MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG1

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011564	AAAG	2	8	340	347	75 %	0 %	25 %	0 %	212550320
2	NC_011564	AAAT	2	8	594	601	75 %	25 %	0 %	0 %	212550320
3	NC_011564	AGTA	2	8	895	902	50 %	25 %	25 %	0 %	212550320
4	NC_011564	GAAA	2	8	1319	1326	75 %	0 %	25 %	0 %	212550320
5	NC_011564	AAGA	2	8	1975	1982	75 %	0 %	25 %	0 %	212550321
6	NC_011564	GATA	2	8	1983	1990	50 %	25 %	25 %	0 %	212550321
7	NC_011564	AATT	2	8	2058	2065	50 %	50 %	0 %	0 %	212550321
8	NC_011564	TAGT	2	8	2577	2584	25 %	50 %	25 %	0 %	212550322
9	NC_011564	TATT	2	8	2984	2991	25 %	75 %	0 %	0 %	212550322
10	NC_011564	GGAA	2	8	3165	3172	50 %	0 %	50 %	0 %	212550323
11	NC_011564	GACA	2	8	3269	3276	50 %	0 %	25 %	25 %	212550323
12	NC_011564	GATG	2	8	3343	3350	25 %	25 %	50 %	0 %	212550323
13	NC_011564	AGAT	2	8	3720	3727	50 %	25 %	25 %	0 %	212550323
14	NC_011564	CTAC	2	8	3746	3753	25 %	25 %	0 %	50 %	212550323
15	NC_011564	AGGA	2	8	3786	3793	50 %	0 %	50 %	0 %	212550323
16	NC_011564	AAAT	2	8	3920	3927	75 %	25 %	0 %	0 %	212550323
17	NC_011564	TTCG	2	8	4043	4050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011564	TGCG	2	8	4317	4324	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011564	TAAT	2	8	4615	4622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011564	TCAT	2	8	4661	4668	25 %	50 %	0 %	25 %	212550324
21	NC_011564	TCAA	2	8	4822	4829	50 %	25 %	0 %	25 %	212550324
22	NC_011564	AACA	2	8	5072	5079	75 %	0 %	0 %	25 %	212550325
23	NC_011564	ATTA	2	8	5152	5159	50 %	50 %	0 %	0 %	212550325
24	NC_011564	TCAA	2	8	5871	5878	50 %	25 %	0 %	25 %	212550326
25	NC_011564	AAAT	2	8	6269	6276	75 %	25 %	0 %	0 %	212550326
26	NC_011564	AGTA	2	8	6573	6580	50 %	25 %	25 %	0 %	212550326
27	NC_011564	GAAA	2	8	6997	7004	75 %	0 %	25 %	0 %	212550326
28	NC_011564	ATCC	2	8	7602	7609	25 %	25 %	0 %	50 %	212550327
29	NC_011564	TTCT	2	8	8022	8029	0 %	75 %	0 %	25 %	212550327
30	NC_011564	CAGT	2	8	8213	8220	25 %	25 %	25 %	25 %	212550327
31	NC_011564	TTTA	2	8	9890	9897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011564	CTAC	2	8	9960	9967	25 %	25 %	0 %	50 %	212550329
33	NC_011564	ATCT	2	8	10056	10063	25 %	50 %	0 %	25 %	212550329
34	NC_011564	TTTC	2	8	10178	10185	0 %	75 %	0 %	25 %	212550329
35	NC_011564	TTTC	2	8	10304	10311	0 %	75 %	0 %	25 %	212550329
36	NC_011564	AAAC	2	8	10369	10376	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011564	TGCA	2	8	10503	10510	25 %	25 %	25 %	25 %	212550330
38	NC_011564	AATG	2	8	10826	10833	50 %	25 %	25 %	0 %	212550331
39	NC_011564	TATC	2	8	11052	11059	25 %	50 %	0 %	25 %	212550331
40	NC_011564	ACGT	2	8	11686	11693	25 %	25 %	25 %	25 %	212550332
41	NC_011564	GATG	2	8	11816	11823	25 %	25 %	50 %	0 %	212550332
42	NC_011564	AGAA	2	8	11824	11831	75 %	0 %	25 %	0 %	212550332
43	NC_011564	TCGT	2	8	13001	13008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011564	CATG	2	8	13285	13292	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011564	CATG	2	8	13307	13314	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011564	ATTG	2	8	13634	13641	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011564	TGCA	2	8	13660	13667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011564	GAGT	2	8	13750	13757	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011564	CATG	2	8	14086	14093	25 %	25 %	25 %	25 %	212550335
50	NC_011564	TTTG	2	8	14338	14345	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011564	AGGC	2	8	14476	14483	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011564	GGGA	2	8	14570	14577	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011564	GCGG	2	8	14700	14707	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011564	GCTG	2	8	14847	14854	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011564	CAAA	2	8	14882	14889	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011564	TAGA	2	8	15466	15473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011564	GTTT	2	8	15863	15870	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011564	AGTT	2	8	16378	16385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011564	TTTA	2	8	16525	16532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011564	TATT	2	8	17220	17227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011564	CATT	2	8	17336	17343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011564	AGTC	2	8	17490	17497	25 %	25 %	25 %	25 %	212550337
63	NC_011564	CCAT	2	8	17761	17768	25 %	25 %	0 %	50 %	212550337
64	NC_011564	AGTC	2	8	17922	17929	25 %	25 %	25 %	25 %	212550337
65	NC_011564	ATCT	2	8	18379	18386	25 %	50 %	0 %	25 %	212550337
66	NC_011564	CAGT	2	8	18596	18603	25 %	25 %	25 %	25 %	212550337
67	NC_011564	CTAC	2	8	18986	18993	25 %	25 %	0 %	50 %	212550337
68	NC_011564	CAAT	2	8	19328	19335	50 %	25 %	0 %	25 %	212550337
69	NC_011564	ATGG	2	8	20016	20023	25 %	25 %	50 %	0 %	212550338
70	NC_011564	ATAG	2	8	20147	20154	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011564	TTTC	2	8	20225	20232	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011564	CAGC	2	8	20344	20351	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011564	TTAT	2	8	20396	20403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011564	AATG	2	8	20463	20470	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011564	GACA	2	8	20511	20518	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011564	ATTC	2	8	20530	20537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011564	GATA	2	8	20539	20546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011564	CGAA	2	8	21363	21370	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011564	TAGA	2	8	21760	21767	50 %	25 %	25 %	0 %	212550340
80	NC_011564	TATT	2	8	21991	21998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011564	TCTA	2	8	22083	22090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011564	TGTA	2	8	22217	22224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011564	TTTC	2	8	22445	22452	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011564	ATTC	2	8	22662	22669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011564	TCTT	2	8	22867	22874	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011564	ATCC	2	8	24032	24039	25 %	25 %	0 %	50 %	212550343
87	NC_011564	TATT	2	8	24634	24641	25 %	75 %	0 %	0 %	212550344
88	NC_011564	GTTT	2	8	24970	24977	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011564	GTAT	2	8	25224	25231	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011564	TAAT	2	8	25242	25249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011564	TACA	2	8	25505	25512	50 %	25 %	0 %	25 %	212550345
92	NC_011564	CGTT	2	8	25573	25580	0 %	50 %	25 %	25 %	212550345
93	NC_011564	CTAT	2	8	25582	25589	25 %	50 %	0 %	25 %	212550345
94	NC_011564	TAAT	2	8	25931	25938	50 %	50 %	0 %	0 %	212550346
95	NC_011564	AATG	2	8	26025	26032	50 %	25 %	25 %	0 %	212550346
96	NC_011564	CTTT	2	8	26300	26307	0 %	75 %	0 %	25 %	212550347
97	NC_011564	GGAT	2	8	26498	26505	25 %	25 %	50 %	0 %	212550347
98	NC_011564	CTTA	2	8	26703	26710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011564	TAAG	2	8	26760	26767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011564	ATTT	2	8	26978	26985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011564	TGTT	2	8	27037	27044	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011564	ATTC	2	8	27155	27162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011564	AAAG	2	8	27861	27868	75 %	0 %	25 %	0 %	212550349
104	NC_011564	TCCT	2	8	28011	28018	0 %	50 %	0 %	50 %	212550349
105	NC_011564	AATG	2	8	28025	28032	50 %	25 %	25 %	0 %	212550349
106	NC_011564	AAAG	2	8	28095	28102	75 %	0 %	25 %	0 %	212550349
107	NC_011564	GTCA	2	8	28470	28477	25 %	25 %	25 %	25 %	212550350
108	NC_011564	AGAT	2	8	28969	28976	50 %	25 %	25 %	0 %	212550350
109	NC_011564	TCGT	2	8	29394	29401	0 %	50 %	25 %	25 %	212550350
110	NC_011564	TTCA	2	8	29503	29510	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011564	AATA	2	8	29523	29530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011564	ATAG	2	8	29589	29596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011564	TAAA	2	8	29726	29733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011564	AATG	2	8	30174	30181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011564	AGAT	2	8	30610	30617	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011564	AGTA	2	8	30869	30876	50 %	25 %	25 %	0 %	212550351
117	NC_011564	TTTG	2	8	31290	31297	0 %	75 %	25 %	0 %	212550351
118	NC_011564	TAAT	2	8	31330	31337	50 %	50 %	0 %	0 %	212550351
119	NC_011564	TATC	2	8	31341	31348	25 %	50 %	0 %	25 %	212550351
120	NC_011564	CAGA	2	8	31364	31371	50 %	0 %	25 %	25 %	212550351
121	NC_011564	GTTA	2	8	31468	31475	25 %	50 %	25 %	0 %	212550351
122	NC_011564	ACTT	2	8	31684	31691	25 %	50 %	0 %	25 %	212550352
123	NC_011564	CTGT	2	8	31767	31774	0 %	50 %	25 %	25 %	212550352
124	NC_011564	CAAT	2	8	32591	32598	50 %	25 %	0 %	25 %	212550353
125	NC_011564	AGAC	2	8	32682	32689	50 %	0 %	25 %	25 %	212550353
126	NC_011564	ACAA	2	8	32696	32703	75 %	0 %	0 %	25 %	212550353
127	NC_011564	TTTA	2	8	32766	32773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011564	ATCT	2	8	32863	32870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011564	TCGT	2	8	32954	32961	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011564	TTCT	2	8	33241	33248	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011564	TTTC	2	8	33823	33830	0 %	75 %	0 %	25 %	212550354
132	NC_011564	TAAC	2	8	33991	33998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011564	AAGA	2	8	34709	34716	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011564	TGGT	2	8	34970	34977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011564	TTTA	2	8	35190	35197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011564	TCTA	2	8	35318	35325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011564	AATC	2	8	35611	35618	50 %	25 %	0 %	25 %	212550355
138	NC_011564	TTAC	2	8	35849	35856	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011564	TCTA	2	8	35863	35870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011564	GATA	2	8	35961	35968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011564	AGAA	2	8	36268	36275	75 %	0 %	25 %	0 %	212550356
142	NC_011564	ATTT	2	8	36408	36415	25 %	75 %	0 %	0 %	212550356
143	NC_011564	ACGA	2	8	36439	36446	50 %	0 %	25 %	25 %	212550356
144	NC_011564	AAAG	2	8	36690	36697	75 %	0 %	25 %	0 %	212550356
145	NC_011564	ATTT	2	8	37551	37558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.