MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG3

Total Repeats: 818

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011562	CAAC	2	8	19524	19531	50 %	0 %	0 %	50 %	212550303
502	NC_011562	CAC	2	6	19606	19611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550303
503	NC_011562	CTTAT	2	10	19629	19638	20 %	60 %	0 %	20 %	212550303
504	NC_011562	CTAT	2	8	19704	19711	25 %	50 %	0 %	25 %	212550303
505	NC_011562	AGA	2	6	19722	19727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550303
506	NC_011562	T	6	6	19745	19750	0 %	100 %	0 %	0 %	212550303
507	NC_011562	CCAT	2	8	19772	19779	25 %	25 %	0 %	50 %	212550303
508	NC_011562	TC	3	6	19851	19856	0 %	50 %	0 %	50 %	212550303
509	NC_011562	TTG	2	6	19923	19928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550303
510	NC_011562	CTTTT	2	10	19993	20002	0 %	80 %	0 %	20 %	212550303
511	NC_011562	ATC	2	6	20009	20014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550303
512	NC_011562	GTT	2	6	20084	20089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550303
513	NC_011562	TTTA	2	8	20129	20136	25 %	75 %	0 %	0 %	212550303
514	NC_011562	T	6	6	20171	20176	0 %	100 %	0 %	0 %	212550303
515	NC_011562	ATA	2	6	20185	20190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550303
516	NC_011562	CT	3	6	20225	20230	0 %	50 %	0 %	50 %	212550303
517	NC_011562	TGT	2	6	20281	20286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550303
518	NC_011562	AGA	2	6	20323	20328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550303
519	NC_011562	ATTTC	2	10	20344	20353	20 %	60 %	0 %	20 %	212550303
520	NC_011562	T	8	8	20365	20372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011562	AGA	2	6	20376	20381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011562	AGAT	2	8	20390	20397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
523	NC_011562	TA	3	6	20419	20424	50 %	50 %	0 %	0 %	212550304
524	NC_011562	T	6	6	20426	20431	0 %	100 %	0 %	0 %	212550304
525	NC_011562	GTT	2	6	20458	20463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550304
526	NC_011562	AGC	2	6	20501	20506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550304
527	NC_011562	T	6	6	20508	20513	0 %	100 %	0 %	0 %	212550304
528	NC_011562	TC	3	6	20554	20559	0 %	50 %	0 %	50 %	212550304
529	NC_011562	TCA	2	6	20607	20612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550304
530	NC_011562	AGA	2	6	20649	20654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550304
531	NC_011562	ATTTTG	2	12	20732	20743	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	212550304
532	NC_011562	ATA	2	6	20810	20815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550304
533	NC_011562	TTC	2	6	21059	21064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550304
534	NC_011562	TCT	2	6	21099	21104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550304
535	NC_011562	ACT	2	6	21122	21127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550304
536	NC_011562	TC	3	6	21161	21166	0 %	50 %	0 %	50 %	212550304
537	NC_011562	T	7	7	21173	21179	0 %	100 %	0 %	0 %	212550304
538	NC_011562	CTA	2	6	21190	21195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550304
539	NC_011562	ATT	2	6	21213	21218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550304
540	NC_011562	ATT	2	6	21270	21275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011562	TTA	2	6	21309	21314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011562	ATC	2	6	21332	21337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_011562	ACCA	2	8	21416	21423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_011562	TCC	3	9	21441	21449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_011562	T	6	6	21467	21472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011562	TTTC	2	8	21496	21503	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
547	NC_011562	TGT	2	6	21512	21517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011562	TCTT	2	8	21543	21550	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_011562	AAC	2	6	21613	21618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_011562	TAA	2	6	21661	21666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011562	TTAT	2	8	21667	21674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011562	AATG	2	8	21728	21735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011562	CTT	2	6	21740	21745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_011562	GACA	2	8	21776	21783	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
555	NC_011562	ATTC	2	8	21795	21802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
556	NC_011562	GAT	2	6	21810	21815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011562	AGT	2	6	21824	21829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_011562	TA	3	6	21865	21870	50 %	50 %	0 %	0 %	212550305
559	NC_011562	TCT	2	6	21871	21876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550305
560	NC_011562	TCA	2	6	21880	21885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550305
561	NC_011562	TCTGA	2	10	21897	21906	20 %	40 %	20 %	20 %	212550305
562	NC_011562	CTA	2	6	22114	22119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550305
563	NC_011562	ACT	2	6	22179	22184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550305
564	NC_011562	T	7	7	22184	22190	0 %	100 %	0 %	0 %	212550305
565	NC_011562	TC	3	6	22192	22197	0 %	50 %	0 %	50 %	212550305
566	NC_011562	TTG	2	6	22274	22279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011562	ATA	2	6	22291	22296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011562	TTC	2	6	22498	22503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_011562	TAG	2	6	22526	22531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011562	AGTTTA	2	12	22572	22583	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011562	TAA	2	6	22596	22601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550306
572	NC_011562	ATA	2	6	22620	22625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550306
573	NC_011562	AAG	2	6	22654	22659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550306
574	NC_011562	GCA	2	6	22664	22669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550306
575	NC_011562	TA	3	6	22681	22686	50 %	50 %	0 %	0 %	212550306
576	NC_011562	ATT	2	6	22700	22705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550306
577	NC_011562	CTC	2	6	22752	22757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550306
578	NC_011562	CAT	2	6	22801	22806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550306
579	NC_011562	TAGTTG	2	12	22872	22883	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	212550306
580	NC_011562	ATC	2	6	22957	22962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550306
581	NC_011562	CTT	2	6	23014	23019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550306
582	NC_011562	TGT	2	6	23027	23032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550306
583	NC_011562	ATTG	2	8	23073	23080	25 %	50 %	25 %	0 %	212550306
584	NC_011562	TTA	2	6	23118	23123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550306
585	NC_011562	ATTTTA	2	12	23186	23197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550306
586	NC_011562	CTG	2	6	23348	23353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_011562	TG	3	6	23383	23388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_011562	CAT	2	6	23396	23401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_011562	GTA	2	6	23445	23450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011562	CAT	2	6	23493	23498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_011562	ATA	2	6	23574	23579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_011562	T	7	7	23610	23616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011562	ATAA	2	8	23630	23637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011562	AAT	2	6	23641	23646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_011562	TGT	2	6	23684	23689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_011562	GAC	2	6	23701	23706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_011562	TATGC	2	10	23731	23740	20 %	40 %	20 %	20 %	212550307
598	NC_011562	CATC	2	8	23799	23806	25 %	25 %	0 %	50 %	212550307
599	NC_011562	TCT	2	6	23936	23941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550307
600	NC_011562	TGT	2	6	23950	23955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550307
601	NC_011562	ATA	2	6	23961	23966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550307
602	NC_011562	GTC	2	6	23983	23988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550307
603	NC_011562	GAA	2	6	24019	24024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550307
604	NC_011562	TGT	2	6	24031	24036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550307
605	NC_011562	T	6	6	24040	24045	0 %	100 %	0 %	0 %	212550307
606	NC_011562	TA	3	6	24106	24111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011562	TCG	2	6	24189	24194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_011562	TTC	2	6	24285	24290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_011562	TG	3	6	24342	24347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
610	NC_011562	T	6	6	24406	24411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011562	TCTT	2	8	24483	24490	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
612	NC_011562	ATA	2	6	24496	24501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011562	T	6	6	24503	24508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011562	ATA	2	6	24572	24577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011562	ATA	2	6	24637	24642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_011562	A	6	6	24650	24655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011562	TCC	2	6	24692	24697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_011562	GA	3	6	24705	24710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011562	ATT	3	9	24721	24729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011562	GTA	2	6	24792	24797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011562	T	6	6	24799	24804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011562	CTT	2	6	24889	24894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_011562	ATC	3	9	24895	24903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_011562	AGC	2	6	24999	25004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_011562	AAC	2	6	25068	25073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_011562	CAG	2	6	25080	25085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_011562	ACT	2	6	25117	25122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_011562	TCT	2	6	25123	25128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_011562	ATT	2	6	25129	25134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011562	TGCC	2	8	25142	25149	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
631	NC_011562	TAT	2	6	25188	25193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_011562	TTC	2	6	25195	25200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_011562	TCT	2	6	25229	25234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550308
634	NC_011562	CAC	2	6	25389	25394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550308
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636	NC_011562	GTT	2	6	25516	25521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550308
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774	NC_011562	ATC	2	6	30380	30385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
775	NC_011562	AAT	2	6	30388	30393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
776	NC_011562	ATA	2	6	30404	30409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
777	NC_011562	AGT	2	6	30435	30440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
778	NC_011562	GAA	2	6	30507	30512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
779	NC_011562	TTC	3	9	30561	30569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
780	NC_011562	CAT	2	6	30575	30580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
781	NC_011562	T	7	7	30597	30603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
782	NC_011562	ATG	2	6	30620	30625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
783	NC_011562	AG	3	6	30631	30636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
784	NC_011562	AGT	2	6	30726	30731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
785	NC_011562	CAT	2	6	30732	30737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
786	NC_011562	TGT	2	6	30776	30781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
787	NC_011562	TCA	2	6	30846	30851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
788	NC_011562	TCT	3	9	30867	30875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
789	NC_011562	AATAA	2	10	30881	30890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
790	NC_011562	ATT	2	6	30955	30960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
791	NC_011562	TGGT	2	8	31000	31007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
792	NC_011562	AAC	2	6	31024	31029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
793	NC_011562	AAG	2	6	31031	31036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
794	NC_011562	CCA	2	6	31062	31067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
795	NC_011562	AATG	2	8	31076	31083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
796	NC_011562	TAAAA	2	10	31109	31118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
797	NC_011562	A	7	7	31164	31170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
798	NC_011562	AAT	2	6	31181	31186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
799	NC_011562	TAA	2	6	31201	31206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
800	NC_011562	TTTA	2	8	31219	31226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
801	NC_011562	ATAA	2	8	31229	31236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
802	NC_011562	TTC	2	6	31273	31278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
803	NC_011562	ATG	2	6	31280	31285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
804	NC_011562	TCC	2	6	31395	31400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
805	NC_011562	T	6	6	31406	31411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
806	NC_011562	TTC	2	6	31424	31429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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808	NC_011562	TCTTT	2	10	31532	31541	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
809	NC_011562	GAT	2	6	31566	31571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
810	NC_011562	GTT	2	6	31583	31588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
811	NC_011562	ATT	2	6	31619	31624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
812	NC_011562	TTA	2	6	31662	31667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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817	NC_011562	TAAT	2	8	31821	31828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
818	NC_011562	TAT	2	6	31856	31861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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