_011565	ATTA	2	8	201367	201374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_011565	TTC	2	6	201375	201380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_011565	ACA	2	6	201428	201433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_011565	TAT	2	6	201448	201453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_011565	T	7	7	201478	201484	0 %	100 %	0 %	0 %	212550519
5078	NC_011565	ATA	2	6	201530	201535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550519
5079	NC_011565	GGAT	2	8	201549	201556	25 %	25 %	50 %	0 %	212550519
5080	NC_011565	AATC	2	8	201623	201630	50 %	25 %	0 %	25 %	212550519
5081	NC_011565	CTT	2	6	201656	201661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550519
5082	NC_011565	TA	3	6	201713	201718	50 %	50 %	0 %	0 %	212550519
5083	NC_011565	T	7	7	201767	201773	0 %	100 %	0 %	0 %	212550519
5084	NC_011565	GT	3	6	201774	201779	0 %	50 %	50 %	0 %	212550519
5085	NC_011565	AATA	2	8	201795	201802	75 %	25 %	0 %	0 %	212550519
5086	NC_011565	TTC	2	6	201861	201866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550519
5087	NC_011565	TTCT	2	8	202004	202011	0 %	75 %	0 %	25 %	212550520
5088	NC_011565	ATTG	2	8	202022	202029	25 %	50 %	25 %	0 %	212550520
5089	NC_011565	CT	3	6	202049	202054	0 %	50 %	0 %	50 %	212550520
5090	NC_011565	TCCC	2	8	202062	202069	0 %	25 %	0 %	75 %	212550520
5091	NC_011565	CAAA	2	8	202151	202158	75 %	0 %	0 %	25 %	212550520
5092	NC_011565	CTG	2	6	202160	202165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550520
5093	NC_011565	TGT	2	6	202195	202200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550520
5094	NC_011565	ACA	2	6	202223	202228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550520
5095	NC_011565	AGCA	2	8	202290	202297	50 %	0 %	25 %	25 %	212550520
5096	NC_011565	TCTA	2	8	202302	202309	25 %	50 %	0 %	25 %	212550520
5097	NC_011565	TAT	2	6	202406	202411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550520
5098	NC_011565	CAA	2	6	202445	202450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550520
5099	NC_011565	A	7	7	202556	202562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_011565	ATT	2	6	202578	202583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_011565	A	6	6	202604	202609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_011565	CAT	2	6	202613	202618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_011565	CT	3	6	202619	202624	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_011565	TC	3	6	202628	202633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_011565	TTA	2	6	202798	202803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_011565	CCATC	2	10	202833	202842	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5107	NC_011565	TTC	2	6	202846	202851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_011565	T	7	7	202867	202873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_011565	AGCA	2	8	202988	202995	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5110	NC_011565	ATC	2	6	203034	203039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_011565	GAT	2	6	203040	203045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_011565	TAT	2	6	203048	203053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_011565	ATC	2	6	203063	203068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_011565	TAT	2	6	203085	203090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_011565	ATTT	2	8	203098	203105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_011565	TAGAA	2	10	203121	203130	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_011565	T	7	7	203227	203233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_011565	CTA	2	6	203256	203261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_011565	A	6	6	203316	203321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_011565	T	6	6	203334	203339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_011565	CAT	2	6	203467	203472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550521
5122	NC_011565	CTT	2	6	203552	203557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550521
5123	NC_011565	TCCC	2	8	203572	203579	0 %	25 %	0 %	75 %	212550521
5124	NC_011565	CTT	2	6	203599	203604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550521
5125	NC_011565	TTC	2	6	203621	203626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550521
5126	NC_011565	TCTGTT	2	12	203638	203649	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	212550521
5127	NC_011565	A	7	7	203663	203669	100 %	0 %	0 %	0 %	212550521
5128	NC_011565	ATT	2	6	203697	203702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550521
5129	NC_011565	ACT	2	6	203714	203719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550521
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5131	NC_011565	TAA	3	9	203769	203777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5383	NC_011565	AAC	2	6	213514	213519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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