MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 45441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_011528	GTT	2	6	2021430	2021435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212219548
44502	NC_011528	TTTCG	2	10	2021444	2021453	0 %	60 %	20 %	20 %	212219548
44503	NC_011528	TTA	2	6	2021463	2021468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212219548
44504	NC_011528	ATA	2	6	2021490	2021495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212219548
44505	NC_011528	T	6	6	2021506	2021511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44506	NC_011528	TAA	2	6	2021543	2021548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44507	NC_011528	GTT	2	6	2021551	2021556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212219549
44508	NC_011528	TAC	2	6	2021602	2021607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212219549
44509	NC_011528	TAAA	2	8	2021716	2021723	75 %	25 %	0 %	0 %	212219549
44510	NC_011528	TTTC	2	8	2021743	2021750	0 %	75 %	0 %	25 %	212219549
44511	NC_011528	TGG	3	9	2021759	2021767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212219549
44512	NC_011528	A	6	6	2021771	2021776	100 %	0 %	0 %	0 %	212219549
44513	NC_011528	GGT	2	6	2021841	2021846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212219549
44514	NC_011528	GAG	3	9	2021911	2021919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212219549
44515	NC_011528	GCATT	2	10	2021966	2021975	20 %	40 %	20 %	20 %	212219549
44516	NC_011528	CTT	2	6	2022049	2022054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212219549
44517	NC_011528	AC	3	6	2022085	2022090	50 %	0 %	0 %	50 %	212219549
44518	NC_011528	AAAG	2	8	2022123	2022130	75 %	0 %	25 %	0 %	212219549
44519	NC_011528	AAC	2	6	2022138	2022143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212219549
44520	NC_011528	AAGG	2	8	2022223	2022230	50 %	0 %	50 %	0 %	212219549
44521	NC_011528	TTAA	2	8	2022279	2022286	50 %	50 %	0 %	0 %	212219549
44522	NC_011528	TAA	2	6	2022313	2022318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212219549
44523	NC_011528	T	8	8	2022379	2022386	0 %	100 %	0 %	0 %	212219549
44524	NC_011528	CTC	2	6	2022389	2022394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212219549
44525	NC_011528	TTA	2	6	2022570	2022575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44526	NC_011528	TTA	2	6	2022582	2022587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44527	NC_011528	CAA	2	6	2022595	2022600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44528	NC_011528	A	6	6	2022659	2022664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44529	NC_011528	CTGC	2	8	2022668	2022675	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44530	NC_011528	AAG	2	6	2022789	2022794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44531	NC_011528	CCG	2	6	2022874	2022879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212219550
44532	NC_011528	AAG	2	6	2022884	2022889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212219550
44533	NC_011528	CAA	2	6	2022982	2022987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212219550
44534	NC_011528	A	7	7	2022986	2022992	100 %	0 %	0 %	0 %	212219550
44535	NC_011528	GCG	2	6	2023036	2023041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212219550
44536	NC_011528	GAT	2	6	2023189	2023194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212219550
44537	NC_011528	AGA	2	6	2023236	2023241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212219550
44538	NC_011528	AAAC	2	8	2023258	2023265	75 %	0 %	0 %	25 %	212219550
44539	NC_011528	AACA	2	8	2023279	2023286	75 %	0 %	0 %	25 %	212219550
44540	NC_011528	AGA	2	6	2023290	2023295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212219550
44541	NC_011528	ATT	3	9	2023416	2023424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212219550
44542	NC_011528	TTG	2	6	2023438	2023443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212219550
44543	NC_011528	CAG	2	6	2023474	2023479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212219550
44544	NC_011528	ATACCA	2	12	2023514	2023525	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	212219550
44545	NC_011528	GAT	3	9	2023585	2023593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212219550
44546	NC_011528	CATC	2	8	2023632	2023639	25 %	25 %	0 %	50 %	212219550
44547	NC_011528	CG	3	6	2023646	2023651	0 %	0 %	50 %	50 %	212219550
44548	NC_011528	GCC	2	6	2023717	2023722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212219550
44549	NC_011528	A	7	7	2023758	2023764	100 %	0 %	0 %	0 %	212219550
44550	NC_011528	GACA	2	8	2023770	2023777	50 %	0 %	25 %	25 %	212219550
44551	NC_011528	CGA	2	6	2023824	2023829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212219550
44552	NC_011528	ACG	2	6	2023886	2023891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212219550
44553	NC_011528	GAA	2	6	2023933	2023938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212219550
44554	NC_011528	TGAT	2	8	2023943	2023950	25 %	50 %	25 %	0 %	212219550
44555	NC_011528	CGTAT	2	10	2023961	2023970	20 %	40 %	20 %	20 %	212219550
44556	NC_011528	T	6	6	2023987	2023992	0 %	100 %	0 %	0 %	212219550
44557	NC_011528	GC	3	6	2023995	2024000	0 %	0 %	50 %	50 %	212219550
44558	NC_011528	ACG	3	9	2024048	2024056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212219550
44559	NC_011528	GTG	2	6	2024071	2024076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212219550
44560	NC_011528	GC	5	10	2024197	2024206	0 %	0 %	50 %	50 %	212219550
44561	NC_011528	A	6	6	2024288	2024293	100 %	0 %	0 %	0 %	212219550
44562	NC_011528	A	6	6	2024326	2024331	100 %	0 %	0 %	0 %	212219550
44563	NC_011528	ATA	2	6	2024333	2024338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212219550
44564	NC_011528	CG	3	6	2024354	2024359	0 %	0 %	50 %	50 %	212219550
44565	NC_011528	AGA	2	6	2024370	2024375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212219550
44566	NC_011528	TTTC	2	8	2024440	2024447	0 %	75 %	0 %	25 %	212219550
44567	NC_011528	GAA	2	6	2024470	2024475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212219550
44568	NC_011528	CAAG	2	8	2024476	2024483	50 %	0 %	25 %	25 %	212219550
44569	NC_011528	TG	3	6	2024497	2024502	0 %	50 %	50 %	0 %	212219550
44570	NC_011528	GCG	2	6	2024521	2024526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212219550
44571	NC_011528	ATT	2	6	2024551	2024556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212219550
44572	NC_011528	ATTT	2	8	2024573	2024580	25 %	75 %	0 %	0 %	212219550
44573	NC_011528	TGC	2	6	2024601	2024606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212219550
44574	NC_011528	AGA	3	9	2024616	2024624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212219550
44575	NC_011528	AATT	2	8	2024666	2024673	50 %	50 %	0 %	0 %	212219550
44576	NC_011528	GCC	2	6	2024690	2024695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212219550
44577	NC_011528	TGG	2	6	2024828	2024833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212219550
44578	NC_011528	TTA	2	6	2024844	2024849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212219550
44579	NC_011528	A	6	6	2024872	2024877	100 %	0 %	0 %	0 %	212219550
44580	NC_011528	CGGGC	2	10	2024880	2024889	0 %	0 %	60 %	40 %	212219550
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44582	NC_011528	GCTA	2	8	2024971	2024978	25 %	25 %	25 %	25 %	212219550
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44586	NC_011528	CTT	2	6	2025094	2025099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212219551
44587	NC_011528	TGC	2	6	2025122	2025127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212219551
44588	NC_011528	GTT	2	6	2025132	2025137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212219551
44589	NC_011528	TCA	3	9	2025176	2025184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212219551
44590	NC_011528	TGC	2	6	2025212	2025217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212219551
44591	NC_011528	TTG	3	9	2025307	2025315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212219551
44592	NC_011528	TCG	2	6	2025346	2025351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212219551
44593	NC_011528	T	6	6	2025359	2025364	0 %	100 %	0 %	0 %	212219551
44594	NC_011528	ATT	3	9	2025384	2025392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212219551
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44599	NC_011528	GCT	2	6	2025599	2025604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212219551
44600	NC_011528	GAA	2	6	2025618	2025623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212219551
44601	NC_011528	TTAC	2	8	2025624	2025631	25 %	50 %	0 %	25 %	212219551
44602	NC_011528	T	7	7	2025674	2025680	0 %	100 %	0 %	0 %	212219551
44603	NC_011528	TTGTT	2	10	2025694	2025703	0 %	80 %	20 %	0 %	212219551
44604	NC_011528	GGTGCG	2	12	2025763	2025774	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	212219552
44605	NC_011528	GAG	2	6	2025799	2025804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212219552
44606	NC_011528	TCA	2	6	2025805	2025810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212219552
44607	NC_011528	GA	3	6	2025824	2025829	50 %	0 %	50 %	0 %	212219552
44608	NC_011528	TTC	2	6	2025861	2025866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212219552
44609	NC_011528	TTC	2	6	2025876	2025881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212219552
44610	NC_011528	TGC	2	6	2025888	2025893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212219552
44611	NC_011528	CGAC	2	8	2025946	2025953	25 %	0 %	25 %	50 %	212219552
44612	NC_011528	CTT	2	6	2025995	2026000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212219552
44613	NC_011528	AAGC	2	8	2026024	2026031	50 %	0 %	25 %	25 %	212219552
44614	NC_011528	GAG	2	6	2026091	2026096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212219552
44615	NC_011528	TCT	2	6	2026114	2026119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212219552
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44617	NC_011528	TCG	2	6	2026168	2026173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212219552
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44619	NC_011528	ATT	2	6	2026272	2026277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212219552
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44743	NC_011528	GTTTC	2	10	2032248	2032257	0 %	60 %	20 %	20 %	212219556
44744	NC_011528	CCAC	2	8	2032263	2032270	25 %	0 %	0 %	75 %	212219556
44745	NC_011528	A	8	8	2032362	2032369	100 %	0 %	0 %	0 %	212219556
44746	NC_011528	CCT	2	6	2032377	2032382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212219556
44747	NC_011528	ACT	2	6	2032397	2032402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212219556
44748	NC_011528	ATCAA	2	10	2032406	2032415	60 %	20 %	0 %	20 %	212219556
44749	NC_011528	GAA	2	6	2032416	2032421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212219556
44750	NC_011528	GAA	2	6	2032425	2032430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212219556
44751	NC_011528	T	6	6	2032455	2032460	0 %	100 %	0 %	0 %	212219556
44752	NC_011528	GAT	2	6	2032503	2032508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212219556
44753	NC_011528	CCT	2	6	2032511	2032516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212219556
44754	NC_011528	TTC	2	6	2032531	2032536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212219556
44755	NC_011528	ATC	2	6	2032577	2032582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212219556
44756	NC_011528	ACT	2	6	2032596	2032601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212219556
44757	NC_011528	A	6	6	2032616	2032621	100 %	0 %	0 %	0 %	212219556
44758	NC_011528	TTAT	2	8	2032677	2032684	25 %	75 %	0 %	0 %	212219556
44759	NC_011528	A	6	6	2032687	2032692	100 %	0 %	0 %	0 %	212219556
44760	NC_011528	A	6	6	2032740	2032745	100 %	0 %	0 %	0 %	212219556
44761	NC_011528	AGT	2	6	2032761	2032766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212219556
44762	NC_011528	GAT	2	6	2032811	2032816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44763	NC_011528	CCA	2	6	2032832	2032837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212219557
44764	NC_011528	CGCAA	2	10	2032861	2032870	40 %	0 %	20 %	40 %	212219557
44765	NC_011528	T	6	6	2032931	2032936	0 %	100 %	0 %	0 %	212219557
44766	NC_011528	T	8	8	2032951	2032958	0 %	100 %	0 %	0 %	212219557
44767	NC_011528	TAAA	2	8	2032988	2032995	75 %	25 %	0 %	0 %	212219557
44768	NC_011528	ATAAA	2	10	2033058	2033067	80 %	20 %	0 %	0 %	212219557
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44771	NC_011528	GGT	2	6	2033211	2033216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212219557
44772	NC_011528	GTT	2	6	2033295	2033300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212219557
44773	NC_011528	CA	3	6	2033343	2033348	50 %	0 %	0 %	50 %	212219557
44774	NC_011528	A	7	7	2033391	2033397	100 %	0 %	0 %	0 %	212219557
44775	NC_011528	AAT	2	6	2033409	2033414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212219557
44776	NC_011528	T	7	7	2033428	2033434	0 %	100 %	0 %	0 %	212219557
44777	NC_011528	A	6	6	2033451	2033456	100 %	0 %	0 %	0 %	212219557
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44779	NC_011528	A	6	6	2033561	2033566	100 %	0 %	0 %	0 %	212219558
44780	NC_011528	TAA	2	6	2033567	2033572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212219558
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44782	NC_011528	GC	3	6	2033627	2033632	0 %	0 %	50 %	50 %	212219558
44783	NC_011528	TCCA	2	8	2033645	2033652	25 %	25 %	0 %	50 %	212219558
44784	NC_011528	TAA	3	9	2033654	2033662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212219558
44785	NC_011528	T	7	7	2033721	2033727	0 %	100 %	0 %	0 %	212219558
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44790	NC_011528	ATTTC	2	10	2033860	2033869	20 %	60 %	0 %	20 %	212219558
44791	NC_011528	T	7	7	2033877	2033883	0 %	100 %	0 %	0 %	212219558
44792	NC_011528	ATACAA	2	12	2033907	2033918	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	212219558
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44795	NC_011528	TAA	2	6	2034012	2034017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212219558
44796	NC_011528	GC	3	6	2034051	2034056	0 %	0 %	50 %	50 %	212219558
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44798	NC_011528	TGAC	2	8	2034124	2034131	25 %	25 %	25 %	25 %	212219558
44799	NC_011528	A	6	6	2034135	2034140	100 %	0 %	0 %	0 %	212219558
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44802	NC_011528	CAA	2	6	2034224	2034229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212219558
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44804	NC_011528	AGC	2	6	2034238	2034243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212219558
44805	NC_011528	AAAT	2	8	2034247	2034254	75 %	25 %	0 %	0 %	212219558
44806	NC_011528	CTA	2	6	2034324	2034329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212219559
44807	NC_011528	CTTTT	2	10	2034332	2034341	0 %	80 %	0 %	20 %	212219559
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44809	NC_011528	CTT	2	6	2034358	2034363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212219559
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44830	NC_011528	GCCG	2	8	2035397	2035404	0 %	0 %	50 %	50 %	212219559
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44833	NC_011528	AGA	2	6	2035439	2035444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212219559
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44836	NC_011528	A	7	7	2035539	2035545	100 %	0 %	0 %	0 %	212219559
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44841	NC_011528	TAAT	2	8	2035847	2035854	50 %	50 %	0 %	0 %	212219560
44842	NC_011528	GA	3	6	2035890	2035895	50 %	0 %	50 %	0 %	212219560
44843	NC_011528	TAA	2	6	2035922	2035927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212219560
44844	NC_011528	AGC	2	6	2035969	2035974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212219560
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44846	NC_011528	ACA	2	6	2036120	2036125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212219560
44847	NC_011528	A	7	7	2036206	2036212	100 %	0 %	0 %	0 %	212219560
44848	NC_011528	TA	3	6	2036234	2036239	50 %	50 %	0 %	0 %	212219560
44849	NC_011528	TTGT	2	8	2036270	2036277	0 %	75 %	25 %	0 %	212219560
44850	NC_011528	ACGC	2	8	2036282	2036289	25 %	0 %	25 %	50 %	212219560
44851	NC_011528	TC	3	6	2036356	2036361	0 %	50 %	0 %	50 %	212219560
44852	NC_011528	A	6	6	2036364	2036369	100 %	0 %	0 %	0 %	212219560
44853	NC_011528	CGTC	2	8	2036438	2036445	0 %	25 %	25 %	50 %	212219560
44854	NC_011528	ATC	2	6	2036470	2036475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212219560
44855	NC_011528	CCG	2	6	2036476	2036481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212219560
44856	NC_011528	GACA	2	8	2036603	2036610	50 %	0 %	25 %	25 %	212219560
44857	NC_011528	GCC	2	6	2036665	2036670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212219560
44858	NC_011528	GAT	2	6	2036679	2036684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212219560
44859	NC_011528	TCGA	2	8	2036703	2036710	25 %	25 %	25 %	25 %	212219560
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