MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG1

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011564	TA	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	212550320
2	NC_011564	TA	3	6	1531	1536	50 %	50 %	0 %	0 %	212550320
3	NC_011564	GA	3	6	1814	1819	50 %	0 %	50 %	0 %	212550321
4	NC_011564	GA	3	6	2215	2220	50 %	0 %	50 %	0 %	212550322
5	NC_011564	AT	3	6	2227	2232	50 %	50 %	0 %	0 %	212550322
6	NC_011564	GA	3	6	2496	2501	50 %	0 %	50 %	0 %	212550322
7	NC_011564	AT	3	6	2733	2738	50 %	50 %	0 %	0 %	212550322
8	NC_011564	AG	3	6	3619	3624	50 %	0 %	50 %	0 %	212550323
9	NC_011564	CT	3	6	4352	4357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011564	CA	3	6	4585	4590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011564	AT	3	6	5894	5899	50 %	50 %	0 %	0 %	212550326
12	NC_011564	TA	3	6	7206	7211	50 %	50 %	0 %	0 %	212550326
13	NC_011564	CG	3	6	9234	9239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011564	AT	3	6	9379	9384	50 %	50 %	0 %	0 %	212550328
15	NC_011564	TG	3	6	9622	9627	0 %	50 %	50 %	0 %	212550328
16	NC_011564	CT	3	6	9994	9999	0 %	50 %	0 %	50 %	212550329
17	NC_011564	TC	3	6	10013	10018	0 %	50 %	0 %	50 %	212550329
18	NC_011564	CT	4	8	10019	10026	0 %	50 %	0 %	50 %	212550329
19	NC_011564	TA	3	6	10128	10133	50 %	50 %	0 %	0 %	212550329
20	NC_011564	CT	3	6	10242	10247	0 %	50 %	0 %	50 %	212550329
21	NC_011564	TA	3	6	10514	10519	50 %	50 %	0 %	0 %	212550330
22	NC_011564	CT	3	6	11125	11130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011564	GA	4	8	11418	11425	50 %	0 %	50 %	0 %	212550332
24	NC_011564	AG	3	6	11795	11800	50 %	0 %	50 %	0 %	212550332
25	NC_011564	AG	3	6	11847	11852	50 %	0 %	50 %	0 %	212550332
26	NC_011564	AG	5	10	12111	12120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011564	TG	3	6	13037	13042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011564	CT	3	6	13977	13982	0 %	50 %	0 %	50 %	212550335
29	NC_011564	AC	3	6	14172	14177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011564	TG	3	6	14771	14776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011564	TG	3	6	14946	14951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011564	AG	3	6	15069	15074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011564	TG	3	6	15257	15262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011564	CA	3	6	15266	15271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011564	CT	3	6	15669	15674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011564	GA	3	6	16000	16005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011564	AT	4	8	16029	16036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011564	GT	3	6	16176	16181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011564	AG	3	6	16284	16289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011564	GT	3	6	16368	16373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011564	TG	3	6	16489	16494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011564	TA	3	6	16720	16725	50 %	50 %	0 %	0 %	212550336
43	NC_011564	CA	3	6	16742	16747	50 %	0 %	0 %	50 %	212550336
44	NC_011564	AT	3	6	17774	17779	50 %	50 %	0 %	0 %	212550337
45	NC_011564	AG	3	6	18160	18165	50 %	0 %	50 %	0 %	212550337
46	NC_011564	AT	3	6	18249	18254	50 %	50 %	0 %	0 %	212550337
47	NC_011564	TC	3	6	19199	19204	0 %	50 %	0 %	50 %	212550337
48	NC_011564	TA	3	6	19415	19420	50 %	50 %	0 %	0 %	212550337
49	NC_011564	CT	3	6	19573	19578	0 %	50 %	0 %	50 %	212550337
50	NC_011564	AT	3	6	19724	19729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011564	AT	3	6	19898	19903	50 %	50 %	0 %	0 %	212550338
52	NC_011564	TA	3	6	20600	20605	50 %	50 %	0 %	0 %	212550339
53	NC_011564	CA	4	8	22097	22104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011564	TC	3	6	23501	23506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011564	TA	3	6	23598	23603	50 %	50 %	0 %	0 %	212550342
56	NC_011564	AT	3	6	24513	24518	50 %	50 %	0 %	0 %	212550344
57	NC_011564	CT	3	6	24588	24593	0 %	50 %	0 %	50 %	212550344
58	NC_011564	AC	3	6	25200	25205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011564	TG	3	6	25814	25819	0 %	50 %	50 %	0 %	212550346
60	NC_011564	AT	3	6	25873	25878	50 %	50 %	0 %	0 %	212550346
61	NC_011564	TG	3	6	26040	26045	0 %	50 %	50 %	0 %	212550346
62	NC_011564	TA	3	6	26152	26157	50 %	50 %	0 %	0 %	212550347
63	NC_011564	TC	3	6	27417	27422	0 %	50 %	0 %	50 %	212550348
64	NC_011564	TA	3	6	27612	27617	50 %	50 %	0 %	0 %	212550348
65	NC_011564	GA	3	6	27746	27751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011564	CT	3	6	27773	27778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011564	AG	3	6	28175	28180	50 %	0 %	50 %	0 %	212550349
68	NC_011564	CT	3	6	28374	28379	0 %	50 %	0 %	50 %	212550350
69	NC_011564	GA	3	6	28400	28405	50 %	0 %	50 %	0 %	212550350
70	NC_011564	TC	3	6	28535	28540	0 %	50 %	0 %	50 %	212550350
71	NC_011564	AG	3	6	28551	28556	50 %	0 %	50 %	0 %	212550350
72	NC_011564	GA	3	6	29254	29259	50 %	0 %	50 %	0 %	212550350
73	NC_011564	GA	3	6	29696	29701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011564	AT	4	8	29986	29993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011564	GA	4	8	31221	31228	50 %	0 %	50 %	0 %	212550351
76	NC_011564	TA	3	6	31651	31656	50 %	50 %	0 %	0 %	212550352
77	NC_011564	CT	3	6	32814	32819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011564	CT	3	6	33523	33528	0 %	50 %	0 %	50 %	212550354
79	NC_011564	TC	3	6	33661	33666	0 %	50 %	0 %	50 %	212550354
80	NC_011564	TA	3	6	33688	33693	50 %	50 %	0 %	0 %	212550354
81	NC_011564	TA	3	6	34235	34240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011564	AG	3	6	34601	34606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011564	CT	3	6	35445	35450	0 %	50 %	0 %	50 %	212550355
84	NC_011564	TC	4	8	35675	35682	0 %	50 %	0 %	50 %	212550355
85	NC_011564	TA	3	6	35717	35722	50 %	50 %	0 %	0 %	212550355
86	NC_011564	GA	3	6	36015	36020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011564	TA	3	6	36206	36211	50 %	50 %	0 %	0 %	212550356
88	NC_011564	CT	3	6	36301	36306	0 %	50 %	0 %	50 %	212550356
89	NC_011564	GA	3	6	36317	36322	50 %	0 %	50 %	0 %	212550356
90	NC_011564	TA	4	8	36345	36352	50 %	50 %	0 %	0 %	212550356
91	NC_011564	GA	3	6	36467	36472	50 %	0 %	50 %	0 %	212550356
92	NC_011564	TA	3	6	36911	36916	50 %	50 %	0 %	0 %	212550356

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.